3.2. Phylogenetic analysis of SS in

3.2. Phylogenetic analysis of SS in vertebrates
Based on the previously cloned and newly identified SS precursor
sequences, a phylogenetic tree was constructed. As shown in Fig. 3,
the vertebrate SS precursors are divided into five clades. Each clade
contains some known orthologous genes (Tostivint et al. (2004) and
see below), indicating that phylogenetic analysis could be helpful to
identify the orthologs among SS genes. In this phylogenetic tree, the
elephant shark SS-like precursor is clustered within the SS2 clade.
Because the elephant shark SS2-like precursor is only a partial
sequence precluded in the present phylogenetic analysis, the
clustering of the elephant shark SS-like precursor within the SS2
clade probably indicates that these precursors are more phylogenetically
related to SS2 rather than its orthologous relationship with the
bony fish SS2. The presence of an SS-like precursor in another
cartilaginous fish (little skate) containing [Pro2]SS-14 also supports
the speculation that the shark SS-like gene is likely descended from
SS2.
Adding the sequence data of other members of the SS gene family
(UII or URP) as an out-group makes the sequence data so divergent
that even sequence alignments cannot be performed. Moreover, most
peptide hormone precursors are short and poorly conserved, which
makes phylogenetic tree analysis unsuitable to address the evolutionary
relationships among homologs (Conlon and Larhammar
2005). To reveal the evolutionary history of multiple SS genes
identified in the present study, we further performed genomic
synteny analysis.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

3.2. Phylogenetic analysis of SS in vertebratesBased on the previously cloned and newly identified SS precursorsequences, a phylogenetic tree was constructed. As shown in Fig. 3,the vertebrate SS precursors are divided into five clades. Each cladecontains some known orthologous genes (Tostivint et al. (2004) andsee below), indicating that phylogenetic analysis could be helpful toidentify the orthologs among SS genes. In this phylogenetic tree, theelephant shark SS-like precursor is clustered within the SS2 clade.Because the elephant shark SS2-like precursor is only a partialsequence precluded in the present phylogenetic analysis, theclustering of the elephant shark SS-like precursor within the SS2clade probably indicates that these precursors are more phylogeneticallyrelated to SS2 rather than its orthologous relationship with thebony fish SS2. The presence of an SS-like precursor in anothercartilaginous fish (little skate) containing [Pro2]SS-14 also supportsthe speculation that the shark SS-like gene is likely descended fromSS2.Adding the sequence data of other members of the SS gene family(UII or URP) as an out-group makes the sequence data so divergentthat even sequence alignments cannot be performed. Moreover, mostpeptide hormone precursors are short and poorly conserved, whichmakes phylogenetic tree analysis unsuitable to address the evolutionaryrelationships among homologs (Conlon and Larhammar2005) นี้จะเปิดเผยประวัติวิวัฒนาการของยีน SS หลายพบในการศึกษา เราเพิ่มเติมทำออกsynteny การวิเคราะห์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

