Phylogenetic analysisA phylogenetic

Phylogenetic analysisA phylogenetic tree based on the almost complete 16S rRNA gene sequences (1400 nucleotides) retrieved from the NCBI database was constructed. The sequences of the type strains of all species of Stutze- rimonas, together with the numbered Stutzerimonas phylogenomic spe- cies, as defined by Gomila and collaborators (Gomila et al., 2022), were included and compared in the present study. The Jukes‐Cantor (JC) (Jukes et al., 1969), maximum likelihood (ML) (Felsenstein, 1981) and maximum parsimony (MP) (Nei and Kumar, 2000) algo- rithms were used for the comparisons.A multilocus sequence analysis was performed at the autoMLST website (https://automlst.ziemertlab.com). It identified up to 100 sin- gle copy housekeeping genes with the highest dN/dS values, the gene sequences were then concatenated, and maximum likelihood infer-

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การวิเคราะห์สายวิวัฒนาการมีการสร้างต้นไม้สายวิวัฒนาการตามลำดับยีน 16S rRNA (1,400 นิวคลีโอไทด์) ที่เกือบสมบูรณ์ซึ่งดึงมาจากฐานข้อมูล NCBI ลำดับของสายพันธุ์ประเภทของ Stutzerimonas ทุกชนิด ร่วมกับสายพันธุ์ Stutzerimonas phylogenomic ที่มีหมายเลขตามที่กำหนดโดย Gomila และผู้ทำงานร่วมกัน (Gomila et al., 2022) ถูกรวมและเปรียบเทียบในการศึกษาปัจจุบัน อัลกอริธึม Jukes‐Cantor (JC) (Jukes et al., 1969), ความน่าจะเป็นสูงสุด (ML) (Felsenstein, 1981) และอัลกอริธึม parsimony สูงสุด (MP) (Nei และ Kumar, 2000) ถูกนำมาใช้ในการเปรียบเทียบ ทำการวิเคราะห์ลำดับหลายจุดบนเว็บไซต์ autoMLST (https://automlst.ziemertlab.com) โดยระบุยีนดูแลทำความสะอาดสำเนาเดี่ยวได้มากถึง 100 ยีนที่มีค่า dN/dS สูงสุด จากนั้นลำดับของยีนจะถูกต่อเข้าด้วยกัน และความน่าจะเป็นไปได้สูงสุดอนุมาน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การวิเคราะห์การพัฒนาระบบ
ต้นไม้การพัฒนาระบบถูกสร้างขึ้นบนพื้นฐานของลำดับยีน 16S rRNA เกือบสมบูรณ์ (1,400 นิวคลีโอไทด์) ดึงมาจากฐานข้อมูล NCBI การศึกษานี้รวมถึงและเปรียบเทียบลำดับของสายพันธุ์รูปแบบของสายพันธุ์ทั้งหมดของ Stutzerimonas ที่กำหนดโดย Gomila และผู้ร่วมงาน (Gomila et al. 2022) รวมถึงลักษณะกลุ่มการพัฒนาระบบ Stutzerimonas จำนวน Jukes‐Cantor (JC) (Jukes et al. 1969), maximum deviliance (ML) (Felsenstein 1981) และ maximum minimum (MP) (Nei และ Kumar, 2000) อัลกอริทึมสำหรับการเปรียบเทียบ
การวิเคราะห์ลำดับหลายโฟกัสได้ดำเนินการบนเว็บไซต์ autoMLST ( https://automlst.ziemertlab.com )。 มันระบุได้ถึง 100 ยีนแม่บ้านสำเนาเดี่ยวที่มีค่า dN / dS สูงสุดจากนั้นเชื่อมต่อลำดับยีนและอนุมานที่เป็นไปได้สูงสุด -

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การวิเคราะห์วิวัฒนาการ
โครงสร้างทางชีววิทยาถูกสร้างขึ้นบนพื้นฐานของลําดับยีนrRNA 16 sที่สมบูรณ์( nucleotide 1,400 )ที่ดึงข้อมูลจากฐานข้อมูลNCBI การศึกษานี้รวมถึงและเปรียบเทียบลําดับรูปแบบของสายพันธุ์streptococcusทั้งหมดและสายพันธุ์ของstreptococcusที่กําหนดโดยGomilaและผู้ร่วมงาน( Gomila et al.,2022 ) Jukes-Cantor ( JC ) ( Jukes et al.,1969 ),ความน่าจะเป็นสูงสุด( ML ) ( Felsenstein,1981 )และขั้นตอนวิธีสูงสุดที่เรียบง่าย( MP ) ( NeiและKumar,2000 )สําหรับการเปรียบเทียบ
การวิเคราะห์ลําดับหลายจุดจะดําเนินการในเว็บไซต์autoMLST (https://auto mlst.probertlab.com ) ได้รับการระบุถึง100สําเนาของยีนโฮมเมดที่มีค่าdN/dSสูงสุดและลําดับยีนถูกเชื่อมต่อเพื่ออนุมานความน่าจะเป็นสูงสุด