To determine if our cell line data

To determine if our cell line data were relevant to human
kidney cancers, we next asked whether HIF1α activity is diminished
in human kidney cancers that have sustained 14q
deletions encompassing the HIF1α locus. Toward this end,
we performed gene expression profiling on the cell lines described
above that either expressed both HIF1α and HIF2α
(either naturally or by virtue of induced expression of HIF1α)
or expressed HIF2α alone (either naturally or by virtue of a
HIF1α shRNA), followed by supervised clustering to arrive at
a “HIF1α transcriptional signature,” which included known
HIF1α-specific targets, such as BNIP3, PGK1, HK1, and TPI1
(Fig. 7A; refs. 10, 34). Gene set enrichment analysis (GSEA)
using this HIF1α signature and gene expression data from
52 VHL–/– clear cell renal carcinomas, including 32 without a
HIF1α deletion and 20 with a HIF1α deletion, confirmed that
HIF1α activity is diminished in tumors that have sustained
a 14q deletion spanning the HIF1α locus (P < 0.01; Fig. 7B).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เพื่อตรวจสอบว่าเซลล์ของเราบรรทัดข้อมูลเกี่ยวข้องกับมนุษย์โรคมะเร็งไต เราต่อไปถามว่า กิจกรรม HIF1α จะลดน้อยลงในโรคมะเร็งของคนไตที่มียั่งยืน 14qลบครอบคลุมโลกัสโพล HIF1α จุดสิ้นสุดนี้เราดำเนินการยีนนิพจน์ที่สร้างโพรไฟล์บนบรรทัดเซลล์อธิบายข้างต้นที่ ทั้งแสดงทั้ง HIF1α และ HIF2α(โดยธรรมชาติ หรืออาศัยอำนาจ ตาม HIF1α ชักนำแสดง)หรือแสดง HIF2α เพียงอย่างเดียว (โดยธรรมชาติ หรือโดยจหน้าที่ของการHIF1α shRNA), ตามด้วยการตรวจสอบคลัสเตอร์ที่จะมาถึง ลาย HIF1α transcriptional เซ็น" ซึ่งรวมเรียกว่าเป้าหมายเฉพาะ HIF1α เช่น BNIP3, PGK1, HK1, TPI1(7A รูป แบบ refs. 10, 34) ยีนที่กำหนดวิเคราะห์การเพิ่มคุณค่า (GSEA)การใช้ HIF1α ลายเซ็นและยีนแสดงออกข้อมูลนี้จาก52 VHL – / – ล้างเซลล์มะเร็งไต รวม 32 ไม่มีลบ HIF1α และ 20 ด้วยการลบ HIF1α ยืนยันว่ากิจกรรม HIF1α จะลดน้อยลงในเนื้องอกที่มีอย่างต่อเนื่องการลบ 14q ขยายโลกัสโพล HIF1α (P < 0.01 รูป 7B)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เพื่อตรวจสอบว่าข้อมูลสายพันธุ์ของเซลล์ของเราที่เกี่ยวข้องกับมนุษย์
มะเร็งไตเราถามต่อไปว่ากิจกรรมHIF1αจะลดน้อยลง
ในการเกิดโรคมะเร็งไตของมนุษย์ที่ได้อย่างยั่งยืน 14q
ลบครอบคลุมสถานทีHIF1α ในช่วงท้ายนี้
เราทำโปรไฟล์การแสดงออกของยีนในเซลล์ที่อธิบายไว้
ข้างต้นว่าทั้งแสดงทั้งHIF1αและHIF2α
(ทั้งธรรมชาติหรือโดยอาศัยอำนาจในการแสดงออกการเหนี่ยวนำของHIF1α)
หรือแสดงHIF2αคนเดียว (ทั้งธรรมชาติหรือโดยอาศัย
HIF1α shRNA) ตามมาด้วยการจัดกลุ่มภายใต้การดูแลที่จะมาถึง
เป็น "ลายเซ็นHIF1αถอดรหัส" ซึ่งรวมถึงการที่รู้จักกันใน
เป้าหมายHIF1αเฉพาะเช่น BNIP3, PGK1, HK1 และ TPI1
(รูป 7A. refs 10, 34.) การวิเคราะห์ยีนชุดการเพิ่มปริมาณ (GSEA)
ใช้นี้HIF1αลายเซ็นและยีนข้อมูลการแสดงจาก
52 VHL - / - มือถือที่ชัดเจนมะเร็งไตรวมทั้ง 32 โดยไม่ต้อง
ลบHIF1αและ 20 ที่มีการลบHIF1αยืนยันว่า
กิจกรรมHIF1αจะลดน้อยลงในเนื้องอกที่ได้อย่างยั่งยืน
การลบ 14q ทอดHIF1αสถานที (P <0.01. รูป 7B)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เพื่อตรวจสอบว่าข้อมูลที่เซลล์ของเราที่เกี่ยวข้องกับมนุษย์ไตมะเร็ง เราถามว่า กิจกรรมต่อไปα hif1 จะลดลงในมะเร็งไตของมนุษย์ที่ยั่งยืน 14qลบαความเชื่อด้าน hif1 . ไปยังจุดสิ้นสุดนี้เราแสดงข้อมูลการแสดงออกของยีนในเซลล์อธิบายข้างต้นที่แสดงทั้ง hif1 α hif2 αและ( ทั้งโดยธรรมชาติหรือโดยอาศัยการเหนี่ยวนำการแสดงออกของ hif1 α )หรือแสดง hif2 αคนเดียว ( ทั้งธรรมชาติหรือคุณธรรมของhif1 α shrna ) รองลงมาคือ การแบ่งกลุ่มจะมาถึง" hif1 αลองลายเซ็น " ซึ่งรวมเรียกว่าhif1 แอลฟาเป้าหมายที่เฉพาะเจาะจง เช่น bnip3 pgk1 hk1 tpi1 , , , และ( รูปที่ 68 ; อ้างอิง 10 , 34 ) การวิเคราะห์ยีนชุดเสริม ( gsea )ใช้ hif1 αลายมือชื่อและข้อมูลการแสดงออกของยีนจาก52 ––ชัดเจนต่อการ / มะเร็งเซลล์ไต รวมถึง 32 ไม่มีhif1 αการลบและ 20 กับ hif1 αการลบ , ยืนยันว่ากิจกรรม hif1 αจะลดลงในเนื้องอกที่ยั่งยืนเป็น 14q การลบสแป hif1 αโลคัส ( P < 0.01 ; รูปที่ 7b )