Computational Analysis of Genes Ind

Computational Analysis of Genes Induced in Olive Roots
by P. Fluorescens PICF7
Analysis of the EST set by the Blast2GO software allowed the
annotation of expressed sequences according to the terms of the
three main GO vocabularies, i.e. ‘biological process’, ‘molecular
function’ and ‘cellular component’. It is worth mentioning that
only 76.6% of the sequences were mapped by the GO annotation
database. Thus, 104 ESTs (85 unknown and 19 predicted
sequences corresponding to the remaining 23.4%) were not
included in this functional classification because they were
automatically discarded by the program before running the
analysis. Since some translated sequences were identified by
different GO terms, they were classified according to the best hits
retrieved from the BLAST homology search. ESTs distribution for
‘biological processes’, ‘molecular function’ and ‘cellular component’
main categories are shown in Figure 1.
Regarding to biological processes, 56% (190 sequences) of the
transcripts corresponded to very low represented GO terms
categories (i.e., cell cycle, flower and reproductive structures
development, cellular homeostasis, photosynthesis, pollination, cell
differentiation, embryonic and post-embryonic development), and
were grouped as ‘other’ in our analysis (Fig. 1A). Concerning to

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

คำนวณวิเคราะห์ยีนเกิดในรากมะกอกโดย P. Fluorescens PICF7วิเคราะห์ของเอสที่กำหนด โดยซอฟต์แวร์ Blast2GO ที่อนุญาตให้คำอธิบายของลำดับแสดงตามเงื่อนไขของการสามหลักไปศัพท์ เช่น 'กระบวนการทางชีวภาพ', ' โมเลกุลฟังก์ชั่น ' และ 'มือถือ ' มันเป็นมูลค่าการกล่าวขวัญที่เพียง 76.6% ลำดับถูกแมป โดยประกอบไปฐานข้อมูล ดังนั้น 104 ESTs (85 19 และรู้จักคาดการณ์ลำดับที่สอดคล้องกับอีก 23.4%) ไม่ได้รวมอยู่ในประเภทนี้ทำงานได้เนื่องจากถูกยกเลิกโดยอัตโนมัติ โดยโปรแกรมก่อนทำการการวิเคราะห์ ตั้งแต่ระบุลำดับบางแปลโดยเงื่อนไขแตกต่างกันไป พวกเขาถูกจัดประเภทตามเพลงฮิตที่ดีที่สุดดึงมาจากการค้นหาระเบิด homology แจก ESTs'กระบวนการทางชีวภาพ' 'โมเลกุลฟังก์ชัน' และ 'มือถือส่วนประกอบ'หมวดหมู่หลักจะแสดงในรูปที่ 1เกี่ยวกับกระบวนการทางชีวภาพ 56% (ลำดับที่ 190) การใบแสดงผลผูกพันเงื่อนไขไปเป็นตัวแทนต่ำมากหมวดหมู่ (เช่น วงจรมือถือ โครงสร้างดอกและการสืบพันธุ์พัฒนา ภาวะธำรงดุลเซลลูลาร์ สังเคราะห์แสง การผสมเกสร เซลล์ความแตกต่าง การพัฒนาตัวอ่อน และตัวอ่อนหลัง), และถูกแบ่งเป็น 'ที่อื่น' ในการวิเคราะห์ของเรา (รูปที่ 1A) เกี่ยวกับการ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การวิเคราะห์การคำนวณของยีนในการชักนำให้เกิดรากมะกอก
