Table 1. Description of the traits studded with their respective abbreviations.
Traits Description
Body performance in grams (g)
BW Body weights at birth
BW21 Body weights at 21 days of age
BW35 Body weights at 35 days of age
BW41 Body weights at 41 days of age
BW42 Body weights at 42 days of age
FI35 41 Feed intake from 35 to 41 days of age
WG35 41 Weight gain from 35 to 41 days of age
FC35 41 Feed conversion from 35 to 41 days of age
Organs and Carcass in grams (g) and yields (%)
BFW and BFY Blood and feather weight and yield
AFW and AFY Abdominal fat weight and yield
LIVW and LIVY Liver weight and yield
HEAW and HEAY Heart weight and yield
GIZW and GIZY Gizzard weight and yield
LUNW and LUNY Lungs weight and yield
PPCW and PPCY Carcass post-bleeding and plucking weight and yield
CCW and CCY Chilled carcass weight and yield
HEADW and HEADY Head weight and yield
FEEW and FEEY Feet weight and yield
TWW and TWY Thing wing weight and yield
WDW and WDY Wing drumette weight and yield
WTW and WTY Wing tip weight and yield
WW and WY Wing weight and yield
TIBW and TIBY Tibia weight and yield
TSW and TSY Thing skin weight and yield
TMW and TMY Thing meat weight and yield
TW and TY Thigh weight and yield
FEMW and FEMY Femur weight and yield
DSW Drumstick skin weight
DMW Drumstick meat weight
DW and DY Drumstick weight and yield
BSW and BSY Breast skin weight and yield
BMW and BMY Breast meat weight and yield
BFW and BFY Breast fillet weight and yield
BBW and BBY Breast bone weight and yield
BREW and BREY Breast weight and yield
BACW and BACY Back weight and yield
NECW and NECY Neck weight and yield
BONW and BONY Bone weight and yield
SW and SY Skins weight and yield
Scientific). The sequencing reactions were carried out
following the protocol of the BigDye R Terminator Cycle Sequencing Ready Reaction (Applied Biosystems)
kit. Each sequencing reaction was carried out in both
directions using 2 μL Save Money buffer (200 mM Tris
pH 9.0, 0.5 mM MgCl2), 1 μL primer (2.5 pmol/μL),
2 μL BigDye Kit and 50 ng DNA were used. The sequencing reaction comprised denaturation at 95◦C for
20 seconds, annealing at 59◦C for 15 seconds and extension at 60◦C for one minute, totaling 25 cycles.
DNA sequences were analyzed using the
Phred/Phrap/Consed/PolyPhred software (Ewing
and Green, 1998; Gordon et al., 1998; Nickerson
et al., 1997). Only DNA sequences with quality
(Phred) greater than or equal to 20 were selected.
Subsequently, the SNP identified were genotyped in
the broilers population by PCR-RFLP. For the RFLP
analysis, a total of 12.5 μL of the PCR products were
digested with 0.15 μL (10U/μL) BsrI (ACTGGN↓)
restriction enzyme (New England Biolabs, Hitchin,
UK) in a final volume of 15 μL at 65◦C overnight.
Detection of restriction fragment length polymorphism
was carried out by electrophoresis on 1% agarose gels
in 1X TBE buffer stained with ethidium bromide
at 100 V for 50 min. Molecular weight marker of
100 bp (Invitrogen) was used to identify the size of the
restriction fragments on the agarose gel. The agarose
gels were analyzed under UV light and the allele
frequencies were obtained by direct counting.
