Endophytes are microbes and fungi t

Endophytes are microbes and fungi that live inside plant tissues without damaging the host. Herein we examine the dynamic changes in the endophytic bacterial community in potato (Solanum tuberosum) tuber in response to pathogenic infection by Pectobacterium atrosepticum, which causes soft rot in numerous economically important crops. We quantified community changes using both cultivation and next-generation sequencing of the 16S rRNA gene and found that, despite observing significant variability in both the mass of macerated tissue and structure of the endophytic community between individual potato tubers, P. atrosepticum is always taken over by the endophytes during maceration. 16S rDNA sequencing revealed bacteria from the phyla Proteobacteria, Actinobacteria, Firmicutes, Bacteroidetes, Fusobacteria, Verrucomicrobia, Acidobacteria, TM7, and Deinococcus-Thermus. Prior to infection, Propionibacterium acnes is frequently among the dominant taxa, yet is out competed by relatively few dominant taxa as the infection proceeds. Two days post-infection, the most abundant sequences in macerated potato tissue are Gammaproteobacteria. The most dominant genera are Enterobacter and Pseudomonas. Eight days post-infection, the number of anaerobic pectolytic Clostridia increases, probably due to oxygen depletion. These results demonstrate that the pathogenesis is strictly initiated by the pathogen (sensu stricto) and proceeds with a major contribution from the endophytic community.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Endophytes มีจุลินทรีย์และเชื้อราที่อาศัยอยู่ภายในเนื้อเยื่อพืชโดยไม่ทำลาย host ซึ่งเราตรวจการเปลี่ยนแปลงแบบไดนามิกในชุมชนแบคทีเรีย endophytic ในหัว (Solanum tuberosum) มันตอบสนองต่อการติดเชื้อ pathogenic โดย Pectobacterium atrosepticum ซึ่งทำให้ soft rot ในพืชสำคัญทางเศรษฐกิจมากมาย เรา quantified เปลี่ยนแปลงชุมชนที่ใช้เพาะปลูกและจัดลำดับรุ่นต่อไปของการ 16S rRNA ยีน และพบว่า แม้ว่าจะ มีการสังเกตอย่างมีนัยสำคัญสำหรับความผันผวนทั้งมวลของเนื้อเยื่อ macerated และโครงสร้างของชุมชน endophytic ระหว่างมันฝรั่งแต่ละ tubers, P. atrosepticum จะเสมอมา โดย endophytes ใน maceration 16S rDNA ลำดับเปิดเผยแบคทีเรียจาก phyla Proteobacteria, Actinobacteria, Firmicutes, Bacteroidetes, Fusobacteria, Verrucomicrobia, Acidobacteria, TM7 และ Deinococcus Thermus ก่อนที่จะติดเชื้อ สิว Propionibacterium เป็นบ่อย taxa หลัก ได้เป็นออกร่วมแข่งขัน โดยหลัก taxa ค่อนข้างน้อยเป็นเชื้อเงิน สองวันหลังติดเชื้อ ลำดับที่อุดมสมบูรณ์ที่สุดในเนื้อเยื่อมันฝรั่ง macerated มี Gammaproteobacteria สกุลหลักส่วนใหญ่เป็น Enterobacter และ Pseudomonas ติดเชื้อหลังแปดวัน จำนวนไม่ใช้ pectolytic Clostridia เพิ่มขึ้น อาจเนื่องจากการลดลงของออกซิเจน ผลเหล่านี้แสดงให้เห็นว่า พยาธิกำเนิดเริ่มต้น โดยศึกษา (sensu stricto) อย่างเคร่งครัด และดำเนินการส่วนใหญ่จากชุมชน endophytic

