3. Results and discussion3.1. Isola

3. Results and discussion
3.1. Isolation of differentially expressed genes in L. regale after F. oxysporum inoculation by SSH
To enrich the differentially expressed genes in resistant defense response of L. regale, a subtracted cDNA library of L.
regale inoculated with F. oxysporum was constructed. The cDNA transcribed from the mRNA of F. oxysporum infected
root was as the tester, and the cDNA from mock-inoculated root as the driver. Two rounds of subtraction between the tester
and the driver were performed, then the pool of differentially expressed gene fragments was amplified with primers of 1 and
2R. Through TA-cloning and blue-white spot screening, 3168 clones were randomly picked.
Totally, 1726 clones were screened out by colony PCR, and the length of cDNA inserts ranged from 200 to 1000 bp with
average length of 400 bp. Then 1101 clones were successfully sequenced, and there were 585 unique sequences including
194 contigs and 391 singlets through CAP3 sequence analysis.
3.2. Functional categories of genes responsive to F. oxysporum infection
The 585 unique sequences were then performed homology analysis with BLASTx tool in GenBank. As a result, more
than one half of the unique sequences were assigned to no significant homology. The partial result of homology analysis
was showed in Table 1. The functional categories of the 243 ESTs which had significant homology with known proteins
were assigned, as a result, they were classified into 14 putative cellular functions on the base of categories established in
Arabidopsis (Fig 1).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

3. ผลลัพธ์ และสนทนา3.1 การแยกของยีน differentially แสดงในเดอะรีเกลบาย L. หลัง F. oxysporum inoculation ด้วย SSHกาย ยีนทนป้องกันการตอบสนองของ L. differentially แสดงจริง ๆ รีลบ cDNA ของ L.เดอะรีเกลบาย inoculated กับ F. oxysporum ถูกสร้างขึ้น CDNA ที่ทับศัพท์จาก mRNA ของ F. oxysporum ติดเชื้อรากเป็นเครื่องวัดที่ cDNA จากราก mock inoculated เป็นโปรแกรมควบคุมได้ รอบสองของลบระหว่างการทดสอบและดำเนินการควบคุม แล้วสระว่ายน้ำของบางส่วนของยีนแสดง differentially ถูกขยาย ด้วยไพรเมอร์ 1 และ2R การโคลนผ่านตา และสีน้ำเงินขาวจุดคัดกรอง 3168 โคลนได้รับการทั้งหมด 1726 โคลนถูกฉายออกมา โดยอาณานิคม PCR และความยาวของ cDNA แทรกอยู่ในช่วงจาก 200 ถึง 1000 bp ด้วยค่าเฉลี่ยความยาวของ 400 bp แล้ว โคลน 1101 ถูกเรียงลำดับเรียบร้อยแล้ว และมีลำดับเฉพาะ 585 รวม194 contigs และ singlets 391 ผ่าน CAP3 ลำดับวิเคราะห์3.2 การประเภทที่ทำงานของยีนที่ตอบสนองต่อการติดเชื้อ F. oxysporumลำดับเฉพาะ 585 ถูกแล้วทำ homology วิเคราะห์ ด้วยเครื่องมือ BLASTx ใน GenBank เป็นผล เพิ่มเติมกว่าหนึ่ง ครึ่งลำดับเฉพาะถูกกำหนดให้กับ homology ไม่สำคัญ ผลลัพธ์บางส่วนของการวิเคราะห์ homologyถูกพบในตารางที่ 1 ประเภทหน้าที่ของ ESTs 243 ซึ่งมี homology สำคัญกับโปรตีนชื่อดังถูกกำหนด เป็นผล พวกเขาถูกแบ่ง 14 putative ฟังก์ชันโทรศัพท์มือถือบนฐานของการก่อตั้งขึ้นในประเภทArabidopsis (ฟิก 1)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