ตารางที่ 1 คำอธิบายของลักษณะ studded มีคำย่อของพวกเขาเกี่ยวข้องคำอธิบายลักษณะประสิทธิภาพของร่างกายในหน่วยกรัม (g)ร่างกายขาวดำน้ำหนักแรกเกิดน้ำหนักร่างกาย BW21 ที่อายุ 21 วันน้ำหนักร่างกาย BW35 ที่อายุ 35 วันน้ำหนักร่างกาย BW41 ที่อายุ 41 วันน้ำหนักร่างกาย BW42 ที่อายุ 42 วันบริโภคอาหาร 41 FI35 จาก 35 วันอายุ 41WG35 41 น้ำหนักจาก 35 ให้อายุ 41 วันอาหาร 41 FC35 แปลงจาก 35 อายุ 41 วันอวัยวะและซากในหน่วยกรัม (g) และอัตราผลตอบแทน (%)BFW และน้ำหนัก BFY เลือดและขน และผลตอบแทนน้ำหนักไขมัน AFW และท้อง AFY และผลผลิตLIVW และตับ LIVY น้ำหนักและผลผลิตน้ำหนัก HEAW และ HEAY ใจและผลตอบแทนGIZW และ GIZY Gizzard น้ำหนักและผลผลิตLUNW และปอด LUNY น้ำหนักและผลผลิตPPCW และ PPCY ซากหลังเลือด และถอนขนน้ำหนักและผลผลิตน้ำหนักซาก CCW และ CCY อาหารและผลผลิตHEADW หัว HEADY น้ำหนัก และผลผลิตFEEW และ FEEY เท้าน้ำหนักและผลผลิตTWW และสิ่ง TWY วิงน้ำหนักและผลผลิตน้ำหนัก drumette WDW และวิง WDY และผลผลิตWTW และวิง WTY แนะนำเกี่ยวกับน้ำหนักและผลผลิตWW และวิงตัน WY น้ำหนักและผลผลิตTIBW และ TIBY Tibia น้ำหนักและผลผลิตTSW และสิ่ง TSY ผิวน้ำหนักและผลผลิตน้ำหนักเนื้อทีเอ็มดับเบิ้ลยูและสิ่ง TMY และผลผลิตผู้ที่ใช้และ TY ต้นขาน้ำหนักและผลผลิตFEMW และ FEMY กระดูกต้นขาน้ำหนักและผลผลิตน้ำหนักผิว DSW Drumstickน้ำหนักเนื้อ DMW DrumstickDW และ DY Drumstick น้ำหนักและผลผลิตน้ำหนักผิว BSW และเต้านม BSY และผลผลิตBMW และเต้านม BMY น้ำหนักเนื้อและผลตอบแทนBFW และเต้านม BFY เนื้อน้ำหนักและผลผลิตBBW และเต้านม BBY กระดูกน้ำหนักและผลผลิตBREW และ BREY เต้านมน้ำหนักและผลผลิตBACW และ BACY กลับน้ำหนักและผลผลิตNECW และ NECY คอน้ำหนักและผลผลิตBONW และกระดูก BONY น้ำหนักและผลผลิตSW และสกินซี่น้ำหนักและผลผลิตวิทยาศาสตร์) ปฏิกิริยาลำดับดำเนินได้โพรโทคอล BigDye อาร์เทอร์มิเนเตอร์วงจรลำดับเบสพร้อมปฏิกิริยา (Biosystems ใช้) ต่อไปนี้ชุด แต่ละปฏิกิริยาลำดับถูกดำเนินการทั้งในเส้นทางที่ใช้ 2 μL บันทึกเงินบัฟเฟอร์ (200 mM ทริสเรทติ้งpH 9.0, 0.5 mM MgCl2), รองพื้น μL 1 (2.5 pmol/μL),ΜL 2 ที่ใช้ชุด BigDye และ 50 ng ดีเอ็นเอ Denaturation ที่ 95◦C สำหรับประกอบด้วยปฏิกิริยาลำดับวินาที การอบเหนียวที่ 59◦C วินาทีและ 60◦C หนึ่งนาที รวม 25 รอบมีวิเคราะห์ลำดับดีเอ็นเอโดยใช้การซอฟต์แวร์ Phred/Phrap/Consed/PolyPhred (Ewingและสี เขียว 1998 Gordon และ al., 1998 Nickersonและ al., 1997) เฉพาะลำดับดีเอ็นเอที่ มีคุณภาพ(Phred) มากกว่า หรือเท่ากับ 20 ได้เลือกในเวลาต่อมา SNP ที่ระบุถูก genotyped ในประชากรออก โดย PCR-RFLP สำหรับแบบ RFLPวิเคราะห์ จำนวน 12.5 μL ผลิตภัณฑ์ PCR ได้เจ่ากับ 0.15 μL (10U/μL) BsrI (ACTGGN↓)เอนไซม์จำกัด (นิวอิงแลนด์ Biolabs, Hitchinสหราชอาณาจักร) ในปริมาตรสุดท้ายของ μL 15 65◦C ที่นอนตรวจสอบข้อจำกัดส่วนความยาวโพลีมอร์ฟิซึมได้ดำเนินการ โดย electrophoresis บน 1% agaroseในบัฟเฟอร์ X TBE 1 สี ด้วยโบรไมด์ ethidium100 V สำหรับเครื่องน้ำหนักโมเลกุลต่ำสุด 50 ของ100 bp (Invitrogen) ถูกใช้เพื่อระบุขนาดของการบางส่วนของข้อจำกัดบนเจ agarose ใน agaroseเจได้วิเคราะห์ภายใต้แสง UV และ alleleความถี่ที่ได้รับ โดยการนับโดยตรง
การแปล กรุณารอสักครู่..

