The approaches for discriminating b

The approaches for discriminating between non-coding and coding sequences resemble the methods for gene discovery in genomic sequences. They are based on either similarity to known coding sequences or the statistics of codon frequencies specific to each organism. Similarity to known coding sequences is detected by using tools for homology search, typically BLASTX [6]. It should be noted that the existence of even a short functional segment of peptides (motifs) supports the
identification of the transcript as coding. For novel lncRNAs, however, we cannot always expect conservation between species. The simplest way that does not rely on phylogenetic conservation is to check whether there is a long open reading frame (ORF) where no stop codon appears. However, it is necessary to evaluate any candidate segments more carefully because there are short ORFs that encode functional peptides [7].

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

วิธีการเหยียดพวกผิวระหว่างลำดับไม่มีการเข้ารหัส และเข้ารหัสมีลักษณะวิธีการสำหรับการค้นพบยีนในลำดับออก พวกเขาจะตามลำดับอักษรรู้จักทั้งคลึงหรือสถิติความถี่รหัสพันธุกรรมเฉพาะของแต่ละชีวิต มีการตรวจพบความคล้ายคลึงกับลำดับอักษรที่รู้จักกัน โดยใช้เครื่องมือสำหรับค้นหา homology, BLASTX โดยทั่วไป [6] ควรสังเกตว่า การดำรงอยู่ของแม้งานส่วนสั้น ๆ ของเปปไทด์ (ลาย) รองรับการรหัสรายงานผลการศึกษาเป็นการเขียนโค้ด สำหรับนวนิยาย lncRNAs อย่างไรก็ตาม เราไม่สามารถเสมอคาดว่าอนุรักษ์ระหว่างพันธุ์ วิธีที่ง่ายที่สุดที่ไม่พึ่งพาทางการอนุรักษ์คือการ ตรวจสอบว่า มีเฟรมยาวเปิดอ่าน (ORF) ที่ไม่มีรหัสพันธุกรรมหยุดปรากฏ อย่างไรก็ตาม ก็จำเป็นในการประเมินใด ๆ ผู้สมัครเพิ่มเติมอย่างระมัดระวังเนื่องจากมี ORFs สั้นที่เข้ารหัสเปปไทด์ทำงาน [7]

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

แนวทางสำหรับการแบ่งแยกระหว่างที่ไม่ใช่การเข้ารหัสและการลำดับการเขียนโปรแกรมมีลักษณะคล้ายกับวิธีการสำหรับการค้นพบยีนในลำดับจีโนม พวกเขาจะอยู่บนพื้นฐานของความคล้ายคลึงกันทั้งที่มีลำดับการถอดรหัสที่รู้จักกันหรือสถิติของความถี่ codon เฉพาะแต่ละชีวิต ความคล้ายคลึงกันในการลำดับการเข้ารหัสที่รู้จักกันจะถูกตรวจสอบโดยใช้เครื่องมือสำหรับการค้นหาที่คล้ายคลึงกันโดยทั่วไป BLASTX [6] มันควรจะตั้งข้อสังเกตว่าการดำรงอยู่ของแม้ส่วนการทำงานสั้น ๆ ของเปปไทด์ (ลวดลาย) สนับสนุน
บัตรประจำตัวของหลักฐานการเข้ารหัส สำหรับ lncRNAs นวนิยาย แต่เราไม่สามารถมักจะคาดหวังการอนุรักษ์ระหว่างเผ่าพันธุ์ วิธีที่ง่ายที่สุดที่ไม่ต้องพึ่งพาการอนุรักษ์สายวิวัฒนาการคือการตรวจสอบว่ามีกรอบเปิดอ่านยาว (ORF) ที่ไม่มีหยุด codon ปรากฏ แต่ก็เป็นสิ่งที่จำเป็นในการประเมินกลุ่มผู้สมัครใด ๆ อย่างระมัดระวังมากขึ้นเพราะมี ORFs สั้น ๆ ที่เข้ารหัสเปปไทด์ทำงาน [7]

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

แนวทางที่ไม่แบ่งแยกระหว่างการเข้ารหัสและการเข้ารหัสลำดับคล้ายกับวิธีการสำหรับการค้นหายีนในจีโนมลำดับดีเอ็นเอ พวกเขาจะตามให้เหมือนกันนะครับ ลำดับ หรือสถิติของความถี่ที่เฉพาะเจาะจงกับแต่ละสิ่งมีชีวิต codon . เหมือนรู้จักกันนะครับ ) ถูกตรวจพบโดยการใช้เครื่องมือค้นหาที่มี โดยปกติ blastx [ 6 ] มันควรจะสังเกตว่ามีแม้สั้นการทำงานส่วนของเปปไทด์ ( ลวดลาย ) สนับสนุนการบันทึกโดยการเข้ารหัส สำหรับ lncrnas นวนิยาย อย่างไรก็ตาม เราไม่สามารถคาดหวังอนุรักษ์ระหว่างสปีชีส์ วิธีที่ง่ายที่สุดที่ไม่ต้องพึ่งพาการอนุรักษ์ ซึ่งคือการตรวจสอบว่ามีการเปิดกรอบ ( ORF ) ที่ไม่มีรหัสหยุดจะปรากฏขึ้น แต่มันเป็นสิ่งที่จำเป็นเพื่อประเมินผู้สมัครใด ๆส่วนอย่างระมัดระวังมากขึ้นเนื่องจากมีสั้น orfs ที่เข้ารหัสหน้าที่เปปไทด์ [ 7 ]