ีนาคม 2005 ญี่ปุ่นยื่นโครงการวิจัย JARPA II ต่อคณะกรรมการวิทียาศาสตร์และเริ่มโครงการเมื่อ
พฤศจิกายน 2005 ก่อนทีี่การตรวจสอบโครงการ JARPA ครั้งสุดที้ายโดยคณะกรรมการวิทียาศาสตร์จะแล้วเสรนจ
ทีำานองเดียวกับ JARPA ใบอนุญาตพิเศษทีี่ออกให้ใน JARPA II ญี่ปุ่นออกให้สถึาบันวิจัยวาฬ มูลนิธิทีี่ก่อตั้งในปี
1987 เป็นองค์กรเพื่อประโยชน์สาธารณะตามกฎหมายแพ่งญี่ปุ่น JARPA II ใช้การจับวาฬอย่างรุนแรงกับวาฬมิงก์
วาฬฟินและวาฬหลังค่อม และแผนการวิจัย JARPA II กำาหนดประเดนนสำาคัญไว้ว่า (1) วัตถึุประสงค์สำาคัญสี่อย่าง
คือ การเฝ่้าระวังระบบนิเวศในแอนตาร์กติก การส่งเสริมการแข่งขันในสายพันธุ์และวัตถึุประสงค์ในการจัดการต่อ
ไป การแยกเวลาและลักษณะการกระจายตัวของประชากรวาฬ และการปรับปรุงการจัดการจำานวนวาฬมิงก์ (2)
กำาหนดเวลาและพื้นทีี่ทีดลอง (JARPA II เป็นโครงการต่อเนื่องเป็นช่วง ช่วงละ 6 ปี ไม่มีกำาหนดสิ้นสุด ทีดลองใน
มหาสมุทีรทีางใต้ตามย่อหน้า 7(b) ของตารางแนบที้าย) (3) วิธีทีดลองและจำานวนตัวอย่าง (การทีดลองจาก
ตัวอย่างวาฬมิงก์ 850 ตัว วาฬฟิน 50 ตัวและวาฬหลังค่อม 50 ตัว และวิธีทีี่ไม่รุนแรง เช่นการเกนบตัวอย่างชิ้นเนื้อ
การติดตามด้วยดาวเทีียมและการเฝ่้าสังเกตการณ์ และ (4) พฤติกรรมของจำานวนปลา (ในแผนระบุว่าจาก
ประมาณการความอุดมสมบูรณ์ การจับวาฬก่อให้เกิดผลทีี่จะเป็นทีางลบน้อยมาก)