Crocodiles are the largest species

Crocodiles are the largest species among the members of class Reptilia in vertebrates and are one of the last living links to the era when dinosaurs lived. Until the early 1950s, these species were numerous in the tropics of Africa, the Americas, Asia and Australia. In the recent years many of crocodilian species are considered endangered due to their habitat destruction and illegal poaching for their lucrative products.34 and 35 According to Convention on International Trade in Endangered Species (CITES) of Wild Fauna and Flora, crocodilian species were grouped in Appendix I and II. A significant illegal trade of crocodilians has engrossed a lot of attention and therefore the species deserve priority for conservation. In order to conserve these antiquities many countries have developed legal policies for prohibition of poaching and hunting.28 However, illegal trade still exists in many parts of world which appears to be a challenging task to proscribe. Moreover, the biological materials are often degraded quality, which do not lead to conclusive identification through conventional methods.6 and 39 In this perspective, development of novel methods for the identification of these species is inevitable towards their conservation.

Mitochondrial (mt) DNA is valuable tool for species identification from highly degraded samples.1 and 11 Many of universal mt DNA markers such as cytochrome b, 18 and 38 12S rRNA, 17 16S rRNA, 14 and noncoding D-Loop region 28 and 40 have shown their potential targets for animal species identifications. Within crocodiles a single mtDNA marker i.e. cytochrome b (cyt b) has been studied as a potential source for species identification. 21, 22, 23, 25 and 27 However, the efficiency of other regions for forensic identification of crocodiles has not been evaluated and thus these markers also need to be studied in forensic analyses.

The 16S rRNA gene, which encodes the mitochondrial large ribosomal subunit (mt LSU) in animals, has been employed extensively to explore phylogenetic relationships in anthropods at most phylogenetic levels,8 familial level2 and the genus level and below.5, 7 and 15 The wide range in utility of 16S at various taxonomic levels suggests that it could be useful marker for forensic identifications as well.

In this paper, we develop novel primer sets to amplify partial 16S ribosomal RNA region for discriminating the crocodile species. The primers were optimized and checked for their efficiency in six species i.e. Crocodylus palustris, Crocodylus porosus, Gavialis gangeticus, Crocodylus niloticus, Crocodylus siamensis and Crocodylus crocodilus which represent the three existing families of Crocodylia.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

