Gene annotation and functional clas

Gene annotation and functional classification
The homology-based approach was adopted in functional annotation. All unigenes were
searched against the NCBI NR and NT databases through BLASTX searches in which an E
value cutoff of 10−5 was set. A total of 32,697 (74.20%) unigenes showed significant similarity
to known proteins in the NR database. Likewise, a total of 25,366 (57.57%) exhibited significant
similarity to known nucleotide sequences in the NT database. Sequences were also searched
against the Swiss-Prot database to detect additional reference annotations, resulting in 23,080
(52.38%) annotated unigenes (Table 1). In the analysis of the matching sequences based on NR
annotation, E value distribution showed that 55.80% of the annotated sequences displayed
strong homology (E value less than 1E − 45; Fig 1A). In species distribution analysis, Vitis vinifera
was ranked first with 12,948 (39.68%) top BLAST hits, followed by Ricinus communis, Prunus
persica, Populus trichocarpa, and Glycine max with 2,813 (8.62%), 2,809 (8.60%), 2,332
(7.15%), and 1,632 (5%) top BLAST hits, respectively (Fig 1B).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

คำอธิบายของยีนและประเภทงานวิธีใช้ homology ถูกนำมาใช้ในการอธิบายการทำงาน มี unigenes ทั้งหมดค้นหาจากฐานข้อมูล NCBI NR และ NT ผ่านค้นหา BLASTX ที่มี Eค่าตัดของ 10−5 ถูกตั้งค่า จำนวน (ร้อยละ 74.20) 32,697 unigenes แสดงให้เห็นความคล้ายคลึงกันอย่างมีนัยสำคัญกับโปรตีนที่รู้จักกันในฐานข้อมูลของ NR ในทำนองเดียวกัน ทั้งหมด 25,366 (57.57%) จัดแสดงอย่างมีนัยสำคัญคล้ายกับลำดับของนิวคลีโอไทด์ที่รู้จักกันในฐานข้อมูล NT ลำดับยังค้นหากับฐานข้อมูล Prot สวิสเพื่อตรวจสอบคำอธิบายข้อมูลอ้างอิงเพิ่มเติม การเกิด 23,080(52.38%) ใส่คำอธิบายประกอบ (ตารางที่ 1) unigenes ในการวิเคราะห์ลำดับตรงกันตาม NRคำอธิบาย การกระจายค่า E พบ 55.80% ลำดับประกอบแสดงแข็งแกร่ง homology (E ค่าน้อยกว่า− 1E 45 ฟิก 1A) ในการวิเคราะห์การกระจายพันธุ์ Vitis viniferaเป็นอันดับแรก ด้วย 12,948 (39.68%) ด้านระเบิดฮิต ตาม Ricinus communis นางpersica, Populus trichocarpa และ Glycine max 2,813 (8.62%), 2,809 (8.60%) 2,332(7.15%), และ 1,632 (5%) อันดับที่ฮิตระเบิด ตามลำดับ (ฟิก 1B)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

บันทึกย่อของยีนและการจำแนกการทำงานวิธีการที่คล้ายคลึงกันตามที่ถูกนำมาใช้ในการทำงานบันทึกย่อ unigenes
ทั้งหมดถูกค้นหากับNCBI NR และฐานข้อมูล NT ผ่านการค้นหา BLASTX ซึ่งใน E
ตัดค่าของ 10-5 ถูกกำหนด รวม 32,697 (74.20%) แสดงให้เห็น unigenes
คล้ายคลึงกันอย่างมีนัยสำคัญกับโปรตีนที่รู้จักกันในฐานข้อมูลNR ในทำนองเดียวกันทั้งหมด 25,366 (57.57%)
อย่างมีนัยสำคัญแสดงความคล้ายคลึงกันในการลำดับเบสที่รู้จักกันในฐานข้อมูลNT ลำดับถูกค้นยังกับฐานข้อมูลสวิส Prot ในการตรวจสอบการอ้างอิงคำอธิบายประกอบเพิ่มเติมส่งผลให้ 23080 (52.38%) unigenes ข้อเขียน (ตารางที่ 1) ในการวิเคราะห์ของลำดับการจับคู่อยู่บนพื้นฐานของยางธรรมชาติบันทึกย่อกระจายค่า E พบว่า 55.80% ของลำดับข้อเขียนที่ปรากฏคล้ายคลึงกันที่แข็งแกร่ง(ค่า E น้อยกว่า 1E - 45 รูปที่ 1A) ในรูปแบบการวิเคราะห์การกระจาย Vitis vinifera เป็นอันดับแรกที่มี 12,948 (39.68%) ระเบิดบนฮิตตาม Ricinus communis, Prunus persica, Populus trichocarpa และถั่วเหลืองกับ 2813 (8.62%) 2,809 (8.60%) 2,332 (7.15 %) และ 1632 (5%) ระเบิดบนฮิตตามลำดับ (รูปที่ 1B)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

What is the Badoo I don't understand.What is the Badoo I don't understand.What is the Badoo I don't understand.What is the Badoo I don't understand.