3.2 การวิเคราะห์วิวัฒนาการของเอสเอสในสัตว์มีกระดูกสันหลัง
ขึ้นอยู่กับโคลนก่อนหน้านี้และระบุใหม่เอสเอสปูชนียบุคคล
ลำดับต้นสายวิวัฒนาการถูกสร้างขึ้น ดังแสดงในรูป 3
สารตั้งต้นที่เลี้ยงลูกด้วยนมเอสเอสจะถูกแบ่งออกเป็นห้า clades แต่ละ clade
มีบางส่วนยีน orthologous ที่รู้จักกัน (Tostivint et al. (2004) และ
ดูด้านล่าง) แสดงให้เห็นว่าการวิเคราะห์สายวิวัฒนาการอาจจะเป็นประโยชน์ในการ
ระบุ orthologs หมู่ยีนเอสเอส ในต้นไม้สายวิวัฒนาการนี้
ช้างฉลาม SS-เช่นสารตั้งต้นเป็นคลัสเตอร์ภายใน clade SS2.
เพราะฉลามช้าง SS2 เหมือนสารตั้งต้นเป็นเพียงบางส่วน
ลำดับจรรยาบรรณในการวิเคราะห์ phylogenetic ปัจจุบัน
การจัดกลุ่มของสารตั้งต้นช้างฉลาม SS-ต้องการภายใน SS2
clade อาจบ่งชี้ว่าสารตั้งต้นเหล่านี้มี phylogenetically
เกี่ยวข้องกับ SS2 มากกว่าความสัมพันธ์ orthologous กับ
SS2 กระดูกปลา การปรากฏตัวของสารตั้งต้นเอสเอสเหมือนในอีก
กระดูกอ่อนปลา (สเก็ตเล็ก ๆ น้อย ๆ ) ที่มี [Pro2] SS-14 นอกจากนี้ยังสนับสนุน
การเก็งกำไรว่ายีนฉลาม SS-เช่นสืบเชื้อสายมาน่าจะมาจาก
SS2.
เพิ่มลำดับข้อมูลของสมาชิกคนอื่น ๆ ของเอสเอส ครอบครัวยีน
(UII หรือ URP) ในฐานะที่เป็นออกจากกลุ่มทำให้ข้อมูลลำดับที่แตกต่างกันเพื่อให้
เห็นว่าแม้การจัดแนวลำดับไม่สามารถดำเนินการ นอกจากนี้ส่วนใหญ่
สารตั้งต้นของฮอร์โมนเปปไทด์ที่มีระยะสั้นและอนุรักษ์ไม่ดีซึ่ง
จะทำให้การวิเคราะห์ phylogenetic ต้นไม้ที่ไม่เหมาะสมเพื่อรับมือกับวิวัฒนาการ
ความสัมพันธ์ระหว่าง homologs (Conlon และ Larhammar
2005) เผยให้เห็นประวัติศาสตร์วิวัฒนาการของยีนหลายเอสเอส
ที่ระบุไว้ในการศึกษาครั้งนี้เราดำเนินการต่อไปจีโนม
การวิเคราะห์ synteny

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

3.2 . การวิเคราะห์ชนิดของ SS ในสัตว์มีกระดูกสันหลังตามโคลนก่อนหน้านี้และระบุสารตั้งต้นใหม่ SSลําดับ , phylogenetic ต้นไม้ถูกสร้างขึ้น ดังแสดงในรูปที่ 3ในสัตว์มีกระดูกสันหลังตั้งต้น SS จะแบ่งออกเป็นห้า clades . แต่ละ cladeมีบางคนรู้จัก orthologous ยีน ( tostivint et al . ( 2004 ) และดูด้านล่าง ) แสดงว่า ซึ่งอาจเป็นประโยชน์ต่อการวิเคราะห์ระบุ orthologs ระหว่างยีน SS . ต้นไม้ชนิดนี้ช้างฉลาม SS เหมือนสารตั้งต้นต่อใน clade ss2 .เพราะช้างฉลาม ss2 สารตั้งต้นเป็นเพียงบางส่วนเช่นลำดับลบในการวิเคราะห์ ซึ่งปัจจุบันการจัดกลุ่มของช้าง เช่น สารตั้งต้นใน ss2 ฉลาม SSclade อาจบ่งชี้ว่า สารเหล่านี้จะ phylogeneticallyที่เกี่ยวข้องกับ ss2 มากกว่าความสัมพันธ์ orthologous กับกระดูกปลา ss2 . การปรากฏตัวของ SS เป็นสารตั้งต้นในอีกปลากระดูกอ่อน ( เจ้ากระเบนน้อย ) ที่มี [ ] ss-14 Pro2 ยังรองรับเก็งกําไรว่าฉลาม SS อย่างจีน น่าจะสืบเชื้อสายมาจากss2 .เพิ่มลำดับข้อมูลของสมาชิกคนอื่น ๆของครอบครัวของ SS( uii หรือ urp ) เป็นกลุ่มให้ข้อมูลลำดับลู่ออกดังนั้นที่แม้แต่ลำดับ การไม่สามารถแสดง นอกจากนี้ มากที่สุดเปปไทด์ฮอร์โมนสารตั้งต้นจะสั้น และงานอนุรักษ์ ซึ่งทำให้การวิเคราะห์ phylogenetic ต้นไม้ที่ไม่เหมาะสมในวิวัฒนาการความสัมพันธ์ระหว่างโฮโมลอกส์ ( larhammar คอลลอน และ2005 ) เผยประวัติวิวัฒนาการของยีนหลาย SSที่ระบุไว้ในการศึกษาปัจจุบัน เรายังดำเนินการจีโนมการวิเคราะห์ synteny .