Contents lists available at ScienceDirect MolecularPhylogeneticsandEvo การแปล - Contents lists available at ScienceDirect MolecularPhylogeneticsandEvo ไทย วิธีการพูด

Contents lists available at Science

Contents lists available at ScienceDirect
MolecularPhylogeneticsandEvolution
journalhomepage:www.elsevier.com/locate/ympev




PhylogeographyandpopulationstructureoftheReevese’sButterflyLizard(Leiolepisreevesii)inferredfrommitochondrialDNAsequences
Long-Hui Lin a,b, Xiang Ji a,*, Cheong-Hoong Diong c,YuDu d, Chi-Xian Lin d
a Jiangsu Key Laboratory for Biodiversity and Biotechnology, College of Life Sciences, Nanjing Normal University, Nanjing 210046, Jiangsu, China b Hangzhou Key Laboratory of Animal Adaptation and Evolution, School of Life Sciences, Hangzhou Normal University, Hangzhou 310036, Zhejiang, China c Faculty of Natural Sciences and Science Education, National Institute of Education, Nanyang Technological University, Singapore 637616, Singapore d Department of Biological Sciences, Qiongzhou University, Wuzhishan 572200, Hainan, China
article info abstract
Article history:
Received 10 October 2009 Revised 21 March 2010 Accepted 23 April 2010 Available online 28 April 2010
Keywords:
Lizard
Leiolepis reevesii
Mitochondrial DNA Cytochrome b Phylogeography Population structure
ButterflylizardsofthegenusLeiolepis(Agamidae)arewidelydistributedincoastalregionsofSoutheastAsiaandSouthChina,withtheReevese’sButterflyLizardLeiolepisreevesiihavingamostnortherlydistri-butionthatrangesfromVietnamtoSouthChina.ToassessthegeneticdiversitywithinL.reevesii,anditspopulationstructureandevolutionaryhistory,wesequenced1004bpofcytochromebfor448individu-alscollectedfrom28localitiescoveringalmostthewholerangeofthelizard.Onehundredandfortyvar-iablesiteswereobserved,and93haplotypesweredefined.Weidentifiedthreegeneticallydistinctclades,ofwhichCladeAincludeshaplotypesmainlyfromsoutheasternHainan,CladeBfromGuangdongandnorthernHainan,andCladeCfromVietnamandtheotherlocalitiesofChina.CladeAwaswelldistin-guishedanddivergentfromtheothertwo.TheWuzhishanandYinggelingmountainrangeswereimpor-tantbarrierslimitinggeneexchangebetweenpopulationsonthebothsidesofthemountainseries,whereastheGulfofTonkinandtheQiongzhouStraitwerenot.OneplausiblescenariotoexplainourgeneticdataisahistoricaldispersionofL.reevesiiasproceedingfromVietnamtoHainan,followedbyasecondwaveofdispersalfromHainantoGuangdongandGuangxi.Anotherequallyplausiblescenarioisahistoricallywidespreadpopulationthathasbeenstructuredbyvicariantfactorssuchasthemoun-tainsinHainanandsealevelfluctuations.

� 2010 Elsevier Inc. All rights reserved.



1. Introduction
The Indo-Burma region encompasses more than 2 million km2 of tropical Asia west of Wallace’s Line, and is one of the most threatenedbiodiversityhotspotsintheworld.Thehotspotbeginsineastern Bangladesh and extends across northeastern India, parts of Yunnan Province of China, Myanmar, Vietnam, Malaysia, Thailand, CambodiaandLaos(Fig.1);italsocoversthecoastallowlandsofSouthChina(GuangxiandGuangdong),aswellasseveraloffshoreislandssuchasHainanIsland(ofChina)intheSouthChinaSeaandAndamanIslands(ofIndia)intheAndamanSea.Onedriverofbiodi-versityinthisregionistherepeatedaccretionofdifferentmicrocon-tinentswithamegacontinentsuchasAsia(Macey et al., 2000). Tectonic processes stimulate episodic restructuring of continental faunasintwoways:faunaldiversityremainsrelativelystableduring times of isolation, whereas rapid faunal turnover occurs during times of contact between tectonic plates (Macey et al., 2000). The Indo-Burma hotspot currently holds remarkable endemism in animal species including agamid lizards of the genus Leiolepis that are
* Corresponding author. Fax: +86 25 85891526.
E-mail address: xji@mail.hz.zj.cn (X. Ji).

1055-7903/$ -see front matter � 2010 Elsevier Inc. All rights reserved. doi:10.1016/j.ympev.2010.04.032
threatenedwithlocalextinctionduetoover-harvesting,habitatloss, and habitat fragmentation.
Lizards of the genus Leiolepis are widely distributed in coastal lowlands of the Indo-Burma hotspot (Fig. 1; Jiang, 1999; Malysheva et al., 2006). The genus contains seven species of large-sized (up to 150 mm snout-vent length) oviparous lizards, with the Reevese’s Butterfly Lizard Leiolepis reevesii having a most northerly distribution that ranges from Vietnam to South China (Guangdong, Guangxi and Hainan) (Jiang, 1999). Leiolepis lizards occur only on the Southeast Asian blocks that broke from the northern margin of the Australia–New Guinea plate hundreds of MYBP and accreted to Asia 120 MYBP (Richter and Fuller, 1996) or earlier (Metcalfe, 1996). Macey et al. (2000) suggestedthattheSoutheastAsianplatesintro-ducedLeiolepisspeciescomplextoAsiaandSouthChina.Onlyonespecies(L.reevesii)occursinChina,inthesouth.
