Out of 76,566 sequences with an ave

Out of 76,566 sequences with an average read length of 504 bp obtained from the GenBank EST database, the number of unique sequences was reduced to 28,940. Those sequences had an average read length of 609 bp, formed 10,902 tentative contigs and 18,038 singletons. The tentative contigs had an average read length of 790 bp whereas the singlets had an average read length of 500 bp.
The Troll software identified 7,270 SSRs which represent an average frequency of EST-SSR of one SSR in every 2,424 bp in the cassava transcriptome. The frequency of EST-SSR found in cassava was similar to that found in Hevea brasiliensis(2.24 kb) . Both cassava and rubber tree are closely related in the same Euphorbiaceae family where a large proportion of EST markers were cross-transferable .

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

จากลำดับ 76,566 โดยเฉลี่ยอ่านยาวของ 504 28,940 ลดลงได้จากฐานข้อมูล GenBank EST หมายเลขลำดับเฉพาะ bp ลำดับที่ได้โดยเฉลี่ยความยาวของ 609 อ่าน bp เกิด 10,902 แน่นอน contigs และ 18,038 singletons Contigs ไม่แน่นอนได้เฉลี่ยความยาวของ 790 อ่าน bp ขณะสวมเสื้อกล้ามที่มีค่าเฉลี่ยการอ่านยาว 500 bpซอฟต์แวร์ Troll identified 7,270 SSRs ซึ่งแสดงถึงความถี่เฉลี่ยของ EST-SSR ของ SSR หนึ่งใน 2,424 ทุก bp ใน transcriptome มันสำปะหลัง ความถี่ของ SSR EST ที่พบในมันสำปะหลังคือคล้ายกับที่พบใน Hevea brasiliensis(2.24 kb) มันสำปะหลังและยางพาราอย่างใกล้ชิดที่เกี่ยวข้องในครอบครัว Euphorbiaceae เดียวที่สัดส่วนขนาดใหญ่ของเครื่องหมายเอสถูกโอนข้าม

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ออกจาก 76,566 ลำดับที่มีความยาวเฉลี่ยของการอ่าน 504 bp ที่ได้รับจากฐานข้อมูลของ GenBank EST จำนวนลำดับที่ไม่ซ้ำกันก็จะลดลง 28,940 ลำดับผู้ที่มีความยาวเฉลี่ยของการอ่าน 609 bp ที่เกิดขึ้น 10,902 contigs เบื้องต้นและ 18,038 singletons contigs เบื้องต้นมีระยะเวลาในการอ่านเฉลี่ย 790 bp ขณะ singlets มีความยาวในการอ่านเฉลี่ย 500 bp.
ซอฟต์แวร์ Troll Fi ระบุ ed 7,270 SSRs ซึ่งเป็นตัวแทนของความถี่เฉลี่ยของ EST-SSR หนึ่ง SSR ในทุก ๆ 2,424 bp ในยีนมันสำปะหลัง ความถี่ของการ EST-SSR พบในมันสำปะหลังเป็นแบบเดียวกับที่พบในยางพารา (2.24 KB) ทั้งมันสำปะหลังและยางพารามีความสัมพันธ์อย่างใกล้ชิดในครอบครัว Euphorbiaceae เดียวกับที่เป็นสัดส่วนใหญ่ของเครื่องหมาย EST ก็ข้ามเปลี่ยนมือได้

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

จาก 76566 ลำดับมีความยาวเฉลี่ยของอ่าน 504 BP ที่ได้จากขนาดและฐานข้อมูล ตัวเลขของลำดับกันถูกลดลงไป 28940 . ลำดับนั้น มีความยาวเฉลี่ยของอ่าน 609 BP , เกิดขึ้นแน่นอนและ 10902 สูง 18038 singletons . มีสูงแน่นอนมีความยาวอ่านเฉลี่ย 790 BP ส่วนเสื้อกล้ามมีความยาวอ่านเฉลี่ย 500 BP .โทรลล์ซอฟต์แวร์ identi จึงเอ็ด 6560.7270 ssrs ซึ่งเป็นตัวแทนของความถี่เฉลี่ยของ est-ssr หนึ่ง SSR ในทุก 2424 BP ในมันสำปะหลัง ทราน ริปโตม . ความถี่ของ est-ssr พบในมันสำปะหลังที่คล้ายกับที่พบในยางพารา ( 2.24 KB ) ทั้งมันสำปะหลังและยางพาราจะเกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดในแบบครอบครัว Euphorbiaceae ซึ่งสัดส่วนขนาดใหญ่ของเครื่องหมายถูกข้ามและสามารถ