The systematics of species of Hypoc

The systematics of species of Hypocrea with green ascospores and their Trichoderma anamorphs is presented. Multiple phenotypic characters were analysed, including teleomorph and anamorph, as well as colony morphology and growth rates at various temperatures. In addition, phylogenetic analyses of two genes, the RNA polymerase II subunit (RPB2) and translation elongation factor 1-alpha (EF-1α), were performed. These analyses revealed that species of Hypocrea with green ascospores and Trichoderma anamorphs are derived from within Hypocrea but do not form a monophyletic group. Therefore, Creopus and Chromocrea, genera formerly segregated from Hypocrea only based on their coloured ascospores, are considered synonyms of Hypocrea. The present study showed that phenotypic characters alone are generally not helpful in understanding phylogenetic relationships in this group of organisms, because teleomorph characters are generally highly conserved and anamorph characters tend to be morphologically divergent within monophyletic lineages or clades. The species concept used here for Hypocrea/Trichoderma is based on a combination of phenotypic and genotypic characteristics. In this study 40 species of Hypocrea/Trichoderma having green ascospores are described and illustrated. Dichotomous keys to the species are given. The following species are treated (names in bold are new species or new combinations): H. albocornea, H. atrogelatinosa, H. aureoviridis/T. aureoviride, H. candida/T. candidum, H. catoptron/T. catoptron, H. centristerilis, H. ceracea/T. ceraceum, H. ceramica/T. ceramicum, H. chlorospora/T. chlorosporum, H. chromosperma/T. chromospermum, H. cinnamomea/T. cinnamomeum, H. clusiae, H. cornea, H. costaricensis, H. crassa/T. crassum, H. cremea/T. cremeum, H. cuneispora/T. cuneisporum, H. estonica/T. estonicum, H. gelatinosa/T. gelatinosum, H. gyrosa, H. lixii/T. harzianum, H. macrospora, H. melanomagna/T. melanomagnum, H. nigrovirens/T. nigrovirens, H. phyllostachydis/T. phyllostachydis, H. rugulosa, H. sinuosa/T. sinuosum, H. spinulosa, H. straminea/T. stramineum, H. strictipilosa/T. strictipile, H. substipitata, H. sulawesensis, H. surrotunda/T. surrotundum, H. tawa/T. tawa, H. thailandica/T. thailandicum, H. thelephoricola/T. thelephoricola, H. tuberosa, H. velenovskyi, H. virens/T. virens, and H. virescentiflava. The following species are excluded: H. andinogelatinosa, H. dacrymycella, H. dichromospora, H. palmicola, H. pseudogelatinosa, H. subalbocornea, H. subatrogelatinosa, H. tropicosinensis, H. viscidula, H. viridis, and Chromocrea leucostroma.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

อนุกรมวิธานของพันธุ์ของ Hypocrea มี ascospores เขียว Trichoderma anamorphs ของพวกเขาจะแสดง อักขระหลายไทป์ถูก analysed รวมทั้ง teleomorph และ anamorph ตลอดจนราคาสัณฐานวิทยาและการเจริญเติบโตของโคโลนีที่อุณหภูมิต่าง ๆ นอกจากนี้ วิเคราะห์ phylogenetic ยีนสอง อาร์เอ็นเอพอลิเมอเรส II ย่อย (RPB2) และแปล elongation ปัจจัย 1-อัลฟ่า (EF-1α) ดำเนิน วิเคราะห์เหล่านี้เปิดเผยว่า พันธุ์ Hypocrea มี ascospores เขียว Trichoderma anamorphs มาจากภายใน Hypocrea แต่แบบกลุ่ม monophyletic ดังนั้น Creopus และ Chromocrea สกุลเดิม แยกจาก Hypocrea ใน ascospores ของสี การถือเป็นคำเหมือนของ Hypocrea การศึกษาปัจจุบันพบว่า