Hainan Island, lying in the northeastern margin of the Indo-Burma hotspot, is influenced by glacially driven eustatic sea-level changes that have caused recent land connections and disconnections among Sumatra, Java, Borneo and the Asian mainland (Hall and Holloway, 1998). The Island is topographically diverse, with the Wuzhishan and Yinggeling Mountains approaching an elevation of 1800 m, rising steeply from the central and southern

Fig. 1. Map of the distribution of the genus Leiolepis (left) and sampling locations of L. reevesii in this study (right). The Arabic numerals in the right plot represent populations grouped according to geographical areas. Shading indicates shoreline limits at times of Pleistocene maximum glaciation. See Table 1 for abbreviation of sample sites. N: The mountain series in Hainan.
regions and giving way to a broad northern plain. However, whether these mountains play an important role in influencing gene exchange among populations of organisms such as L. reevesii remains unclear.
Thequantificationofgeneticvariabilityandpopulationgeneticstructureiscrucialforimprovedmanagementandconservationofnaturalpopulations(Avise, 1989; Marmi et al., 2006), yet genetic variation in Leiolepis has received little empirical scrutiny. Malysheva et al. (2006) examined intraspecific genetic variation of L. reevesii by using multilocus DNA fingerprinting with several microsatellite probes, but their samples were localized in central Vietnam. Until now, there are no comparable sequence data on L. reevesii from geographically separated populations, although such data are urgently needed to elucidate the evolutionary history of the species and contemporary population genetic structure and to guide the development of appropriate management and conservation strategy for the lizard.
The effects of historical events on faunal movements outlined by Macey et al. (2000) and the range of L. reevesii in South China raise several questions that form the basis of this study: (1) How did Leiolepis extend its historical range into China? Did the dispersal route proceed from Vietnam in a northerly direction to Chinese mainland and then southerly from Chinese mainland to Hainan, or easterly from Vietnam to Hainan and then northerly from Hainan to Chinese mainland? (2) How important were the Wuzhishan and Yinggeling mountain ranges and the sea barrier in the Gulf of Tonkin and the Qiongzhou Strait to gene flow (Fig. 1)?(3)WhatisthedemographichistoryofL.reevesiiandtheeventsthatshapeditspopulationdemography?(4)WhatisthelevelofgeneticvariabilityamongpopulationsofL.reevesiiandhowisthevariationpartitionedwithinpopulations?
2. Materials and methods
2.1. Sample collection and DNA extraction
To answer the above questions, we sequenced the mitochondrial cytochrome b gene from 448 individuals. The study sample represents 16 adults of L reevesii collected between 2007 and 2008 from each of 28 sampling localities almost covering the species’ distribution range from Chinese mainland (Guangdong and Guangxi) to Hainan (the largest island second to Taiwan in China) and Vietnam (Fig. 1).Duringourcollectingtriptothecoastalre-gionofVietnamandGuangxi(aprovinceofChina),wedidnotfindanyL.reevesiiinthenorthofVietnamandinthewestofGuangxi,closetoVietnam.ThisistheregionwherethemicrocontinentalblocksofSoutheastAsiaandthemegacontinentofAsiacontacted(Fig. 1), currently having no habitat suitable for L. reevesii.
Themostdistal15mmofthetailtipofeachlizardwasexcisedusingasterilizedscalpel.Individuallizardswerereleasedattheirsiteofcaptureaftertissuesampling.Tissuesampleswerepre-servedin95%ethanolbeforetheyweredepositedatHangzhouNormalUniversityandassignedvouchernumbersidentifiedbylocality-haplotypenumbers.TotalDNAwasextractedusingstan-dardphenol–chloroformmethods(Sambrook et al., 1989), and stored at 80 �C until ready for use.
2.2. Mitochondrial DNA amplification and sequencing
We used primers L14910 (50-GACCTGTGATMTGAAAAACCAYCG TTG T-30)(de Queiroz et al., 2002)andH16064(50-CTTTGGTTT ACA AGA ACA ATG CTT TA-30)(Burbrink et al., 2000)toamplifythecytochromebgene.MitochondrialDNAwasamplifiedfromtemplateDNAin100llreactionsusingahot-startmethodinathermalcyclerwitha7-mindenaturingstepat94�Cfollowedby40cyclesofdenaturingfor40sat94�C,primerannealingfor30sat46�Candelongationforoneminat72�Cwithafinal7-minelongationstepat72�C.CyclesequencingwasconductedwithprimerL14919(Burbrink et al., 2000), L15584 (de Queiroz et al., 2002), H15149 (Kocher et al., 1989),andH15715(Slowinskiand Lawson, 2005).
