The Tools for T-RFLP data analysis

The Tools for T-RFLP data analysis template provides procedures for the analysis of large T-RFLP datasets including application of a noise baseline threshold and setting of the analysis range, normalization and alignment of replicate profiles, generation of consensus profiles, normalization and alignment of consensus profiles and final analysis of the samples including calculation of association coefficients and diversity index. The procedures are designed so that in all analysis steps, from the initial preparation of the data to the final comparison of the samples, there are various different options available. The parameters regarding analysis range, noise baseline, T-RF alignment and generation of consensus profiles are all given by the user and several different methods are available for normalization of the T-RF profiles. In each step, the user can also choose to base the calculations on either peak height data or peak area data.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เครื่องมือสำหรับต้นแบบการวิเคราะห์ข้อมูล T RFLP อธิบายตอนการวิเคราะห์ของ datasets T RFLP ขนาดใหญ่รวมทั้งใช้เป็นขีดจำกัดพื้นฐานเสียง และการตั้งค่าช่วงวิเคราะห์ ฟื้นฟู และจัดตำแหน่งของโพรไฟล์การ replicate สร้างโพรไฟล์มติ ฟื้นฟู และจัดตำแหน่งของโพรไฟล์มติและสรุปตัวอย่างการคำนวณค่าสัมประสิทธิ์ความสัมพันธ์และดัชนีความหลากหลายรวมทั้ง ขั้นตอนถูกออกแบบมาเพื่อให้ขั้นตอนการวิเคราะห์ทั้งหมด จากการเตรียมเริ่มต้นของข้อมูลเพื่อการเปรียบเทียบขั้นสุดท้ายของตัวอย่าง มีตัวเลือกต่าง ๆ ที่แตกต่างกัน พารามิเตอร์เกี่ยวกับการวิเคราะห์ช่วง เสียงพื้นฐาน ตำแหน่ง T-RF และสร้างมติที่มีโพรไฟล์ทั้งหมดที่กำหนด โดยผู้ใช้และวิธีการต่าง ๆ หลายวิธีมีการฟื้นฟูของค่า T RF ในแต่ละขั้นตอน ผู้ใช้ยังสามารถเลือกเพื่อคำนวณข้อมูลความสูงสูงสุดหรือข้อมูลสูงสุดที่ตั้ง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เครื่องมือสำหรับการ T-RFLP แม่แบบการวิเคราะห์ข้อมูลมีขั้นตอนในการวิเคราะห์ชุดข้อมูล T-RFLP ขนาดใหญ่รวมถึงการประยุกต์ใช้เก​​ณฑ์พื้นฐานเสียงและการตั้งค่าของช่วงการวิเคราะห์ฟื้นฟูและการจัดตำแหน่งของโปรไฟล์ซ้ำรุ่นของโปรไฟล์ฉันทามติกา​​รฟื้นฟูและการจัดตำแหน่งของ โปรไฟล์ฉันทามติและการวิเคราะห์สุดท้ายของกลุ่มตัวอย่างรวมทั้งการคำนวณค่าสัมประสิทธิ์การเชื่อมโยงและดัชนีความหลากหลาย ขั้นตอนที่ได้รับการออกแบบเพื่อที่ว่าในขั้นตอนการวิเคราะห์ทั้งหมดจากการเตรียมการเริ่มต้นของข้อมูลเพื่อเปรียบเทียบสุดท้ายของกลุ่มตัวอย่างที่มีตัวเลือกที่แตกต่างกันต่างๆที่มีอยู่ พารามิเตอร์เกี่ยวกับช่วงการวิเคราะห์พื้นฐานเสียงการจัดตำแหน่ง T-RF และการสร้างฉันทามติโปรไฟล์ทั้งหมดที่ได้รับจากผู้ใช้และวิธีการที่แตกต่างกันที่มีอยู่สำหรับการฟื้นฟูของโปรไฟล์ T-RF ในแต่ละขั้นตอนนี้ผู้ใช้ยังสามารถเลือกที่จะเป็นฐานการคำนวณทั้งข้อมูลความสูงของยอดเขาหรือข้อมูลพื้นที่สูงสุด

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เครื่องมือสำหรับการวิเคราะห์ข้อมูล t-rflp ให้แม่แบบสำหรับขั้นตอนการวิเคราะห์ข้อมูล t-rflp ขนาดใหญ่รวมทั้งการประยุกต์ใช้เสียงพื้นฐานและระดับการตั้งค่าในช่วงการวิเคราะห์ บรรทัดฐานและการสร้างโปรไฟล์ สร้างโปรไฟล์ฉันทามติ ,บรรทัดฐานและแนวของ Consensus โปรไฟล์และการวิเคราะห์ขั้นสุดท้ายของตัวอย่างรวมทั้งการคำนวณค่าสัมประสิทธิ์ของสมาคม และดัชนีความหลากหลาย ขั้นตอนที่ถูกออกแบบมาเพื่อให้ทุกขั้นตอน วิเคราะห์ จากการเริ่มต้นของข้อมูลเพื่อเปรียบเทียบสุดท้ายของกลุ่มตัวอย่าง มีตัวเลือกต่าง ๆ ที่แตกต่างกันใช้ได้ พารามิเตอร์ที่เกี่ยวกับการวิเคราะห์พื้นฐาน ช่วงเสียงt-rf แนวร่วมและสร้างโปรไฟล์เอกฉันท์ทั้งหมดที่กำหนดโดยผู้ใช้ และวิธีการที่แตกต่างกันที่ใช้ได้สำหรับการฟื้นฟูของ t-rf โปรไฟล์ ในแต่ละขั้นตอน ผู้ใช้ยังสามารถเลือกฐานการคำนวณบนยอดสูงสุดสูงข้อมูลหรือพื้นที่ข้อมูล