จระเข้มีสายพันธุ์ที่ใหญ่ที่สุดในหมู่สมาชิกของคลาส Reptilia vertebrates และเป็นหนึ่งในการเชื่อมโยงชีวิตสุดท้ายเพื่อยุคเมื่อไดโนเสาร์อาศัยอยู่ จนถึงช่วงต้นทศวรรษ 1950 พันธุ์เหล่านี้มีมากมายในเขตร้อนของแอฟริกา อเมริกา เอเชีย และออสเตรเลีย ในปีล่าสุดหลายพันธุ์ crocodilian กำลังทำ การทำลายถิ่นฐานธรรมชาติของพวกเขา และ poaching products.34 ความร่ำรวยและ 35 ตามอนุสัญญาว่าด้วยการค้าระหว่างประเทศในใกล้สูญพันธุ์ (CITES) ของสัตว์ป่าและพืช crocodilian พันธุ์ได้ถูกจัดกลุ่มในภาคผนวกดาว การค้าผิดกฎหมายสำคัญของ crocodilians มีใจจดใจจ่อมีความสนใจมาก และดังนั้น พันธุ์สมควรได้รับความสำคัญในการอนุรักษ์ การอนุรักษ์โบราณวัตถุเหล่านี้หลายประเทศได้พัฒนานโยบายกฎหมายการ prohibition poaching และ hunting.28 อย่างไรก็ตาม การค้าผิดกฎหมายยังคงมีอยู่ในหลายส่วนของโลกที่ดูเหมือนจะเป็นงานที่ท้าทายเพื่อ proscribe นอกจากนี้ วัสดุชีวภาพมักมีคุณภาพเสื่อมโทรม ซึ่งไม่ทำให้ข้อสรุปรหัสผ่าน methods.6 ปกติและ 39 ในมุมมองนี้ พัฒนาวิธีนวนิยายสำหรับการระบุพันธุ์เหล่านี้จะหลีกเลี่ยงต่อการอนุรักษ์Mitochondrial (mt) ดีเอ็นเอเป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าสำหรับการระบุชนิด samples.1 สูงเสื่อมโทรมและ 11 ของ mt สากลเครื่องหมายดีเอ็นเอเช่น cytochrome b, 38 และ 18 12S rRNA, 17 16S rRNA, 14 และ noncoding D วนภูมิภาค 28 และ 40 ได้แสดงเป้าหมายของพวกเขาสำหรับรหัสพันธุ์สัตว์ ภายในจระเข้ เครื่องหมาย mtDNA เดียวเช่น cytochrome b (cyt b) มีการศึกษาเป็นแหล่งที่มีศักยภาพสำหรับการระบุชนิด 21, 22, 23, 25 และ 27 อย่างไรก็ตาม ไม่ได้ประเมินประสิทธิภาพของภูมิภาคอื่น ๆ สำหรับรหัสนิติเวชของจระเข้ และดัง เครื่องหมายเหล่านี้ต้องถูกศึกษาในการวิเคราะห์ทางนิติวิทยาศาสตร์16S rRNA ยีน ซึ่งจแมปที่ mitochondrial ใหญ่ ribosomal ย่อย (mt ชุดปั๊มหมึก) ในสัตว์ มีการจ้างอย่างกว้างขวางเพื่อสำรวจความสัมพันธ์ phylogenetic ใน anthropods ระดับมากที่สุด phylogenetic, 8 ภาวะ level2 และระดับสกุล และ below.5, 7 และ 15 หลากหลายในยูทิลิตี้ของ 16S ระดับต่าง ๆ อนุกรมวิธานแนะนำว่า อาจเป็นเครื่องหมายที่มีประโยชน์สำหรับรหัสทางนิติวิทยาศาสตร์เช่นการในเอกสารนี้ เราพัฒนาพื้นนวนิยายชุดขยายบางส่วน 16S ribosomal อาร์เอ็นเอภูมิภาคเหยียดพวกผิวพันธุ์จระเข้ ไพรเมอร์ที่ถูกปรับให้เหมาะสม และตรวจสอบประสิทธิภาพในหกชนิดเช่นจ palustris, porosus จ Gavialis gangeticus, niloticus จ จดอยอินทนนท์ และ crocodilus จซึ่งเป็นตัวแทนของครอบครัวที่มีอยู่สามของ Crocodylia

