Background: In 2009, 3 genome-wide

Background: In 2009, 3 genome-wide association studies implicated IL28B single-nucleotide
polymorphisms (SNPs) as the strongest genetic pretreatment predictor of sustained
virological response (SVR) in hepatitis C infection. Recently, the American Association
for the Study of Liver Diseases (AASLD) and the European Association for the Study of
the Liver (EASL) included IL28B testing in their guidelines.
Objectives: The main aim of this study was to develop and validate a simple, rapid, and
inexpensive polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism
(PCR-RFLP) method for genotyping of common IL28B polymorphisms (rs12979860 and
rs8099917).
Patients and Methods: Two methods were developed to genotype common IL28B polymorphisms:
1) PCR-sequencing as a reference method and 2) PCR-RFLP as a rapid and
inexpensive method. Both polymorphisms were genotyped in 104 Iranian hepatitis C patients
by both methods simultaneously. To validate the PCR-RFLP method, the PCR-RFLP
genotyping results should be 100% concordant with the PCR-sequencing results.
Results: Genotyping of rs12979860 and rs8099917 by PCR-RFLP was concordant with
PCR-sequencing in 104 (100%) individuals. The analytical sensitivity and specificity of
the PCR-RFLP method for genotyping of both SNPs are 100%. Among these 104 patients
with chronic hepatitis C, the frequency of the rs12979860 CC, CT and TT genotypes were
40.4%, 47.1% and 12.5% and the frequency of the rs8099917 TT, GT and GG genotypes were
59.6%, 35.6% and 4.8%, respectively. Also, three IL28B haplotypes (rs12979860-rs8099917)
were found among our patients including C-T, T-G and T-T with 63.9%, 22.6% and 13.5%
frequency, respectively. C-G haplotype was absent in all of our patients.
Conclusions: We have developed a validated, fast, and simple PCR-RFLP method for genotyping
of common IL28B SNPs that is more cost-effective than sequencing.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

พื้นหลัง: 2552 ศึกษาจีโนมทั้งสมาคม 3 อู๊ดนิวคลีโอไทด์ IL28B เดียวยั่งยืน polymorphisms (SNPs) เป็นจำนวนประตู pretreatment ทางพันธุกรรมที่แข็งแกร่งของตอบ virological (SVR) ในโรคติดเชื้อ สมาคมอเมริกันล่าสุดการศึกษาโรคตับ (AASLD) และสมาคมยุโรปเพื่อการศึกษาตับ (EASL) รวม IL28B ทดสอบในแนวทางของพวกเขาวัตถุประสงค์: วัตถุประสงค์หลักของการศึกษานี้คือการ พัฒนา และตรวจสอบง่าย รวดเร็ว และโพลิมอร์ฟิซึมยาวของส่วนจำกัดปฏิกิริยาลูกโซ่พอลิเมอเรสที่ราคาไม่แพง(PCR-RFLP) วิธีการ genotyping polymorphisms IL28B ทั่วไป (rs12979860 และrs8099917)ผู้ป่วยและวิธีการ: วิธีการสองวิธีพัฒนาขึ้นเพื่อ polymorphisms IL28B ทั่วไปลักษณะทางพันธุกรรม:1) PCR-ลำดับเป็นวิธีการอ้างอิงและ 2) PCR-RFLP เป็นรวดเร็ว และวิธีราคาไม่แพง Polymorphisms สองถูก genotyped ในผู้ป่วยตับอักเสบ C อิหร่าน 104โดยทั้งสองวิธีพร้อม ๆ กัน การตรวจสอบวิธี PCR-RFLP, PCR-RFLPผล genotyping ควร concordant ผล PCR ลำดับ 100%ผลลัพธ์: Genotyping rs12979860 และ rs8099917 โดย PCR-RFLP ถูก concordant ด้วยPCR-ลำดับใน 104 คน (100%) การวิเคราะห์ความไวและ specificity ของวิธี PCR-RFLP ใน genotyping ของ SNPs ทั้ง 100% ได้ ในผู้ป่วยเหล่านี้ 104ด้วยโรคตับอักเสบ C มีความถี่ rs12979860 CC, CT และการศึกษาจีโนไทป์ TT40.4%, 47.1% และ 12.5% และความถี่ของการ rs8099917 TT, GT และ GG59.6%, 35.6% และ 4.8% ตามลำดับ ยัง สาม IL28B haplotypes (rs12979860-rs8099917)พบผู้ป่วยรวมถึง C-T, T-G และ T-T ของเรากับ 63.9%, 22.6% และ 13.5%ความถี่ ตามลำดับ C-G haplotype ขาดในทั้งหมดของผู้ป่วยบทสรุป: เราได้พัฒนาวิธี PCR-RFLP ตรวจ รวดเร็ว และง่ายสำหรับ genotypingของ SNPs IL28B ทั่วไปที่มีประสิทธิภาพมากขึ้นกว่าลำดับ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

