Automated ribosomal intergenic spac

Automated ribosomal intergenic spacer analysis
It is a high throughput technique involving PCR amplification
of ribosomal intergenic regions (16S–23S for
archaea and bacteria; 18S–28S for fungi) using a fluorescence
labeled primer (Fisher and Triplett 1999). The
electrophoresis is performed on an automated system
with laser detection of fluorescence DNA fragments
resulting in a complex community-specific banding pattern,
where each band corresponding to at least one
organism in the original community. The differences in
the sizes of amplified intergenic region form the basis
of subtyping of bacterial strains (Larue et al. 2005;
Welkie et al. 2010). Welkie et al. (2010) showed that
bacterial community composition in liquid and solid
phases of same diet fed to dairy cows differed substantially.
Using automated ribosomal intergenic spacer analysis
(ARISA), Pulmonari et al. (2010) revealed that
Megasphaera elsdenii is associated with milk fat depression
in dairy cows where mean pH of rumen content is
6.3–6.33. ARISA was used to elucidate rumen fungi
diversity in cow (Denman et al. 2008; Cheng et al.
2009a, b). In another study, Edwards et al. (2008) used
ARISA for studying the colonization dynamics of anaerobic
fungi on perennial ryegrass.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

อัตโนมัติเป็นตัวเว้นวรรค intergenic ribosomal วิเคราะห์จึงมีอัตราความเร็วสูงเทคนิค PCR ขยายภูมิภาค intergenic ribosomal (16S – 23S สำหรับอาร์เคียและแบคทีเรีย 18S – 28S สำหรับเชื้อรา) ใช้ fluorescence การป้ายรองพื้น (Fisher และ Triplett 1999) ที่ในระบบอัตโนมัติทำ electrophoresisด้วยเลเซอร์ ชิ้นส่วนของดีเอ็นเอ fluorescenceในรูปแบบที่ซับซ้อนเฉพาะชุมชน bandingซึ่งแต่ละวงตรงกับอย่างน้อยหนึ่งสิ่งมีชีวิตในชุมชนเดิม ความแตกต่างในขนาดภาคเอาต์ intergenic เป็นพื้นฐานของลูกผสมสามสายพันธุ์แบคทีเรีย (Larue et al. 2005 ของWelkie et al. 2010) Welkie et al. (2010) พบว่าองค์ประกอบชุมชนแบคทีเรียในของเหลวและของแข็งระยะติดตามนมอาหารเดียวกันแตกต่างมากใช้การวิเคราะห์เป็นตัว intergenic ribosomal อัตโนมัติเว้นวรรค(อาริสา), Pulmonari et al. (2010) การเปิดเผยที่Megasphaera elsdenii ที่สัมพันธ์กับภาวะซึมเศร้าไขมันนมนมที่มีค่า pH เฉลี่ยต่อเนื้อหา6.3-6.33 อาริสาใช้ elucidate ต่อเชื้อราความหลากหลายในวัว (Denman et al. 2008 เฉิง et al2009a, b) ในการศึกษาอื่น เอ็ดเวิร์ด et al. (2008) ใช้อาริสาสำหรับการศึกษาการเปลี่ยนแปลงสนามของที่ไม่ใช้ออกซิเจนเชื้อราบนเพเรนเนียล ryegrass

