Linear model vs. survival analysis

Linear model vs. survival analysis for genetic evaluation of sires for longevity in Chianina beef cattle

Abstract
The objective of this study was to compare sire EBVs for longevity in Chianina beef cattle estimated with linear models and survival analysis. Two datasets were created, one considered all data (SURVall), the other only uncensored records (SURVun). The linear models were used to analyze longevity measured as three correlated dichotomous (yes/no) measures of survival in the first three parities (LIN-S3) and as an overall measure of lifespan in months (LIN-LPL). Correlation between sire EBVs from the two survival analyses were 0.85. For LIN-S3 the correlations of EBVs across parities were between 0.69 to 0.93. Medium correlations (from 0.50 to 0.62) were found when only uncensored data (SURVun) were compared to the linear model (LIN-S3). Higher correlations (from 0.71 to 0.93) were found when EBV based on both censored and uncensored data (SURVall) were compared to LIN-S3. Heritability was estimated at 0.11, 0.09 and 0.08 for SURVall, SURVun and LIN-LPL, respectively; and 0.05, 0.02 and 0.02, respectively, for survival in the first three parities according to LIN-S3. Linear and non-linear models differed in many aspects; the most precise EBV were obtained when all data was used in the evaluation.

Keywords
Beef cattle; Chianina; Genetic parameters; Breeding values; Longevity

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

แบบจำลองเชิงเส้นเทียบกับรอดวิเคราะห์ประเมินพันธุกรรมของพ่อพันธุ์โคในลักษณะใน Chianina เนื้อวัวบทคัดย่อวัตถุประสงค์ของการศึกษานี้เพื่อ เปรียบเทียบ EBVs เดินในลักษณะใน Chianina เนื้อวัวประมาณการ ด้วยแบบจำลองเชิงเส้นและการวิเคราะห์ความอยู่รอดได้ สร้าง datasets สอง หนึ่งพิจารณาข้อมูลทั้งหมด (SURVall), อื่น ๆ เพียงแอบระเบียน (SURVun) ใช้แบบจำลองเชิงเส้นการวิเคราะห์ลักษณะวัดเป็นสาม correlated dichotomous (ใช่/ไม่) มาตรการการอยู่รอด ใน parities ก่อนสาม (หลิน-S3) และ เป็นการวัดอายุโดยรวมในเดือน (หลินเอส) ความสัมพันธ์ระหว่าง EBVs เดินจากวิเคราะห์อยู่รอดสองได้ 0.85 สำหรับหลิน-S3 สัมพันธ์ของ EBVs ข้าม parities อยู่ระหว่าง 0.69-0.93 ความสัมพันธ์ปานกลาง (ตั้งแต่ 0.50 ถึง 0.62) พบเมื่อเฉพาะแอบข้อมูล (SURVun) ได้เปรียบเทียบกับแบบจำลองเชิงเส้น (หลิน-S3) ความสัมพันธ์สูง (ตั้งแต่ 0.71 ถึง 0.93) พบ EBV ตามทั้ง censored และข้อมูลแอบ (SURVall) ได้เปรียบเทียบกับ S3 หลิน Heritability ได้ประมาณ ที่ 0.11, 0.09 0.08 SURVall, SURVun และหลิน เอส ตามลำดับ และ 0.05, 0.02 และ 0.02 ตามลำดับ เพื่อความอยู่รอดใน parities ก่อนสามตามหลิน-S3 แบบจำลองเชิงเส้น และไม่เชิงเส้นที่แตกต่างแง่ EBV แม่นยำที่สุดได้รับเมื่อมีใช้ข้อมูลทั้งหมดในการประเมินคำสำคัญเนื้อวัว Chianina พารามิเตอร์ทางพันธุกรรม ค่าผสมพันธุ์ ลักษณะ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

