Anthracnose, caused by Colletotrich

Anthracnose, caused by Colletotrichum gloeosporioides, is a major disease of the postharvest mango (Mangifera indica L.) fruit. However, a lack of transcriptomic and genomic information hinders our understanding of the molecular mechanisms underlying the mango fruit defense response. Here, we studied the host responses of the mango fruit against C. gloeosporioides using Illumina paired-end sequencing technology, and expression profiles of 35 defense-related genes were further analyzed by qRT-PCR. The results indicated that 5.9 Gigabase pair clean reads were assembled into a total of 131,750 unigenes, of which 89,050 unigenes found to be homologous to genes in the NCBI GenBank database and 61,694 unigenes annonated in the Swiss-Prot database. Orthologous analyses showed that 47,770 unigenes were assigned with one or more Gene Ontology terms and 44,145 unigenes were classified into 256 Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes pathways. Moreover, qRT-PCR of 35 defense-related unigenes, including 17 ethylene response factors (ERFs), 6 nucleotide binding site-leucine-rich repeats (NBS-LRRs), 6 nonexpressor of pathogenesis-related genes (NPRs) and 6 pathogenesis-related protein (PRs), revealed that most of these defense-related genes were up-regulated after C. gloeosporioides infection. Taken together, our study provides a platform to discover new candidate genes in mango fruit in relation to pathogen resistance.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Anthracnose สาเหตุ Colletotrichum gloeosporioides เป็นโรคสำคัญของผลไม้หลังการเก็บเกี่ยวมะม่วง (Mangifera indica L.) อย่างไรก็ตาม การขาดของ transcriptomic และข้อมูลออกเป็นอุปสรรคต่อความเข้าใจของกลไกระดับโมเลกุลที่พื้นฐานการตอบสนองการป้องกันผลไม้มะม่วง ที่นี่ เราศึกษาการตอบสนองของโฮสต์ของผลไม้มะม่วงกับ C. gloeosporioides Illumina สิ้นจับคู่ลำดับเทคโนโลยี และโพรไฟล์การแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับการป้องกัน 35 ถูกวิเคราะห์ โดย qRT PCR เพิ่มเติม ผลระบุว่า 5.9 Gigabase คู่สะอาดอ่านถูกประกอบเข้ารวม 131,750 unigenes ซึ่ง 89,050 unigenes พบว่าเซทจะมียีนในฐานข้อมูล NCBI GenBank และ 61,694 unigenes annonated ในฐานข้อมูลสวิส Prot Orthologous การวิเคราะห์แสดงให้เห็นว่า 47,770 unigenes กำหนดเงื่อนไขภววิทยายีนมากกว่า หนึ่ง และ 44,145 unigenes ถูกแบ่งออกเป็น 256 สารานุกรมยีนเกียวโตและ Genomes วิถี นอกจากนี้ qRT PCR ของ 35 ด้าน unigenes รวมทั้งปัจจัยการตอบสนองต่อเอทิลีนที่ 17 (ERFs) นิวคลีโอไทด์ 6 ผูกอุดมด้วย leucine ไซต์ทำซ้ำ (NBS-LRRs), nonexpressor 6 ยีนที่เกี่ยวข้องกับพยาธิกำเนิด (NPRs) และโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับพยาธิกำเนิด 6 (พีอาร์เอส), เปิดเผยว่า ยีนที่เกี่ยวข้องกับการป้องกันเหล่านี้ส่วนใหญ่ถูกควบคุมขึ้นหลังจากการติดเชื้อ C. gloeosporioides นำมารวมกัน ศึกษาของเรามีแพลตฟอร์มเพื่อการค้นพบยีนผู้สมัครใหม่ในผลไม้มะม่วงให้สัมพันธ์กับความต้านทานต่อเชื้อโรค