2.3. Data analysis
The sequences were translated to amino acids with the program squint (www.cebl.auckland.ac.nz/index.php ) to verify if a functional mitochondrial DNA sequence was obtained and that nuclear pseudogenes are not being amplified. We compiled and aligned sequences using mega version 3.1 (Kumar et al., 2004). We used dnasp version 4.0 (Rozas et al., 2003)toidentifyhaplotypesandestimategeneticdiversitywithinpopulationsbyhaplotype(h)andnucleotidediversities(p)(Nei, 1987).
Wereconstructedaphylogenetictreebasedonthemaximumlikelihood(ML)andaBayesianmethod,usingtheChineseWaterDragonPhysignathuscocincinus(GenBankaccessionno.AB263945)astheoutgroup.MLanalysiswascarriedoutbyaheuristicsearchof10randomadditionanalyseswithtree-bisection-reconnection(TBR)branchswappingusingpaupversion4.0beta(Swofford, 2003). The TIM + I + G substitution model (Tamura
0/5000
จาก: -
เป็น: -
ผลลัพธ์ (ไทย) 1: [สำเนา]
คัดลอก!
เนื้อหารายการ ScienceDirect MolecularPhylogeneticsandEvolutionjournalhomepage:www.elsevier.com/locate/ympev PhylogeographyandpopulationstructureoftheReevese'inferredfrommitochondrialDNAsequences sButterflyLizard (Leiolepisreevesii)หลินฮุยยาว a, b เซียงจิยัง, *, Hoong ชอง Diong c โรงแรมอู d, d Lin Chi-ซีอาน ห้องปฏิบัติการสำคัญมณฑลเจียงซูในความหลากหลายทางชีวภาพ และเทคโนโลยีชีวภาพ วิทยาลัยวิทยาศาสตร์สุขภาพ มหาวิทยาลัยหนานจิง จิง 210046 มณฑลเจียงซู จีน b หางคีย์ห้องปฏิบัติการสัตว์ปรับตัว และวิวัฒนาการ โรงเรียนวิทยาศาสตร์ชีวิต มหาวิทยาลัยปกติหางโจว หางโจว 310036 เจ้อเจียง จีน c คณะวิทยาศาสตร์ธรรมชาติและวิทยาศาสตร์ศึกษา สถาบันการศึกษา Nanyang เทคโนโลยีมหาวิทยาลัย สิงคโปร์ 637616 สิงคโปร์ d แผนกชีวภาพวิทยาศาสตร์ มหาวิทยาลัย Qiongzhou วูซิฉาน 572200 ซานย่า จีน บทความข้อมูลบทคัดย่อ บทความประวัติ: ได้รับ 10 2552 ตุลาคมแก้ไข 21 2553 มีนาคมรับ 23 2553 เมษายนว่างออนไลน์ 28 2010 เมษายน คำสำคัญ: ลิซาร์ด แย้ reevesii Mitochondrial DNA Cytochrome b โครงสร้างประชากร Phylogeography ButterflylizardsofthegenusLeiolepis (Agamidae) arewidelydistributedincoastalregionsofSoutheastAsiaandSouthChina, withtheReevese'sButterflyLizardLeiolepisreevesiihavingamostnortherlydistri-butionthatrangesfromVietnamtoSouthChina ToassessthegeneticdiversitywithinL.reevesii,anditspopulationstructureandevolutionaryhistory,wesequenced1004bpofcytochromebfor448individu-alscollectedfrom28localitiescoveringalmostthewholerangeofthelizard Onehundredandfortyvar-iablesiteswereobserved, and93haplotypesweredefined Weidentifiedthreegeneticallydistinctclades,ofwhichCladeAincludeshaplotypesmainlyfromsoutheasternHainan,CladeBfromGuangdongandnorthernHainan,andCladeCfromVietnamandtheotherlocalitiesofChina.CladeAwaswelldistin-guishedanddivergentfromtheothertwo.TheWuzhishanandYinggelingmountainrangeswereimpor-tantbarrierslimitinggeneexchangebetweenpopulationsonthebothsidesofthemountainseries,whereastheGulfofTonkinandtheQiongzhouStraitwerenot.OneplausiblescenariotoexplainourgeneticdataisahistoricaldispersionofL.reevesiiasproceedingfromVietnamtoHainan,followedbyasecondwaveofdispersalfromHainantoGuangdongandGuangxi.Anotherequallyplausiblescenarioisahistoricallywidespreadpopulationthathasbeenstructuredbyvicariantfactorssuchasthemoun-tainsinHainanandsealevelfluctuations. 