3. ผลการอภิปรายและ
3.1 การแยกยีนที่แสดงออกแตกต่างกันในการเลี้ยงอาหารลิตรหลังจากการฉีดวัคซีน F. oxysporum โดย SSH
เพื่อเพิ่มยีนแสดงออกแตกต่างกันในการตอบสนองการป้องกันทนของ L. เลี้ยงอาหาร, หักห้องสมุด cDNA ของ L.
Regale เชื้อด้วย F. oxysporum ถูกสร้างขึ้น cDNA คัดลอกจาก mRNA ของ F. oxysporum ติดเชื้อ
รากเป็นผู้ทดสอบและ cDNA จากรากจำลองเชื้อเป็นคนขับรถ รอบสองของการลบระหว่างการทดสอบ
และคนขับได้ดำเนินการแล้วสระว่ายน้ำของแสดงความแตกต่างของยีนเศษถูกขยายด้วยไพรเมอร์ 1 และ
2R ผ่าน TA-โคลนและการตรวจคัดกรองจุดสีฟ้าสีขาว 3168 โคลนถูกหยิบสุ่ม.
ครบ, 1726 โคลนถูกคัดกรองโดยวิธี PCR อาณานิคมและความยาวของ cDNA แทรกอยู่ระหว่าง 200-1,000 bp กับ
ความยาวเฉลี่ยของ 400 bp แล้ว 1,101 โคลนมีลำดับขั้นตอนที่ประสบความสำเร็จและมี 585 ลำดับไม่ซ้ำกันรวมทั้ง
194 และ 391 contigs singlets ผ่านการวิเคราะห์ลำดับ CAP3.
3.2 ประเภทการทำงานของยีนที่ตอบสนองต่อการติดเชื้อเอฟ oxysporum
585 ลำดับไม่ซ้ำกันจากนั้นได้ดำเนินการวิเคราะห์ด้วยเครื่องมือที่คล้ายคลึงกัน BLASTx ใน GenBank เป็นผลให้มากขึ้น
กว่ากึ่งหนึ่งของลำดับไม่ซ้ำกันได้รับมอบหมายให้ไม่มีที่คล้ายคลึงกันอย่างมีนัยสำคัญ ผลของการวิเคราะห์บางส่วนที่คล้ายคลึงกัน
คือการแสดงให้เห็นในตารางที่ 1 ประเภทการทำงานของ 243 โคลนที่มีความคล้ายคลึงกันอย่างมีนัยสำคัญกับโปรตีนที่รู้จักกัน
ที่ได้รับมอบหมายเป็นผลให้พวกเขาถูกแบ่งออกเป็น 14 ฟังก์ชั่นโทรศัพท์มือถือสมมุติบนฐานของประเภทที่จัดตั้งขึ้นใน
Arabidopsis ( รูปที่ 1)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

3 . ผลและการอภิปราย
3.1 . การแยกยีนแสดงออกแตกต่างกันในแอลเอ หลังจากเลี้ยงเชื้อ F . oxysporum โดยใช้ SSH
เพื่อเพิ่มแสดงออกแตกต่างกันยีนในการตอบสนองการป้องกันป้องกันของ L . ให้ความเพลิดเพลิน , หักออก cDNA ห้องสมุดของ L .
เลี้ยงเชื้อ F . oxysporum ได้ด้วยการสร้าง วิธีคัดลอกจาก mRNA ของ F . oxysporum ติดเชื้อ
รากเป็น testerและยีนจากเชื้อเยาะเย้ยรากเป็นคนขับ สองรอบในการลบระหว่างทดสอบ
และคนขับแสดง แล้วสระว่ายน้ำของยีนแสดงออกแตกต่างกันของชิ้นส่วนเป็นไพรเมอร์ 1 และ
2R ผ่านการโคลนนิ่งตาและจุดคัดกรอง สีฟ้าขาว 3168 โคลนถูกเลือกแบบสุ่ม .
ทั้งหมด 1726 โคลนออกโดยมีอาณานิคม PCR ,และความยาวของการแทรกยีนอยู่ระหว่าง 200 ถึง 1000 BP กับ
ความยาวเฉลี่ย 400 BP . แล้ว 1101 โคลนนี้เรียบร้อยแล้ว และมีเอกลักษณ์ รวมทั้งเป็นลำดับ
194 สูงและ 391 เสื้อกล้ามผ่านการวิเคราะห์ลำดับ cap3 .
2 . หมวดการทำงานของยีนที่ตอบสนองต่อการติดเชื้อ
F . oxysporumโดยเฉพาะการเป็นลำดับแล้ววิเคราะห์ด้วยเครื่องมือที่มี blastx บริเวณ เป็นผลให้มากขึ้น
กว่าครึ่งหนึ่งของลำดับเฉพาะ ได้รับไม่พบตัว . ผลของการวิเคราะห์ซึ่งเป็นบางส่วน
แสดงในตารางที่ 1 ประเภทการทำงานของธุรกิจซึ่งมีความแตกต่างกับที่รู้จักกันเป็นฐานข้อมูลโปรตีน
ได้รับมอบหมาย ผลพวกเขาถูกแบ่งออกเป็น 14 ซึ่งเซลล์การทำงานบนฐานของประเภทก่อตั้งขึ้นใน
Arabidopsis ( ตารางที่ 1 )