plugs by washing with 1 mL of 0.5 TBE buffer (SigmaeAldrich®,
USA). DNA fragments were resolved in 1% (w/v) pulsed-field
certified agarose (BioShop, Canada) in 0.5 TBE buffer by pulsed
field gel electrophoresis (PFGE) using CHEF-DR III System (Bio-
Rad®, USA). Low range PFG Marker (New England Biolabs, UK) was
used as a molecular size standard. Electrophoresis was performed
for 16 h at 120 included angle. Pulse times ranged from 0.22 s to
17.33 s at a constant voltage of 6 V/cm (Rasschaert et al. 2009). The
agarose gels were stained with ethidium bromide (10 mg/mL,
marka) and visualized under UV light. A digital image was obtained
with Gel Logic 200 Imaging System (Kodak Company, Canada).
NTSYS-pc version 2.2 (Rohlf, 1993) computer software was used for
the cluster analysis of the isolates. The Dice coefficient of similarity
was calculated and comparison of the banding patterns was performed
by the unweighted pair group method with arithmetic
averages (UPGMA) (Sneath & Sokal, 1973).
ปลั๊กซัก 1 ml 0.5 ทีบีบัฟเฟอร์ ( sigmaealdrich ®
, USA ) ชิ้นส่วนดีเอ็นเอที่ถูกแก้ไขใน 1% ( w / v ) การได้รับการรับรองด้าน
, ( bioshop , แคนาดา ) 0.5 ทีบีบัฟเฟอร์โดยวิธีพัล
เจลฟิลด์ ( PFGE ) โดยใช้ระบบ chef-dr III ( Bio - Rad
® , USA ) เครื่องหมายรองช่วงต่ำ ( อังกฤษ biolabs , UK ) คือ
ใช้เป็นโมเลกุลขนาดมาตรฐาน วิธีทํา
16 H ที่ 120 รวมมุม ชีพจรครั้งระหว่าง 0.22 s
s 17.33 แรงดันคงที่ 6 v / cm ( rasschaert et al . 2009 )
( เจลถูกย้อมด้วยสีทิเดียมโบรไมด์ ( 10 mg / ml
Marka ) และภาพภายใต้แสงยูวี ภาพดิจิตอลได้
เจลตรรกะ 200 Imaging System ( บริษัท โกดักประเทศแคนาดา ) .
NTSYS pc รุ่น 2.2 ( rohlf , 1993 ) ซอฟต์แวร์คอมพิวเตอร์ที่ใช้เพื่อ
ส่วนการวิเคราะห์การเกาะกลุ่มของเชื้อ ค่าสัมประสิทธิ์ความเหมือน
ลูกเต๋าถูกคำนวณและเปรียบเทียบรูปแบบของแถบแสดง
โดยกลุ่มคู่วิธีถ่วงน้ำหนักกับค่าเฉลี่ยเลขคณิต
( UPGMA ) ( สเนท& Sokal , 1973 )
การแปล กรุณารอสักครู่..