2010 Elsevier Inc. สงวนลิขสิทธิ์ทั้งหมด 1. บทนำ ภูมิภาคอินโด-พม่าครอบคลุมมากกว่า 2 ล้าน km2 ของเอเชียเขตร้อนทางตะวันตกของบรรทัดของ Wallace และเป็นหนึ่งใน threatenedbiodiversityhotspotsintheworld มากที่สุด Thehotspotbeginsineastern บังกลาเทศ และอินเดียตะวันออกเฉียงเหนือ ส่วนของมณฑลยูนนานมณฑลของจีน พม่า เวียดนาม มาเลเซีย ไทย ครอบคลุม CambodiaandLaos (ภาพ); italsocoversthecoastallowlandsofSouthChina (GuangxiandGuangdong), aswellasseveraloffshoreislandssuchasHainanIsland (ofChina) intheSouthChinaSeaandAndamanIslands (ofIndia) intheAndamanSea.Onedriverofbiodi-versityinthisregionistherepeatedaccretionofdifferentmicrocon-tinentswithamegacontinentsuchasAsia(Macey et al., 2000) กระบวนการธรณีกระตุ้น episodic ปรับโครงสร้างเวลา faunasintwoways:faunaldiversityremainsrelativelystableduring ยุโรปแยก ในขณะที่หมุนเวียน faunal อย่างรวดเร็วเกิดขึ้นในช่วงเวลาติดต่อระหว่างแผ่นธรณี (Macey et al., 2000) จุดอินโด-พม่าเก็บ endemism โดดเด่นอยู่ใน agamid กิ้งก่าของตระกูลนี้แย้ที่รวมพันธุ์สัตว์ * ผู้สอดคล้องกัน โทรสาร: + 86 25 85891526ที่อยู่อีเมล์: xji@mail.hz.zj.cn (x. อัพจี)1055-7903 / $ - ดูหน้าเรื่อง อิงค์ Elsevier 2010 สงวนลิขสิทธิ์ทั้งหมด doi:10.1016/j.ympev.2010.04.032 กระจายตัวเก็บ เกี่ยว threatenedwithlocalextinctionduetoover, habitatloss และอยู่อาศัย กิ้งก่าแย้ตระกูลนี้นำไปเผยแพร่ในสกอตแลนด์ตอนใต้ชายฝั่งของจุดอินโด-พม่า (Fig. 1 เจียง 1999 Malysheva และ al., 2006) ตระกูลนี้ประกอบด้วยขนาดใหญ่ (สูงสุดความยาว 150 มม.ระบาย snout) กิ้งก่า oviparous เจ็ดชนิด มี reevesii Butterfly จิ้งจกแย้ของ Reevese ที่มีการกระจายมากที่สุดเหนือตั้งแต่เวียดนามใต้จีน (กวางตุ้ง กว่าง และไหหลำ) (เจียง 1999) กิ้งก่าแย้เกิดเฉพาะในเอเชียตะวันออกเฉียงใต้บล็อกที่ยากจนจากขอบด้านเหนือของออสเตรเลีย-นิวกินีแผ่นร้อยของ MYBP และ accreted เพื่อ MYBP 120 เอเชีย (ถือและ Fuller, 1996) หรือก่อนหน้า (เมตคาล์ฟ 1996) Macey et al. (2000) suggestedthattheSoutheastAsianplatesintro-ducedLeiolepisspeciescomplextoAsiaandSouthChina.Onlyonespecies (L.reevesii) occursinChina, inthesouthเกาะไหหลำ โกหกขอบตะวันออกเฉียงเหนือของจุดพม่าอินโด เป็น influenced glacially ซึ่ง eustatic ระดับน้ำทะเลเปลี่ยนแปลงที่เกิดจากการเชื่อมต่อล่าสุดที่ดินและ disconnections สุมาตรา ชวา บอร์เนียว และแผ่นดินใหญ่เอเชีย (ฮอลล์และฮอลโลเวย์ 1998) เกาะมีหลากหลาย topographically วูซิฉานและภูเขา Yinggeling ที่ระดับความสูง 1800 เมตร กำลังที่เพิ่มขึ้นอย่างสูงจากภาคกลาง และภาคใต้ Fig. 1 แผนที่การกระจายของพืชสกุลแย้ (ซ้าย) และสุ่มตัวอย่างตำแหน่งของ L. reevesii ในการศึกษานี้ (ขวา) เลขอารบิกในพล็อตขวาแสดงประชากรที่จัดกลุ่มตามภูมิศาสตร์ แรเงาแสดงชายฝั่งจำกัดเวลาสูงสุด glaciation Pleistocene ดูตารางที่ 1 สำหรับตัวย่อของเว็บไซต์ตัวอย่าง N:ชุดเท่ที่อยู่ ภูมิภาคและราบเหนือกว้างเพื่อเปิดทางให้ อย่างไรก็ตาม ว่า ภูเขาเหล่านี้มีบทบาทสำคัญใน influencing การแลกเปลี่ยนยีนระหว่างประชากรของสิ่งมีชีวิตเช่น L. reevesii ยังคงไม่ชัดเจน Thequantificationofgeneticvariabilityandpopulationgeneticstructureiscrucialforimprovedmanagementandconservationofnaturalpopulations (Avise, 1989 Marmi และ al., 2006), แต่ความผันแปรทางพันธุกรรมในแย้ได้รับ scrutiny น้อยประจักษ์ Malysheva et al. (2006) กล่าวถึง intraspecific ทางพันธุกรรมความผันแปรของ L. reevesii โดย multilocus fingerprinting ดีเอ็นเอมีหลายชนิด microsatellite คลิปปากตะเข้ แต่มีตัวอย่างของพวกเขามีภาษาท้องถิ่นในเวียดนามกลาง จนถึงขณะนี้ มีไม่เทียบลำดับข้อมูลบน reevesii L. จากกันทางภูมิศาสตร์แยกประชากร แม้ว่าข้อมูลดังกล่าวอย่างเร่งด่วนจำเป็น elucidate ประวัติวิวัฒนาการของสายพันธุ์และโครงสร้างทางพันธุกรรมของประชากรร่วมสมัย และแนวทางการพัฒนากลยุทธ์การอนุรักษ์และจัดการที่เหมาะสมสำหรับจิ้งจก