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

จระเข้เป็นสายพันธุ์ที่ใหญ่ที่สุดในหมู่สมาชิกของชั้นทิในสัตว์ที่มีกระดูกสันหลังและเป็นส่วนหนึ่งของการเชื่อมโยงการใช้ชีวิตที่ผ่านมาในยุคเมื่อไดโนเสาร์อาศัยอยู่ จนกว่าจะถึงปี 1950 ต้นปีชีส์เหล่านี้เป็นจำนวนมากในเขตร้อนของทวีปแอฟริกาอเมริกาเอเชียและออสเตรเลีย ในปีที่ผ่านมาหลายชนิด crocodilian ถือว่าใกล้สูญพันธุ์เนื่องจากการทำลายแหล่งที่อยู่อาศัยและการลักลอบล่าสัตว์ที่ผิดกฎหมายสำหรับ products.34 ร่ำรวยของพวกเขาและ 35 ตามอนุสัญญาว่าด้วยการค้าระหว่างประเทศในสัตว์ใกล้สูญพันธุ์ (CITES) ของป่าและพืชป่าชนิด crocodilian ถูกจัดกลุ่มใน ภาคผนวก I และ II ค้าที่ผิดกฎหมายอย่างมีนัยสำคัญของ crocodilians ได้รักความสนใจมากและดังนั้นจึงสมควรได้รับสายพันธุ์ที่มีความสำคัญในการอนุรักษ์ เพื่อที่จะอนุรักษ์โบราณวัตถุเหล่านี้หลายประเทศได้มีการพัฒนานโยบายกฎหมายข้อห้ามของการรุกล้ำและ hunting.28 อย่างไรก็ตามค้าที่ผิดกฎหมายยังคงมีอยู่ในหลายส่วนของโลกซึ่งดูเหมือนจะเป็นงานที่ท้าทายที่จะห้าม นอกจากนี้วัสดุชีวภาพมักจะอายที่มีคุณภาพซึ่งไม่ได้นำไปสู่การระบุแน่ชัดผ่าน methods.6 ธรรมดาและ 39 ในมุมมองนี้การพัฒนาวิธีการใหม่สำหรับบัตรประจำตัวของสายพันธุ์นี้เป็นที่แน่นอนของพวกเขาที่มีต่อการอนุรักษ์ยล (MT) ดีเอ็นเอเป็น เครื่องมือที่มีคุณค่าสำหรับการระบุสายพันธุ์จาก samples.1 เสื่อมโทรมอย่างมากและ 11 หลายเครื่องหมายดีเอ็นเอ mt สากลเช่น cytochrome ข, 18 และ 38 12S rRNA, 17 16S rRNA, 14 และ noncoding D-วนภูมิภาค 28 และ 40 ได้แสดงให้เห็นเป้าหมายที่มีศักยภาพของพวกเขาสำหรับ ระบุสัตว์ชนิด ภายในจระเข้เดียว mtDNA เครื่องหมายเช่น cytochrome ข (CYT ข) ได้รับการศึกษาในฐานะที่เป็นแหล่งที่มีศักยภาพในการจำแนกชนิด 21, 22, 23, 25 และ 27 อย่างไรก็ตามประสิทธิภาพของภูมิภาคอื่น ๆ เพื่อระบุตัวตนทางกฎหมายของจระเข้ยังไม่ได้รับการประเมินและทำให้เครื่องหมายเหล่านี้ยังจะต้องมีการศึกษาในทางนิติเวชวิเคราะห์16S rRNA ยีนซึ่ง encodes ยล subunit โซมอลขนาดใหญ่ (MT LSU) ในสัตว์ได้รับการว่าจ้างอย่างกว้างขวางในการสำรวจความสัมพันธ์ของสายวิวัฒนาการใน anthropods สายวิวัฒนาการในระดับมากที่สุด 8 level2 ครอบครัวและระดับประเภทและ below.5, 7 และ 15 หลากหลายในยูทิลิตี้ของ 16S ในระดับการจัดหมวดหมู่ต่าง ๆ แสดงให้เห็นว่า มันอาจจะเป็นเครื่องหมายที่มีประโยชน์สำหรับการวินิจฉัยทางนิติเวชได้เป็นอย่างดีในบทความนี้เราพัฒนาไพรนวนิยายชุดเพื่อขยาย 16S บางส่วนภูมิภาคโซมอล rna สำหรับจำแนกสายพันธุ์จระเข้ ไพรเมอร์ที่ได้รับการเพิ่มประสิทธิภาพและการตรวจสอบประสิทธิภาพของพวกเขาในหกชนิดคือจระเข้ palustris, Crocodylus porosus, Gavialis gangeticus, Crocodylus niloticus, Crocodylus siamensis และ Crocodylus crocodilus ซึ่งเป็นตัวแทนสามครอบครัวที่มีอยู่ของ Crocodylia

