proposed an accelerated MD method b

proposed an accelerated MD method based on the earlier approaches of Voter, Grubmuller , and others
that uses modified potential energy landscape, which is based on a simpler definition of the boost potential, to promote the sampling of infrequent events of molecular systems in biomolecular systems without the need for advance knowledge of the location of the potential energy barriers or the diagonalization of a Hessian matrix.




They showed that this technique can accelerate all-atom MD simulations of biomolecules by many orders of magnitude and can be used to not only recapture the canonical Boltzmann distribution but also to determine the kinetics of the system.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

นำเสนอวิธีการเร่ง MD ที่อิงวิธีก่อนหน้าของต่อ Grubmuller และอื่น ๆที่สามารถใช้พลังงานศักย์ปรับภูมิทัศน์ ซึ่งยึดตามคำจำกัดความที่ง่ายเพิ่มศักยภาพ ส่งเสริมการสุ่มตัวอย่างของเหตุการณ์งานระบบโมเลกุลในระบบวทคร ๕๐๘ โดยไม่ต้องใช้ความรู้ขั้นสูงของตำแหน่งของอุปสรรคพลังงานศักย์หรือ diagonalization ของเมทริกซ์กระสอบพวกเขาแสดงให้เห็นว่า เทคนิคนี้สามารถเร่งจำลอง MD อะตอมทั้งหมดของชื่อโมเลกุลชีวภาพ โดยหลายอันดับของขนาด และสามารถใช้ เพื่อเรียกคืนการกระจายตัวโบลทซ์มานน์มาตรฐานไม่เพียง แต่ การกำหนดจลนพลศาสตร์ของระบบ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เสนอวิธี MD เร่งขึ้นอยู่กับวิธีการก่อนหน้าของผู้มีสิทธิเลือกตั้ง Grubmuller และอื่น ๆ
ที่ใช้การปรับเปลี่ยนภูมิทัศน์พลังงานที่มีศักยภาพซึ่งจะขึ้นอยู่กับความละเอียดที่เรียบง่ายของที่มีศักยภาพเพิ่มเพื่อส่งเสริมการสุ่มตัวอย่างจากเหตุการณ์ที่เกิดขึ้นไม่บ่อยนักของระบบโมเลกุลในระบบชีวโมเลกุลโดยไม่ต้อง ความจำเป็นในการพัฒนาความรู้ของสถานที่ตั้งของปัญหาและอุปสรรคที่พลังงานที่มีศักยภาพหรือ diagonalization ของเมทริกซ์รัฐที่. พวกเขาแสดงให้เห็นว่าเทคนิคนี้สามารถเร่งทุกอะตอมจำลองแมรี่แลนด์ของสารชีวโมเลกุลโดยมากคำสั่งของขนาดและสามารถนำมาใช้ไม่เพียง แต่รำลึกยอมรับ กระจาย Boltzmann แต่ยังตรวจสอบจลนศาสตร์ของระบบ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เสนอเร่ง MD วิธีตามแนวทางของผู้มีสิทธิเลือกตั้ง grubmuller ก่อนหน้านี้ , และคนอื่น ๆที่ใช้แก้ไขภูมิทัศน์ พลังงานศักย์ ซึ่งขึ้นอยู่กับคำจำกัดความที่ง่ายของการเพิ่มศักยภาพในการส่งเสริมการวิจัยเข้มเหตุการณ์ของระบบโมเลกุลในระบบชีวโมเลกุล โดยไม่ต้องใช้ความรู้ล่วงหน้าของตำแหน่งของพลังงานที่มีศักยภาพ อุปสรรคหรือ diagonalization ของกระสอบเมทริกซ์พวกเขาพบว่าเทคนิคนี้สามารถเร่งทุกอะตอม MD จำลองของชีวโมเลกุลจากหลายคำสั่งของขนาดและสามารถใช้ไม่เพียง แต่แฝงการรวมมาตรฐานแต่ยังศึกษาจลนพลศาสตร์ของระบบ