ผลของเหตุการณ์ในประวัติศาสตร์การเคลื่อนไหว faunal อธิบายไว้โดย Macey et al. (2000) และคำถามต่าง ๆ ที่เป็นพื้นฐานของการศึกษานี้เพิ่ม reevesii ช่วง L. ในจีนใต้: (1) วิธีทำแย้ขยายช่วงของประวัติศาสตร์ในจีน ไม่ dispersal กระบวนการดำเนินการจากเวียดนามในทิศทางเหนือแผ่นดินจีนแล้วนอกจากจีนแผ่นดินใหญ่ไปไหหลำ หรือ easterly จากเวียดนามไปไหหลำแล้วเหนือจากไหหลำกับจีนแผ่นดินใหญ่ (2) ความสำคัญคำวูซิฉานและ Yinggeling ภูเขากั้นทะเลในอ่าว Tonkin และช่องแคบ Qiongzhou กับยีน flow (Fig. 1) หรือไม่ (3) WhatisthedemographichistoryofL.reevesiiandtheeventsthatshapeditspopulationdemography (4) WhatisthelevelofgeneticvariabilityamongpopulationsofL.reevesiiandhowisthevariationpartitionedwithinpopulations2. วัสดุและวิธีการ 2.1. ตัวอย่างเก็บรวบรวมและสกัดดีเอ็นเอ ตอบคำถามข้างต้น เราเรียงลำดับยีน b mitochondrial cytochrome จาก 448 คน ตัวอย่างศึกษาแทนผู้ใหญ่ 16 ของ reevesii L รวบรวมระหว่างปี 2007 และ 2008 จากมาสุ่มตัวอย่าง 28 เกือบจะครอบคลุมช่วงการกระจายของพันธุ์จากจีนแผ่นดินใหญ่ (กวางตุ้งและกว่าง) ไหหลำ (เกาะที่ใหญ่ที่สุดที่สองไปไต้หวันในจีน) และเวียดนาม (Fig. 1) Duringourcollectingtriptothecoastalre-gionofVietnamandGuangxi (aprovinceofChina), wedidnotfindanyL.reevesiiinthenorthofVietnamandinthewestofGuangxi, closetoVietnam.ThisistheregionwherethemicrocontinentalblocksofSoutheastAsiaandthemegacontinentofAsiacontacted(Fig. 1) ในปัจจุบันมีอยู่อาศัยไม่เหมาะสมกับ L. reevesii Themostdistal15mmofthetailtipofeachlizardwasexcisedusingasterilizedscalpel.Individuallizardswerereleasedattheirsiteofcaptureaftertissuesampling.Tissuesampleswerepre-servedin95%ethanolbeforetheyweredepositedatHangzhouNormalUniversityandassignedvouchernumbersidentifiedbylocality-haplotypenumbers.TotalDNAwasextractedusingstan-dardphenol–chloroformmethods(Sambrook et al., 1989), and stored at 80 C until ready for use. 2.2. mitochondrial DNA amplification และจัดลำดับ เราใช้ไพรเมอร์ L14910 (TTG 50-GACCTGTGATMTGAAAAACCAYCG T-30) (de Queiroz et al., 2002) andH16064 (50-CTTTGGTTT ACA AGA ACA ATG CTT TA-30) (Burbrink และ al., 2000) toamplifythecytochromebgene C MitochondrialDNAwasamplifiedfromtemplateDNAin100llreactionsusingahot-startmethodinathermalcyclerwitha7-mindenaturingstepat94 Cfollowedby40cyclesofdenaturingfor40sat94, primerannealingfor30sat46 Candelongationforoneminat72 Cwithafinal7 minelongationstepat72 C.CyclesequencingwasconductedwithprimerL14919 (Burbrink และ al., 2000), L15584 (de Queiroz et al., 2002), H15149 (Kocher et al., 1989), andH15715 (Slowinskiand ลอว์สัน 2005) 2.3. ข้อมูลวิเคราะห์ ลำดับที่แปลได้กรดอะมิโนด้วยโปรแกรมเหล่ (ส่วน www.cebl.auckland.ac.nz/index.php) เพื่อตรวจ สอบถ้า ลำดับงาน mitochondrial DNA กล่าวว่า pseudogenes นิวเคลียร์กำลังถูก amplified เรารวบรวม และจัดลำดับใช้ร็อคเวอร์ชัน 3.1 (Kumar et al., 2004) เราใช้ dnasp เวอร์ชัน 4.0 (Rozas et al., 2003)toidentifyhaplotypesandestimategeneticdiversitywithinpopulationsbyhaplotype(h)andnucleotidediversities(p) (Nei, 1987) Wereconstructedaphylogenetictreebasedonthemaximumlikelihood (มล) andaBayesianmethod, astheoutgroup usingtheChineseWaterDragonPhysignathuscocincinus (GenBankaccessionno.AB263945) MLanalysiswascarriedoutbyaheuristicsearchof10randomadditionanalyseswithtree-bisection-เชื่อมต่ออีก (TBR) branchswappingusingpaupversion4.0beta (Swofford, 2003) ทิมฉัน + G แทนรุ่น (Tamura
การแปล กรุณารอสักครู่..
