A comprehensive DNA barcoding libra

A comprehensive DNA barcoding library is very useful for rapid identification and detection of invasive pest species. We tested the performance of species identification in the economically most damaging group of wood-boring insects - the bark and ambrosia beetles - with particular focus on broad geographical sampling across the boreal Palearctic forests. Neighbour-joining and Bayesian analyses of cytochrome oxidase I (COI) sequences from 151 species in 40 genera revealed high congruence between morphology-based identification and sequence clusters. Inconsistencies with morphological identifications included the discovery of a likely cryptic Nearctic species of Dryocoetes autographus, the possible hybrid origin of shared mitochondrial haplotypes in Pityophthorus micrographus and P. pityographus, and a possible paraphyletic Xyleborinus saxeseni. The first record of Orthotomicus suturalis in North America was confirmed by DNA barcoding. The mitochondrial data also revealed consistent divergence across the Palearctic or Holarctic, confirmed in part by data from the large ribosomal subunit (28S). Some populations had considerable variation in the mitochondrial barcoding marker, but were invariant in the nuclear ribosomal marker. These findings must be viewed in light of the high number of nuclear insertions of mitochondrial DNA (NUMTs) detected in eight bark beetle species, suggesting the possible presence of additional cryptic NUMTs. The occurrence of paralogous COI copies, hybridization or cryptic speciation demands a stronger focus on data quality assessment in the construction of DNA barcoding databases.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ไลบรารีปกรณ์บาร์โค้ดดีเอ็นเอที่ครอบคลุมมีประโยชน์มากสำหรับรหัสอย่างรวดเร็วและการตรวจหาศัตรูพืชแพร่กระจายพันธุ์ เราได้ทดสอบประสิทธิภาพของชนิดในกลุ่มเศรษฐกิจเสียหายมากที่สุดน่าเบื่อไม้แมลง -เปลือกไม้และแอมโบรเซียด้วง - เน้นเฉพาะการสุ่มตัวอย่างทางภูมิศาสตร์กว้างทั่วป่าเขตอา เพื่อนบ้านเข้าร่วมและการวิเคราะห์ทฤษฎีของ cytochrome oxidase ฉัน (COI) ลำดับจาก 151 ชนิด 40 สกุลลงตัวเปิดเผยสูงระหว่างรหัสตามสัณฐานวิทยาและคลัสเตอร์ลำดับใน ไม่สอดคล้องกับรหัสสัณฐานรวมการค้นพบสายพันธุ์ Nearctic ลับแนวโน้มของ Dryocoetes autographus ต้นกำเนิดไฮบริได้ร่วมยล haplotypes Pityophthorus micrographus P. pityographus และเป็นไปได้ paraphyletic Xyleborinus saxeseni ระเบียนแรกของ Orthotomicus suturalis ในอเมริกาเหนือได้รับการยืนยัน โดยปกรณ์บาร์โค้ดดีเอ็นเอ ข้อมูลยลยังเปิดเผยเศรษฐกิจสอดคล้องกันข้ามเขต หรือ Holarctic ยืนยันบางส่วนจากข้อมูลย่อย ribosomal ใหญ่ (28S) ประชากรบางส่วนมีความผันแปรมากในหมายยลปกรณ์บาร์โค้ด แต่การบล็อกในหมาย ribosomal นิวเคลียร์ ค้นพบเหล่านี้ต้องดูในแง่จำนวนแทรกนิวเคลียร์ของจื่อ (NUMTs) พบในสายพันธุ์ของด้วงเจาะไม้แปด นำสถานะของ NUMTs ลับเพิ่มเติมเป็นไปได้สูง การเกิดขึ้นของสำเนา COI paralogous, hybridization