ตารางที่ 1 คำอธิบายของลักษณะเรียงรายด้วยตัวย่อของตน.
ลักษณะรายละเอียดผลการดำเนินงานในร่างกายกรัม (g) น้ำหนักร่างกาย BW ที่เกิดน้ำหนักร่างกายBW21 ที่ 21 วันอายุน้ำหนักร่างกายBW35 ที่ 35 วันอายุน้ำหนักร่างกายBW41 ที่ 41 วันของการ อายุน้ำหนักร่างกายBW42 ที่ 42 วันอายุFI35 41 การบริโภคอาหาร 35-41 วันอายุWG35 41 น้ำหนักตัวเพิ่มขึ้น 35-41 วันอายุFC35 41 แปลงฟีด 35-41 วันอายุอวัยวะและซากกรัม(g) และอัตราผลตอบแทน (%) BFW และ BFY เลือดและน้ำหนักขนนกและผลผลิตAFW และน้ำหนัก AFY ไขมันหน้าท้องและผลผลิตLIVW และน้ำหนักลิวี่ตับและผลผลิตเหวและน้ำหนักHEAY หัวใจและผลผลิตGIZW และน้ำหนัก GIZY กระเพาะอาหารของนกและผลผลิตLUNW และน้ำหนัก Luny ปอดและผลผลิตPPCW และ PPCY ซากหลังมีเลือดออกและน้ำหนักถอนขนและผลผลิตทวนเข็มนาฬิกาและCCY น้ำหนักซากแช่เย็นและผลผลิตHEADW และน้ำหนักมึนเมาหัวหน้าและผลผลิตรู้สึกและFEEY น้ำหนักเท้าและผลผลิตTWW และ TWY น้ำหนักปีกสิ่งและผลผลิตWDW และ WDY ปีกน้ำหนัก drumette และผลผลิตWTW และน้ำหนักปลาย WTY ปีกและผลผลิตWW และน้ำหนักปีก WY และผลผลิตTIBW และน้ำหนัก Tiby Tibia และผลผลิตTSW และน้ำหนักผิว TSY สิ่งและผลผลิตTMW และน้ำหนักเนื้อ TMY สิ่งและผลผลิตทีดับบลิวและTY น้ำหนักต้นขาและผลผลิตFEMW และ femy ขาอ่อนน้ำหนัก และผลผลิตDSW น่องน้ำหนักผิวDMW น่องเนื้อน้ำหนักDW และน้ำหนัก DY น่องและผลผลิตBSW และ BSY น้ำหนักผิวเต้านมและผลผลิตBMW และ BMY น้ำหนักเนื้อเต้านมและผลผลิตBFW และ BFY น้ำหนักเนื้อเต้านมและผลผลิตBBW และรักน้ำหนักกระดูกเต้านมและผลผลิตBREW และ Brey น้ำหนักเต้านมและผลผลิตBACW และน้ำหนัก BACY กลับและผลผลิตNECW และน้ำหนัก NECY คอและผลผลิตBONW และน้ำหนักกระดูกกระดูกและผลผลิตSW และ SY น้ำหนักกินและผลผลิตทางวิทยาศาสตร์) ปฏิกิริยาลำดับถูกดำเนินการดังต่อไปนี้โปรโตคอลของ BigDye หรือไม่ R Terminator วงจรลำดับพร้อมปฏิกิริยา (Applied Biosystems) ชุด ปฏิกิริยาลำดับแต่ละคนได้ดำเนินการทั้งในเส้นทางโดยใช้ 2 ไมโครลิตรบันทึกบัฟเฟอร์เงิน (200 มิลลิทริสพีเอช9.0, 0.5 มิลลิ MgCl2) ไพรเมอร์ 1 ไมโครลิตร (2.5 pmol / ไมโครลิตร) 2 ไมโครลิตร BigDye ชุดและ 50 นาโนกรัมดีเอ็นเอถูกนำมาใช้ ปฏิกิริยาลำดับประกอบด้วย