3.2. Molecular analysisThe ITS-1 an

3.2. Molecular analysis
The ITS-1 and -2 regions of the rDNA of strain SS10 was successfully amplified by PCR, with the expected fragment sizes of 500 bp. After sequencing the PCR product, the newly identi- fied sequence was deposited into the GenBank database under the following Accession No. HQ401273. A BLAST search against the GenBank or proprietary fungal DNA databases
showed that the rDNA sequence of strain SS10 showed 99% similarity with a 603-bp ITS region of A. niger. A phylogenetic relationship was established through the alignment and cladistic analysis of homologous nucleotide sequences among these fungal species (Fig. 1). Strain SS10 was shown to be the closest to the genus Aspergillus. According to this phylogenetic analysis, strain SS10 was classified under the genus Aspergillus as a variant of Aspergillus niger

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

3.2. โมเลกุลวิเคราะห์ของ-1 และ-2 ภูมิภาคของ rDNA ของต้องใช้ SS10 สำเร็จได้ถูกขยาย โดย PCR มีขนาดส่วนที่คาดไว้ของ 500 bp หลังจากลำดับเบสผลิตภัณฑ์ PCR เพิ่งถูกฝากลำดับ identi ฟองลงในฐานข้อมูลของ GenBank ภายใต้หมายเลขทะเบียนดังต่อไปนี้ HQ401273 การค้นหาระเบิดกับ GenBank หรือฐานข้อมูล DNA เชื้อราเป็นกรรมสิทธิ์พบว่าลำดับ rDNA ของต้องใช้ SS10 พบ 99% คล้ายคลึงกับภูมิภาคของ 603 bp ของไนเจอร์อ. ความสัมพันธ์ phylogenetic ก่อตั้งขึ้น โดยตำแหน่งและวิเคราะห์ cladistic ลำดับนิวคลีโอไทด์ที่ homologous ระหว่างสายพันธุ์เชื้อราเหล่านี้ (Fig. 1) ต้องใช้ SS10 ที่แสดงจะ ใกล้เคียงกับสกุล Aspergillus ตามวิเคราะห์นี้ phylogenetic ต้องใช้ SS10 ถูกจัดภายใต้สกุล Aspergillus เป็นตัวแปรของ Aspergillus ไนเจอร์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

3.2 การวิเคราะห์โมเลกุลของมัน-1 -2 และภูมิภาคของ rDNA ของสายพันธุ์ SS10 ถูกขยายประสบความสำเร็จโดยวิธี PCR ที่มีขนาดชิ้นส่วนที่คาดหวังของ 500 bp
หลังจากลำดับผลิตภัณฑ์ PCR, ใหม่บ่งลำดับกระแสไฟถูกวางลงในฐานข้อมูล GenBank ภายใต้การดังต่อไปนี้เลข HQ401273 ค้นหากับระเบิด GenBank
หรือเป็นเจ้าของฐานข้อมูลดีเอ็นเอของเชื้อราพบว่าลำดับrDNA ของสายพันธุ์ SS10 แสดงให้เห็นความคล้ายคลึงกัน 99% กับ 603 bp-ภูมิภาคของไนเจอร์เอ ความสัมพันธ์ phylogenetic ก่อตั้งขึ้นผ่านการจัดตำแหน่งและการวิเคราะห์ cladistic ของลำดับเบสคล้ายคลึงกันในหมู่สายพันธุ์เชื้อราเหล่านี้ (รูปที่ 1). สายพันธุ์ SS10 ถูกแสดงให้เห็นว่าใกล้เคียงกับสกุล Aspergillus ตามการวิเคราะห์สายวิวัฒนาการนี้ความเครียด SS10 ถูกจัดอยู่ในสกุล Aspergillus เป็นตัวแปรของเชื้อรา Aspergillus ไนเจอร์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

3.2 . การวิเคราะห์ระดับโมเลกุลและ its-1
- 2 ภูมิภาคของ rDNA ของ ss10 ความเครียดได้โดยขยาย PCR ด้วยคาดว่าชิ้นส่วนขนาด 500 BP . หลังจากการจัดลำดับผลิตภัณฑ์ PCR , identi ใหม่ fied ลำดับฝากเข้าไปพบฐานข้อมูลภายใต้การไม่ hq401273 ดังต่อไปนี้ ระเบิดค้นหากับขนาดหรือเป็นกรรมสิทธิ์ของดีเอ็นเอฐานข้อมูล
พบว่าลำดับของสายพันธุ์ ss10 rDNA พบ 99 % ความเหมือนกับ 603 ภูมิภาคของ A . niger BP . ความสัมพันธ์ ซึ่งถูกจัดตั้งขึ้นโดยการเปรียบเทียบและการวิเคราะห์ลำดับนิวคลีโอไทด์ของ cladistic ระหว่างชนิดของเชื้อราเหล่านี้ ( รูปที่ 1 ) ss10 สายพันธุ์เป็นใกล้กุล Aspergillus . ตามการวิเคราะห์ phylogenetic เช่นนี้ss10 สายพันธุ์จัดอยู่ในจีนัสเป็นตัวแปรของเชื้อ Aspergillus niger