ไทป์ตัวคนเดียวโดยทั่วไปไม่เป็นประโยชน์ในการศึกษาเนื่องจากอักขระ teleomorph จะโดยทั่วไปสูงอาศัย และอักขระ anamorph มักขันติธรรม morphologically ภายในเชื้อชาติ monophyletic หรือ clades phylogenetic ความสัมพันธ์ในกลุ่มนี้ของสิ่งมีชีวิต แนวคิดชนิดใช้สำหรับ Hypocrea/Trichoderma นี่ขึ้นอยู่กับการรวมกันของลักษณะฟีโนไทป์ และจีโนไทป์ ในการศึกษานี้ พันธุ์ Hypocrea/Trichoderma มี ascospores เขียว 40 จะอธิบาย และภาพประกอบ แป้น dichotomous เพื่อสายพันธุ์ให้ ชนิดต่อไปนี้จะถือว่า (ชื่อที่เป็นตัวหนาเป็นสายพันธุ์ใหม่หรือชุดใหม่): H. albocornea, H. atrogelatinosa, aureoviride H. aureoviridis/ต., candidum H. แคน/ต. catoptron H. catoptron/ต., H. centristerilis, H. ceracea/ต. ceraceum, H. ceramica/ต. ceramicum, H. chlorospora/ต. chlorosporum, H. chromosperma/ต. chromospermum, H. cinnamomea/ต. cinnamomeum, H. clusiae กระจกตา H., H. costaricensis, crassum H. crassa/ต. , Cremeum H. cremea/ต., H. cuneispora/ต. cuneisporum, H. estonica/ต. estonicum, H. gelatinosum gelatinosa/ต., H. gyrosa, H./ต. lixii harzianum, H. macrospora, melanomagnum H. melanomagna/ต., nigrovirens H. nigrovirens/ต., phyllostachydis H. phyllostachydis/ต., H. rugulosa, sinuosum H. sinuosa/ต., H. spinulosa, stramineum H. straminea/ต., H. strictipilosa/ต. strictipile, H. substipitata, H. sulawesensis, surrotundum H. surrotunda/ต., tawa H. tawa/ต. , H. thailandica/ต. thailandicum, H. thelephoricola/ต. thelephoricola, H. tuberosa, H. velenovskyi, H. virens/ต. virens และ H. virescentiflava ชนิดต่อไปนี้จะไม่รวม: H. andinogelatinosa, H. dacrymycella, H. dichromospora, H. palmicola, H. pseudogelatinosa, H. subalbocornea, H. subatrogelatinosa, H. tropicosinensis, H. viscidula, H. viridis และ Chromocrea leucostroma

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ระบบของสายพันธุ์ของ Hypocrea กับ ascospores สีเขียวและ anamorphs เชื้อรา Trichoderma ของพวกเขาจะนำเสนอ ตัวละครหลายฟีโนไทป์วิเคราะห์รวมทั้ง teleomorph และ anamorph เช่นเดียวกับลักษณะทางสัณฐานวิทยาอาณานิคมและอัตราการเจริญเติบโตที่อุณหภูมิต่างๆ นอกจากนี้การวิเคราะห์สายวิวัฒนาการของทั้งสองยีน rna โพลิเมอร์ที่สอง subunit (RPB2) และปัจจัยการยืดตัวแปล 1 อัลฟา (EF-1α) ถูกดำเนินการ การวิเคราะห์เหล่านี้แสดงให้เห็นว่าสายพันธุ์ของ Hypocrea กับ ascospores สีเขียวและ anamorphs เชื้อรา Trichoderma จะได้มาจากภายใน Hypocrea แต่ไม่ก่อให้เกิดกลุ่มไฟย์เลติ ดังนั้น Creopus และ Chromocrea, จำพวกก่อนแยกจาก Hypocrea อยู่เฉพาะใน ascospores สีของพวกเขาได้รับการพิจารณาคำพ้องความหมายของ Hypocrea การศึกษาครั้งนี้แสดงให้เห็นว่าตัวละครฟีโนไทป์คนเดียวมักจะไม่เป็นประโยชน์ในการทำความเข้าใจความสัมพันธ์ของสายวิวัฒนาการในกลุ่มของสิ่งมีชีวิตนี้เพราะตัวละครมักจะ teleomorph ป่าสงวนและตัวอักษร anamorph มีแนวโน้มที่จะสัณฐานที่แตกต่างกันภายใน lineages ไฟย์เลติหรือ clades แนวคิดสายพันธุ์ที่นำมาใช้ที่นี่สำหรับ Hypocrea / เชื้อรา Trichoderma จะขึ้นอยู่กับการรวมกันของลักษณะทางพันธุกรรมและฟีโนไทป์ ในการศึกษานี้ 40 ชนิดของ Hypocrea / เชื้อรา Trichoderma ascospores มีสีเขียวจะมีการอธิบายและภาพประกอบ dichotomous กุญแจชนิดจะได้รับ สายพันธุ์ที่ได้รับการรักษาต่อไปนี้เป็น (ชื่อตัวหนาเป็นสายพันธุ์ใหม่หรือชุดใหม่): albocornea เอชเอช atrogelatinosa เอช aureoviridis / T aureoviride เอชเชื้อราแคนดิดา / T candidum เอช catoptron / T catoptron เอช centristerilis เอช ceracea / T ceraceum เอช Ceramica / T ceramicum เอช chlorospora / T chlorosporum เอช chromosperma / T