that could not be adequately classified, nearly 332,000 sequences
remained with an average of3,200 sequences obtained for each
of the 102 palm surfaces swabbed (Table 1). For comparison, the
total number of sequences included in this study exceeds the
total number of sequences obtained from the largest previously
published molecular surveys of skin bacterial communities (6, 7)
by nearly 2 orders of magnitude. This dataset also provided the
most comprehensive survey of bacterial diversity in any humanassociated
habitat to date.
The average palm surface harbors 150 distinct species-level
bacterial phylotypes [a species is defined here as organisms
sharing 97% identity in their 16S rRNA gene sequences (13)]
(Table 1). Not surprisingly, this number of unique phylotypes
exceeds the number of bacterial types typically cultivated from
the skin surface by at least an order of magnitude (8), confirming
that culture-based surveys of the skin surface, like surveys
conducted in many other microbial habitats (14), dramatically
underestimate the full extent of bacterial diversity. The average
phylotype richness observed on a single palm surface was also3
times higher than the richness observed in a molecular survey of
forearm skin (6) and elbow skin (7). Although we would expect
the hand surface to have higher levels of diversity than other skin
surfaces because of the more frequent contact with potential
inocula from the environment, this discrepancy in observed
bacterial diversity is more likely a result of the depth of our
sampling, which allowed us to survey even those rare bacterial
taxa present on the skin surface. However, despite the depth of
our surveys, our diversity estimates still represent only the lower
bounds of phylotype richness on individual hands; the rarefaction
curves for individual palm surfaces do not asymptote
[supporting information (SI) Fig. S1], indicating that the true
diversity is likely even higher. The total diversity of bacteria on
the hand surface appears to match or exceed the levels of
bacterial diversity found in other human-associated microbial
habitats, including the esophagus, the mouth, and at specific sites
ที่ไม่อาจจะค่อนข้างจัด เกือบ 332000 ลำดับ
ยังคงอยู่กับค่าเฉลี่ยของลำดับ 3200 ได้สำหรับแต่ละ
ของ 102 ปาล์มพื้นผิวทำความสะอาด ( ตารางที่ 1 ) สำหรับการเปรียบเทียบ ,
จำนวนลำดับรวมอยู่ในการศึกษานี้ เกินกว่าจำนวนของลำดับได้
จากใหญ่ก่อนหน้านี้เผยแพร่การสำรวจของโมเลกุลผิวแบคทีเรีย ( 6 , 7 )
)เกือบ 2 ใบขนาด ข้อมูลนี้ยังให้การสำรวจครอบคลุมมาก
humanassociated ของความหลากหลายของแบคทีเรียในสิ่งแวดล้อมวันที่ .
ผิวปาล์มเฉลี่ยท่าเรือ 150 สายพันธุ์ที่แตกต่างกันระดับ
แบคทีเรีย phylotypes [ ชนิดถูกกำหนดมาเป็นสิ่งมีชีวิต
แบ่งปัน 97% ของยีน 16S rRNA ลำดับเอกลักษณ์ ( 13 ) ]
( ตารางที่ 1 ) ไม่น่าแปลกใจ , จํานวนนี้
phylotypes เฉพาะเกินกว่าจำนวนของชนิดเชื้อแบคทีเรียมักจะปลูกจาก
ผิวอย่างน้อยคำสั่งของขนาด ( 8 ) ยืนยันว่า วัฒนธรรมตามการสำรวจของ
ผิว เช่น การจัดพื้นที่ของจุลินทรีย์อื่น ๆอีกมากมาย
( 14 ) , อย่างดูถูกที่เต็มไปด้วยความหลากหลายของเชื้อแบคทีเรีย ส่วน phylotype เฉลี่ย
สังเกตบนพื้นผิวฝ่ามือเดียวก็
3สูงกว่าส่วนที่พบในการสำรวจระดับโมเลกุลของ
ปลายแขนผิวครั้ง ( 6 ) และผิวข้อศอก ( 7 ) ถึงแม้ว่าเราจะคาดหวัง
ผิวมือให้มีระดับที่สูงขึ้นของความหลากหลายกว่าพื้นผิว
ผิวอื่น ๆ เพราะการติดต่อบ่อยกับศักยภาพ
inocula จากสิ่งแวดล้อม ความแตกต่างนี้ในสังเกต
ความหลากหลายของแบคทีเรียมีแนวโน้มผลของความลึกของ
ตัวอย่างของเราซึ่งอนุญาตให้เราสำรวจที่หายากและแบคทีเรีย
ปัจจุบันบนพื้นผิวของผิวหนัง อย่างไรก็ตาม แม้จะมีความลึกของ
การสำรวจของเรา ความหลากหลาย ประมาณการของเรายังเป็นตัวแทนเพียงลดขอบเขตของความมั่งคั่งในมือ
phylotype บุคคล ; rarefaction
โค้งสำหรับแต่ละบุคคล ปาล์ม พื้นผิวไม่มูลฐาน
[ ข้อมูลสนับสนุน ( SI ) รูปที่ S1 ] แสดงว่าจริง
ความหลากหลายมีแนวโน้มสูงขึ้น ความหลากหลายของแบคทีเรียบนพื้นผิวทั้งหมด
มือปรากฏขึ้นตรงกับ หรือเกินระดับของความหลากหลายของแบคทีเรียที่พบในมนุษย์อื่น ๆ
ที่เกี่ยวข้องจากแหล่งที่อยู่อาศัยรวมทั้งหลอดอาหาร , ปาก , และเว็บไซต์ที่เฉพาะเจาะจง
การแปล กรุณารอสักครู่..