Karisa, B. K., Thomson, J., Wang, Z

Karisa, B. K., Thomson, J., Wang, Z., Bruce, H. L., Plastow, G. S. and Moore, S. S. 2013. Candidate genes and biological pathways associated with carcass quality traits in beef cattle. Can. J. Anim. Sci. 93: 295–306. The objective of this study was to use the candidate gene approach to identify the genes associated with carcass quality traits in beef cattle steers at the University of Alberta Ranch at Kinsella, Canada. This approach involved identifying positional candidate genes and prioritizing them according to their functions into functional candidate genes before performing statistical association analysis. The positional candidate genes and single nucleotide polymorphisms (SNP) were identified from previously reported quantitative trait loci for component traits including body weight, average daily gain, metabolic weight, feed efficiency and energy balance. Positional candidate genes were then prioritized into functional candidate genes according to the associated gene ontology terms and their functions. A total of 116 genes were considered functional candidate genes and 117 functional SNPs were genotyped and used for multiple marker association analysis using ASReml®. Seven SNPs were significantly associated with various carcass quality traits (P≤0.005). The significant genes were associated with biological processes such as fat, glucose, protein and steroid metabolism, growth, energy utilization and DNA transcription and translation as inferred from the protein knowledgebase (UniprotKB). Gene network analysis indicated significant involvement of biological processes related to fat and steroid metabolism and regulation of transcription and translation of DNA.

Keywords: Beef cattle, carcass traits, gene networks

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

คาริซา คุณเกิด ทอม J. วัง z., บรูซ H. L., Plastow, G. S. และ มัวร์ S. S. 2013 ผู้สมัครยีนและมนต์ชีวภาพที่เกี่ยวข้องกับลักษณะคุณภาพซากในเนื้อวัว สามารถได้ J. Anim. Sci. 93:295-306 วัตถุประสงค์ของการศึกษานี้ได้ใช้วิธียีนผู้สมัครระบุยีนที่เกี่ยวข้องกับลักษณะคุณภาพซากเนื้อวัวสำเร็จที่ไร่มหาวิทยาลัยเบอร์ที่ Kinsella แคนาดา วิธีการนี้เกี่ยวข้องกับการระบุผู้สมัครตำแหน่งยีน และจัดระดับความสำคัญตามหน้าที่เป็นยีนผู้สมัครงานก่อนทำการวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางสถิติ ผู้สมัครตำแหน่งยีนและนิวคลีโอไทด์เดี่ยว polymorphisms (SNP) ได้ระบุจาก loci ติดก่อนหน้านี้รายงานเชิงปริมาณในลักษณะส่วนรวมน้ำหนัก น้ำหนัก เผาผลาญอาหารอย่างมีประสิทธิภาพและพลังงานสมดุล กำไรเฉลี่ยต่อวัน ผู้สมัครตำแหน่งยีนได้จัดลำดับความสำคัญแล้วในยีนผู้สมัครทำงานตามเงื่อนไขภววิทยายีนที่เกี่ยวข้องและหน้าที่ จำนวน 116 ยีนได้ถือยีนผู้สมัครงานและทำงาน SNPs 117 ถูกใช้สำหรับการวิเคราะห์เชื่อมโยงเครื่องหมายหลายใช้ ASReml ® และ genotyped SNPs เจ็ดได้อย่างมีนัยสำคัญเกี่ยวกับลักษณะคุณภาพซากต่าง ๆ (P≤0.005) ยีนสำคัญเกี่ยวข้องกับกระบวนการทางชีวภาพเช่นไขมัน กลูโคส เผาผลาญโปรตีนและสเตอรอยด์ เติบโต การใช้ประโยชน์พลังงาน DNA transcription และแปลเป็นสรุปจากฐานโปรตีน (UniprotKB) การวิเคราะห์เครือข่ายยีนระบุมีส่วนร่วมที่สำคัญของกระบวนการทางชีวภาพที่เกี่ยวข้องกับไขมัน และเผาผลาญเตียรอยด์ และระเบียบของราชบัณฑิตยสถานและแปลของดีเอ็นเอคำสำคัญ: เนื้อวัว ลักษณะซาก เครือข่ายยีน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

