Proteomics efforts with G. sulfurre

Proteomics efforts with G. sulfurrenducens complement other projects under the DOE Microbial Genome Program and have focused on creating a database of characteristic peptide mass and elution time tags, which serve as unique 2D markers for subsequent peptide identifications. This collaborative effort with Derek Lovely and the Geobacter project (www.geobactor.org) has produced initial global protein determinations with protein expression in most functional categories assigned by The Institute for Genome Research (TIGR). Thus far, quantitative analyses of protein expression patterns in Geobacter have been derived only by using an absolute peak intensity method. Characterization of the multiple cytochrome proteins in the organism has shown interesting changes in these proteins when they are exposed to different electron acceptors. Additionally, extension of these studies to protein expression pattern clustering is revealing interesting trends in protein expression as a result of the variation in solubility among the electron acceptor.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ความพยายามของรตีโอมิกส์กับ G. sulfurrenducens เสริมโครงการอื่น ๆ ภายใต้โปรแกรม DOE พันธุจุลินทรีย์ และเน้นการสร้างฐานข้อมูลของเพปไทด์ลักษณะมวลและชะเวลาแท็ก ซึ่งเป็นเครื่องหมาย 2D ไม่ซ้ำสำหรับรหัสเปปไทด์ตามมา ความพยายามนี้ร่วมกัน ด้วยน่ารักดีและโครงการ Geobacter (www.geobactor.org) มีผลิตการวิเคราะห์ปริมาณโปรตีนทั่วโลกเริ่มต้น ด้วยโปรตีนประเภทสุดการทำงานที่กำหนด โดยสถาบันที่สำหรับวิจัยพันธุ (TIGR) ป่านนี้ วิเคราะห์เชิงปริมาณของโปรตีนรูปแบบนิพจน์ใน Geobacter ได้รับมาเท่านั้น โดยใช้วิธีการความเข้มสูงสุดสัมบูรณ์ คุณลักษณะของโปรตีนเจาะจงหลายในชีวิตได้แสดงการเปลี่ยนแปลงที่น่าสนใจในโปรตีนเหล่านี้เมื่อพวกเขากำลังเผชิญกับ acceptors อิเล็กตรอนแตกต่างกัน นอกจากนี้ ส่วนขยายเหล่านี้ศึกษารูปแบบการแสดงออกโปรตีนคลัสเตอร์จะเปิดเผยแนวโน้มที่น่าสนใจในการแสดงออกของโปรตีนเป็นผลมาจากการเปลี่ยนแปลงในละลายในกลุ่มให้เป็นผู้รับอิเล็กตรอน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ความพยายามของโปรตีนที่มีจี sulfurrenducens เสริมโครงการอื่น ๆ ภายใต้ DOE จุลินทรีย์โครงการจีโนมและมีการมุ่งเน้นการสร้างฐานข้อมูลของมวลเปปไทด์และแท็กชะเวลาลักษณะที่ให้บริการเครื่องหมาย 2D เป็นเอกลักษณ์สำหรับการระบุเปปไทด์ที่ตามมา นี้ความพยายามร่วมกันกับดีเร็กน่ารักและโครงการ Geobacter นี้ (www.geobactor.org) มีการผลิตเริ่มต้นหาความโปรตีนระดับโลกที่มีการแสดงออกของโปรตีนในประเภทส่วนใหญ่ทำงานได้รับมอบหมายจากสถาบันจีโนมการวิจัย (TIGR) ป่านนี้วิเคราะห์เชิงปริมาณของรูปแบบการแสดงออกของโปรตีนใน Geobacter ได้รับมาโดยใช้วิธีการที่รุนแรงแน่นอนสูงสุดเท่านั้น ลักษณะของโปรตีน cytochrome หลายในชีวิตที่ได้แสดงให้เห็นการเปลี่ยนแปลงที่น่าสนใจในโปรตีนเหล่านี้เมื่อพวกเขากำลังเผชิญกับตัวรับอิเล็กตรอนที่แตกต่างกัน นอกจากนี้การขยายตัวของการศึกษาเหล่านี้โปรตีนรูปแบบการแสดงออกการจัดกลุ่มจะเผยให้เห็นแนวโน้มที่น่าสนใจในการแสดงออกของโปรตีนเป็นผลมาจากการเปลี่ยนแปลงในการละลายในหมู่ตัวรับอิเล็กตรอน