denaturation ที่95◦Cสำหรับ20 วินาทีที่หลอม59◦C 15 วินาทีและการขยายที่60◦Cเป็นเวลาหนึ่งนาทีรวมเป็นเงินทั้งสิ้น 25 รอบ. ลำดับดีเอ็นเอที่ได้มาวิเคราะห์โดยใช้Phred / Phrap / Consed / PolyPhred ซอฟแวร์ ( วิงและสีเขียว1998;. กอร์ดอน, et al, 1998; Nickerson., et al, 1997) เฉพาะลำดับดีเอ็นเอที่มีคุณภาพ(Phred) มากกว่าหรือเท่ากับ 20 ได้รับการคัดเลือก. ต่อจากนั้น SNP ที่ระบุถูก genotyped ในประชากรไก่เนื้อโดยPCR-RFLP สำหรับ RFLP วิเคราะห์รวม 12.5 ไมโครลิตรของผลิตภัณฑ์ PCR ถูกย่อยด้วย0.15 ไมโครลิตร (10U / ไมโครลิตร) BsrI (ACTGGN ↓) เอนไซม์ จำกัด (นิวอิงแลนด์ Biolabs, Hitchin, สหราชอาณาจักร) ในเล่มสุดท้าย 15 ไมโครลิตรที่65◦ C ในชั่วข้ามคืน. ตรวจความแตกต่างความยาวส่วนข้อ จำกัดได้ดำเนินการโดยเจลอิเล็กบน agarose 1% ในบัฟเฟอร์ 1X TBE ย้อมด้วย ethidium bromide ที่ 100 V สำหรับ 50 นาที เครื่องหมายน้ำหนักโมเลกุล100 bp (Invitrogen) ถูกนำมาใช้เพื่อระบุขนาดของชิ้นส่วนข้อจำกัด ในการเจล agarose agarose เจลถูกนำมาวิเคราะห์ภายใต้แสงยูวีและอัลลีลความถี่ที่ได้รับจากการนับโดยตรง
การแปล กรุณารอสักครู่..

ตารางที่ 1 . รายละเอียดของลักษณะ studded กับตน
อธิบายอักษรย่อ ลักษณะร่างกาย ประสิทธิภาพในกรัม ( g )
bw21 BW ร่างกายน้ำหนักเมื่อแรกเกิดร่างกายน้ำหนัก 21 วัน อายุ 35 วัน น้ำหนักตัวที่ bw35
bw41 ร่างกายน้ำหนักที่อายุ 41 วัน อายุ
bw42 ร่างกายน้ำหนัก 42 วันของอายุ
fi35 41 ปริมาณอาหารจาก 35 ถึง 41 วัน อายุ 41
wg35 น้ำหนักเพิ่มจาก 35 ถึง 41 วัน อายุ
fc35 41 อาหารการแปลงจาก 35 - 41 วันอวัยวะอายุ
และซากในกรัม ( g ) และอัตราผลตอบแทน ( % )
bfw bfy เลือดและน้ำหนักและขนนกและผลผลิต
afw afy น้ำหนักและไขมันหน้าท้อง และผลผลิต
livw ลิวี่ตับและน้ำหนักและผลผลิต
heaw น้ำหนักและหัวใจ heay และผลผลิต
gizw และน้ำหนัก และผลผลิตของ gizy
lunw และน้ำหนัก luny ปอดและผลผลิต
และซาก ppcw ppcy โพสต์เลือดออกและถอนขนน้ำหนักและผลผลิต
CCW ดูเย็นและน้ำหนักซากและผลผลิต
headw และน้ำหนักหัวรุนแรงและผลผลิต
feew และน้ำหนัก feey เท้าและผลผลิต
tww twy สิ่งปีกและน้ำหนักและผลผลิต
wdw และปีก wdy น้ำหนัก drumette และผลผลิต
