In a previous study, culturable car

In a previous study, culturable carboxymethyl-cellulose (CMC) decomposing soil bacteria isolated from different sampling positions across an agricultural encatchment have been classified into 31 pattern groups by digestion of amplified 16S rDNA using a single restriction enzyme (Ulrich and Wirth: Microb. Ecol. 37, 238–247, 1999). In order to reveal relationships between phylogenetic diversity and phenotypic functions, a further differentiation of two selected site-specific pattern groups (I and H) was performed, resulting in a sub-classification of four and three ARDRA groups, respectively. Based on sequencing a representative isolate of each ARDRA group, the isolates were assigned to the genus Streptomyces. The ARDRA groups were dispersed across various clades of the genus with a direct affiliation to species known for cellulolytic activity in one group, only. The isolates differed in potentials to degrade colloidal, native or highly crystalline cellulose derivatives. Out of 39 isolates, 11 were capable of degrading all substrates, 17 were restricted to degrade CMC only, and 11 were active decomposers of exclusively both CMC and colloidal cellulose. In most cases, the genetic classification of the isolates corresponded with groupings based on cellulose degrading capabilities. Thus, isolates of four ARDRA groups were restricted to the degradation of CMC, while two further isolates which efficiently degraded all cellulose derivatives formed two separate ARDRA groups. The major ARDRA group, however, displayed a high variability of degradation capabilities. The study of additional phenotypic features revealed a broad potential to decompose a set of various carbon substrates, which matched the phylogenetic classification in several cases.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ในการศึกษาก่อนหน้านี้ culturable carboxymethyl-เซลลูโลส (CMC) จู่ดินแบคทีเรียที่แยกได้จากตำแหน่งที่แตกต่างกันอย่างใน encatchment การเกษตรถูกแบ่งเป็นกลุ่มรูป 31 โดยย่อยขยาย 16S rDNA ใช้เอนไซม์จำกัดเดียว (Ulrich และ Wirth: Microb Ecol. 37, 238-247, 1999) จะเผยให้เห็นความสัมพันธ์ระหว่างความหลากหลาย phylogenetic ไทป์ฟังก์ชัน การเพิ่มเติมความแตกต่างของกลุ่มเลือกเฉพาะรูปที่สอง (ฉันและ H) ทำ เป็นผลในการจำแนกย่อยของกลุ่ม ARDRA สาม และสี่ ตามลำดับ จากการจัดลำดับโปรตีนตัวแทนของแต่ละกลุ่ม ARDRA แยกถูกกำหนดให้สกุล Streptomyces กลุ่ม ARDRA ได้กระจายทั่ว clades ต่าง ๆ ของพืชมีสังกัดโดยตรงกับสายพันธุ์ที่รู้จักกันสำหรับกิจกรรม cellulolytic ในหนึ่งกลุ่ม เพียง แยกความแตกต่างในศักยภาพการลด colloidal ดั้งเดิมหรืออนุพันธ์เซลลูโลสผลึกสูง จากแยก 39, 11 สามารถลดพื้นผิวทั้งหมด 17 ถูกจำกัดให้ลด CMC เท่านั้น และ 11 มีผู้ย่อยสลายที่ใช้งานอยู่โดยเฉพาะ CMC และ colloidal เซลลูโลส ในกรณีส่วนใหญ่ การจัดประเภทของการแยกพันธุกรรมผูกพันกับกลุ่มตามความสามารถในการย่อยสลายเซลลูโลส ดังนั้น แยกกลุ่ม ARDRA สี่ได้จำกัดการสลายของ CMC ในขณะที่สองการแยกซึ่งมีประสิทธิภาพลดลงทั้งหมดอนุพันธ์เซลลูโลสเกิดกลุ่ม ARDRA ที่แยกต่างหากสอง นอกจากนี้กลุ่ม ARDRA ใหญ่ อย่างไรก็ตาม แสดงความแปรปรวนสูงสามารถย่อยสลายของ การศึกษาการใช้คุณสมบัติเพิ่มเติมเผยศักยภาพหลากหลายเพื่อสลายชุดของวัสดุคาร์บอนต่าง ๆ ซึ่งตรงกับการจัดประเภท phylogenetic ในหลายกรณี

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ในการศึกษาก่อนหน้านี้ culturable คาร์บอกซีเซลลูโลส (CMC) ที่เน่าเฟะดินแบคทีเรียที่แยกได้จากตำแหน่งการสุ่มตัวอย่างที่แตกต่างกันทั่ว encatchment การเกษตรได้รับการจำแนกออกเป็น 31 กลุ่มรูปแบบโดยการย่อยขยาย 16S rDNA ใช้เอนไซม์ จำกัด เดียว (อูลและเวิร์ ธ :. จุลชีววิทยา Ecol . 37, 238-247, 1999) เพื่อที่จะแสดงให้เห็นถึงความสัมพันธ์ระหว่างความหลากหลายทางสายวิวัฒนาการและฟังก์ชั่นฟีโนไทป์เป็นความแตกต่างของทั้งสองต่อไปเลือกเว็บไซต์ที่เฉพาะเจาะจงกลุ่มรูปแบบ (ผมและ H) ได้ดำเนินการส่งผลให้การจัดหมวดหมู่ย่อยสี่และสามกลุ่ม ARDRA ตามลำดับ ขึ้นอยู่กับลำดับเก็บเนื้อเก็บตัวตัวแทนของแต่ละกลุ่ม ARDRA, เชื้อได้รับมอบหมายให้ Streptomyces ประเภท กลุ่ม ARDRA กำลังระบาดทั่ว clades ต่างๆของพืชและสัตว์ที่มีความผูกพันโดยตรงกับสายพันธุ์ที่รู้จักกันสำหรับกิจกรรมเซลลูโลสในกลุ่มหนึ่งเท่านั้น แยกแตกต่างกันในศักยภาพในการย่อยสลายคอลลอยด์อนุพันธ์เซลลูโลสพื้นเมืองหรือผลึกสูง ออกจาก 39 สายพันธุ์ 11 มีความสามารถในการย่อยสลายพื้นผิวทั้งหมด 17 ถูก จำกัด ในการย่อยสลาย CMC เท่านั้นและ 11 เป็นตัวย่อยสลายที่ใช้งานของทั้งสองโดยเฉพาะ CMC และเซลลูโลสคอลลอยด์ ในกรณีส่วนใหญ่การจำแนกทางพันธุกรรมของเชื้อตรงกับการจัดกลุ่มขึ้นอยู่กับความสามารถในการย่อยสลายเซลลูโลส ดังนั้นแยกสี่กลุ่ม ARDRA ถูก จำกัด ให้การย่อยสลายของ CMC ในขณะที่ทั้งสองสายพันธุ์ต่อไปได้อย่างมีประสิทธิภาพซึ่งย่อยสลายเซลลูโลสอนุพันธ์ทุกรูปแบบที่สองกลุ่ม ARDRA แยกต่างหาก กลุ่ม ARDRA สำคัญ แต่แสดงความแปรปรวนสูงของความสามารถในการย่อยสลาย การศึกษาคุณสมบัติเพิ่มเติมฟีโนไทป์เผยให้เห็นศักยภาพในวงกว้างในการย่อยสลายชุดของพื้นผิวคาร์บอนต่างๆซึ่งตรงกับการจำแนกสายวิวัฒนาการในหลายกรณี