ผลลัพธ์ (ไทย) 2:[สำเนา]
คัดลอก!
รายการเนื้อหาที่สามารถดูได้ที่ หลิน b, Xiang Ji ที่ * Cheong-Hoong Diong C, Yudu D, Chi-ซีอานหลิน d มณฑลเจียงซูทางห้องปฏิบัติการที่สำคัญสำหรับความหลากหลายทางชีวภาพและเทคโนโลยีชีวภาพ, วิทยาลัยวิทยาศาสตร์ชีวิตหนานจิงปกติมหาวิทยาลัยหนานจิง 210046 มณฑลเจียงซูประเทศจีนข หางโจวห้องปฏิบัติการที่สำคัญของการปรับตัวสัตว์และวิวัฒนาการโรงเรียนวิทยาศาสตร์เพื่อชีวิต, หางโจว Normal University, หางโจว 310036 เจ้อเจียงประเทศจีนคคณะวิทยาศาสตร์และวิทยาศาสตร์การศึกษา, สถาบันการศึกษา, นันยางมหาวิทยาลัยเทคโนโลยี, Singapore 637616, Singapore d ภาควิชาชีววิทยา วิทยาศาสตร์ Qiongzhou มหาวิทยาลัย Wuzhishan 572,200 ไหหลำประเทศจีนบทความข้อมูลนามธรรมประวัติศาสตร์บทความที่ได้รับ10 ตุลาคม 2009 ปรับปรุง 21 มีนาคม 2010 ได้รับการยอมรับ 23 เมษายน 2010 ที่มีจำหน่ายออนไลน์ 28 เมษายน 2010 คำสำคัญ: จิ้งจกLeiolepis reevesii ยลดีเอ็นเอ Cytochrome ข phylogeography ประชากร 2010 เอลส์อิงค์สงวนลิขสิทธิ์. 1 บทนำภูมิภาคอินโดพม่าครอบคลุมกว่า 2 ล้านกิโลเมตร 2 ของเอเชียเขตร้อนทางตะวันตกของเส้นวอลเลซและเป็นหนึ่งในที่สุด threatenedbiodiversityhotspotsintheworld.Thehotspotbeginsineastern บังคลาเทศและทอดตัวข้ามภาคตะวันออกเฉียงเหนือของอินเดียบางส่วนของมณฑลยูนนานของจีนพม่าเวียดนามมาเลเซียไทย , et al., 2000) กระบวนการกระตุ้นการปรับโครงสร้างเปลือกโลกหลักการของคอนติเนน faunasintwoways: เวลา faunaldiversityremainsrelativelystableduring ของการแยกในขณะที่มูลค่าการซื้อขายที่เกิดขึ้นอย่างรวดเร็ว faunal ในช่วงเวลาของการติดต่อระหว่างแผ่นเปลือกโลก (. Macey, et al, 2000) สปอตอินโดพม่าในปัจจุบันมีถิ่นที่โดดเด่นในสัตว์ชนิดรวมทั้งสัตว์เลื้อยคลาน agamid ประเภท Leiolepis ที่มีผู้เขียนที่สอดคล้องกัน* แฟกซ์: +86 25 85891526. อีเมล์: xji@mail.hz.zj.cn (เอ็กซ์จี). 1055-7903 / $ -See หน้าเรื่อง 2010 เอลส์อิงค์สงวนลิขสิทธิ์ ดอย: 10.1016 / j.ympev.2010.04.032. threatenedwithlocalextinctionduetoover เก็บเกี่ยว habitatloss และการกระจายตัวของที่อยู่อาศัย. จิ้งจก Leiolepis ของพืชและสัตว์ที่มีกระจายอยู่ทั่วไปในที่ราบลุ่มชายฝั่งทะเลของสปอตอินโดพม่า (รูปที่ 1; เจียง 1999; Malysheva et al, ., 2006) ประเภทที่มีเจ็ดชนิดของขนาดใหญ่ (ไม่เกิน 150 มิลลิเมตรความยาวจมูกระบาย) จิ้งจกไข่กับชั้นเนย Reevese y ของจิ้งจก Leiolepis reevesii มีการกระจายทางเหนือมากที่สุดที่อยู่ในช่วงจากเวียดนามไปยังจีนตอนใต้ (มณฑลกวางตุ้งกวางสีและไหหลำ) (เจียง , 1999) จิ้งจก Leiolepis เกิดขึ้นเฉพาะในเอเชียตะวันออกเฉียงใต้บล็อกที่ยากจนจากขอบเหนือของแผ่นออสเตรเลียนิวกินีหลายร้อย MYBP และรู้นี้ไปยังเอเชีย 120 MYBP (ริกเตอร์และฟุลเลอร์, 1996) หรือก่อนหน้า (เมทคาล์ฟ, 1996) Macey et al, (2000) เกาะนอนอยู่ในขอบตะวันออกเฉียงเหนือของสปอตอินโดพม่าที่อยู่ในชั้น uenced โดยขับเคลื่อน glacially การเปลี่ยนแปลงระดับน้ำทะเล eustatic ที่ได้ก่อให้เกิดการเชื่อมต่อที่ดินที่ผ่านมาและ disconnections หมู่สุมาตราชวาบอร์เนียวและแผ่นดินใหญ่เอเชีย (ฮอลล์และ Holloway, 1998) เกาะที่มีความหลากหลาย topographically กับ Wuzhishan และ Yinggeling เทือกเขาใกล้ระดับความสูง 1800 เมตรเพิ่มขึ้นสูงลิ่วจากกลางและภาคใต้รูป 1. แผนที่การกระจายตัวของสกุล Leiolepis (ซ้าย) และสถานที่ของการสุ่มตัวอย่างลิตร reevesii ในการศึกษานี้ (ขวา) อารบิคในพล็อตที่เหมาะสมแทนประชากรกลุ่มตามพื้นที่ทางภูมิศาสตร์ แรเงาแสดงให้เห็นข้อ จำกัด ชายฝั่งในช่วงเวลาของความเย็นสูงสุด Pleistocene ดูตารางที่ 1 สำหรับคำย่อของเว็บไซต์ตัวอย่าง ตรชุดภูเขาหนาน. ภูมิภาคและให้วิธีการธรรมดาภาคเหนือในวงกว้าง แต่ไม่ว่าจะเป็นภูเขาเหล่านี้มีบทบาทสำคัญในการในชั้น uencing แลกเปลี่ยนยีนในหมู่ประชากรของสิ่งมีชีวิตเช่นซาก reevesii ลิตร 1989; Marmi et al., 2006) แต่การเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมใน Leiolepis ได้รับการตรวจสอบข้อเท็จจริงเชิงประจักษ์เล็ก ๆ น้อย ๆ Malysheva et al, (2006) การตรวจสอบสาย intraspeci คการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมของแอล reevesii โดยใช้สายดีเอ็นเอ Multilocus ngerprinting กับยานสำรวจไมโครหลาย แต่ตัวอย่างของพวกเขาได้รับการแปลเป็นภาษาท้องถิ่นในภาคกลางของเวียดนาม จนถึงขณะนี้ยังไม่มีข้อมูลลำดับเปรียบในแอล reevesii จากประชากรแยกทางภูมิศาสตร์แม้ว่าข้อมูลดังกล่าวมีความจำเป็นเร่งด่วนที่จะอธิบายประวัติศาสตร์วิวัฒนาการของสายพันธุ์และโครงสร้างทางพันธุกรรมของประชากรร่วมสมัยและเพื่อเป็นแนวทางในการพัฒนาของการจัดการที่เหมาะสมและกลยุทธ์การอนุรักษ์สำหรับ จิ้งจก. ผลกระทบจากเหตุการณ์ในประวัติศาสตร์การเคลื่อนไหว faunal ระบุไว้โดย Macey et al, (2000) และช่วงของ reevesii ลิตรในภาคใต้ของจีนเพิ่มคำถามหลายอย่างที่เป็นพื้นฐานของการศึกษานี้คือ (1) วิธีการไม่ Leiolepis ขยายช่วงประวัติศาสตร์ในประเทศจีน? ไม่เส้นทางกระจายดำเนินการต่อจากเวียดนามในทิศเหนือไปยังจีนแผ่นดินใหญ่และจากนั้นพัดมาจากแผ่นดินใหญ่จีนไหหลำหรือทางทิศตะวันออกจากเวียดนามไปยังเกาะไหหลำแล้วเหนือจากเกาะไหหลำไปยังแผ่นดินใหญ่จีน (2) เป็นวิธีที่สำคัญและ Wuzhishan Yinggeling ภูเขาและอุปสรรคทะเลในอ่าวตังเกี๋ยและช่องแคบ Qiongzhou ยีนชั้นโอ๊ย (รูปที่ วัสดุและวิธีการ2.1. การเก็บตัวอย่างและการสกัดดีเอ็นเอเพื่อที่จะตอบคำถามข้างต้นเราติดใจcytochrome ยลขยีนจาก 448 บุคคล. ตัวอย่างการศึกษาแสดงให้เห็นถึง 16 ผู้ใหญ่ L reevesii เก็บรวบรวมระหว่างปี 2007 และ 2008 จากแต่ละ 28 เมืองสุ่มตัวอย่างเกือบครอบคลุม ช่วงการกระจายสายพันธุ์จากจีนแผ่นดินใหญ่ (มณฑลกวางตุ้งและกวางสี) เพื่อไหหลำ (ที่สองเกาะที่ใหญ่ที่สุดในประเทศจีนไต้หวัน) และเวียดนาม (รูปที่ 1), ขณะนี้มีที่อยู่อาศัยที่ไม่เหมาะสำหรับลิตร et al., 1989) และเก็บไว้ที่ 80 องศาเซลเซียสจนกว่าจะพร้อมสำหรับการใช้งาน. 2.2 ยลดีเอ็นเอ ampli ไอออนบวก fi และลำดับเราใช้ไพรเมอร์L14910 (50 GACCTGTGATMTGAAAAACCAYCG TTG T-30) (de Queiroz et al., 2002) andH16064 (50 CTTTGGTTT ACA AGA ACA ATG CTT TA-30) (Burbrink et al., et al., 2000) L15584 (เด Queiroz et al., 2002) H15149 (Kocher et al., 1989) andH15715 (Slowinskiand ลอว์สัน, 2005). 