BACKGROUND: Rapid detection and ide

BACKGROUND: Rapid detection and identification of viruses are important for early diagnosis and effective surveillance of hand, foot, and mouth disease (HFMD). We described a novel assay using multilocus PCR and reverse transcription-PCR coupled with electrospray ionization mass spectrometry (RT-PCR/ESI-MS) to simultaneously detect and identify human enterovirus A-D, adenovirus A-F, human herpesvirus 1-8, parvovirus B19 and polyomavirus. OBJECTIVES: To evaluate the accuracy and efficacy of the RT-PCR/ESI-MS method, to detect and type enterovirus from specimens of clinical diagnosed HFMD patients. STUDY DESIGN: In this study, 152 specimens of clinically diagnosed HFMD patients were studied by the assay using RT-PCR/ESI-MS method. The detection and typing of enterovirus by RT-PCR/ESI-MS were compared with results from reference molecular methods. RESULTS: The assay detected enteroviruses in 97 (63.8%) specimens, resulting in a sensitivity of 93.8% (95% CI: 91.8-95.7%) and a specificity of 87.5% (95% CI: 84.8-90.2%) compared with a reference clinical diagnostic test. Most enterovirus genotypes (65/84; 77%) determined by the platform were consistent with 5' UTR sequence analysis, and most misidentifications resulted from the virus library, which could be further improved by updating the enterovirus database. In addition to enteroviruses, herpesviruses, polyomaviruses, adenoviruses and human rhinoviruses were detected and identified in 55 (36%) HFMD specimens by RT-PCR/ESI-MS. CONCLUSION: With the capability of high throughput and detection and typing of multiple clinically relevant viruses simultaneously, RT-PCR/ESI-MS can be a rapid and robust laboratory tool for identifying viral pathogens.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

พื้นหลัง: ตรวจสอบอย่างรวดเร็วและรหัสของไวรัสมีความสำคัญสำหรับช่วงการวินิจฉัยและการเฝ้าระวังที่มีประสิทธิภาพของมือ เท้า และโรคปาก (กิโลกรัม) เราอธิบายวิเคราะห์นวนิยายที่ใช้ multilocus PCR และย้อน transcription-PCR ควบคู่กับวิธีพ่นละอองไฟฟ้า ionization โตรเมทรี (RT-PCR/ESI-MS) เพื่อตรวจสอบ และระบุมนุษย์เอนเทอโรไวรัส A-D, A-F adenovirus สไวรัสมนุษย์ 1-8, parvovirus B19 และ polyomavirus พร้อมกัน วัตถุประสงค์: เพื่อประเมินความถูกต้องและประสิทธิภาพของวิธี RT-PCR/ESI-MS การตรวจสอบ และชนิดเอนเทอโรไวรัสจากไว้เป็นตัวอย่างของทางคลินิกการวินิจฉัยผู้ป่วยกิโลกรัม ออกแบบการศึกษา: ในการศึกษานี้ 152 ไว้เป็นตัวอย่างของทางคลินิกการวินิจฉัยผู้ป่วยกิโลกรัมถูกศึกษา โดยการวิเคราะห์ใช้วิธี RT-PCR/ESI-MS การตรวจพบและการพิมพ์ของเอนเทอโรไวรัสโดย RT-PCR/ESI-MS ถูกเปรียบเทียบกับผลลัพธ์จากวิธีอ้างอิงระดับโมเลกุล ผลลัพธ์: การวิเคราะห์ตรวจพบ enteroviruses ใน 97 (63.8%) ไว้เป็นตัวอย่าง ในความไวของ 93.8% (95% CI: 91.8-95.7%) และ specificity 87.5% (95% CI: 84.8 90.2%) เมื่อเทียบกับการทดสอบการวินิจฉัยทางคลินิกอ้างอิง ศึกษาจีโนไทป์เอนเทอโรไวรัสส่วนใหญ่ (65/84; 77%) กำหนดจากแพลตฟอร์มได้สอดคล้องกับ 5' UTR ลำดับวิเคราะห์ และ misidentifications ส่วนใหญ่เป็นผลมาจากไวรัสรี ซึ่งสามารถเพิ่มเติมปรับปรุงได้ โดยการปรับปรุงฐานข้อมูลเอนเทอโรไวรัส นอกจาก enteroviruses, herpesviruses, polyomaviruses, adenoviruses rhinoviruses มนุษย์ถูกตรวจพบ และระบุใน 55 (36%) กิโลกรัมไว้เป็นตัวอย่าง โดยสรุป RT-PCR/ESI-นางสาว: ด้วยความสามารถของอัตราความเร็วสูง และการตรวจสอบ และพิมพ์ของไวรัสหลายทางคลินิกที่เกี่ยวข้องกัน RT-PCR/ESI-MS สามารถเป็นเครื่องมือห้องปฏิบัติการอย่างรวดเร็ว และมีประสิทธิภาพสำหรับการระบุโรคไวรัสได้

