Attachment of a bacterial albumin-b

Attachment of a bacterial albumin-binding protein module is an attractive strategy for extending the plasma residence time of protein therapeutics. However, a protein fused with such a bacterial module could induce unfavorable immune reactions. To address this, we designed an alternative binding protein by imparting albumin-binding affinity to a human protein using molecular surface grafting. The result was a series of human-derived 6 helix-bundle proteins, one of which specifically binds to human serum albumin (HSA) with adequate affinity (KD = 100 nM). The proteins were designed by transferring key binding residues of a bacterial albumin-binding module, Finegoldia magna protein G-related albumin-binding domain (GA) module, onto the human protein scaffold. Despite 13–15 mutations, the designed proteins maintain the original secondary structure by virtue of careful grafting based on structural informatics. Competitive binding assays and thermodynamic analyses of the best binders show that the binding mode resembles that of the GA module, suggesting that the contacting surface of the GA module is mimicked well on the designed protein. These results indicate that the designed protein may act as an alternative low-risk binding module to HSA. Furthermore, molecular surface grafting in combination with structural informatics is an effective approach for avoiding deleterious mutations on a target protein and for imparting the binding function of one protein onto another.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ของโมดูลโปรตีน albumin ผูกแบคทีเรียเป็นกลยุทธ์น่าสนใจสำหรับการขยายเวลาพำนักพลาสม่า therapeutics โปรตีน อย่างไรก็ตาม โปรตีนที่พร้อมโมแบคทีเรียอาจก่อให้เกิดปฏิกิริยาภูมิคุ้มกันเสียเปรียบ ที่อยู่นี้ เรามาเป็นโปรตีนทดแทนรวม โดย imparting albumin ผูกความสัมพันธ์กับโปรตีนมนุษย์ใช้ grafting ผิวโมเลกุล ผลคือ ชุดของมนุษย์มา 6 เกลียวกลุ่มโปรตีน หนึ่งโดยเฉพาะ binds กับมนุษย์ serum albumin (HSA) มีความเกี่ยวข้องอย่างเพียงพอ (KD = 100 nM) โปรตีนที่ถูกออกแบบ โดยการถ่ายโอนตกรวมคีย์ของโมผูก albumin แบคทีเรีย Finegoldia magna โปรตีนเกี่ยวข้อง G albumin รวมโดเมน (GA) โมดูล บนนั่งร้านโปรตีนมนุษย์ แม้จะกลายพันธุ์ 13-15 โปรตีนออกรักษาโครงสร้างเดิมรองอาศัย grafting ระวังตามโครงสร้างสารสนเทศ Assays แข่งขันรวมและการวิเคราะห์ทางอุณหพลศาสตร์แสดงยึดประสานดีว่า โหมดผูกคล้ายกับของโมดู GA แนะนำว่า ผิวกำลังติดต่อโม GA จะ mimicked ดีในโปรตีนออก ผลลัพธ์เหล่านี้บ่งชี้ว่า โปรตีนออกอาจทำหน้าที่เป็นโมดูลเพื่อ HSA ผูกความเสี่ยงต่ำทดแทนการ นอกจากนี้ โมเลกุลผิว grafting ร่วมกับโครงสร้างสารสนเทศเป็นวิธีมีประสิทธิภาพ สำหรับการหลีกเลี่ยงการกลายพันธุ์ที่สุดบนโปรตีนเป้าหมาย และ imparting ฟังก์ชันการรวมของโปรตีนหนึ่งไปยังอีก

