The dahlia isolate of potato spindle tuber viroid (PSTVd) accumulates slowly and induces mild disease symptoms in tomato (Solanum lycopersicum, cv. Rutgers) plants in contrast to the intermediate isolate (PSTVd-I). The dahlia isolate (PSTVd-D) differs from PSTVd-I in eight locations: 42 and 43 in the terminal left (TL); 64/65, 311, and 312/313 in the pathogenicity (P); 118 and 126 in the variable (V); and 201 in the terminal right (TR) domains. To investigate the molecular determinants in the PSTVd-D genome responsible for the attenuation of symptom severity and lower replication/accumulation in tomato plants, a series of mutants between PSTVd-D and PSTVd-I were constructed by focusing first on the mutations in the TL and P domains in the left-hand half of the molecule. Then, more detailed analysis was performed on the three mutations at positions 118, 126, and 201 in the V and TR domains. One of these mutations is located around the boundary of the right border of the RY-motif, a predicted recognition site of Virp1, a viroid-binding protein. Of 14 mutants (seven based on PSTVd-D and the other seven based on PSTVd-I) examined, 11 propagated stably and three lost infectivity. Mutations in the TL and P domains (42U, 43C, 310U/C, and U or UU insertion to 311/312 in PSTVd mild types) majorly influenced the expression of mild-like symptoms. In contrast, when each of the mutations at 118, 126, and 201 in the V and TR domains were exchanged independently, they minimally influenced systemic accumulation and symptom expression. Mutants based on PSTVd-D with PSTVd-I-type mutations at nucleotide positions 118, 126, and/or 201 showed mild symptoms similar to PSTVd-D, but their systemic accumulation was a little faster than PSTVd-D. In contrast, mutants based on PSTVd-I with PSTVd-D-type mutations at 118, 126, and/or 201 nucleotide positions showed severe symptoms similar to PSTVd-I, and the systemic accumulation was similar to or a little slower than PSTVd-I. The nucleotide at position 201 could be changed to U, G, or A, but C was not acceptable for replication. Because introduction of C at the position 201 can change the loop structure at the right boundary of the RY-motif’s consensus sequence, the loop structure may influence recognition by Virp1.
โปรตีนดอกรักเร่ของแกนมันหัวไวรอยด์ (PSTVd) สะสมช้าลง และก่อให้เกิดอาการของโรครุนแรงในมะเขือ (Solanum lycopersicum พันธุ์รัทเนอร์) พืชตรงข้ามกับโปรตีนปานกลาง (PSTVd-ฉัน) ดอกรักเร่โปรตีน (PSTVd-D) แตกต่างจาก PSTVd-ฉันที่แปด: 42 และ 43 ในขั้วซ้าย (TL); 64/65, 311 และ 312/313 pathogenicity อยู่ (P); 118 และ 126 ตัวแปร (V); และ 201 ในโดนัลขวา (TR) ตรวจสอบดีเทอร์มิแนนต์โมเลกุลในจีโน PSTVd D ผิดชอบในการลดทอนความรุนแรงของอาการและจำลองแบบล่างรวบรวมในมะเขือเทศพืช ชุดของการกลายพันธุ์ระหว่าง PSTVd และ PSTVd-D-ฉันถูกสร้างขึ้น โดยครั้งแรกเน้นพันธุ์ในโดเมน TL และ P ครึ่งซ้ายของโมเลกุล จากนั้น ทำวิเคราะห์เพิ่มเติมในพันธุ์สามที่ตำแหน่ง 118, 126 และ 201 ในโดเมน V และ TR พันธุ์เหล่านี้อย่างใดอย่างหนึ่งคือบริเวณขอบเขตของเส้นขอบขวาของลี่ลาย Virp1 โปรตีนรวมไวรอยด์ในไซต์การคาดการณ์ ของสายพันธุ์ 14 (เจ็ดตาม PSTVd-D และอื่น ๆ เจ็ดตาม PSTVd-ฉัน) ตรวจสอบ 11 สามารถแพร่กระจาย และสามหาย infectivity Majorly ในโดเมน TL และ P (42U, 43C, 310U/C และ U หรือ UU แทรกการ 311/312 PSTVd อ่อนประเภท) ได้รับอิทธิพลการแสดงอาการเล็กน้อยเช่น คมชัด เมื่อแต่ละพันธุ์ที่ 118, 126 และ 201 ในโดเมน V และ TR แลกเปลี่ยนอย่างอิสระ พวกเขา minimally ผลระบบสะสมและอาการการแสดงออก การกลายพันธุ์ตาม PSTVd-D กับ PSTVd-ฉันชนิดกลายพันธุ์ที่ตำแหน่งนิวคลีโอไทด์ 118, 126 หรือ 201 แสดงอาการไม่รุนแรงคล้ายคลึงกับ PSTVd-D แต่สะสมของระบบได้เร็วน้อยกว่า PSTVd D. คมชัด การกลายพันธุ์ตาม PSTVd-ด้วยกลายพันธุ์ชนิด PSTVd D 118, 126 หรือตำแหน่งนิวคลีโอไทด์ 201 แสดงอาการรุนแรงคล้ายคลึงกับ PSTVd-ผม และการสะสมระบบถูกคล้ายกับ หรือช้าน้อยกว่า PSTVd-ฉัน นิวคลีโอไทด์ที่ตำแหน่ง 201 สามารถเปลี่ยนเป็น U, G หรือ A แต่ C ไม่สามารถยอมรับได้สำหรับการจำลองแบบ เนื่องจากการแนะนำของ C ที่ตำแหน่ง 201 สามารถเปลี่ยนโครงสร้างการวนรอบที่ขอบด้านขวาของลำดับฉันทามติของลี่ลาย โครงสร้างการวนรอบอาจมีผลต่อการรับรู้ โดย Virp1
การแปล กรุณารอสักครู่..