Karisa, BK, ทอมสัน, เจ, วัง, Z. , บรูซ, HL, Plastow, GS และมัวร์เอสเอสปี 2013 ยีนและวิถีทางชีววิทยาที่เกี่ยวข้องกับลักษณะคุณภาพซากในการเลี้ยงโคเนื้อ สามารถ เจ Anim วิทย์ 93: 295-306 วัตถุประสงค์ของการศึกษาครั้งนี้คือการใช้วิธีการที่ยีนของผู้สมัครที่จะระบุยีนที่เกี่ยวข้องกับลักษณะคุณภาพซากในการเลี้ยงโคเนื้อนำพาที่มหาวิทยาลัยอัลเบอร์ต้าไร่ที่คินเซลลา, แคนาดา วิธีการนี้เกี่ยวข้องกับการระบุยีนตำแหน่งและจัดลำดับความสำคัญพวกเขาตามฟังก์ชั่นของพวกเขาในยีนการทำงานก่อนที่จะดำเนินการวิเคราะห์การเชื่อมโยงทางสถิติ ยีนตำแหน่งและหลากหลายเดี่ยวเบื่อหน่าย (SNP) ถูกระบุจากรายงานก่อนหน้านี้ loci ลักษณะเชิงปริมาณลักษณะองค์ประกอบรวมทั้งน้ำหนักตัวที่ได้รับในชีวิตประจำวันโดยเฉลี่ยน้ำหนักเผาผลาญประสิทธิภาพการใช้อาหารและความสมดุลของพลังงาน ยีนตำแหน่งถูกจัดลำดับความสำคัญแล้วเป็นยีนทำงานตามข้อกำหนดอภิปรัชญายีนที่เกี่ยวข้องและการทำงานของพวกเขา ทั้งหมดจาก 116 ยีนที่ได้รับการพิจารณายีนทำงานและ 117 SNPs ทำงานถูก genotyped และใช้สำหรับเครื่องหมายการวิเคราะห์การเชื่อมโยงโดยใช้ASReml® เซเว่น SNPs มีความสัมพันธ์อย่างมีนัยสำคัญที่มีลักษณะคุณภาพซากต่างๆ (P≤0.005) ยีนที่สำคัญที่เกี่ยวข้องกับกระบวนการทางชีวภาพเช่นไขมันกลูโคสโปรตีนและการเผาผลาญเตียรอยด์, การเจริญเติบโตของการใช้พลังงานและการถอดรหัสดีเอ็นเอและการแปลเป็นสรุปจากโปรตีนฐานความรู้ (UniprotKB) การวิเคราะห์เครือข่ายการมีส่วนร่วมที่ระบุยีนที่สำคัญของกระบวนการทางชีววิทยาที่เกี่ยวข้องกับการเผาผลาญไขมันและเตียรอยด์และกฎระเบียบของการถอดความและการแปลของดีเอ็นเอ. คำสำคัญ: โคเนื้อลักษณะซากเครือข่ายยีน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

คาริ บา บี เค ทอมสัน , เจ , วัง , Z , บรูซ , H . L . plastow จี เอส และ มัวร์ , S . s . 2013 ยีนที่เกี่ยวข้องกับกระบวนการทางชีวภาพของผู้สมัครและลักษณะคุณภาพซากของโคเนื้อ สามารถ เจ ทำให้มีชีวิตชีวา สภาวะโลกร้อน 93 : 295 – 306 .วัตถุประสงค์ของการศึกษานี้คือ การใช้ยีนผู้สมัครวิธีการระบุยีนที่เกี่ยวข้องกับคุณภาพซากของโคเนื้อเพศผู้ลักษณะที่มหาวิทยาลัยอัลเบอร์ตา ฟาร์ม ใน คินเซลลา , แคนาดาวิธีการนี้เกี่ยวข้องกับการระบุตำแหน่งของยีนและจัดลำดับความสำคัญตามบทบาทหน้าที่ในการทำงานก่อนแสดงยีนผู้สมัครการวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางสถิติ ยีนตำแหน่งผู้สมัครลและซิงเกิลนิวคลีโอไทด์ ( SNP ) ถูกระบุจากรายงานก่อนหน้านี้เกี่ยวกับคุณลักษณะของลักษณะองค์ประกอบ ได้แก่ น้ำหนักตัวเพิ่มปริมาณน้ำหนักสลาย ประสิทธิภาพการใช้อาหาร และพลังงานที่สมดุล ผู้สมัครตำแหน่งยีนแล้วจัดลำดับความสำคัญในการทำงานตามผู้สมัครที่ยีนยีนอภิปรัชญาเงื่อนไขและการทำงานของพวกเขา ทั้งหมด 116 ยีน ถือว่าเป็นหน้าที่และการทำงาน snps ผู้สมัครยีน 117 ) และการวิเคราะห์ความสัมพันธ์ genotyped ใช้เครื่องหมายต่างๆโดยใช้ asreml ® .เจ็ด snps มีความสัมพันธ์กับลักษณะคุณภาพซากต่าง ๆ ( P ≤ 0.005 ) ยีนที่เกี่ยวข้องกับกระบวนการทางชีวภาพอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ เช่น โปรตีน ไขมัน กลูโคส การเจริญเติบโตและการเผาผลาญสเตอรอยด์ การถอดความและแปลเป็นค่าที่ได้จากการใช้พลังงานและโปรตีนดีเอ็นเอฐานความรู้ ( uniprotkb )การวิเคราะห์เครือข่ายยีนพบอย่างมีส่วนร่วมของกระบวนการทางชีวภาพที่เกี่ยวข้องกับการเผาผลาญไขมันและสเตียรอยด์ และระเบียบของการถอดความและแปลของ ดีเอ็นเอ

คำสำคัญ : โคเนื้อ ลักษณะซาก เครือข่ายจีน