In molecular biology, a hybridizati

In molecular biology, a hybridization probe is a fragment of DNA or RNA of variable length (usually 100-1000 bases long) which is used in DNA or RNA samples to detect the presence of nucleotide sequences (the DNA target) that are complementary to the sequence in the probe. The probe thereby hybridizes to single-stranded nucleic acid (DNA or RNA) whose base sequence allows probe-target base pairing due to complementarity between the probe and target. The labeled probe is first denatured (by heating or under alkaline conditions such as exposure to sodium hydroxide) into single stranded DNA (ssDNA) and then hybridized to the target ssDNA (Southern blotting) or RNA (Northern blotting) immobilized on a membrane or in situ.

To detect hybridization of the probe to its target sequence, the probe is tagged (or "labeled") with a molecular marker of either radioactive or (more recently) fluorescent molecules; commonly used markers are 32P (a radioactive isotope of phosphorus incorporated into the phosphodiester bond in the probe DNA) or Digoxigenin, which is a non-radioactive, antibody-based marker. DNA sequences or RNA transcripts that have moderate to high sequence similarity to the probe are then detected by visualizing the hybridized probe via autoradiography or other imaging techniques. Normally, either X-ray pictures are taken of the filter, or the filter is placed under UV light. Detection of sequences with moderate or high similarity depends on how stringent the hybridization conditions were applied — high stringency, such as high hybridization temperature and low salt in hybridization buffers, permits only hybridization between nucleic acid sequences that are highly similar, whereas low stringency, such as lower temperature and high salt, allows hybridization when the sequences are less similar. Hybridization probes used in DNA microarrays refer to DNA covalently attached to an inert surface, such as coated glass slides or gene chips, to which a mobile cDNA target is hybridized.

Depending on the method, the probe may be synthesized using the phosphoramidite method, or it can be generated and labeled by PCR amplification or cloning (both are older methods). In order to increase the in vivo stability of the probe RNA is not used, instead RNA analogues may be used, in particular morpholino- derivatives. Molecular DNA- or RNA-based probes are now routinely used in screening gene libraries, detecting nucleotide sequences with blotting methods, and in other gene technologies, such as nucleic acid and tissue microarrays.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ในอณูชีววิทยา การสอบสวน hybridization เป็นส่วนของดีเอ็นเอหรืออาร์เอ็นเอของความยาวตัวแปร (มักจะ 100-1000 ฐานยาว) ซึ่งใช้ในตัวอย่างดีเอ็นเอหรืออาร์เอ็นเอการตรวจหาลำดับนิวคลีโอไทด์ (DNA เป้าหมาย) ที่ประกอบกับลำดับในการสอบสวน การสอบสวนจึง hybridizes ที่เดียวที่ควั่นกรดนิวคลีอิก (DNA หรือ RNA) ที่มีลำดับฐานให้สอบสวนเป้าหมายฐานจับคู่เนื่องจากเขาระหว่างวัดและเป้าหมาย โพรบที่มีป้ายชื่อเป็นเอทิลแอลกอฮอล์ (ด้วยเครื่องทำความร้อน หรือสภาวะด่างเช่นสัมผัสกับโซเดียมไฮดรอกไซด์) เป็นเดียวควั่น DNA (ssDNA) แรก และไฮบริดแล้ว เป้าหมาย ssDNA (blotting วิธีภาคใต้) หรืออาร์เอ็นเอ (การ blotting วิธีเหนือ) ในรูปทรง หรือแบบตรึงบนเยื่อหุ้มเซลล์ตรวจหา hybridization ของการสอบสวนการลำดับของเป้าหมาย การสอบสวนคือแท็ก (หรือ "ชื่อ") ด้วยเครื่องหมายโมเลกุลของโมเลกุลกัมมันตรังสี หรือหลอดฟลูออเรสเซนต์ (เมื่อเร็ว ๆ นี้) เครื่องหมายที่ใช้กันทั่วไปเป็น P 32 (ไอโซโทปกัมมันตรังสีของฟอสฟอรัสที่อยู่ในพันธะ phosphodiester ในโพรบดีเอ็นเอ) หรือ Digoxigenin ซึ่งเป็นเครื่องหมายของกัมมันตรังสี แอนติบอดีขึ้น ลำดับดีเอ็นเอหรือใบอาร์เอ็นเอที่มีลำดับปานกลางถึงสูงคล้ายกับโพรบ แล้ว โดยการแสดงผลโพรบผสมพันธุ์ผ่าน autoradiography หรือเทคนิคอื่น ๆ เกี่ยวกับภาพทันที ปกติ มีถ่ายภาพเอ็กซเรย์ของตัวกรอง หรือตัวกรองอยู่ภายใต้แสงยูวี การตรวจหาลำดับมีความคล้ายคลึงกันที่ระดับปานกลาง หรือสูงตามวิธีเข้มงวดเงื่อนไข hybridization ใช้ — stringency สูง อุณหภูมิสูง hybridization และเกลือต่ำในบัฟเฟอร์ hybridization อนุญาตให้เพียง hybridization ระหว่างลำดับกรดนิวคลีอิกที่สูงคล้ายกัน ในขณะที่ stringency ต่ำ อุณหภูมิต่ำและเกลือสูง ช่วยให้การ hybridization เมื่อลำดับที่คล้ายน้อย Hybridization รบที่ใช้ใน DNA microarrays อ้างถึงดีเอ็นเอด้วยแนบกับพื้นผิวเฉื่อย เช่นเคลือบกระจกสไลด์หรือยีนชิป ซึ่งเคลื่อน cDNA เป้าหมายเป็นไฮบริดขึ้นอยู่กับวิธีการ การสอบสวนอาจสังเคราะห์ได้โดยใช้วิธี phosphoramidite หรือสามารถสร้าง และป้าย โดยกระบือหรือโคลน (ทั้งสองเป็นวิธีการเก่า) เพื่อเพิ่มเสถียรภาพของการสอบสวนที่ไม่มีใช้ RNA ในร่างกาย แทน RNA analogues อาจใช้ ในเฉพาะ morpholino-อนุพันธ์ โมเลกุลดีเอ็นเอ หรืออาร์เอ็นเอตามหัวอยู่เป็นประจำไว้ ในไลบรารีของยีน ลำดับของนิวคลีโอไทด์กับ blotting วิธีวิธีการตรวจจับคัดกรอง และ เทคโนโลยียีนอื่น ๆ เช่นกรดนิวคลีอิกและเนื้อเยื่อ microarrays