โมเดลเชิงเส้นตรงกับการวิเคราะห์การอยู่รอดสำหรับการประเมินผลทางพันธุกรรมของตระกูลสำหรับยืนยาวใน Chianina โคเนื้อบทคัดย่อวัตถุประสงค์ของการศึกษาครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อเปรียบเทียบ EBVs ฝ่าบาทสำหรับยืนยาวใน Chianina โคเนื้อประมาณที่มีรูปแบบเชิงเส้นและการวิเคราะห์การอยู่รอด สองถูกสร้างชุดข้อมูลหนึ่งพิจารณาข้อมูลทั้งหมด (SURVall), อื่น ๆ ที่แอบบันทึกเท่านั้น (SURVun) รูปแบบเชิงเส้นถูกนำมาใช้ในการวิเคราะห์ยืนยาววัดสามความสัมพันธ์ dichotomous (Yes / No) มาตรการของการอยู่รอดในครั้งแรกที่สาม parities (LIN-S3) และเป็นมาตรการโดยรวมของอายุการใช้งานในเดือน (LIN- LPL) ความสัมพันธ์ระหว่าง EBVs ฝ่าบาทจากทั้งสองการวิเคราะห์การอยู่รอดเป็น 0.85 สำหรับ LIN-S3 ความสัมพันธ์ของ EBVs ทั่ว parities อยู่ระหว่าง 0.69-0.93 ความสัมพันธ์กลาง (0.50-0.62) พบเมื่อข้อมูลที่แอบเท่านั้น (SURVun) ถูกนำมาเปรียบเทียบกับรูปแบบเชิงเส้น (LIN-S3) ความสัมพันธ์อุดมศึกษา (0.71-0.93) พบเมื่อ EBV บนพื้นฐานของข้อมูลทั้งเซ็นเซอร์และไม่แน่ใจ (SURVall) ถูกเมื่อเทียบกับ LIN-S3 พันธุกรรมที่ประมาณ 0.11, 0.09 และ 0.08 สำหรับ SURVall, SURVun และ LIN-LPL ตามลำดับ; และ 0.05, 0.02 และ 0.02 ตามลำดับสำหรับการอยู่รอดในครั้งแรกที่สาม parities ตาม LIN-S3 เชิงเส้นและรูปแบบไม่ใช่เชิงเส้นที่แตกต่างกันในหลาย ๆ ด้าน; . EBV ที่แม่นยำที่สุดเมื่อได้รับข้อมูลทั้งหมดถูกนำมาใช้ในการประเมินผลคำวัว; Chianina; พารามิเตอร์ทางพันธุกรรม; ค่าการผสมพันธุ์; อายุยืน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

รูปแบบเชิงเส้นและการวิเคราะห์การอยู่รอดสำหรับพันธุกรรมการประเมินพ่อพันธุ์โคเนื้อเพื่ออายุการใช้งานในคีนินา

บทคัดย่อ วัตถุประสงค์ของการศึกษานี้เพื่อเปรียบเทียบครับ ebvs สำหรับอายุการใช้งานในเคียนนีนาโคเนื้อประมาณแบบเชิงเส้นกับการอยู่รอดและการวิเคราะห์ สองชุดข้อมูลที่ถูกสร้างขึ้นหนึ่งพิจารณาข้อมูลทั้งหมด ( survall ) , อื่น ๆเพียง Uncensored ประวัติ ( survun )แบบจำลองเชิงวิเคราะห์อายุยืนวัดสามความสัมพันธ์ไดโคโตมัส ( ใช่ / ไม่ใช่ ) มาตรการของการอยู่รอดใน 3 parities แรก ( lin-s3 ) และเป็นวัดของอายุการใช้งานโดยรวมในเดือน lin-lpl ) ความสัมพันธ์ระหว่างฝ่าบาท ebvs จากสองรอดวิเคราะห์เป็น 0.85 สำหรับ lin-s3 ความสัมพันธ์ของ ebvs ข้ามระหว่าง 0.93 0.69 parities . มีความสัมพันธ์ปานกลาง ( จาก 050 ถึง 0.62 ) พบเพียงข้อมูล Uncensored ( survun ) เปรียบเทียบกับแบบจำลองเชิงเส้น ( lin-s3 ) การศึกษาสูง ( จาก 0.71 0.93 ) พบเมื่ออีบีวีจากทั้งเซ็นเซอร์และข้อมูล Uncensored ( survall ) เปรียบเทียบกับ lin-s3 . การประมาณ 0.11 , 0.09 และ 0.08 สำหรับ survall survun lin-lpl , และ ตามลำดับ และ 0.01 , 0.02 และ 0.02 ตามลำดับเพื่อความอยู่รอดใน 3 parities แรกตาม lin-s3 . ตัวแบบเชิงเส้นและแบบไม่เชิงเส้นแตกต่างกันในหลายด้าน และอีบีวีแม่นยำที่สุดได้เมื่อข้อมูลทั้งหมดถูกใช้ในการประเมินค่า

คำสำคัญ
โคเนื้อ ; คีนินา ; พารามิเตอร์ทางพันธุกรรม ; ค่าการผสมพันธุ์ ; อายุยืน