In this section, we show how our so

In this section, we show how our software infrastructure can be used to implement two data-intensive applications the K-mer Match-ing Interface (KMI)4 and Breadth First Search (BFS), and compare their performance to the respective MPI implementations. KMI is a distributed, domain specific library for hashing, designed for genome assembly and mapping analysis applications. BFS is a fundamental kernel in graph analytics, that is widely employed in many graph algorithms, including connected components, betweeness centrality,and heuristic search algorithms [27, 30].

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ในส่วนนี้ เราแสดงวิธีใช้ของเราซอฟต์แวร์โครงสร้างพื้นฐานการใช้โปรแกรมประยุกต์ข้อมูลมากทั้งสองอินเตอร์เฟซตรง ing K แมร์ (KMI) 4 และกว้างแรกค้นหา (BFS), และเปรียบเทียบผลการใช้งาน MPI ที่เกี่ยวข้อง KMI เป็นกระจาย โดเมน specific ไลบรารีสำหรับ hashing ออกแบบมาเพื่อกลุ่มแอสเซมบลีและการแม็ปวิเคราะห์ BFS เป็นเคอร์เนลเป็นพื้นฐานในการวิเคราะห์กราฟ ที่ใช้กันอย่างแพร่หลายในหลายกราฟอัลกอริทึม เชื่อมประกอบ betweeness แห่ง และอัลกอริทึมค้นหาพฤติกรรม [27, 30]

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ในส่วนนี้เราแสดงให้เห็นว่าโครงสร้างพื้นฐานของซอฟแวร์ของเราสามารถนำมาใช้ในการดำเนินการทั้งสองงานข้อมูลจำนวนมาก K-Mer Match-Ing Interface (KMI) 4 และความกว้างแรกค้นหา (BFS) และเปรียบเทียบประสิทธิภาพของพวกเขาเพื่อการใช้งานที่ MPI ที่เกี่ยวข้อง KMI เป็นกระจายโดเมน speci Fi C Library สำหรับคร่ำเครียดได้รับการออกแบบสำหรับการชุมนุมและการทำแผนที่จีโนมการใช้งานการวิเคราะห์ BFS เป็นเคอร์เนลพื้นฐานในการวิเคราะห์กราฟที่มีการจ้างงานกันอย่างแพร่หลายในขั้นตอนวิธีกราฟจำนวนมากรวมทั้งชิ้นส่วนเชื่อมต่อ betweeness ศูนย์กลางและขั้นตอนวิธีการแก้ปัญหาการค้นหา [27 30]

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ในส่วนนี้เราจะแสดงวิธีการที่ซอฟต์แวร์โครงสร้างพื้นฐานของเราสามารถใช้ที่จะใช้สองโปรแกรมที่ตรงกับข้อมูลที่เข้มข้น k-mer ไอเอ็นจีอินเตอร์เฟซ ( kmi ) 4 และความกว้างค้นหาแรก ( BFS ) และเปรียบเทียบประสิทธิภาพการทำงานของพวกเขาที่จะใช้สำหรับแต่ละ kmi เป็นกระจาย , เมนกาจึง C ห้องสมุด บริการ ออกแบบมาเพื่อการประกอบจีโนมและการประยุกต์ใช้การวิเคราะห์แผนที่ BFS เป็นเคอร์เนลพื้นฐานในการวิเคราะห์กราฟ ที่เป็นกันอย่างแพร่หลายใช้ในขั้นตอนวิธีกราฟหลาย รวมทั้งเชื่อมต่อคอมโพเนนต์ betweeness ศูนย์กลาง และขั้นตอนวิธีการค้นหาแบบศึกษาสำนึก [ 27 , 30 ]