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

จระเข้เป็นชนิดที่ใหญ่ที่สุดในหมู่สมาชิกของคลาสเรปทิเลียในสัตว์มีกระดูกสันหลังและสุดท้ายหนึ่งเชื่อมโยงชีวิตในยุคเมื่อไดโนเสาร์มีชีวิต จนกว่าช่วงต้นทศวรรษ 1950 , ชนิดเหล่านี้มีมากมายในเขตร้อนของทวีปแอฟริกา , ทวีปอเมริกา , เอเชียและออสเตรเลียในปีล่าสุดหลาย crocodilian ชนิดใกล้สูญพันธุ์ เนื่องจากถือว่าเป็นการทำลายสิ่งแวดล้อม และผิดกฎหมายการลักลอบล่าสัตว์ สำหรับ products.34 lucrative พวกเขาและ 35 ตามอนุสัญญาว่าด้วยการค้าระหว่างประเทศซึ่งชนิดของสัตว์ป่าและพืชป่าที่ไซเตส ) , ( 4 ) crocodilian ชนิดในภาคผนวกที่ I และ IIการค้าที่ผิดกฎหมายสำคัญของฟักแม้วได้มุ่งความสนใจมากและดังนั้นชนิดสมควรได้รับความสำคัญสำหรับการอนุรักษ์ เพื่ออนุรักษ์โบราณวัตถุเหล่านี้ หลายประเทศได้พัฒนากฎหมาย นโยบายการห้ามล่าสัตว์และ hunting.28 อย่างไรก็ตาม กฎหมายการค้ายังคงมีอยู่ในส่วนต่างๆ ของโลก ซึ่งดูเหมือนจะเป็นสิ่งที่ท้าทายที่จะเนรเทศ นอกจากนี้วัสดุทางชีวภาพมักจะเสื่อมคุณภาพ ซึ่งไม่ได้นำไปสู่การสรุปผ่านวิธีการแบบดั้งเดิม และ 39 ในมุมมองนี้ , การพัฒนาวิธีใหม่สำหรับการระบุชนิดนี้เป็นสิ่งที่หลีกเลี่ยงไม่ได้ต่อการอนุรักษ์ของพวกเขา .

ไมโตคอนเดรียดีเอ็นเอ ( MT ) เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าสำหรับการจำแนกชนิดจากสูงสลายตัวอย่าง1 กับ 11 มากมายของ Universal MT ดีเอ็นเอ เช่น ไซโตโครม บี , 18 และ 38 12s rRNA 16S rRNA 17 , 14 และ noncoding d-loop เขต 28 และ 40 ได้แสดงศักยภาพของพวกเขาสำหรับสัตว์ชนิดอะไรบ่งบอกเป้าหมาย . ภายในเดี่ยวแสดงเครื่องหมายเช่นจระเข้ - B ( cyt B ) ได้ศึกษาเป็นแหล่งที่มีศักยภาพสำหรับการจำแนกชนิด 21 , 22 , 23 , 25 และ 27 อย่างไรก็ตามประสิทธิภาพของภูมิภาคอื่น ๆเพื่อพิสูจน์นิติเวชของจระเข้ยังไม่ได้ประเมิน และดังนั้น เครื่องหมายเหล่านี้ยังต้องศึกษาในการวิเคราะห์นิติเวช

16S rRNA ยีนที่เข้ารหัสตัดขนาดใหญ่ไรโบโซมหน่วย ( MT LSU ) ในสัตว์ มีการใช้อย่างกว้างขวางเพื่อสำรวจความสัมพันธ์ต่างๆใน anthropods ระดับต่างๆมากที่สุด8 level2 สกุลและครอบครัวและระดับล่าง ที่ 5 , 7 และ 15 ช่วงกว้างในระดับการศึกษาต่าง ๆที่ใช้โปรแกรมแสดงให้เห็นว่ามันอาจจะมีประโยชน์เครื่องหมายนิติเวชอะไรบ่งบอกเป็นอย่างดี

ในงานวิจัยนี้ เราได้พัฒนาชุดรองพื้นใหม่เพื่อขยายบางส่วน 16S ไรโบโซมอล อาร์เอ็นเอภูมิภาคจำแนกจระเข้ชนิดไพรเมอร์เหมาะสมและการตรวจสอบประสิทธิภาพของพวกเขาในหกชนิดคือ crocodylus palustris crocodylus porosus , หนังยาง , crocodylus niloticus , , และ crocodylus siamensis และ crocodylus ซึ่งเป็นตัวแทนของครอบครัวสามที่มีอยู่ของโครโคดีเลีย .