For target sequence capture, DNA wa

For target sequence capture, DNA was first
sheared to give a standardized fragment size using a
Covaris Sample Preparation System, and then quantified
using a High-Sensitivity Bioanalyzer assay
(Agilent). Two samples (R. bocharicus and
R. imaizumi) (Table 1) were not sheared as a result
of low concentrations. Libraries were prepared from
the whole sheared DNA for bait capture using the
NEB Next Ultra DNA Library Prep kit (New England
Biosciences). Illumina adaptors were attached
to the sheared DNA, followed by amplification of the
libraries prior to bait capture. We performed a polymerase
chain reaction with the universal primers,
P1 and P2 (Agilent), using the thermocycler conditions
in accordance with the manufacturer’s instructions.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

สำหรับการจับภาพเป้าหมายลำดับ ดีเอ็นเอเป็นเจ้าแรกตัดให้ขนาดส่วนเป็นมาตรฐานโดยใช้การCovaris ตัวอย่างการจัดทำระบบ และวัดแล้วโดยใช้การทดสอบความไวสูง Bioanalyzer(Agilent) ตัวอย่างสอง (อาร์ bocharicus และอาร์ imaizumi) (ตาราง 1) ถูกตัดไม่เป็นผลของความเข้มข้นต่ำ ไลบรารีถูกจัดทำขึ้นจากทั้งหมดตัดดีเอ็นเอสำหรับใช้จับเหยื่อชุด NEB ต่อ Ultra DNA คลังเตรียม (นิวอิงแลนด์ออก) อะแดปเตอร์ Illumina แนบกับดีเอ็นเอ sheared ตาม ด้วยการขยายของการไลบรารีก่อนที่จะจับเหยื่อ เราดำเนินการพอลิเมอเรสปฏิกิริยาลูกโซ่กับไพรเมอร์สากลP1 และ P2 (Agilent), ใช้เงื่อนไข thermocyclerตามคำแนะนำของผู้ผลิต

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สำหรับเป้าหมายการจับลำดับดีเอ็นเอเป็นครั้งแรกที่
ตัดให้เป็นชิ้น ๆ ขนาดมาตรฐานใช้
Covaris การเตรียมสารตัวอย่างระบบแล้ววัด
โดยใช้การทดสอบความไวแสงสูง Bioanalyzer
(Agilent) สองตัวอย่าง (อาร์ bocharicus และ
อาร์ imaizumi) (ตารางที่ 1) ไม่ได้ถูกตัดเป็นผล
ของความเข้มข้นต่ำ ห้องสมุดที่เตรียมจาก
ดีเอ็นเอ Sheared ทั้งสำหรับการจับเหยื่อโดยใช้
NEB ถัดไปอัลตร้าชุดดีเอ็นเอห้องสมุดเตรียม (นิวอิงแลนด์
ชีววิทยาศาสตร์) อะแดปเตอร์ Illumina ติด
กับดีเอ็นเอ Sheared ตามด้วยการขยายของ
ห้องสมุดก่อนที่จะมีการจับเหยื่อ เราดำเนินการโพลิเมอร์
ปฏิกิริยาลูกโซ่กับไพรเมอร์สากล
P1 และ P2 (Agilent) โดยใช้เงื่อนไข thermocycler
ตามคำแนะนำของผู้ผลิต

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

จับลำดับเป้าหมาย ดีเอ็นเอก่อนตัดให้มีขนาดมาตรฐานใช้ระบบการเตรียมสารตัวอย่าง covaris แล้วเชิงปริมาณใช้ความไวสูง ( bioanalyzer( ด้าน ) สองตัวอย่าง ( R . bocharicus และอาร์ อิไมซูมิ ) ( ตารางที่ 1 ) ไม่ตัดผลความเข้มข้นต่ำ ห้องสมุดที่เตรียมจากทั้งตัดดีเอ็นเอสำหรับจับเหยื่อ โดยใช้หน้าอัลตร้าเอ็นดีเอ็นเอห้องสมุดเตรียมชุดใหม่ ( อังกฤษชีววิทยา ) Illumina อะแดปเตอร์ถูกผูกติดการตัดดีเอ็นเอ ตามการขยายของห้องสมุดก่อนที่จะล่อจับ เราใช้วิธีปฏิกิริยาลูกโซ่ด้วยวิธีสากลP1 กับ P2 ( Agilent ) โดยใช้เงื่อนไขเทอร์มอไซเคล ์ตามคำแนะนำของผู้ผลิต