A total of 35 sequences with 1392 b

A total of 35 sequences with 1392 bp valid positions passed through 50% positional conservatory filter in ARB were used for phylogenetic analysis. A neighbour-joining phylogenetic tree was constructed using the Jukes–Cantor correction in ARB (Saitou & Nei, 1987; Jukes & Cantor, 1969). Bootstrap resampling analyses with 1000 replicates were performed for the neighbour-joining, maximum-likelihood and maximum-parsimony analyses to estimate the confidence of the tree topologies. MEGA 4.0 (Tamura et al., 2007) was used for the neighbour-joining and maximum-parsimony analyses
and PHYML 2.4.5 (Guindon & Gascuel, 2003) was used for the maximum-likelihood analysis. The sequence similarity values were calculated using the calculate matrix function of the ARB program without a filter.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

จำนวนลำดับ 35 กับ 1392 bp ถูกต้องตำแหน่งผ่านตัวกรองตำแหน่งเรือนกระจก 50% ใน ARB ที่ใช้สำหรับวิเคราะห์ phylogenetic Phylogenetic tree รวมเพื่อนบ้านถูกสร้างขึ้นโดยใช้การแก้ไข Jukes – คันทอร์ใน ARB (Saitou และ Nei, 1987 Jukes และคันทอร์ 1969) มีดำเนินการวิเคราะห์เปลี่ยนความละเอียดของเริ่มต้นระบบ ด้วยเหมือนกับ 1000 สำหรับวิเคราะห์ รวมเพื่อนบ้าน ความเป็นไป ได้มากที่สุด และสูงสุด parsimony ประเมินความเชื่อมั่นของโททรี ใช้สำหรับวิเคราะห์ รวมเพื่อนบ้าน และสูงสุด parsimony ร็อค 4.0 (Tamura et al., 2007)และ PHYML 2.4.5 (Guindon & Gascuel, 2003) ใช้สำหรับการวิเคราะห์ความเป็นไปได้สูงสุด มีคำนวณค่าความคล้ายคลึงกันของลำดับโดยใช้ฟังก์ชันคำนวณเมทริกซ์โปรแกรม ARB โดยตัวกรอง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

รวมเป็น 35 ลำดับ 1392 bp กับตำแหน่งที่ถูกต้องผ่าน 50% กรองเรือนกระจกในตำแหน่ง ARB ถูกนำมาใช้สำหรับการวิเคราะห์สายวิวัฒนาการ เพื่อนบ้านเข้าสู่ต้นไม้สายวิวัฒนาการที่ถูกสร้างขึ้นโดยใช้การแก้ไขจุกส์-ต้นเสียงใน ARB (Saitou และ Nei 1987; จุกส์และแคนเทอร์, 1969) บูตวิเคราะห์ resampling 1000 ซ้ำได้ดำเนินการสำหรับเพื่อนบ้านเข้า, โอกาสสูงสุดและความประหยัดสูงสุดวิเคราะห์เพื่อประเมินความเชื่อมั่นของโครงสร้างต้นไม้ MEGA 4.0 (ทามูระ et al., 2007)
ใช้สำหรับเพื่อนบ้านเข้าและสูงสุดประหยัดวิเคราะห์และPHYML 2.4.5 (Guindon และ Gascuel, 2003) ถูกนำมาใช้สำหรับการวิเคราะห์โอกาสสูงสุด ลำดับค่าความคล้ายคลึงกันนี้จะถูกคำนวณโดยใช้ฟังก์ชั่นการคำนวณเมทริกซ์ของโปรแกรม ARB โดยไม่ต้องกรอง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ทั้งหมด 35 ลำดับกับ 397 BP ใช้ได้ตำแหน่งผ่าน 50% ตำแหน่งเรือนกระจกกรองใน ARB วิเคราะห์ phylogenetic . เพื่อนบ้านร่วม phylogenetic ต้นไม้ถูกสร้างโดยใช้จูกส์– Admin แก้ไขใน ARB ( ไซโตะ&เนย , 1987 ; จูกส์&คันทอร์ , 1969 ) บู 1000 จำนวนสุ่มซ้ำวิเคราะห์ซ้ำเพื่อเพื่อนบ้านเข้าร่วมโอกาสสูงสุดและความตระหนี่สูงสุดการวิเคราะห์ค่าความเชื่อมั่นของต้นไม้ topologies . ร็อค 4.0 ( ทามูระ et al . , 2007 ) ใช้เพื่อนบ้านร่วมงานและวิเคราะห์ความตระหนี่และสูงสุด
phyml 2.4.5 ( กินเดิ้น& gascuel , 2003 ) สถิติที่ใช้ในการวิเคราะห์ความน่าจะเป็นสูงสุดความเหมือนของลำดับค่าคำนวณโดยใช้การคำนวณเมทริกซ์ฟังก์ชันของโปรแกรม ARB ไม่มีตัวกรอง