Genetic improvement of beef quality

Genetic improvement of beef quality will benefit both producers and consumers, and can be achieved by selecting animals that carry desired quantitative trait nucleotides (QTN), which result from intensive searches using genetic markers. This paper presents a genome-wide association approach utilizing single nucleotide polymorphisms (SNP) in the Illumina BovineSNP50 BeadChip to seek genomic regions that potentially harbor genes or QTN underlying variation in carcass quality of beef cattle. This study used 747 genotyped animals, mainly crossbred, with phenotypes on twelve carcass quality traits, including hot carcass weight (HCW), back fat thickness (BF), Longissimus dorsi muscle area or ribeye area (REA), marbling scores (MRB), lean yield grade by Beef Improvement Federation formulae (BIFYLD), steak tenderness by Warner-Bratzler shear force 7-day post-mortem (LM7D) as well as body composition as determined by partial rib (IMPS 103) dissection presented as a percentage of total rib weight including body cavity fat (BDFR), lean (LNR), bone (BNR), intermuscular fat (INFR), subcutaneous fat (SQFR), and total fat (TLFR). Results: At the genome wide level false discovery rate (FDR

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Genetic improvement of beef quality will benefit both producers and consumers, and can be achieved by selecting animals that carry desired quantitative trait nucleotides (QTN), which result from intensive searches using genetic markers. This paper presents a genome-wide association approach utilizing single nucleotide polymorphisms (SNP) in the Illumina BovineSNP50 BeadChip to seek genomic regions that potentially harbor genes or QTN underlying variation in carcass quality of beef cattle. This study used 747 genotyped animals, mainly crossbred, with phenotypes on twelve carcass quality traits, including hot carcass weight (HCW), back fat thickness (BF), Longissimus dorsi muscle area or ribeye area (REA), marbling scores (MRB), lean yield grade by Beef Improvement Federation formulae (BIFYLD), steak tenderness by Warner-Bratzler shear force 7-day post-mortem (LM7D) as well as body composition as determined by partial rib (IMPS 103) dissection presented as a percentage of total rib weight including body cavity fat (BDFR), lean (LNR), bone (BNR), intermuscular fat (INFR), subcutaneous fat (SQFR), and total fat (TLFR). Results: At the genome wide level false discovery rate (FDR<10%), eight SNP were found significantly associated with HCW. Seven of these SNP were located on Bos taurus autosome (BTA) 6. At a less stringent significance level (P<0.001), 520 SNP were found significantly