Small RNA samples were sequenced by Beijing Genomics Institute by using the high throughput Illumina technology. Briefly, small RNAs with 16–30 nt in length were first separated from the total RNA by size fractionation with 15 % Tris/Borate/EDTA urea polyacrylamide gel (TBU).
The isolated sRNAs were then ligated to 50 adaptor (50 UCAGAGUUCUACAGUCCGACGAUC) using T4 RNA ligase (Promega, Madison, WI, USA) in the presence of RNase Out (Invitrogen, Shanghai, China) overnight at 4 C according to the manufacturer’s instructions. After selecting the ligated products by size fractionation, a 30 adaptor (50 UCGUAUGCCGUCUUCUGCUUGUidT) was ligated to the sRNAs following the same procedure as the ligation of the 50 adaptor. Finally, the ligated RNAs were size fractionated on a 10 % TBU and the 64–78 nt RNAs were excised. The excised sRNAs were then purified from the gel and precipitated as described above followed by resuspension in 5.0
lL DEPC treated water.
ตัวอย่าง RNA ขนาดเล็กมีลำดับขั้นตอนโดยฟังก์ชั่นปักกิ่งสถาบันโดยใช้การประเมินผลเทคโนโลยี Illumina สั้น ๆ , RNAs ขนาดเล็กที่มี 16-30 NT ยาวถูกแยกแรกจาก RNA โดยรวมขนาดแยกกับ 15% ทริส / บอเรต / EDTA ยูเรียเจลอะคริเลต (TBU).
sRNAs บางแห่งถูกผูกแล้วถึง 50 อะแดปเตอร์ (50 UCAGAGUUCUACAGUCCGACGAUC) โดยใช้ T4 อาร์เอ็นเอลิกาเซ (Promega, Madison, WI, USA) ในการปรากฏตัวของ RNase ออก (Invitrogen, เซี่ยงไฮ้, จีน) ค้างคืนที่ 4 C ตามคำแนะนำของผู้ผลิต หลังจากที่เลือกผลิตภัณฑ์ ligated ตามขนาดแยก 30 อะแดปเตอร์ (50 UCGUAUGCCGUCUUCUGCUUGUidT) คือการผูกกับ sRNAs ต่อไปตามขั้นตอนที่ ligation ของอะแดปเตอร์ 50 สุดท้าย RNAs ligated ถูกขนาด fractionated บน TBU 10% และ 64-78 NT RNAs ถูกตัดทิ้ง sRNAs พอบริสุทธิ์แล้วจากเจลและตกตะกอนตามที่อธิบายไว้ข้างต้นตาม resuspension ใน 5.0
LL DEPC รับการรักษาน้ำ
การแปล กรุณารอสักครู่..