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

อัตโนมัติโซมวิเคราะห์ spacer intergenic
มันเป็นเทคนิคที่อัตราความเร็วสูงที่เกี่ยวข้องกับการขยาย PCR
ของภูมิภาค intergenic โซม (16S-23S สำหรับ
เคีและแบคทีเรีย; 18S-28S สำหรับเชื้อรา) โดยใช้การเรืองแสง
ไพรเมอร์ที่มีข้อความ (ฟิชเชอร์และ Triplett 1999)
อิเล็กจะดำเนินการในระบบอัตโนมัติ
มีการตรวจสอบเลเซอร์ของดีเอ็นเอเรืองแสง
ที่เกิดขึ้นในชุมชนที่มีความซับซ้อนเฉพาะรูปแบบแถบ
ที่แต่ละวงที่สอดคล้องกับอย่างน้อยหนึ่ง
ชีวิตในชุมชนเดิม ความแตกต่างใน
ขนาดของภูมิภาค intergenic ขยายรูปแบบพื้นฐาน
ของ subtyping ของแบคทีเรีย (Larue, et al. 2005;
Welkie et al, 2010.) Welkie และคณะ (2010) แสดงให้เห็นว่า
องค์ประกอบชุมชนแบคทีเรียในของเหลวและของแข็ง
ขั้นตอนของการรับประทานอาหารที่เดียวกันเลี้ยงโคนมขัดแย้งกันอย่างมีนัยสำคัญ.
โดยใช้การวิเคราะห์ spacer อัตโนมัติโซม intergenic
(อริสา) Pulmonari และคณะ (2010) เปิดเผยว่า
Megasphaera elsdenii มีความสัมพันธ์กับภาวะซึมเศร้าไขมันนม
ในโคนมที่หมายถึงค่าความเป็นกรดในกระเพาะรูเมนของเนื้อหาเป็น
6.3-6.33 อริสาถูกใช้ในการอธิบายในกระเพาะรูเมนเชื้อรา
หลากหลายในวัว (เดนแมน et al, 2008;.. เฉิงและคณะ
2009A b) ในการศึกษาอื่นเอ็ดเวิร์ดและคณะ (2008) ที่ใช้
สำหรับการศึกษาอริสาพลวัตของการล่าอาณานิคมแบบไม่ใช้ออกซิเจน
เชื้อราบน RYEGRASS ยืนต้น

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

โดยอัตโนมัติการวิเคราะห์ spacer ribosomal ส่า
มันเป็นเทคนิคที่เกี่ยวข้องกับการเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอสูง throughput ของภูมิภาค ( 16S ไรโบโซมอล ส่า

อาร์เคียและแบคทีเรียและ 23s สำหรับ ; พบ– 28s สำหรับเชื้อรา ) โดยใช้ fluorescence
ป้ายรองพื้น ( ฟิชเชอร์และ triplett 1999 )
electrophoresis แสดงบนระบบอัตโนมัติ
ด้วยเลเซอร์ตรวจจับดีเอ็นเอ
ฟลูออเรสเซนซ์ส่งผลให้ชุมชนที่ซับซ้อนโดยเฉพาะแถบลาย
ซึ่งแต่ละวงที่ตรงกับอย่างน้อยหนึ่ง
สิ่งมีชีวิตในชุมชนเดิม ความแตกต่างในขนาดของเขตส่า

รูปแบบพื้นฐานของ subtyping สายพันธุ์แบคทีเรียขยาย ( ลารู et al . 2005 ;
welkie et al . 2010 ) welkie et al . ( 2010 ) พบว่าแบคทีเรียในชุมชน

องค์ประกอบของเหลวและของแข็งระยะเดียวกันของอาหารเลี้ยงโคนมกันมาก ใช้ spacer ribosomal ส่าอัตโนมัติ

( ริซ่า ) , การวิเคราะห์ pulmonari et al . ( 2010 ) พบว่า
megasphaera elsdenii เกี่ยวข้องกับ Depression ไขมันนมในโคนมที่หมายความว่าอ

( เนื้อหาทั้งหมด ) 6.33 . ซ่า ถูกใช้เพื่ออธิบายกระบวนการเชื้อรา
ความหลากหลายในวัว ( เดนแมน et al . 2008 ; เฉิง et al .
2009a , B )ในการศึกษาอื่น เอ็ดเวิร์ด et al . ( 2008 ) ใช้
ซ่า เพื่อศึกษาการเปลี่ยนแปลงของเชื้อราแอน
บนไม้ยืนต้น ryegrass .