associated with mostly individual traits (473 SNP), and multiple traits (47 SNP). Of these significant SNP, 48 were located on BTA6, and 22 of them were in association with hot carcass weight. There were 53 SNP associated with percentage of rib bone, and 12 of them were on BTA20. The rest of the significant SNP were scattered over other chromosomes. They accounted for 1.90 - 5.89% of the phenotypic variance of the traits. A region of approximately 4 Mbp long on BTA6 was found to be a potential area to harbor candidate genes influencing growth. One marker on BTA25 accounting for 2.67% of the variation in LM7D may be worth further investigation for the improvement of beef tenderness. Conclusion: This study provides useful information to further assist the identification of chromosome regions and subsequently genes affecting carcass quality traits in beef cattle. It also revealed many SNP that acted pleiotropically to affect carcass quality. This knowledge is important in selecting subsets of SNP to improve the performance of beef cattle.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การปรับปรุงทางพันธุกรรมของคุณภาพเนื้อจะเป็นประโยชน์ต่อทั้งผู้ผลิตและผู้บริโภคและสามารถทำได้โดยการเลือกสัตว์ที่มีนิวคลีโอที่ต้องการลักษณะเชิงปริมาณ (QTN) ซึ่งเป็นผลมาจากการค้นหาอย่างเข้มข้นโดยใช้เครื่องหมายทางพันธุกรรม บทความนี้นำเสนอจีโนมทั้งวิธีการใช้ประโยชน์จากการเชื่อมโยงหลากหลายเดี่ยวเบื่อหน่าย (SNP) ใน Illumina BovineSNP50 BeadChip ที่จะแสวงหาภูมิภาคจีโนมที่อาจท่าเรือยีนหรือ QTN พื้นฐานการเปลี่ยนแปลงในคุณภาพซากของโคเนื้อ การศึกษาครั้งนี้ใช้สัตว์ genotyped 747, ลูกผสมส่วนใหญ่มี phenotypes ในสิบสองลักษณะคุณภาพซากรวมทั้งซากน้ำหนักร้อน (HCW) กลับความหนาของไขมัน (BF) บริเวณกล้ามเนื้อ Dorsi longissimus หรือพื้นที่ริบอาย (REA), คะแนนหินอ่อน (MRB) เกรดผลผลิตลีนสูตรโดยสหพันธ์ปรับปรุงเนื้อ (BIFYLD) อ่อนโยนสเต็กโดยวอร์เนอ-Bratzler แรงเฉือน 7 วันภายหลังการตาย (LM7D) เช่นเดียวกับองค์ประกอบของร่างกายตามที่กำหนดโดยบางส่วนซี่โครง (IMPS 103) ผ่าแสดงเป็นร้อยละของจำนวน น้ำหนักซี่โครงรวมถึงช่องไขมันในร่างกาย (BDFR), ลีน (LNR), กระดูก (แบนเนอร์) intermuscular ไขมัน (INFR), ไขมันใต้ผิวหนัง (SQFR) และไขมันทั้งหมด (TLFR) ผล: ในจีโนมกว้างระดับอัตราการค้นพบที่ผิดพลาด (FDR <10%), แปด SNP พบความสัมพันธ์กับ HCW เซเว่นเหล่านี้ SNP ตั้งอยู่บน autosome บอสราศีพฤษภ (BTA) 6. ที่ระดับนัยสำคัญเข้มงวดน้อยกว่า (p <0.001) 520 SNP ได้พบความสัมพันธ์กับลักษณะของแต่ละคนส่วนใหญ่ (473 SNP) และลักษณะหลาย ๆ (47 SNP) ของ SNP ที่สำคัญเหล่านี้ 48 ตั้งอยู่บน BTA6 และ 22 ของพวกเขาในการคบหาสมาคมกับซากน้ำหนักร้อน มีกำลัง 53 SNP ที่เกี่ยวข้องกับร้อยละของกระดูกซี่โครงและ 12 ของพวกเขาเป็นที่ BTA20 ส่วนที่เหลือของ SNP อย่างมีนัยสำคัญกระจัดกระจายอยู่ทั่วโครโมโซมอื่น ๆ พวกเขาคิดเป็น 1.90-5.89% ของความแปรปรวนของลักษณะฟีโนไทป์ ภูมิภาคประมาณ 4 Mbp ยาวใน BTA6 ถูกพบว่าเป็นพื้นที่ที่มีศักยภาพในท่าเรือยีนที่มีอิทธิพลต่อการเจริญเติบโต หนึ่งในเครื่องหมาย BTA25 บัญชีสำหรับ 2.67% ของการเปลี่ยนแปลงใน LM7D อาจจะตรวจสอบต่อไปคุ้มค่าสำหรับการปรับปรุงของความอ่อนโยนเนื้อ สรุป: การศึกษานี้จะให้ข้อมูลที่เป็นประโยชน์ที่จะช่วยให้ประชาชนในภูมิภาคโครโมโซมและต่อยีนที่มีผลต่อลักษณะคุณภาพซากในการเลี้ยงโคเนื้อ นอกจากนี้ยังเผยให้เห็นหลาย SNP ที่ทำหน้าที่ pleiotropically ส่งผลกระทบต่อคุณภาพซาก ความรู้นี้เป็นสิ่งสำคัญในการเลือกส่วนย่อยของ SNP เพื่อปรับปรุงประสิทธิภาพของการเลี้ยงโคเนื้อ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การปรับปรุงคุณภาพเนื้อจะเป็นประโยชน์ทั้งผู้ผลิตและผู้บริโภค และสามารถทำได้โดยการเลือกสัตว์ที่มีลักษณะที่ต้องการปริมาณนิวคลีโอไทด์ ( qtn ) ซึ่งผลจากการค้นหาเข้มข้นโดยใช้เครื่องหมายพันธุกรรมบทความนี้นำเสนอแนวทางการใช้พันธุ์ สมาคม genome-wide ซิงเกิลนิวคลีโอไทด์ ( SNP ) ใน beadchip Illumina bovinesnp50 แสวงหาจีโนมภูมิภาคที่อาจท่าเรือยีนหรือ qtn ต้นแบบการเปลี่ยนแปลงคุณภาพซากของโคเนื้อ การศึกษานี้ใช้ 747 genotyped สัตว์ ส่วนใหญ่เป็นลูกผสมที่มีฟีโนไทป์ในสิบสองลักษณะคุณภาพซาก ,รวมน้ำหนักซากอุ่น ( hcw ) ความหนาไขมันสันหลัง ( BF ) , โคเนื้อบริเวณเมารถหรือริบอาย พื้นที่ ( REA ) คะแนน marbling ( MRB ) เกรดผลผลิต Lean โดยสหพันธ์ปรับปรุงสูตรเนื้อ ( bifyld )สเต็กพิศวาสโดยวอร์เนอร์ bratzler 7 แรงเฉือนชันสูตรศพ ( lm7d ) เช่นเดียวกับร่างกายที่กำหนดโดยซี่โครงบางส่วน ( อิมพ์ 103 ) การแสดงเป็นเปอร์เซ็นต์ของน้ำหนักทั้งหมดรวมถึงช่องซี่โครง ไขมันในร่างกาย ( bdfr ) ยัน ( ในปริมาณ ) , กระดูก ( บีเอ็นอาร์ ) , intermuscular ไขมัน ( infr ) , ชั้นไขมันใต้ผิวหนัง ( sqfr ) และไขมันทั้งหมด ( tlfr ) ผลลัพธ์ : ในระดับจีโนมกว้างเท็จค้นพบอัตรา ( FDR < 10% )แปด SNP พบความสัมพันธ์กับ hcw . เจ็ดของ SNP เหล่านี้ตั้งอยู่บนบอสราศีพฤษภออโตโซม ( BTA ) 6 . ในระดับที่เข้มงวดน้อยกว่า ( P < 0.001 ) และพบว่ามีความสัมพันธ์กับคุณลักษณะ SNP ส่วนใหญ่บุคคล ( 473 SNP ) และคุณลักษณะหลาย ( 47 SNP ) ของเหล่านี้ที่สำคัญ SNP , 48 ตั้งอยู่บน bta6 และ 22 ของพวกเขาอยู่ในความสัมพันธ์กับน้ำหนักซากร้อนมี 53 SNP ที่เกี่ยวข้องกับเปอร์เซ็นต์ของกระดูกซี่โครงและ 12 ของพวกเขาใน bta20 . ส่วนที่เหลือของ SNP อย่างมีนัยสำคัญทางสถิติกระจายทั่วเซลล์อื่น ๆ พวกเขาคิดเป็นร้อยละ 1.90 - 5.89 % ของความแปรปรวนของลักษณะปรากฏของลักษณะ . พื้นที่ประมาณ 4 stop ยาว bta6 พบว่ามีพื้นที่ที่มีศักยภาพท่าเรือยีนผู้สมัครที่มีอิทธิพลต่อการเจริญเติบโต หนึ่งเครื่องหมายบน bta25 การบัญชี 267 % ของการเปลี่ยนแปลงใน lm7d อาจจะมีมูลค่าการสอบสวนเพิ่มเติมเพื่อปรับปรุงคุณภาพเนื้อ จากการศึกษานี้ได้ให้ข้อมูลที่เป็นประโยชน์เพิ่มเติม ช่วยเหลือประชาชนของโครโมโซมและยีนที่มีผลต่อคุณภาพซากภูมิภาคในภายหลังคุณลักษณะในโคเนื้อ นอกจากนี้ยังพบมากที่ทำ pleiotropically SNP ที่จะส่งผลกระทบต่อคุณภาพซากความรู้นี้เป็นสิ่งสำคัญในการเลือกชุดย่อยของ SNP เพื่อปรับปรุงประสิทธิภาพของโคเนื้อ