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

Endophytes มีจุลินทรีย์และเชื้อราที่อาศัยอยู่ภายในเนื้อเยื่อพืชโดยไม่ทำลายโฮสต์ ในที่นี้เราตรวจสอบการเปลี่ยนแปลงแบบไดนามิกในชุมชนแบคทีเรียเอนโดไฟท์ในมันฝรั่ง (Solanum tuberosum) หัวในการตอบสนองต่อการติดเชื้อที่ทำให้เกิดโรคโดย Pectobacterium atrosepticum ซึ่งเป็นสาเหตุของโรคเน่าเละในหลายพืชเศรษฐกิจที่สำคัญ เราวัดการเปลี่ยนแปลงของชุมชนโดยใช้ทั้งการเพาะปลูกและการจัดลำดับรุ่นต่อไปของยีน 16S rRNA และพบว่าแม้จะมีการสังเกตความแปรปรวนอย่างมีนัยสำคัญทั้งในมวลของเนื้อเยื่อ macerated และโครงสร้างของชุมชนเอนโดไฟท์ระหว่างหัวมันฝรั่งแต่ละ atrosepticum พีจะได้รับการเสมอมากกว่า โดยในช่วง endophytes ยุ่ย 16S rDNA ลำดับเปิดเผยจากแบคทีเรีย phyla Proteobacteria, actinobacteria, Firmicutes, Bacteroidetes, Fusobacteria, Verrucomicrobia, Acidobacteria, TM7 และ Deinococcus-Thermus ก่อนที่จะมีการติดเชื้อสิว Propionibacterium เป็นบ่อยในหมู่แท็กซ่าที่โดดเด่นยังมีการแข่งขันโดยแท็กซ่าโดดเด่นค่อนข้างน้อยเป็นเงินที่ติดเชื้อ สองวันหลังการติดเชื้อลำดับมากที่สุดในเนื้อเยื่อมันฝรั่ง macerated มี Gammaproteobacteria จำพวกที่โดดเด่นมากที่สุดคือ Enterobacter และ Pseudomonas แปดวันหลังการติดเชื้อจำนวนเพิ่มขึ้นแบบไม่ใช้ออกซิเจน pectolytic Clostridia อาจจะเป็นเพราะการสูญเสียออกซิเจน ผลการศึกษานี้แสดงให้เห็นว่าการเกิดโรคจะเริ่มต้นอย่างเคร่งครัดโดยเชื้อโรค (sensu stricto) และวิธีการที่มีผลงานที่สำคัญจากชุมชนเอนโดไฟท์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ทะเลแอคติโนมัยสีท เป็นที่รู้จักกันเป็นแหล่งที่อุดมไปด้วยสารใหม่ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพที่หลากหลาย ในการศึกษานี้พบว่า ศักยภาพ l-asparaginase เป็นลักษณะจาก Streptomyces griseus niot-vkma29 . การเพิ่มประสิทธิภาพตามกล่อง เบน เค่นศึกษาวัฒนธรรมสื่อประกอบเพื่อเพิ่ม l-asparaginase การผลิต pH , แป้งทะเลแอคติโนมัยสีท เป็นที่รู้จักกันเป็นแหล่งที่อุดมไปด้วยสารใหม่ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพที่หลากหลาย ในการศึกษานี้พบว่า ศักยภาพ l-asparaginase เป็นลักษณะจาก Streptomyces griseus niot-vkma29 . การเพิ่มประสิทธิภาพตามกล่อง เบน เค่นศึกษาวัฒนธรรมสื่อประกอบเพื่อเพิ่ม l-asparaginase การผลิต pH , แป้งทะเลแอคติโนมัยสีท เป็นที่รู้จักกันเป็นแหล่งที่อุดมไปด้วยสารใหม่ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพที่หลากหลาย ในการศึกษานี้พบว่า ศักยภาพ l-asparaginase เป็นลักษณะจาก Streptomyces griseus niot-vkma29 . การเพิ่มประสิทธิภาพตามกล่อง เบน เค่นศึกษาวัฒนธรรมสื่อประกอบเพื่อเพิ่ม l-asparaginase การผลิต pH , แป้งทะเลแอคติโนมัยสีท เป็นที่รู้จักกันเป็นแหล่งที่อุดมไปด้วยสารใหม่ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพที่หลากหลาย ในการศึกษานี้พบว่า ศักยภาพ l-asparaginase เป็นลักษณะจาก Streptomyces griseus niot-vkma29 . การเพิ่มประสิทธิภาพตามกล่อง เบน เค่นศึกษาวัฒนธรรมสื่อประกอบเพื่อเพิ่ม l-asparaginase การผลิต pH , แป้งทะเลแอคติโนมัยสีท เป็นที่รู้จักกันเป็นแหล่งที่อุดมไปด้วยสารใหม่ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพที่หลากหลาย ในการศึกษานี้พบว่า ศักยภาพ l-asparaginase เป็นลักษณะจาก Streptomyces griseus niot-vkma29 . การเพิ่มประสิทธิภาพตามกล่อง เบน เค่นศึกษาวัฒนธรรมสื่อประกอบเพื่อเพิ่ม l-asparaginase การผลิต pH , แป้ง