![](//thimg.ilovetranslation.com/pic/loading_3.gif?v=b9814dd30c1d7c59_8619)
เชื้อรักเร่มันฝรั่งแกนหัวไวรอยด์ (PSTVd) สะสมอย่างช้า ๆ และก่อให้เกิดอาการของโรคที่ไม่รุนแรงในมะเขือเทศ (Solanum lycopersicum, CV. รัท) พืชในทางตรงกันข้ามกับแยกกลาง (PSTVd-I) รักเร่แยก (PSTVd-D) แตกต่างจาก PSTVd-I ในแปดสถานที่: 42 และ 43 ในด้านซ้ายขั้ว (TL); 64/65, 311, และ 312/313 ในการทำให้เกิดโรค (P); 118 และ 126 ในตัวแปร (V); และ 201 ในขั้วขวา (TR) โดเมน เพื่อศึกษาปัจจัยโมเลกุลใน PSTVd-D จีโนมรับผิดชอบในการลดทอนความรุนแรงของอาการและการจำลองแบบต่ำ / สะสมในพืชมะเขือเทศชุดของการกลายพันธุ์ระหว่าง PSTVd-D และ PSTVd ฉันถูกสร้างขึ้นโดยมุ่งเน้นเป็นครั้งแรกในการกลายพันธุ์ใน TL และโดเมน P ในช่วงครึ่งซ้ายมือของโมเลกุล จากนั้นการวิเคราะห์รายละเอียดเพิ่มเติมได้ดำเนินการในสามกลายพันธุ์ที่ตำแหน่ง 118, 126 และ 201 ใน V และ TR โดเมน หนึ่งของการกลายพันธุ์เหล่านี้จะตั้งอยู่รอบเขตแดนของเส้นขอบด้านขวาของ RY-บรรทัดฐานเว็บไซต์การรับรู้การคาดการณ์ของ Virp1 เป็นโปรตีนไวรอยด์-ผูกพัน 14 กลายพันธุ์ (เจ็ดอยู่บนพื้นฐานของ PSTVd-D และอื่น ๆ ที่อยู่บนพื้นฐานของเจ็ด PSTVd-I) การตรวจสอบ 11 แพร่กระจายเสถียรและสามหายไปการติดเชื้อ การกลายพันธุ์ใน TL และ P โดเมน (42U, 43C, 310U / C และ U หรือ UU แทรกเพื่อ 311/312 ใน PSTVd ชนิดอ่อน) อิทธิพล majorly การแสดงออกของอาการไม่รุนแรงเหมือน ในทางตรงกันข้ามเมื่อแต่ละของการกลายพันธุ์ที่ 118, 126, และ 201 V และ TR โดเมนที่มีการแลกเปลี่ยนความอิสระที่พวกเขาได้รับอิทธิพลน้อยที่สุดระบบการสะสมและการแสดงออกอาการ การกลายพันธุ์ขึ้นอยู่กับ PSTVd-D ที่มีการกลายพันธุ์ PSTVd-I-ประเภทที่เบื่อหน่ายตำแหน่ง 118, 126, และ / หรือ 201 แสดงให้เห็นว่าอาการไม่รุนแรงคล้ายกับ PSTVd-D แต่ระบบการสะสมของพวกเขาเป็นเพียงเล็กน้อยเร็วกว่า PSTVd-D ในทางตรงกันข้ามการกลายพันธุ์ขึ้นอยู่กับ PSTVd-I กับการกลายพันธุ์ PSTVd-D-ประเภทที่ 118, 126 และ / หรือ 201 ตำแหน่งเบสแสดงให้เห็นอาการรุนแรงคล้ายกับ PSTVd-I และการสะสมของระบบก็คล้ายคลึงกับหรือน้อยช้ากว่า PSTVd- ผม. เบื่อหน่ายที่ตำแหน่ง 201 อาจมีการเปลี่ยนแปลงไป U, G, หรือ A, C แต่ก็ไม่ได้รับการยอมรับสำหรับการจำลองแบบ เพราะการแนะนำของ C ที่ตำแหน่ง 201 สามารถเปลี่ยนโครงสร้างวงในขอบเขตที่เหมาะสมของลำดับฉันทามติ RY-บรรทัดฐานของโครงสร้างห่วงอาจมีอิทธิพลต่อการรับรู้โดย Virp1
การแปล กรุณารอสักครู่..
