The oxidative breakdown of caroteno

The oxidative breakdown of carotenoid evidences the formation of apocarotenoids through carotenoid cleavage dioxygenases (CCDs). Numerous CCDs and apocarotenoids have been identified and characterized in plants. Using available sequence data, a study was performed to investigate the phylogenetic relationship among CCD genes and to statistically estimate the sequence conservation and functional divergence. In total, 77 genes were identified from 39 species belonging to 21 families. Our result of phylogenetic analysis indicated the existence of well-conserved subfamilies. Moreover, comparative genomic analysis showed that the gene structures of the CCDs were highly conserved across some different lineage species. Through functional divergence analysis, a substantial divergence was found between CCD subfamilies. In addition, examination of the site-specific profile revealed the critical amino acid residues accounting for functional divergence. This study mainly focused on the evolution of CCD genes and their functional divergence which may deliver an initial step for further experimental verifications.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

แบ่ง oxidative ของ carotenoid evidences การก่อตัวของ apocarotenoids ผ่าน dioxygenases ปริ carotenoid (ใช้) ใช้จำนวนมากและ apocarotenoids มีการระบุ และลักษณะในพืช โดยใช้ข้อมูลลำดับว่าง การศึกษาที่ดำเนิน การตรวจสอบความสัมพันธ์ระหว่างยีน CCD phylogenetic และ การประเมินทางสถิติลำดับอนุรักษ์และทำ divergence รวม ยีน 77 ได้ระบุจาก 39 สปีชีส์ของครอบครัว 21 ผลของการวิเคราะห์ phylogenetic ระบุการมีอยู่ของ subfamilies ดีนำ นอกจากนี้ genomic วิเคราะห์เปรียบเทียบพบว่า โครงสร้างของการใช้ยีนที่มีอยู่สูงข้ามบางชนิดคนเชื้อสายต่าง ๆ ผ่านการวิเคราะห์ทำ divergence, divergence พบพบระหว่าง CCD subfamilies นอกจากนี้ การตรวจสอบโพรไฟล์เฉพาะเปิดเผยตกกรดอะมิโนสำคัญบัญชีสำหรับทำ divergence การศึกษานี้ส่วนใหญ่เน้นในวิวัฒนาการของยีน CCD และ divergence ของพวกเขาทำงานซึ่งอาจส่งเป็นขั้นตอนแรกสำหรับต่อทดลอง verifications

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สลายออกซิเดชันหลักฐาน carotenoid การก่อตัวของ apocar​​otenoids ผ่าน dioxygenases แตกแยก carotenoid (CCDs) หลาย CCDs และ apocar​​otenoids ได้รับการระบุและโดดเด่นในพืช โดยใช้ข้อมูลที่มีอยู่ลำดับการศึกษาได้ดำเนินการในการตรวจสอบความสัมพันธ์ของสายวิวัฒนาการในหมู่ยีน CCD และการประเมินสถิติการอนุรักษ์ลำดับและแตกต่างทำงาน ทั้งหมด 77 ยีนที่ถูกระบุจาก 39 สายพันธุ์ที่อยู่ในประเภท 21 ครอบครัว ผลของการวิเคราะห์ของเราชี้ให้เห็นวิวัฒนาการการดำรงอยู่ของครอบครัวดีอนุรักษ์ นอกจากนี้การวิเคราะห์จีโนมเปรียบเทียบพบว่าโครงสร้างของยีน CCDs ถูกอนุรักษ์สูงข้ามบางสายพันธุ์ที่แตกต่างกันเชื้อสาย ผ่านการวิเคราะห์ความแตกต่างการทำงานแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญคือการพบกันระหว่างครอบครัวที่ CCD นอกจากนี้ยังมีการตรวจสอบรายละเอียดของเว็บไซต์ที่เฉพาะเจาะจงเปิดเผยกรดอะมิโนที่สำคัญการบัญชีสำหรับความแตกต่างการทำงาน การศึกษาครั้งนี้ส่วนใหญ่มุ่งเน้นไปที่การวิวัฒนาการของยีนที่ CCD และความแตกต่างของพวกเขาทำงานซึ่งอาจส่งขั้นตอนแรกสำหรับการตรวจสอบการทดลองต่อไป

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การออกซิเดชันของแคโรทีนอยด์ หลักฐานการ apocarotenoids ผ่านในการ dioxygenases ( ccds ) ccds มากมายและ apocarotenoids ได้รับการระบุและลักษณะในพืช การใช้ลำดับข้อมูลที่พร้อมใช้งานการศึกษาได้ดำเนินการเพื่อศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างยีนชนิด CCD และสถิติประมาณลำดับอนุรักษ์ และความแตกต่างในการทํางาน ทั้งหมด 77 ยีนถูกระบุจาก 39 ชนิดของ 21 ครอบครัว ผลของการวิเคราะห์ phylogenetic พบการดำรงอยู่ของอนุรักษ์วงศ์ย่อย . นอกจากนี้การวิเคราะห์เปรียบเทียบจีโนมพบว่า ยีนโครงสร้างของ ccds มีการอนุรักษ์ข้ามบางชนิดพื้นเพที่แตกต่างกัน ผ่านการวิเคราะห์ความแตกต่างใช้ความแตกต่างมากที่พบระหว่างวงศ์ย่อย 2 . นอกจากนี้ จากการตรวจสอบประวัติพบว่ามีกรดอะมิโนตกค้างเฉพาะบัญชีสำหรับความแตกต่างในการทํางานการศึกษานี้เน้นหลักในวิวัฒนาการของยีนและการทำงานของ CCD divergence ซึ่งอาจส่งเป็นขั้นตอนแรกสำหรับ verifications ทดลองต่อไป