หรือสปีลับต้องแข็งแกร่งเน้นการประเมินคุณภาพของข้อมูลในการก่อสร้างฐานปกรณ์บาร์โค้ดดีเอ็นเอ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ห้องสมุดดีเอ็นเอบาร์โค้ดที่ครอบคลุมเป็นประโยชน์อย่างมากสำหรับการระบุอย่างรวดเร็วและการตรวจสอบของสายพันธุ์ศัตรูพืชรุกราน เราได้ทดสอบประสิทธิภาพของบัตรประจำตัวสายพันธุ์ในกลุ่มเศรษฐกิจที่สร้างความเสียหายมากที่สุดของแมลงไม้ที่น่าเบื่อ - เปลือกไม้และทิพย์ด้วง - มีความสำคัญโดยเฉพาะอย่างยิ่งในการสุ่มตัวอย่างทางภูมิศาสตร์ในวงกว้างทั่วทั้งป่า Palearctic เหนือ เพื่อนบ้านเข้าสู่คชกรรมและวิเคราะห์ cytochrome oxidase ฉัน (COI) ลำดับจาก 151 สายพันธุ์ใน 40 จำพวกเปิดเผยความสอดคล้องกันสูงระหว่างประจำตัวประชาชนตามลักษณะทางสัณฐานวิทยาและกลุ่มลำดับ ไม่สอดคล้องกับการวินิจฉัยทางสัณฐานวิทยารวมถึงการค้นพบน่าจะเป็นสายพันธุ์ที่คลุมเครือของ Nearctic Dryocoetes autographus ที่มาไฮบริดเป็นไปได้ของ haplotypes ยลร่วมกันใน Pityophthorus micrographus พี pityographus และที่เป็นไปได้ paraphyletic saxeseni Xyleborinus บันทึกแรกของ suturalis Orthotomicus ในทวีปอเมริกาเหนือได้รับการยืนยันโดยบาร์โค้ดดีเอ็นเอ ข้อมูลยลยังเผยให้เห็นความแตกต่างที่สอดคล้องกันระหว่างพาลีอาร์คติหรือ Holarctic ได้รับการยืนยันในส่วนของข้อมูลจากโซมอล subunit ขนาดใหญ่ (28S) ประชากรบางส่วนมีการเปลี่ยนแปลงอย่างมากในเครื่องหมายบาร์โค้ดยล แต่ก็คงอยู่ในเครื่องหมายโซมนิวเคลียร์ การค้นพบเหล่านี้จะต้องถูกมองในแง่ของจำนวนมากของการแทรกนิวเคลียร์ยลดีเอ็นเอ (NUMTs) ตรวจพบในแปดเปลือกด้วงชนิดแนะนำการแสดงตนเป็นไปได้ของ NUMTs ลับเพิ่มเติม การเกิดขึ้นของสำเนา COI paralogous พันธุ์หรือ speciation ลับความต้องการที่แข็งแกร่งในการมุ่งเน้นการประเมินข้อมูลที่มีคุณภาพในการก่อสร้างของฐานข้อมูลดีเอ็นเอบาร์โค้ด

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ครอบคลุมดีเอ็นเอ barcoding ห้องสมุดมีประโยชน์มากสำหรับการตรวจสอบอย่างรวดเร็วของแมลงศัตรูพืชที่รุกราน . เราได้ทดสอบประสิทธิภาพของการระบุชนิดในทางเศรษฐกิจมากที่สุดในกลุ่มของแมลงทำลายไม้น่าเบื่อ - เปลือกและทิพย์ด้วง - ด้วยการมุ่งเน้นเฉพาะในวงกว้างทางภูมิศาสตร์เพื่อข้ามเหนือพาลี ร์กติกป่า เพื่อนบ้านร่วมงานและคชกรรมการวิเคราะห์นกลุมพู ( ลำปาง ) ลำดับจาก 151 ชนิด 40 สกุลพบความสอดคล้องกันระหว่างสัณฐานวิทยาของตัวสูงและกลุ่มลำดับตาม ไม่สอดคล้องกับลักษณะทางสัณฐานวิทยาการแสดงตัวของรวมการค้นพบของโอกาสที่ nearctic ชนิด dryocoetes autographus , เป็นไปได้ ไฮบริดที่มาร่วมกันยลแฮปใน pityophthorus micrographus และ P . pityographus และเป็นไปได้ paraphyletic xyleborinus saxeseni . บันทึกแรกของ orthotomicus suturalis ในทวีปอเมริกาเหนือได้รับการยืนยันโดย barcoding ดีเอ็นเอ ตัดข้อมูลที่พบสอดคล้องความแตกต่างข้ามพาลี ร์กติก หรือ ฮอลาร์กติก ยืนยัน ในส่วน โดยข้อมูลจากหน่วยย่อยขนาดใหญ่ไรโบโซม ( 28s ) มีประชากรมีมากการเปลี่ยนแปลงในไมโตคอนเดรีย barcoding เครื่องหมาย แต่มีความหมายไรโบโซมอล นิวเคลียร์ ข้อมูลเหล่านี้จะต้องดูในแง่ของจำนวนของนิวเคลียร์ใหม่ของดีเอ็นเอ ( numts ) ที่ตรวจพบในแปดเปลือกด้วงชนิด แสดงสถานะที่เป็นไปได้ของ numts ลับเพิ่มเติม การเกิดของชุดผม paralogous hybridization หรือคลุมเครือ , ชนิดความต้องการแข็งแกร่ง เน้นการประเมินคุณภาพข้อมูลในการสร้างดีเอ็นเอ barcoding ฐานข้อมูล