![](//thimg.ilovetranslation.com/pic/loading_3.gif?v=b9814dd30c1d7c59_8619)
การแยกของแกน รักเร่มันฝรั่งหัวไวรอยด์ ( pstvd ) สะสมช้า และก่อให้เกิดอาการของโรคไม่รุนแรง ในมะเขือเทศ ( ไม่สามารถจะยอมรับได้ lycopersicum CV . รัท ) พืชในทางตรงกันข้ามกับกลางแยก ( pstvd-i ) ส่วนรักเร่แยก ( pstvd-d ) แตกต่างจาก pstvd-i ในแปดที่ตั้ง : 42 และ 43 ในขั้วซ้าย ( TL ) ; 64 / 65 , 311 และ 312 / 313 ในการก่อโรค ( P ) ; และ 126 ในตัวแปร ( V ) และ 201 ในขั้วขวา ( TR ) โดเมน เพื่อศึกษาปัจจัยที่มีผลต่อระดับโมเลกุลใน pstvd-d จีโนมที่รับผิดชอบในการลดความรุนแรงของอาการ และการทำซ้ำ / สะสมในพืชมะเขือเทศ , ชุดของมนุษย์กลายพันธุ์และระหว่าง pstvd-d pstvd-i ถูกสร้างโดยเน้นเป็นครั้งแรกในการกลายพันธุ์ใน TL และโดเมนในครึ่งซ้ายของโมเลกุล จากนั้นวิเคราะห์รายละเอียดเพิ่มเติมได้บนสามการกลายพันธุ์ที่ตำแหน่ง 118 , 126 , 201 ใน V และ TR โดเมน หนึ่งของการกลายพันธุ์เหล่านี้ตั้งอยู่บริเวณแนวชายแดนด้านขวาของแม่ลาย ry , ทำนายการยอมรับเว็บไซต์ของ virp1 , ไวรอยด์ผูกพันโปรตีน 14 สายพันธุ์ ( เจ็ดตาม pstvd-d และอีกเจ็ดตาม pstvd-i ) ตรวจ 11 ไปอย่างถาวร และสามหายไปการติดเชื้อ . การกลายพันธุ์ใน TL และ P ( 42u 43c 310u , โดเมน , / C และ U หรือสหรัฐอเมริกาแทรกถึง 311 / 312 ใน pstvd ชนิดอ่อน ) majorly มีอิทธิพลต่อการแสดงออกของอ่อน เช่นอาการ ในทางตรงกันข้าม เมื่อแต่ละของการกลายพันธุ์ที่ 118 , 126 , 201 ใน V และ TR โดเมนมีการแลกเปลี่ยนอย่างอิสระ พวกเขามีอิทธิพลต่อการสะสมทั่วร่างกายและการแสดงออกต่ออาการของโรค กลายพันธุ์จาก pstvd-d กับ pstvd-i-type การกลายพันธุ์ที่ตำแหน่งนิวคลีโอไทด์ 118 , 126 , และ / หรือ 201 แสดงอาการไม่รุนแรงเหมือน pstvd-d แต่ระบบของพวกเขาคือการสะสมเล็กน้อยเร็วกว่า pstvd-d. ในทางตรงกันข้ามการกลายพันธุ์ตาม pstvd-i กับ pstvd-d-type การกลายพันธุ์ที่ 118 , 126 , และ / หรือนิวคลีโอไทด์ 201 ตำแหน่งแสดงอาการรุนแรงคล้ายกับ pstvd-i , และ การสะสมระบบคล้ายกับหรือช้าลงเล็กน้อยกว่า pstvd-i. มีนิวคลีโอไทด์ที่ตำแหน่ง 201 จะเปลี่ยน u , G , หรือ , แต่ C ยังไม่เป็นที่ยอมรับสำหรับการทำซ้ำ เพราะตัว C ที่ตำแหน่ง 201 สามารถเปลี่ยนแปลงโครงสร้างห่วงที่ขอบขวาของ Consensus ลำดับ ry แม่ลาย , โครงสร้างวงอาจจะมีอิทธิพลต่อการรับรู้โดย virp1 .
การแปล กรุณารอสักครู่..
![](//thimg.ilovetranslation.com/pic/loading_3.gif?v=b9814dd30c1d7c59_8619)