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ภูมิหลัง: การตรวจสอบและการตรวจสอบอย่างรวดเร็วของไวรัสมีความสำคัญต่อการวินิจฉัยและการเฝ้าระวังที่มีประสิทธิภาพของมือเท้าและโรคปาก (HFMD) เราอธิบายวิธีใหม่โดยใช้ Multilocus PCR และ reverse RT-PCR คู่กับ electrospray ไอออนไนซ์มวลสาร (RT-PCR / ESI-MS) ไปพร้อม ๆ กันตรวจสอบและระบุ AD enterovirus มนุษย์ adenovirus AF, herpesvirus มนุษย์ 1-8, parvovirus B19 และ polyomavirus . วัตถุประสงค์: เพื่อประเมินความถูกต้องและความมีประสิทธิภาพของวิธี RT-PCR / ESI-MS, การตรวจสอบและพิมพ์ enterovirus จากตัวอย่างของการวินิจฉัยผู้ป่วยโรคมือเท้าปากทางคลินิก รูปแบบการศึกษา: การศึกษาครั้งนี้ 152 ตัวอย่างของผู้ป่วยที่ได้รับการวินิจฉัยทางคลินิกโรคมือเท้าปากได้รับการศึกษาโดยการทดลองใช้วิธี RT-PCR / ESI-MS การตรวจสอบและการพิมพ์ของ enterovirus โดย RT-PCR / ESI-MS ถูกเมื่อเทียบกับผลลัพธ์ที่ได้จากการอ้างอิงวิธีโมเลกุล ผลการทดสอบพบ enteroviruses ใน 97 (63.8%) ตัวอย่างที่เกิดขึ้นในความไวของ 93.8% (95% CI: 91.8-95.7%) และความจำเพาะของ 87.5% (95% CI: 84.8-90.2%) เมื่อเทียบกับ อ้างอิงทดสอบวินิจฉัยทางคลินิก ส่วนใหญ่สายพันธุ์เอนเทอโร (65/84; 77%) กำหนดโดยแพลตฟอร์มมีความสอดคล้องกับการวิเคราะห์ลำดับ 5 'UTR และ misidentifications ส่วนใหญ่เป็นผลมาจากห้องสมุดไวรัสซึ่งอาจจะดีขึ้นต่อไปโดยการปรับปรุงฐานข้อมูล enterovirus นอกจาก enteroviruses, herpesviruses, polyomaviruses, อะดีโนไวรัสและ rhinoviruses ของมนุษย์ได้รับการตรวจพบและระบุใน 55 (36%) ตัวอย่างโรคมือเท้าปากโดย RT-PCR / ESI-MS สรุป: ด้วยความสามารถของ throughput สูงและการตรวจสอบและการพิมพ์ของไวรัสทางคลินิกหลายคนพร้อมกัน, RT-PCR / ESI-MS สามารถเป็นเครื่องมือทางห้องปฏิบัติการอย่างรวดเร็วและมีประสิทธิภาพสำหรับการระบุเชื้อไวรัส

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

พื้นหลัง : การตรวจสอบอย่างรวดเร็วและการจำแนกชนิดของไวรัสที่สำคัญสำหรับการวินิจฉัยและมีประสิทธิภาพการเฝ้าระวังโรค มือ เท้า ปาก ( เปื่อย ) เราอธิบายนวนิยาย assay โดยใช้ PCR PCR และถอดความ multilocus ย้อนกลับควบคู่กับวิธีพ่นละอองไฟฟ้าไอแมสสเปกโตรเมทรี ( 4 / esi-ms ) เพื่อตรวจหาและระบุมนุษย์และ AD อะดีโนไวรัส A-F , พร้อมกันไวรัสเริมของมนุษย์ที่มี polyomavirus 1-8 Parvovirus และ . วัตถุประสงค์ : เพื่อประเมินความถูกต้องและประสิทธิภาพของเทคนิค / วิธีการ esi-ms เพื่อตรวจหาและชนิดและจากตัวอย่างทางคลินิกการวินิจฉัยคืออะไร ผู้ป่วย รูปแบบการศึกษา : การศึกษานี้ตัวอย่างของการวินิจฉัยทางคลินิก ผู้ป่วยก็เปื่อยได้ทำการศึกษาโดยวิธี RT-PCR / esi-ms โดยใช้วิธีการตรวจหาและการพิมพ์ของเอนเทอโรไวรัสโดยวิธี RT-PCR ) / esi-ms เปรียบเทียบกับผลลัพธ์ที่ได้จากการอ้างอิงของโมเลกุล วิธีการ ผลการทดสอบพบว่าเทอโรไวรัสใน 97 ( 63.8 % ) ตัวอย่างผลในความไวของ 93.8 % ( 95% CI : 91.8-95.7 % ) และความจำเพาะร้อยละ 87.5 ( 95% CI : 84.8-90.2 % ) เมื่อเทียบกับการอ้างอิงทางคลินิกการวินิจฉัยทดสอบ สายพันธุ์ เอนเทอโรไวรัส ( 65 / 84 ; มากที่สุด77% ) กำหนดโดยแพลตฟอร์มสอดคล้องกับการวิเคราะห์ลำดับ 5 ' UTR และ misidentifications ส่วนใหญ่เกิดจากไวรัสห้องสมุดซึ่งสามารถปรับปรุงเพิ่มเติมโดยการปรับปรุงฐานข้อมูลและ . นอกจาก enteroviruses เลิฟเทกส์ไทม์ polyomaviruses Adenoviruses , , , และมนุษย์ไรโนไวรัสตรวจพบและระบุใน 55 ( 36% ) เปื่อยตัวอย่างโดยวิธี RT-PCR ) / esi-ms. สรุป :กับความสามารถของ throughput สูงและการตรวจสอบและพิมพ์หลายคลินิกที่เกี่ยวข้องไวรัสพร้อมกัน 4 / esi-ms ได้อย่างรวดเร็วและมีประสิทธิภาพเครื่องมือห้องปฏิบัติการสำหรับการระบุไวรัสเชื้อโรค