wtw และปีก wty น้ำหนักเคล็ดลับและผลผลิต
WW และน้ำหนักปีก WY และผลผลิต
tibw tiby กระดูกหน้าแข้งและน้ำหนักและผลผลิต
tsw tsy สิ่งน้ำหนักและผิวและผลผลิต
tmw TMY สิ่งน้ำหนักและเนื้อและผลผลิต
tw และไทต้นขาน้ำหนักและผลผลิต
femw femy กระดูกต้นขาและน้ำหนักและผลผลิต
0
dmw หรือไม่ผิวน้ำหนักน่องเนื้อน้ำหนัก
DW และน้ำหนักน่องดี้และผลผลิต
bsw และเต้านม bsy น้ำหนักผิวและผลผลิต
BMW และเต้านม bmy น้ำหนักเนื้อสัตว์และผลผลิต
bfw และเต้านม bfy น้ำหนักเนื้อปลาและผลผลิต
เรื่อง BBW และเต้านม bby น้ำหนักกระดูกและผลผลิต
ตั้งเค้า และ Brey เต้านมน้ำหนักและผลผลิต
bacw bacy กลับและน้ำหนักและผลผลิต
necw necy คอและน้ำหนักและผลผลิต
bonw และน้ำหนักกระดูกกระดูก และผลผลิต
SW SY สกินและน้ำหนักและผลผลิต
ทางวิทยาศาสตร์ ) ปฏิกิริยาดังกล่าวได้ดำเนินการตามขั้นตอนของ bigdye
R Terminator รอบลำดับปฏิกิริยาพร้อม ( Applied Biosystems )
kitแต่ละลำดับปฏิกิริยาออกมาทั้ง
เส้นทางโดยใช้ 2 μฉันบันทึกเงินบัฟเฟอร์ ( 200 มม. โดย
pH 9.0 , 0.5 มม. , MgCl2 ) รองพื้น L 1 μ ( 2.5 pmol / μ L )
2 L bigdye μชุด 50 นาโนดีเอ็นเอและการใช้ ปฏิกิริยาดังกล่าวประกอบด้วย ( 95 ◦ C
20 วินาที annealing ที่ 59 ◦ C เป็นเวลา 15 วินาทีและส่วนขยายที่ 60 ◦ C เป็นเวลา 1 นาที รวมทั้งสิ้น 25 รอบ
ลำดับดีเอ็นเอโดยใช้
/ / / phred เกตุทัสสา MA พระมหา consed polyphred ซอฟต์แวร์ ( วิง
และสีเขียว , 1998 ; กอร์ดอน et al . , 1998 ; นิเคอร์สัน
et al . , 1997 ) ลำดับ DNA เท่านั้นที่มีคุณภาพ
( phred ) มากกว่าหรือเท่ากับ 20 เลือก .
โดยระบุเป็น genotyped SNP ใน
ไก่ว่าประชากรโดย . สำหรับการวิเคราะห์ RFLP
, รวม 12.5 μ l ผลิตภัณฑ์ PCR ถูก
ย่อยกับ 0.15 μ L ( 10u / μ L ) bsri ( actggn ↓ )
เอนไซม์จำกัด ( อังกฤษ biolabs Hitchin
, , UK ) ในเล่มสุดท้าย 15 μ l ที่ 65 ◦ C ค้างคืน
ตรวจจับการ fragment length polymorphism
กระทำโดยวิธีอิเล็กโทรโฟรีซีสบน 1% ( 1x เจล
ใน ทีบีบัฟเฟอร์คู่เปื้อนโบรไมด์
ที่ 100 V สำหรับ 50 นาที โมเลกุลเครื่องหมายของ
100 BP ( Invitrogen ) ถูกใช้เพื่อระบุขนาดของ
จำกัดชิ้นส่วนบนเจล . โดย
เจล , วิเคราะห์แสงยูวีและความถี่อัลลีล
ได้รับจากการนับโดยตรง
การแปล กรุณารอสักครู่..
