Synechocystis sp. PCC 6803 is the m

Synechocystis sp. PCC 6803 is the most popular cyanobacterial strain, serving as a standard in the research fields of photosynthesis, stress response, metabolism and so on. A glucose-tolerant (GT) derivative of this strain was used for genome sequencing at Kazusa DNA Research Institute in 1996, which established a hallmark in the study of cyanobacteria.
However, apparent differences in sequences deviating from the database have been noticed among different strain stocks. For this reason, we analysed the genomic sequence of another GT strain (GT-S) by 454 and partial Sanger sequencing.We found 22 putative single nucleotide polymorphisms (SNPs) in comparison to the published sequence of the Kazusa strain.However, Sanger sequencing of 36 direct PCR products of the Kazusa strains stored in small aliquots resulted in their identity with the GT-S sequence at 21 of the 22 sites, excluding the possibility of their being SNPs.
In addition, we were able to combine five split open reading frames present in the database sequence, and to remove the C-terminus of an ORF.Aside from these, two of the Insertion Sequence elements were not present in the GT-S strain.
We have thus become able to provide an accurate genomic sequence of Synechocystis sp. PCC 6803 for future studies on this important cyanobacterial strain.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เอสพี Synechocystis PCC 6803 เป็นนิยมมากที่สุด cyanobacterial สายพันธุ์ที่ ให้การบริการที่เป็นมาตรฐานในด้านวิจัยการสังเคราะห์แสง การตอบสนองความเครียด เผาผลาญอาหาร และอื่น ๆ อนุพันธ์ (GT) ทนต่อกลูโคสจากสายพันธุ์นี้ถูกใช้สำหรับลำดับพันธุ Kazusa DNA การวิจัยสถาบันในปี 1996 ซึ่งสร้างจุดเด่นในการศึกษาของ cyanobacteria อย่างไรก็ตาม ความแตกต่างชัดเจนในลำดับที่ไม่ปกติ ฐานข้อมูลการสังเกตระหว่างหุ้นสายพันธุ์แตกต่างกันด้วย ด้วยเหตุนี้ เราวิเคราะห์ลำดับการของสายพันธุ์อื่น GT (GT-S) โดย Sanger 454 และบางส่วนจัดลำดับ เราสามารถพบ 22 อ้างว่าฝาหลากหลายเดี่ยวเบื่อหน่าย (SNPs) เปรียบเทียบกับลำดับที่เผยแพร่ของสายพันธุ์ Kazusa อย่างไรก็ตาม ไม่รวมความเป็นไปได้ของการจัดลำดับผลิตภัณฑ์ PCR โดยตรง 36 สายพันธุ์ Kazusa เก็บใน aliquots เล็กส่งผลให้ตนด้วย GT-S ลำดับที่ 21 ของเว็บไซต์ 22, Sanger SNPs นอกจากนี้ เราไม่สามารถรวมห้าแยกเปิดอ่านเฟรมในลำดับฐานข้อมูล และลบสถานี C มี ORF นอกจากนี้ สององค์ประกอบแทรกลำดับไม่ได้อยู่ในสายพันธุ์ GT-S นอกจากนี้เราจึงมีสามารถที่จะให้มีลำดับจีโนมของแม่นยำของเอสพี Synechocystis PCC 6803 สำหรับการศึกษาในอนาคตในสายพันธุ์ cyanobacterial นี้สำคัญ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ไซยาโนแบคทีเรีย SP PCC 6803 เป็นสายพันธุ์ไซยาโนแบคทีเรียที่นิยมมากที่สุดที่ทำหน้าที่เป็นมาตรฐานในด้านการวิจัยการสังเคราะห์ตอบสนองต่อความเครียด, การเผาผลาญอาหารและอื่น ๆ กลูโคสใจกว้าง (GT) ที่มาของสายพันธุ์นี้ถูกใช้สำหรับการลำดับจีโนมที่ Kazusa ดีเอ็นเอสถาบันวิจัยในปี 1996 ซึ่งเป็นที่ยอมรับจุดเด่นในการศึกษาของไซยาโนแบคทีเรียได้.
อย่างไรก็ตามความแตกต่างที่เห็นได้ชัดในลำดับที่เบี่ยงเบนไปจากฐานข้อมูลได้รับการสังเกตในหมู่สายพันธุ์ที่แตกต่างกัน หุ้น ด้วยเหตุนี้เราวิเคราะห์ลำดับจีโนมของ GT อีกสายพันธุ์หนึ่ง (GT-S) โดย 454 และบางส่วนแซงเจอร์ sequencing.We พบ 22 สมมุติหลากหลายเดี่ยวเบื่อหน่าย (SNPs) ในการเปรียบเทียบกับลำดับการตีพิมพ์ของ Kazusa strain.However แซงเจอร์ลำดับ 36 ผลิตภัณฑ์ PCR โดยตรงของ Kazusa ไปด้วยจากที่เก็บไว้ใน aliquots ขนาดเล็กส่งผลให้ในตัวตนของพวกเขากับ GT-S ลำดับที่ 21 ใน 22 เว็บไซต์ที่ไม่รวมเป็นไปได้ของ SNPs เป็นของพวกเขา.
นอกจากนี้เราก็สามารถที่จะรวมการอ่านห้าแยกเปิด เฟรมอยู่ในลำดับฐานข้อมูลและการเอา C-ปลายทางของ ORF.Aside จากทั้งสององค์ประกอบแทรกลำดับที่ไม่ได้อยู่ในสายพันธุ์ GT-S.
เราได้จึงกลายสามารถที่จะให้ลำดับจีโนมที่ถูกต้องของ ไซยาโนแบคทีเรีย SP PCC 6803 สำหรับการศึกษาในอนาคตเกี่ยวกับสายพันธุ์ไซยาโนแบคทีเรียที่สำคัญนี้

