AbstractBackground: Phasianidae is

Abstract
Background: Phasianidae is a family of Galliformes containing 38 genera and approximately 138 species, which is
grouped into two tribes based on their morphological features, the Pheasants and Partridges. Several studies have
attempted to reconstruct the phylogenetic relationships of the Phasianidae, but many questions still remain
unaddressed, such as the taxonomic status and phylogenetic relationships among Crossoptilon species. The
mitochondrial genome (mitogenome) has been extensively used to infer avian genetic diversification with
reasonable resolution. Here, we sequenced the entire mitogenomes of three Crossoptilon species (C. harmani,
C. mantchuricum and C. crossoptilon) to investigate their evolutionary relationship among Crossoptilon species.
Results: The complete mitogenomes of C. harmani, C. mantchuricum and C. crossoptilon are 16682 bp, 16690 bp
and 16680 bp in length, respectively, encoding a standard set of 13 protein-coding genes, 2 ribosomal RNA genes,
22 transfer RNA genes, and a putative control region. C. auritum and C. mantchuricum are more closely related
genetically, whereas C. harmani is more closely related to C. crossoptilon. Crossoptilon has a closer relationship with
Lophura, and the following phylogenetic relationship was reconstructed: ((Crossoptilon + Lophura) + (Phasianus +
Chrysolophus)). The divergence time between the clades C. harmani-C. crossoptilon and C. mantchuricum-C. auritum
is consistent with the uplift of the Tibetan Plateau during the Tertiary Pliocene. The Ka/Ks analysis showed that atp8
gene in the Crossoptilon likely experienced a strong selective pressure in adaptation to the plateau environment.
Conclusions: C. auritum with C. mantchuricum and C. harmani with C. crossoptilon form two pairs of sister groups.
The genetic distance between C. harmani and C. crossoptilon is far less than the interspecific distance and is close to
the intraspecific distance of Crossoptilon, indicating that C. harmani is much more closely related to C. crossoptilon. Our
mito-phylogenomic analysis supports the monophyly of Crossoptilon and its closer relationship with Lophura. The
uplift of Tibetan Plateau is suggested to impact the divergence between C. harmani-C. crossoptilon clade and
C. mantchuricum-C. auritum clade during the Tertiary Pliocene. Atp8 gene in the Crossoptilon species might have
experienced a strong selective pressure for adaptation to the plateau environment.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

บทคัดย่อพื้นหลัง: นกกระทาเป็นครอบครัวของฟรอมส์มี 38 สกุลและประมาณ 138 สายพันธุ์ซึ่งเป็นแบ่งออกเป็นสองชนเผ่าตามลักษณะทางสัณฐานวิทยาของพวกเขาไก่ฟ้าและPartridges มีงานวิจัยหลายความพยายามที่จะสร้างความสัมพันธ์ที่สายวิวัฒนาการของนกกระทา แต่คำถามมากมายที่ยังคง unaddressed เช่นสถานะการจัดหมวดหมู่และความสัมพันธ์ในหมู่สายวิวัฒนาการสายพันธุ์ Crossoptilon จีโนมยล (mitogenome) ได้ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในการสรุปความหลากหลายทางพันธุกรรมของนกที่มีความละเอียดที่เหมาะสม ที่นี่เราติดใจ mitogenomes ทั้งสามชนิด Crossoptilon (ค Harmani, ซี mantchuricum และ C crossoptilon) เพื่อศึกษาความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการของพวกเขาในหมู่สายพันธุ์ Crossoptilon. ผลการ mitogenomes สมบูรณ์ของซี Harmani ซี mantchuricum และ C crossoptilon มี bp 16682, 16690 bp และ 16,680 bp ในความยาวตามลำดับการเข้ารหัสชุดมาตรฐานของ 13 ยีนโปรตีนเข้ารหัส 2 โซมอลยีน RNA, 22 การถ่ายโอนยีน RNA และเขตควบคุมสมมุติ ซี auritum และ C mantchuricum จะเพิ่มเติมเกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดทางพันธุกรรมในขณะที่ซีHarmani มีความสัมพันธ์อย่างใกล้ชิดกับซี crossoptilon Crossoptilon มีความสัมพันธ์ใกล้ชิดกับLophura และความสัมพันธ์ของสายวิวัฒนาการต่อไปนี้ถูกสร้างขึ้น: ((+ Crossoptilon Lophura) + (+ Phasianus Chrysolophus)) เวลาที่แตกต่างระหว่าง clades ซี Harmani-C crossoptilon และ C-C mantchuricum auritum มีความสอดคล้องกับการยกของที่ราบสูงธิเบตในช่วงตติย Pliocene กา / การวิเคราะห์แสดงให้เห็นว่า Ks atp8 ยีนใน Crossoptilon มีแนวโน้มประสบความดันเลือกที่แข็งแกร่งในการปรับตัวเข้ากับสภาพแวดล้อมที่ราบสูง. สรุป: ค. auritum กับซี mantchuricum และ C Harmani กับรูปแบบ crossoptilon ซีคู่ที่สองของกลุ่มน้องสาวระยะทางพันธุกรรมระหว่างซี Harmani และ C crossoptilon อยู่ไกลน้อยกว่าระยะทางข้ามและอยู่ใกล้กับระยะทางที่สำนวนของCrossoptilon แสดงให้เห็นว่าซี Harmani อื่น ๆ อีกมากมายที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับซี crossoptilon เราวิเคราะห์โตะ-phylogenomic สนับสนุน monophyly ของ Crossoptilon และความสัมพันธ์ที่ใกล้ชิดกับ Lophura ยกของที่ราบสูงทิเบตเป็นข้อเสนอแนะที่จะส่งผลกระทบต่อความแตกต่างระหว่างซี Harmani-ซี clade crossoptilon และซี mantchuricum-C auritum clade ช่วงตติย Pliocene ยีน Atp8 ในสายพันธุ์ Crossoptilon อาจจะมีประสบการณ์ความดันเลือกที่แข็งแกร่งสำหรับการปรับตัวเข้ากับสภาพแวดล้อมที่ราบสูง