โดย P. fluorescens PICF7
การวิเคราะห์ของ EST กำหนดโดยซอฟต์แวร์ Blast2GO ได้รับอนุญาตให้
บันทึกย่อของลำดับแสดงตามเงื่อนไขของ
สามคำศัพท์ GO หลักคือกระบวนการทางชีวภาพ ',' โมเลกุล
ฟังก์ชั่นและ 'องค์ประกอบมือถือ' เป็นมูลค่าการกล่าวขวัญว่า
มีเพียง 76.6% ของลำดับที่ถูกแมปโดยคำอธิบายประกอบ GO
ฐานข้อมูล ดังนั้น ESTs 104 (85 และ 19 ไม่รู้จักคำทำนาย
ลำดับสอดคล้องกับส่วนที่เหลืออีก 23.4%) ไม่ได้ถูก
รวมอยู่ในการจัดหมวดหมู่การทำงานนี้เพราะพวกเขาจะถูก
ยกเลิกโดยอัตโนมัติโดยโปรแกรมก่อนที่จะรัน
การวิเคราะห์ เนื่องจากบางลำดับแปลโดยระบุว่า
ข้อตกลงและเงื่อนไขที่แตกต่างกันไปพวกเขาถูกจัดแบ่งตามไปกับเพลงฮิตที่ดีที่สุด
ที่ดึงมาจากการค้นหาระเบิดที่คล้ายคลึงกัน กระจาย ESTs สำหรับ
'กระบวนการทางชีวภาพ', 'โมเลกุลฟังก์ชั่น' และ 'องค์ประกอบมือถือ'
หมวดหมู่หลักจะแสดงในรูปที่ 1
เกี่ยวกับกระบวนการทางชีวภาพ 56% (190 ลำดับ) ของ
ยีนที่ตรงกับตัวแทนที่ต่ำมากแง่ GO
ประเภท (เช่น วัฏจักรของเซลล์ดอกไม้และโครงสร้างสืบพันธุ์
พัฒนาสภาวะสมดุลของเซลล์สังเคราะห์ผสมเกสรเซลล์
แตกต่างของการพัฒนาตัวอ่อนและการโพสต์ของตัวอ่อน) และ
ถูกจัดกลุ่มเป็น 'อื่น ๆ ' ในการวิเคราะห์ของเรา (รูป. 1A) เกี่ยวกับการที่จะ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การวิเคราะห์เชิงคำนวณของยีนนำรากมะกอกโดย P . fluorescens picf7การวิเคราะห์ของชุดซอฟต์แวร์ที่ได้รับอนุญาตโดย blast2go ���แสดงบันทึกย่อของลำดับตามข้อตกลงของ3 คำศัพท์ไปหลักกระบวนการทางชีวภาพเช่น " " , " " ของโมเลกุลส่วนประกอบของเซลล์หน้าที่ " และ " " เป็นมูลค่าการกล่าวขวัญว่าเพียง 76.6 % ของลำดับสาม โดยไปหมายเหตุฐานข้อมูล ดังนั้น , 104 ฐานข้อมูล ( 85 ที่ไม่รู้จักและ 19 พยากรณ์ลำดับสอดคล้องกับที่เหลืออยู่ 23.4% ) ไม่ได้รวมอยู่ในการต่อสู้ เพราะพวกเขาโดยอัตโนมัติโดยโปรแกรมก่อน ใช้ทิ้งการวิเคราะห์ เนื่องจากบางแปลลำดับถูกระบุโดยเงื่อนไขที่แตกต่างกันไป พวกเขา จำแนกตามความฮิตที่สุดดึงจากระเบิดที่มีการค้นหา ฐานข้อมูลการกระจายสำหรับ" กระบวนการ " " ฟังก์ชันทางชีวภาพโมเลกุลของเซลล์องค์ประกอบ " " และ " "หมวดหมู่หลักแสดงในรูปที่ 1เกี่ยวกับกระบวนการทางชีววิทยา 56 % ( 190 ) ) ของประวัติของน้อยมากแสดงเงื่อนไขไปประเภท ( เช่น วัฏจักรของเซลล์สืบพันธุ์ , ดอกไม้ และ โครงสร้างการพัฒนามือถือ , สมดุล , การสังเคราะห์แสง การเซลล์การหาอนุพันธ์และการพัฒนาตัวอ่อนตัวอ่อนโพสต์ )มีประเด็นสำคัญอื่น ๆ " " ในการวิเคราะห์ของเรา ( รูปที่ 1A ) เกี่ยวกับ