Detection of pathogenic Escherichia

Detection of pathogenic Escherichia coli such as E. coli O157 and ETEC has been known as an
extremely important indication for their prevalence in many types of samples. The quality and quantity of DNA
and the sensitivity of DNA detection may vary upon different extraction techniques and directly affect the
results of sample analysis. In this study we compared five chromosomal DNA extraction methods using
conventional method; the phenol/chloroform extraction, and other four more rapid ones: the ChargeSwitch gDNA
Mini Kit, ChelexTM 100, InstaGeneTM Matrix and InstaGeneTM Matrix+lysozyme. The results of DNA extraction
were evaluated by agarose gel electrophoresis, optical density determination and amplification of specific
DNA fragment. The phenol/chloroform extraction and InstaGeneTM Matrix methods gave the DNA that
provided higher sensitivity of pathogenic E. coli detection by PCR at the detection limit of

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ตรวจพบ pathogenic Escherichia coli E. coli O157 และ ETEC เป็นที่รู้จักเป็นบ่งชี้ที่สำคัญอย่างมากสำหรับความชุกในหลายชนิดของตัวอย่าง คุณภาพและปริมาณของดีเอ็นเอและความไวของการตรวจสอบดีเอ็นเออาจแตกต่างกันไปตามเทคนิคการบีบอัดที่แตกต่างกัน และส่งผลกระทบโดยตรงต่อการผลการวิเคราะห์ตัวอย่าง ในการศึกษานี้ เราเปรียบเทียบห้าของโครโมโซม DNA สกัดวิธีใช้วิธีทั่วไป แยกวาง/คลอโรฟอร์ม และคนอื่น ๆ อย่างรวดเร็วมากขึ้น 4: ChargeSwitch gDNAมินิชุด ChelexTM 100, InstaGeneTM เมตริกซ์ และ เมตริกซ์ InstaGeneTM + lysozyme ผลของการสกัดดีเอ็นเอถูกประเมิน โดย agarose เจ electrophoresis ความหนาแน่นออปติคอล และการขยายเฉพาะส่วนของดีเอ็นเอ การวาง/คลอโรฟอร์มสกัดและวิธีเมตริกซ์ InstaGeneTM ให้ในดีเอ็นเอที่โดยความไวสูงของ pathogenic E. coli ตรวจ PCR ในการตรวจหาจำนวน < 10 pg.วิธี InstaGeneTM เมตริกซ์ยังแสดงให้เห็นประโยชน์มากกว่าวาง/คลอโรฟอร์ม ที่ใช้เวลาน้อยกว่า 90 นาทีสำหรับสกัดหนึ่ง ขณะเวลาวาง/คลอโรฟอร์มประมาณสี่ชั่วโมง ดังนั้น การInstaGeneTM เมตริกซ์ที่มีแนวโน้มให้ดีเพื่อสนับสนุนการตรวจพบ pathogenic E. coli ในการศึกษานี้

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การตรวจหาเชื้อ Escherichia coli ที่ทำให้เกิดโรคเช่นเชื้อ E. coli O157 และ ETEC
ได้เป็นที่รู้จักในฐานะที่เป็นตัวบ่งชี้ที่สำคัญอย่างยิ่งสำหรับความชุกในหลายประเภทของกลุ่มตัวอย่าง ที่มีคุณภาพและปริมาณของดีเอ็นเอและความไวของการตรวจสอบดีเอ็นเออาจแตกต่างกันเมื่อใช้เทคนิคการสกัดที่แตกต่างกันและส่งผลโดยตรงต่อผลของการวิเคราะห์ตัวอย่าง ในการศึกษานี้เราเมื่อเทียบกับห้าวิธีการสกัดดีเอ็นเอโครโมโซมโดยใช้วิธีการทั่วไป; ฟีนอล / สกัดคลอโรฟอร์มและคนที่สี่อย่างรวดเร็วอื่น ๆ เพิ่มเติมที่: ChargeSwitch gDNA มินิชุด ChelexTM 100 InstaGeneTM เมทริกซ์และ InstaGeneTM เมทริกซ์ + ไลโซไซม์ ผลที่ได้จากการสกัดดีเอ็นเอได้รับการประเมินโดยข่าวคราว agarose การกำหนดความหนาแน่นของแสงและการขยายของเฉพาะชิ้นดีเอ็นเอ ฟีนอล / สกัดคลอโรฟอร์มและ InstaGeneTM วิธีเมทริกซ์ให้ดีเอ็นเอที่ให้ความไวที่สูงขึ้นของการตรวจสอบที่ทำให้เกิดโรคอีโคไลโดยวิธีPCR ที่ขีด จำกัด ของการตรวจสอบ <10 หน้า วิธี Matrix InstaGeneTM ยังแสดงให้เห็นประโยชน์ที่มากกว่าฟีนอล / คลอโรฟอร์มในการที่จะใช้เวลาน้อยกว่า 90 นาทีสำหรับหนึ่งสกัดขณะที่ฟีนอล / คลอโรฟอร์มใช้เวลาประมาณสี่ชั่วโมง ดังนั้นInstaGeneTM เมทริกซ์มีแนวโน้มที่จะให้มีการปฏิบัติที่ดีในการสนับสนุนการตรวจสอบที่ทำให้เกิดโรคอีโคไลในการศึกษานี้

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การตรวจหาเชื้อก่อโรค เช่น เชื้อ Escherichia coli เป็นสมาชิก และผู้เชี่ยวชาญได้ถูกเรียกว่าเป็นข้อบ่งชี้ที่สำคัญมากสำหรับความชุก
ของหลายประเภทของตัวอย่าง คุณภาพและปริมาณของดีเอ็นเอ
และความไวของการตรวจหาดีเอ็นเออาจแตกต่างกันไปตามเทคนิคการสกัดที่แตกต่างกันและส่งผลกระทบโดยตรงต่อ
ผลของการวิเคราะห์ตัวอย่างการศึกษาเปรียบเทียบวิธีการสกัดดีเอ็นเอโครโมโซมโดยใช้วิธีฟีนอล /
; การสกัดคลอโรฟอร์ม และอีกสี่อย่างรวดเร็วมากกว่า : chargeswitch gdna
มินิคิท chelextm 100 instagenetm ไลโซไซม์ instagenetm และเมทริกซ์เมทริกซ์ ผลของ
การสกัดดีเอ็นเอ ได้แก่ เจลอิเลคโตรโฟรีซีส การหาความหนาแน่นของแสงและแบบเฉพาะ
ชิ้นส่วนดีเอ็นเอ ส่วนฟีนอล / คลอโรฟอร์มสกัดและวิธีเมทริกซ์ instagenetm ให้ดีเอ็นเอที่
ให้สูงกว่าความไวของเชื้อ E . coli โดยวิธี PCR ในการตรวจหาขอบเขต < 10 PG
instagenetm วิธีเมตริกซ์มีความได้เปรียบมากกว่า ฟีนอล / คลอโรฟอร์ม ที่ใช้เวลาน้อยกว่า 90 นาที
หนึ่งในขณะที่ฟีนอล / แยก ( ใช้เวลาประมาณ 4 ชั่วโมงดังนั้น ,
instagenetm แมทริกซ์มีแนวโน้มที่จะให้ปฏิบัติดีเพื่อสนับสนุนการตรวจเชื้อ E . coli ในการศึกษานี้