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ในอณูชีววิทยา , hybridization probe คือชิ้นส่วนของ DNA หรือ RNA ของความยาวแปรได้ ( โดยปกติในระบบฐานยาว ) ซึ่งถูกใช้ในตัวอย่างดีเอ็นเอ หรืออาร์เอ็นเอ เพื่อตรวจสอบสถานะของลำดับนิวคลีโอไทด์ ( เป้าหมาย DNA ) ที่ประกอบกับลำดับในการสอบสวน การสอบสวนจึง hybridizes เดียวควั่นกรดนิวคลีอิก ( DNA หรือ RNA ) ที่มีลำดับฐานให้สอบสวนฐานเป้าหมายคู่เนื่องจากข้อมูลระหว่างการสอบสวน และเป้าหมาย การติดป้ายตัวแรกเกิด ( โดยความร้อน หรือภายใต้เงื่อนไขที่เป็นด่างเช่นแสงโซเดียม ไฮดรอกไซด์ ) เป็นเดี่ยวเกลียวดีเอ็นเอ ( ssdna ) แล้วสามารถไป ssdna เป้าหมาย ( Southern blotting ) หรือ RNA ( Northern blotting ) ที่ถูกตรึงบนเยื่อหุ้มเซลล์หรือในแหล่งกำเนิดการตรวจหาชนิดของการสอบสวนเพื่อลำดับเป้าหมาย การสอบสวนเป็นแท็ก ( หรือ " ข้อความ " ) ด้วยเครื่องหมายโมเลกุลของสารกัมมันตรังสี หรือ ( เมื่อเร็วๆนี้ ) โมเลกุลเรืองแสง ; มักใช้เครื่องหมายเป็น 32p ( ไอโซโทปกัมมันตรังสีของธาตุฟอสฟอรัสรวมอยู่ในฟ โฟไดเ เตอร์ บอนด์ในดีเอ็นเอ ) หรือติด ซึ่งไม่ใช่กัมมันตรังสีจากเครื่องหมายตาม ลำดับ DNA หรือ RNA transcripts นั้นมีความเหมือนลำดับสูงกับการสอบสวนอยู่แล้วที่ตรวจพบโดยการตรวจสอบดีเอ็นเอผ่านเก้าอี้รับแขกหรือเทคนิคการถ่ายภาพอื่น ๆ ปกติ ทั้งเอ็กซเรย์ภาพถ่ายของตัวกรองหรือตัวกรองอยู่ภายใต้แสงยูวี การตรวจหาลำดับปานกลางหรือสูงเหมือนกัน ขึ้นอยู่กับว่าเข้มงวดเงื่อนไข ( เป็น stringency สูงที่ใช้ - เช่นอุณหภูมิสูงและต่ำในเกลือสารบัฟเฟอร์ ( อนุญาตเฉพาะลูกผสมระหว่างลำดับกรดนิวคลีอิกที่คล้ายคลึงกันอย่างมาก ในขณะที่ stringency ต่ำ เช่น อุณหภูมิต่ำและเกลือสูง ช่วยให้ทำเมื่อลำดับจะคล้ายกัน น้อย ฟิวส์ที่ใช้ในดีเอ็นเอไฮบริิอ้างถึงดีเอ็นเอ covalently แนบกับพื้นผิวที่เฉื่อย เช่น สไลด์ กระจกเคลือบ หรือ ยีนชิป ซึ่งมือถือดีเอ็นเอเป้าหมาย 3 .ขึ้นอยู่กับวิธี การสอบสวนอาจจะสังเคราะห์โดยใช้วิธี phosphoramidite หรือมันสามารถสร้างและขยายข้อความโดยวิธี PCR หรือโคลน ( ทั้งคู่เป็นวิธีเก่า ) เพื่อเพิ่มความมั่นคงในตัวของมัน ซึ่งไม่ได้ใช้แทน RNA ซึ่งอาจจะใช้ โดยเฉพาะ morpholino - สัญญาซื้อขายล่วงหน้า DNA หรือ RNA probes - โมเลกุลพื้นฐานตอนนี้ตรวจที่ใช้ในการตรวจหาลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีนห้องสมุด , กับ blotting วิธี และในเทคโนโลยียีนอื่น ๆเช่น กรดนิวคลีอิก และิทิชชู่