HepG2 represents a pure cell line o

HepG2 represents a pure cell line of human liver carcinoma, often used as HCC model due to the absence of viral infection. In this study we compare gene expression profiles associated with HepG2 (as HCC model) and normal hepatocyte cells by microarray technology. Hierarchical cluster analysis of genes evidenced that 2646 genes significantly down-regulated in HepG2 cells compared to hepatocytes whereas a further 3586 genes significantly up-regulated. By using the Ingenuity Pathway Analysis (IPA) program, we have classified the genes that were differently expressed and studied the functional networks correlating these genes in the complete human interactome. Moreover, to confirm the differentially expressed genes as well as the reliability of our microarray data, we performed a quantitative Real time RT-PCR analysis on 9 up-regulated and 11 down-regulated genes, respectively.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

HepG2 แทนสายบริสุทธิ์เซลล์ของมะเร็งตับมนุษย์ มักใช้เป็น HCC รุ่นเนื่องจากการติดเชื้อไวรัส ในการศึกษานี้ เราเปรียบเทียบโปรไฟล์แสดงยีนที่เกี่ยวข้องกับ HepG2 (เป็น HCC) และเซลล์ hepatocyte ปกติ โดยเทคโนโลยี microarray การวิเคราะห์คลัสเตอร์ลำดับของยีนหลักฐานยีนที่ 2646 ควบคุมอย่างมีนัยสำคัญลงในเซลล์ HepG2 เทียบกับ hepatocytes ขณะ 3586 เพิ่มเติมยีนมากขึ้นควบคุม โดยใช้โปรแกรมวิเคราะห์เส้นทางความฉลาด (IPA) เรามีจำแนกยีนที่ถูกแสดงแตกต่างกัน และศึกษาเครือข่ายทำงานกำลังรวบรวมสำหรับยีนเหล่านี้ใน interactome มนุษย์สมบูรณ์ นอกจากนี้ ยืนยันยีน differentially แสดงเป็นความน่าเชื่อถือของข้อมูล microarray เราดำเนินการเวลาจริงเชิงวิเคราะห์ RT-PCR 9 ที่กำหนดขึ้นและยีนควบคุมลง 11 ตามลำดับ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

HepG2 หมายถึงสายพันธุ์ของเซลล์บริสุทธิ์ของมะเร็งตับของมนุษย์มักจะใช้เป็นรูปแบบ HCC เนื่องจากขาดของการติดเชื้อไวรัส ในการศึกษานี้เราเปรียบเทียบการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับการ HepG2 (เป็นรูปแบบ HCC) และเซลล์ตับปกติโดยเทคโนโลยี microarray การวิเคราะห์กลุ่มตามลำดับชั้นของยีนหลักฐานที่ 2646 อย่างมีนัยสำคัญยีนควบคุมลงในเซลล์ HepG2 เมื่อเทียบกับเซลล์ตับในขณะที่อีก 3586 ยีนอย่างมีนัยสำคัญขึ้นควบคุม โดยการใช้ความฉลาด Pathway วิเคราะห์ Program (IPA) เราได้จัดยีนที่มีการแสดงออกที่แตกต่างกันและการศึกษาเครือข่ายการทำงานมีความสัมพันธ์ยีนเหล่านี้ใน interactome มนุษย์ที่สมบูรณ์ นอกจากนี้ในการยืนยันการแสดงออกของยีนที่แตกต่างกันเช่นเดียวกับความน่าเชื่อถือของข้อมูล microarray เราดำเนินการเวลาจริงการวิเคราะห์ RT-PCR เชิงปริมาณในวันที่ 9 ขึ้นควบคุมและ 11 ยีนที่ควบคุมลงตามลำดับ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

มะเร็งตับเป็นเซลล์ที่บริสุทธิ์สายมะเร็งตับ มนุษย์ มักใช้เป็น HCC รุ่นเนื่องจากขาดของการติดเชื้อไวรัส ในการศึกษานี้เราเปรียบเทียบการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับโปรไฟล์ของมะเร็งตับ ( แบบของเรา ) และเซลล์ตับปกติโดย microarray เทคโนโลยี การวิเคราะห์กลุ่มลำดับชั้นของยีน ) ที่ 2646 ยีนควบคุมในระดับลงเมื่อเทียบกับเซลล์ตับและเซลล์มะเร็งตับต่อไป 3586 ยีนอย่างคา . โดยการใช้ความฉลาดเพื่อการวิเคราะห์ ( IPA ) มียีนที่แตกต่างกันแสดงและศึกษาการทำงานเครือข่ายศึกษายีนใน interactome มนุษย์สมบูรณ์จัด นอกจากนี้ เพื่อยืนยันแสดงออกแตกต่างกันยีนเช่นเดียวกับความน่าเชื่อถือของข้อมูล microarray ของเรา เราได้ทำการวิเคราะห์เชิงเวลาจริงนี้สามารถควบคุมยีนลง 9 และ 11 ตามลำดับ