Stable-isotope probing is a method

Stable-isotope probing is a method used in microbial ecology that provides a means by which specific functional groups of organisms that incorporate particular substrates are identified without the prerequisite of cultivation. Stable-isotope-labeled carbon (13C) or nitrogen (15N) sources are assimilated into microbial biomass of environmental samples. Separation and molecular analysis of labeled nucleic acids (DNA or RNA) reveals phylogenetic and functional information about the microorganisms responsible for the metabolism of a particular substrate. Here, we highlight general guidelines for incubating environmental samples with labeled substrate and provide a detailed protocol for separating labeled DNA from unlabeled community DNA. The protocol includes a modification of existing published methods, which maximizes the recovery of labeled DNA from CsCl gradients. The separation of DNA and retrieval of unlabeled and labeled fractions can be performed in 4-5 days, with much of the time being committed to the ultracentrifugation step.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ตรวจสอบพื้นคอกไอโซโทปเป็นวิธีการที่ใช้ในระบบนิเวศวิทยาจุลินทรีย์ที่ให้วิธีการที่ระบุเฉพาะ functional กลุ่มของสิ่งมีชีวิตพื้นผิวเฉพาะที่ โดยไม่มีข้อกำหนดเบื้องต้นของการเพาะปลูก คอกไอโซโทปมีป้ายชื่อว่าคาร์บอน (13C) หรือไนโตรเจน (15N) แหล่งคือขนบธรรมเนียมประเพณีเป็นชีวมวลจุลินทรีย์ตัวอย่างสิ่งแวดล้อม แยกและวิเคราะห์โมเลกุลป้ายกรดนิวคลีอิก (ดีเอ็นเอหรืออาร์เอ็นเอ) แสดงถึง phylogenetic และทำข้อมูลเกี่ยวกับจุลินทรีย์ชอบเผาผลาญของพื้นผิวโดยเฉพาะ ที่นี่ เราเน้นแนวทางทั่วไปสำหรับ incubating ตัวอย่างสิ่งแวดล้อมกับป้ายพื้นผิว และมีโพรโทคอลรายละเอียดการแยกชื่อดีเอ็นเอจากดีเอ็นเอเพียงชุมชน โพรโทคอลมีการปรับเปลี่ยนวิธีการเผยแพร่ที่มีอยู่ ที่วางการฟื้นตัวของดีเอ็นเอที่มีป้ายชื่อจาก CsCl ไล่ระดับสี แยกของดีเอ็นเอและเรียกของเศษส่วนที่มีป้ายชื่อ และไม่สามารถดำเนินการใน 4-5 วัน มีมากของเวลาถูกกำหนดไปยังขั้นตอน ultracentrifugation

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เสถียรไอโซโทปละเอียดเป็นวิธีที่ใช้ในระบบนิเวศของจุลินทรีย์ที่ให้วิธีการที่กลุ่มทำงานที่เฉพาะเจาะจงของสิ่งมีชีวิตที่รวมพื้นผิวโดยเฉพาะอย่างยิ่งจะมีการระบุโดยไม่จำเป็นของการเพาะปลูก เสถียรไอโซโทปติดฉลากคาร์บอน (13C) หรือไนโตรเจน (15N) แหล่งที่มาจะถูกหลอมรวมเข้าชีวมวลจุลินทรีย์ตัวอย่างสิ่งแวดล้อม การแยกและการวิเคราะห์โมเลกุลที่มีข้อความกรดนิวคลิอิก (DNA หรือ RNA) เผยข้อมูลสายวิวัฒนาการและการทำงานเกี่ยวกับจุลินทรีย์ที่รับผิดชอบในการเผาผลาญอาหารของพื้นผิวโดยเฉพาะอย่างยิ่ง ที่นี่เราเน้นแนวทางทั่วไปสำหรับการบ่มตัวอย่างจากสิ่งแวดล้อมที่มีพื้นผิวที่มีข้อความและให้รายละเอียดโปรโตคอลสำหรับการแยกดีเอ็นเอที่มีข้อความจากดีเอ็นเอชุมชนที่ไม่มีป้ายกำกับ โปรโตคอลรวมถึงการปรับเปลี่ยนของที่มีอยู่วิธีการตีพิมพ์ซึ่งจะเพิ่มการฟื้นตัวของดีเอ็นเอที่มีข้อความจากการไล่ระดับสี CsCl การแยกดีเอ็นเอและการดึงเศษส่วนที่ไม่มีป้ายกำกับและติดป้ายสามารถดำเนินการใน 4-5 วันมีมากเวลาที่จะมุ่งมั่นไปยังขั้นตอน ultracentrifugation

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ไอโซโทปเสถียร พิสูจน์เป็นวิธีที่ใช้ในทางนิเวศวิทยาที่มีหมายความว่าหน้าที่เฉพาะกลุ่มของสิ่งมีชีวิตที่รวมเฉพาะพื้นผิวที่ระบุโดยไม่มีการเพาะปลูก ข้อความมั่นคงไอโซโทปคาร์บอน ( 13C ) หรือไนโตรเจน ( 15 ) เหมือนเป็นแหล่งจุลินทรีย์จากตัวอย่างสิ่งแวดล้อมการแยกและการวิเคราะห์โมเลกุลของกรดนิวคลีอิก ( DNA หรือ RNA ติดป้าย ) เผยข้อมูลเกี่ยวกับชนิดและการทำงานของจุลินทรีย์ต่อเมแทบอลิซึมของสารอาหารโดยเฉพาะ ที่นี่เราเน้นแนวทางทั่วไปสำหรับการแช่ตัวอย่างสิ่งแวดล้อมกับป้าย ( ให้โปรโตคอลรายละเอียดแยกดีเอ็นเอดีเอ็นเอที่มีข้อความจากชุมชนใกล้เคียงกันซึ่งรวมถึงการปรับปรุงที่มีอยู่เผยแพร่วิธีการ ซึ่งจะเพิ่มการกู้คืนข้อความแลกเปลี่ยนดีเอ็นเอจากการไล่ระดับสี . การแยกดีเอ็นเอและการสืบค้นให้ใกล้เคียงกัน และป้าย เศษส่วน ที่สามารถดำเนินการได้ใน 4-5 วัน กับมากเวลาถูกมุ่งมั่นที่จะ ultracentrifugation ขั้นตอน