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

แอนแทรกโนที่เกิดจากเชื้อรา Colletotrichum เป็นโรคที่สำคัญของมะม่วงหลังการเก็บเกี่ยว (Mangifera indica L. ) ผลไม้ อย่างไรก็ตามการขาดข้อมูลจีโนม transcriptomic และเป็นอุปสรรคต่อความเข้าใจในกลไกระดับโมเลกุลพื้นฐานมะม่วงผลไม้การตอบสนองต่อการป้องกันของเรา ที่นี่เราศึกษาการตอบสนองของโฮสต์ของผลไม้มะม่วงกับ gloeosporioides ซีโดยใช้เทคโนโลยีการจัดลำดับ Illumina จับคู่-end และโปรไฟล์การแสดงออกของยีนที่ 35 เกี่ยวข้องกับการป้องกันที่ได้มาวิเคราะห์ต่อไปโดย qRT-PCR ผลการวิจัยพบว่า 5.9 Gigabase คู่สะอาดอ่านถูกประกอบเป็นทั้งหมด 131,750 unigenes ซึ่ง 89,050 unigenes พบว่ามีความคล้ายคลึงกันยีนในฐานข้อมูล NCBI GenBank และ 61,694 unigenes annonated ในฐานข้อมูลของสวิส Prot การวิเคราะห์แสดงให้เห็นว่า Orthologous 47,770 unigenes ได้รับมอบหมายหนึ่งคนหรือมากกว่าอภิปรัชญายีนข้อกำหนดและ 44,145 unigenes ถูกแบ่งออกเป็น 256 เกียวโตสารานุกรมของยีนและทางเดินจีโนม นอกจากนี้ qRT-PCR 35 unigenes เกี่ยวข้องกับการป้องกันรวมทั้งปัจจัยการตอบสนอง 17 เอทิลีน (ERFs), 6 เบื่อหน่ายผูกพันซ้ำเว็บไซต์ leucine ที่อุดมไปด้วย (NBS-LRRS), 6 nonexpressor ​​ของยีนที่เกี่ยวข้องกับการเกิดโรค (NPRs) และ 6 pathogenesis- โปรตีนที่เกี่ยวข้องกัน (PRs) เปิดเผยว่าส่วนใหญ่เหล่านี้มียีนที่เกี่ยวข้องกับการป้องกันเพิ่มขึ้นหลังจากการควบคุมการติดเชื้อ C. gloeosporioides ที่ร่วมกันศึกษาของเรามีเวทีที่จะค้นพบยีนใหม่ในผลไม้มะม่วงในความสัมพันธ์กับการติดเชื้อต้านทาน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

โรคที่เกิดจาก Colletotrichum gloeosporioides , เป็นโรคที่สำคัญของมะม่วงหลังการเก็บเกี่ยว ( เขียวเสวย L . ) ผลไม้ อย่างไรก็ตาม การขาด transcriptomic และข้อมูลจีโนมเป็นอุปสรรคต่อความเข้าใจในกลไกระดับโมเลกุลพื้นฐานมะม่วงผลไม้ป้องกันการตอบสนอง ที่นี่ เราศึกษาการตอบสนองของโฮสต์ต่อ C . gloeosporioides ผลมะม่วงโดยใช้ Illumina ลำดับสุดท้ายคู่เทคโนโลยี และรูปแบบการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับ 35 ป้องกันได้โดยใช้ข้าพเจ้า PCR ผลการวิจัยพบว่า การนำ gigabase คู่สะอาดอ่านถูกประกอบรวมของ 131750 unigenes ซึ่ง 89050 unigenes พบว่ามีความคล้ายคลึงกับยีนใน ncbi ขนาดฐานข้อมูลและ 61694 unigenes annonated ในฐานข้อมูลก่อน สวิส การวิเคราะห์ orthologous พบว่า 47770 unigenes ได้รับมอบหมายกับหนึ่งหรือมากกว่าหนึ่งยีนอภิปรัชญา เงื่อนไข และ 44145 unigenes แบ่งออกเป็น 256 Kyoto Encyclopedia ของยีนและหาแนวทาง . ยิ่งกว่านั้น ข้าพเจ้า PCR 35 การป้องกันที่เกี่ยวข้อง unigenes รวมถึง 17 ลีนตอบสนองปัจจัย ( erfs ) , 6 นิวคลีโอไทด์มัดเว็บไซต์ต่างๆที่อุดมไปด้วยซ้ำ ( NBS LRRS ) , 6 nonexpressor ของยีนที่เกี่ยวข้องกับโรค ( nprs ) และ 6 ซึ่งเกี่ยวข้องกับโปรตีน ( PRS ) พบว่าส่วนใหญ่เหล่านี้สามารถป้องกันยีนที่เกี่ยวข้องหลังจากการติดเชื้อ C . gloeosporioides . ถ่ายด้วยกัน การศึกษาของเราให้แพลตฟอร์มเพื่อค้นหายีนที่ผู้สมัครใหม่ในผลมะม่วงในความสัมพันธ์กับเชื้อต้านทาน