chromospermum เอช cinnamomea / T cinnamomeum เอช clusiae กระจกตาเอชเอช costaricensis เอช crassa / T crassum เอช cremea / T cremeum เอช cuneispora / T cuneisporum เอช estonica / T estonicum เอช gelatinosa / T gelatinosum เอช gyrosa เอช lixii / T harzianum เอช macrospora เอช melanomagna / T melanomagnum เอช nigrovirens / T nigrovirens เอช phyllostachydis / T phyllostachydis เอช rugulosa เอช sinuosa / T sinuosum เอช spinulosa เอช straminea / T stramineum เอช strictipilosa / T strictipile เอช substipitata เอช sulawesensis เอช surrotunda / T surrotundum เอช Tawa / T Tawa เอช thailandica / T thailandicum เอช thelephoricola / T thelephoricola เอช tuberosa เอช velenovskyi เอช virens / T virens และเอช virescentiflava สายพันธุ์ที่ได้รับการยกเว้นดังต่อไปนี้: andinogelatinosa เอชเอช dacrymycella เอช dichromospora เอช palmicola เอช pseudogelatinosa เอช subalbocornea เอช subatrogelatinosa เอช tropicosinensis เอช viscidula เอชดิสและ Chromocrea leucostroma

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ในระบบของชนิดของ hypocrea กับ ascospores สีเขียวและ anamorphs เชื้อราของพวกเขาจะนำเสนอ หลายคุณสมบัติตัวละครที่นำมาศึกษา ได้แก่ teleomorph และ anamorph ตลอดจนลักษณะของโคโลนีและอัตราการเจริญเติบโตที่อุณหภูมิต่าง ๆ นอกจากนี้การวิเคราะห์ยีนสองชนิด , อาร์เอ็นเอพอลิเมอเรส II subunit ( rpb2 ) และการแปลการปัจจัย 1-alpha ( ef-1 α )ในการวิจัย เหล่านี้พบว่าชนิดของ hypocrea กับ ascospores สีเขียวและ Trichoderma anamorphs มาจากภายใน hypocrea แต่ไม่ตั้งกลุ่ม monophyletic . ดังนั้น creopus และ chromocrea สกุลเดิม , แยกจาก hypocrea เท่านั้นตามสี ascospores จะมีการพิจารณาคำพ้องความหมายของ hypocrea .การศึกษาพบว่าลักษณะปรากฏอักขระคนเดียวมักจะไม่ได้ประโยชน์ในความเข้าใจความสัมพันธ์ ซึ่งในกลุ่มของสิ่งมีชีวิต เพราะ teleomorph ตัวอักษรโดยทั่วไปที่มีการอนุรักษ์และตัวอักษร anamorph มีแนวโน้มที่จะจากอเนกภายในเชื้อสาย monophyletic หรือ clades .ชนิดของแนวคิดใช้ที่นี่ hypocrea / เชื้อราจะขึ้นอยู่กับการรวมกันของลักษณะปรากฏและการศึกษาลักษณะ ในการศึกษานี้ 40 ชนิดของเชื้อราที่มีสีเขียว hypocrea / ascospores อธิบายและภาพประกอบ ไดโคโตมัสคีย์ชนิดที่ได้รับ ต่อไปนี้ชนิดรักษา ( ชื่อเป็นตัวหนาเป็นสายพันธุ์ใหม่หรือชุดใหม่ ) : H . albocornea H atrogelatinosa Haureoviridis / ต. aureoviride เอช แคนดิด / ต. candidum H catoptron / ต. catoptron H centristerilis H ceracea / ต. ceraceum เอช เซรามิก / ต. ceramicum H chlorospora / ต. chlorosporum H chromosperma / ต. chromospermum เอช ฤทธิ์ทางชีวภาพ / ต. cinnamomeum H clusiae เอช เอช costaricensis กระจกตา crassa / ต. crassum H , H . cremea / ต. cremeum H cuneispora / ต. cuneisporum H estonica / ต. estonicum Hgelatinosa / ต. gelatinosum H gyrosa H lixii / T . harzianum , H . macrospora H melanomagna / ต. melanomagnum H nigrovirens / ต. nigrovirens H phyllostachydis / ต. phyllostachydis บทบาท , H . H sinuosa / ต. sinuosum H spinulosa H straminea / ต. stramineum H strictipilosa / ต. strictipile H substipitata sulawesensis H , H . surrotunda / ต. surrotundum เอช ตะวา / ต. ตะวา O.woodmasoni / T . Hthailandicum H thelephoricola / ต. thelephoricola , H . จาก H velenovskyi , H . virens / T . virens และ H . virescentiflava . ชนิดเหล่านี้จะถูกแยกออก andinogelatinosa : H H dacrymycella H dichromospora H palmicola H pseudogelatinosa H subalbocornea H subatrogelatinosa H tropicosinensis H viscidula เอช ไฮโดรคาร์บอน และ chromocrea leucostroma .