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

synechocystis sp . หรือ ระบบยู 6803 เป็นสายพันธุ์ที่ได้รับความนิยมมากที่สุด การให้บริการเป็นมาตรฐานในเขตข้อมูลการวิจัยของการสังเคราะห์แสง การตอบสนองต่อความเครียด เมแทบอลิซึม และ กลูโคสใจกว้าง ( GT ) อนุพันธ์ของสายพันธุ์นี้ถูกใช้ในการจัดลำดับที่คาซูสะดีเอ็นเอวิจัยสถาบันในปี 1996 ซึ่งสร้างจุดเด่นในการศึกษาไซยาโนแบคทีเรีย .อย่างไรก็ตาม ความชัดเจนในลำดับที่เบี่ยงเบนไปจากฐานข้อมูลที่ได้รับการสังเกตในหุ้นสายพันธุ์ที่แตกต่างกัน สำหรับเหตุผลนี้ เราได้วิเคราะห์ลำดับจีโนมของสายพันธุ์อื่น GT ( gt-s ) และบางส่วนลำดับแซงเจอร์ เราพบเส้นใยเดี่ยวเบื่อหน่ายความหลากหลาย ( 22 snps ) ในการเปรียบเทียบเพื่อเผยแพร่ลำดับของคาซุ สายพันธุ์ อย่างไรก็ตาม แซงเจอร์ลำดับ 36 PCR โดยตรงผลิตภัณฑ์ของคาซุ สายพันธุ์เล็ก ส่งผลให้ตัวตนเฉยๆ เก็บไว้ใน กับลำดับ gt-s ที่ 21 จาก 22 สถานที่ ไม่รวมเป็นไปได้ของการ snps .นอกจากนี้ เราสามารถที่จะรวมห้าแยกเปิดอ่านเฟรมปัจจุบันในฐานข้อมูลลำดับและลบ c-terminus ของ ORF . นอกเหนือจากนี้ , สองของการแทรกลำดับองค์ประกอบที่ไม่ได้อยู่ใน gt-s สายพันธุ์เราจึงจะสามารถให้ความถูกต้องของจีโนมลำดับ synechocystis sp . หรือเพื่อการศึกษาในอนาคต 6803 ความเครียดในระบบยู นี้สำคัญ