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สิ่งที่แนบมาของโมดูลโปรตีนอัลบูมิแบคทีเรียที่มีผลผูกพันเป็นกลยุทธ์ที่น่าสนใจสำหรับการขยายเวลาพลาสม่าที่อยู่อาศัยของการรักษาโปรตีน แต่โปรตีนผสมด้วยเช่นโมดูลแบคทีเรียก่อให้เกิดปฏิกิริยาภูมิคุ้มกันที่ไม่เอื้ออำนวย จะอยู่ที่นี่เราได้ออกแบบโปรตีนที่มีผลผูกพันทางเลือกโดยการให้ความสัมพันธ์ที่ใกล้ชิดอัลบูมิผูกพันกับโปรตีนมนุษย์โดยใช้การปลูกถ่ายอวัยวะพื้นผิวโมเลกุล ผลที่ได้คือชุดของมนุษย์ที่ได้มาจาก 6 โปรตีนเกลียวมัดซึ่งหนึ่งในนั้นโดยเฉพาะจับกับโปรตีนชนิดหนึ่งในซีรั่มของมนุษย์ (HSA) ที่มีความสัมพันธ์อย่างเพียงพอ (KD = 100 นาโนเมตร) โปรตีนที่ได้รับการออกแบบโดยการโอนตกค้างมีผลผูกพันที่สำคัญของโมดูลโปรตีนชนิดหนึ่งที่มีผลผูกพันแบคทีเรีย Finegoldia นาโปรตีน G ที่เกี่ยวข้องกับโดเมนโปรตีนชนิดหนึ่งที่มีผลผูกพัน (GA) โมดูลบนนั่งร้านโปรตีนของมนุษย์ แม้จะมีการกลายพันธุ์ 13-15, โปรตีนออกแบบรักษาโครงสร้างทุติยภูมิเดิมโดยอาศัยอำนาจของการปลูกถ่ายอวัยวะร​​ะมัดระวังบนพื้นฐานของข้อมูลที่มีโครงสร้าง การตรวจที่มีผลผูกพันในการแข่งขันและการวิเคราะห์ความร้อนของสารที่ดีที่สุดที่แสดงให้เห็นว่าโหมดผูกพันที่มีลักษณะของโมดูล GA, บอกว่าผิวติดต่อของโมดูล GA จะเลียนแบบได้ดีในโปรตีนที่ได้รับการออกแบบ เหล่านี้แสดงให้เห็นว่าผลการโปรตีนที่ได้รับการออกแบบอาจทำหน้าที่เป็นทางเลือกที่มีความเสี่ยงต่ำที่จะมีผลผูกพันโมดูล HSA นอกจากนี้พื้นผิวโมเลกุลรับสินบนในการรวมกันกับข้อมูลที่มีโครงสร้างเป็นวิธีการที่มีประสิทธิภาพในการหลีกเลี่ยงการกลายพันธุ์ที่อันตรายโปรตีนเป้าหมายและฟังก์ชั่นการให้ความผูกพันของโปรตีนบนอีก

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

สิ่งที่แนบมาของแบคทีเรียโปรตีนอัลบูมินในโมดูลเป็นกลยุทธ์ที่น่าสนใจสำหรับการขยายระยะเวลาของการรักษาพลาสมาโปรตีน อย่างไรก็ตาม โปรตีนผสมด้วยเช่นโมดูลสามารถชักนำให้เกิดปฏิกิริยาภูมิคุ้มกันเชื้อร้าย ไปที่อยู่นี้เราออกแบบทางเลือกโปรตีนโดยการให้ขะยิกความสัมพันธ์กับมนุษย์โปรตีนโดยใช้โมเลกุลพื้นผิวการกราฟต์ผลที่ได้คือชุดของมนุษย์ได้มา 6 เกลียวมัดโปรตีน ซึ่งเฉพาะผูกกับอัลบูมินจากซีรัมของมนุษย์ ( HSA ) ความสัมพันธ์ที่เพียงพอ ( Kd = 100 nm ) โปรตีนที่ถูกออกแบบโดยการโอนกุญแจผูกตกค้างของแบคทีเรียขะยิกโมดูล , โปรตีน finegoldia Magna g-related ขะยิกโดเมน ( GA ) โมดูลบนนั่งร้านโปรตีนมนุษย์ แม้จะมี 13 – 15 การกลายพันธุ์การออกแบบโปรตีนรักษาโครงสร้างเดิมโดยอาศัยการระวังตามสารสนเทศที่มีโครงสร้าง วิธีการแข่งขันและอุณหพลศาสตร์และผูกยึดที่ดีที่สุดแสดงให้เห็นว่ารวมโหมดคล้ายกับที่ของกาโมว่า ที่ติดต่อกับพื้นผิวของ GA โมดูล mimicked ในการออกแบบโปรตีนผลลัพธ์เหล่านี้บ่งชี้ว่าออกแบบโปรตีนอาจเป็นทางเลือกที่มีความเสี่ยงน้อยผูกโมดูล HSA . นอกจากนี้โมเลกุลพื้นผิวทาบกิ่งร่วมกับสารสนเทศโครงสร้างเป็นวิธีที่มีประสิทธิภาพเพื่อหลีกเลี่ยงการกลายพันธุ์ที่โปรตีนและคงเป้าหมายให้ฟังก์ชันผูกพันของโปรตีน 1 ไปยังอีก