พื้นหลัง: ในปี 2009 การศึกษา 3 สมาคมจีโนมทั้งที่เกี่ยวข้องเดียวเบื่อหน่าย IL28B
หลากหลาย (SNPs) ตามที่ทำนายการปรับสภาพทางพันธุกรรมที่แข็งแกร่งอย่างยั่งยืนของ
การตอบสนองต่อไวรัสวิทยา (SVR) ในการติดเชื้อไวรัสตับอักเสบซี เมื่อเร็ว ๆ นี้สมาคมอเมริกัน
เพื่อการศึกษาของโรคตับ (AASLD) และสมาคมยุโรปเพื่อการศึกษาของ
ตับ (EASL) รวมถึงการทดสอบ IL28B ในแนวทางของพวกเขา.
วัตถุประสงค์จุดมุ่งหมายหลักของการศึกษาครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อพัฒนาและตรวจสอบง่าย, อย่างรวดเร็วและ
ราคาไม่แพงโพลิเมอร์ปฏิกิริยาลูกโซ่-ข้อ จำกัด ส่วน length polymorphism
(PCR-RFLP) วิธีการ genotyping ของความหลากหลาย IL28B ทั่วไป (rs12979860 และ
rs8099917).
ผู้ป่วยและวิธีการ: สองวิธีถูกพัฒนาขึ้นเพื่อ genotype หลากหลาย IL28B ทั่วไป:
1) PCR-เป็นลำดับ วิธีการอ้างอิงและ 2) PCR-RFLP เป็นอย่างรวดเร็วและ
วิธีการที่ไม่แพง ทั้งความหลากหลายถูก genotyped ใน 104 ผู้ป่วยโรคไวรัสตับอักเสบอิหร่าน C
โดยวิธีการทั้งสองพร้อมกัน เพื่อตรวจสอบวิธี PCR-RFLP, PCR-RFLP
ผล genotyping ควรจะเป็น 100% สอดคล้องกับผล PCR-ลำดับ.
ผลการศึกษา: Genotyping ของ rs12979860 และ rs8099917 โดย PCR-RFLP ก็สอดคล้องกับ
PCR-ลำดับใน 104 (100%) บุคคล . การวิเคราะห์ความไวและความจำเพาะของ
วิธี PCR-RFLP สำหรับ genotyping ของ SNPs ทั้งสองเป็น 100% กลุ่มคนเหล่านี้ 104 ผู้ป่วย
ที่มีเชื้อไวรัสตับอักเสบซีเรื้อรังความถี่ของ rs12979860 CC, CT และจีโนไทป์ TT เป็น
40.4%, 47.1% และ 12.5% ​​และความถี่ของการ rs8099917 TT, GT และจีโนไทป์ GG เป็น
59.6%, 35.6% และ 4.8% ตามลำดับ นอกจากนี้สาม haplotypes IL28B (rs12979860-rs8099917)
ที่พบในผู้ป่วยของเรารวมถึง CT, TG และซับวูฟเฟอร์ที่มี 63.9%, 22.6% และ 13.5%
ความถี่ตามลำดับ CG haplotype ขาดในทั้งหมดของผู้ป่วยของเรา.
สรุป: เรามีการพัฒนาผ่านการตรวจสอบได้อย่างรวดเร็วและวิธี PCR-RFLP ง่ายสำหรับ genotyping
ของ SNPs IL28B ทั่วไปที่เป็นมีประสิทธิภาพมากขึ้นกว่าการเรียงลำดับ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ประวัติ : ใน 2009 , 3 genome-wide สมาคมการศึกษาที่เกี่ยวข้อง il28b เดี่ยวเบื่อหน่ายความหลากหลาย (
snps ) เป็นที่แข็งแกร่งที่สุดทางพันธุกรรมทำนายการตอบสนองทางไวรัสวิทยา
( SVR ) ไวรัสตับอักเสบ C การติดเชื้อ เมื่อเร็วๆ นี้ สมาคมอเมริกัน
สำหรับการศึกษาโรคตับ ( aasld ) และสมาคมยุโรปเพื่อการศึกษา
ตับ ( easl ) รวม il28b การทดสอบในแนวทางของพวกเขา
วัตถุประสงค์ : วัตถุประสงค์หลักของการศึกษานี้ก็เพื่อพัฒนาและตรวจสอบง่าย รวดเร็ว และ ราคาไม่แพง
ปฏิกิริยาลูกโซ่โพลิเมอร์จำกัด fragment length polymorphism
( ว่า ) วิธีส่งเสริมความหลากหลายของ il28b ทั่วไป ( rs12979860 และ

rs8099917 ) ผู้ป่วยและวิธีการ :2 วิธีคือการพัฒนาพันธุกรรม ความหลากหลาย il28b ทั่วไป :
1 ) PCR เป็นวิธีอ้างอิงลำดับ 2 ) ว่าเป็นวิธีที่รวดเร็วและราคาไม่แพง
. มีทั้งความหลากหลายใน genotyped 104 อิหร่านไวรัสตับอักเสบซีผู้ป่วย
โดยวิธีการทั้งสองพร้อมกัน เพื่อตรวจสอบว่าวิธีการ ว่า
เขตผลลัพธ์ที่ควรจะ 100% และด้วย PCR ผลลำดับ .
ผลลัพธ์ :และเขตของ rs12979860 rs8099917 โดยว่าเป็นสอดคล้องกันกับ
ลำดับใน 104 PCR ( 100% ) บุคคล การวิเคราะห์ความไวและความจำเพาะของวิธี
ว่าเขตของทั้ง snps 100% ในหมู่เหล่านี้ 104 ผู้ป่วย
กับไวรัสตับอักเสบซีเรื้อรัง , ความถี่ของจีโนไทป์และ rs12979860 CC , CT TT )
40.4 % 47.1 % และ 12.5% และความถี่ของ rs8099917 TT ,GT และ GG เมื่อถูก
59.6 % ว % และ 4.8 ตามลำดับ นอกจากนี้สามแฮป il28b ( rs12979860-rs8099917 )
) พบว่า ในผู้ป่วยของเรารวมทั้ง c-t t-g t-t กับ , และร้อยละ 63.9 22.6 % , 13.5 %
ความถี่ตามลำดับ c-g พบขาดในทั้งหมดของผู้ป่วยของเรา .
สรุป : เราได้พัฒนาขึ้นอย่างรวดเร็ว และวิธีที่ง่ายสำหรับการอ่าน
ว่าของ snps il28b ทั่วไปที่คุ้มค่ากว่าของ