2.3 การวิเคราะห์ข้อมูลลำดับถูกแปลเป็นกรดอะมิโนกับโปรแกรมเหล่ (www.cebl.auckland.ac.nz/index.php) เพื่อตรวจสอบถ้ายลดีเอ็นเอลำดับการทำงานที่ได้รับและที่ pseudogenes นิวเคลียร์จะไม่ได้เอ็ดสาย ampli เรารวบรวมและสอดคล้องลำดับใช้รุ่น 3.1 ล้าน (Kumar et al., 2004) เราใช้ dnasp รุ่น 4.0 (Rozas et al., 2003) ทิม + I + G รุ่นทดแทน (ทามูระ












































การแปล กรุณารอสักครู่..
ผลลัพธ์ (ไทย) 3:[สำเนา]
คัดลอก!
เนื้อหารายการของที่ molecularphylogeneticsandevolution บริการ

journalhomepage : www.elsevier.com/locate/ympev




phylogeographyandpopulationstructureofthereevese'sbutter fl ylizard ( leiolepisreevesii ) inferredfrommitochondrialdnasequences
ยาวฮุยหลิน บี เซียงจี , * ชองหุ่งดิ ง C , D ดาวน์โหลด ชิ เซียนหลิน D
Jiangsu คีย์ปฏิบัติการความหลากหลายทางชีวภาพและเทคโนโลยีชีวภาพวิทยาลัยวิทยาศาสตร์แห่งชีวิตจิงปกติมหาวิทยาลัย 210046 หนานจิง , Jiangsu , จีน B หางโจวกุญแจห้องปฏิบัติการวิจัยของการปรับตัวของสัตว์และวิวัฒนาการ โรงเรียนวิทยาศาสตร์ชีวิต , หางโจวมหาวิทยาลัยปกติ 310036 , หางโจว , Zhejiang , จีน ซี คณะวิทยาศาสตร์ และวิทยาศาสตร์ศึกษา สถาบันการศึกษาแห่งชาติมหาวิทยาลัยเทคโนโลยีนันยางสิงคโปร์ 637616 , ,สิงคโปร์ D ภาควิชาวิทยาศาสตร์ทางชีวภาพ qiongzhou มหาวิทยาลัย wuzhishan 572200 ไหหลำ , ประเทศจีน

บทความข้อมูลบทคัดย่อบทความประวัติศาสตร์ :
ได้รับ 10 ตุลาคม 2552 ฉบับวันที่ 21 มีนาคม 2553 รับ 23 เมษายน 2010 ออนไลน์ 28 เมษายน 2553
คำสำคัญ :


reevesii วงศ์ย่อยแย้ จิ้งจก ดีเอ็นเอ phylogeography โครงสร้างประชากร
- Bเนยfl ylizardsofthegenusleiolepis ( Agamidae ) arewidelydistributedincoastalregionsofsoutheastasiaandsouthchina withthereevese'sbutter fl , ylizardleiolepisreevesiihavingamostnortherlydistri butionthatrangesfromvietnamtosouthchina . toassessthegeneticdiversitywithinl . reevesii anditspopulationstructureandevolutionaryhistory , ,wesequenced1004bpofcytochromebfor448individu-alscollectedfrom28localitiescoveringalmostthewholerangeofthelizard . onehundredandfortyvar iablesiteswereobserved and93haplotypeswerede จึง , เน็ด weidenti จึง edthreegeneticallydistinctclades ofwhichcladeaincludeshaplotypesmainlyfromsoutheasternhainan cladebfromguangdongandnorthernhainan andcladecfromvietnamandtheotherlocalitiesofchina , , , .
การแปล กรุณารอสักครู่..
 
ภาษาอื่น ๆ
การสนับสนุนเครื่องมือแปลภาษา: กรีก, กันนาดา, กาลิเชียน, คลิงออน, คอร์สิกา, คาซัค, คาตาลัน, คินยารวันดา, คีร์กิซ, คุชราต, จอร์เจีย, จีน, จีนดั้งเดิม, ชวา, ชิเชวา, ซามัว, ซีบัวโน, ซุนดา, ซูลู, ญี่ปุ่น, ดัตช์, ตรวจหาภาษา, ตุรกี, ทมิฬ, ทาจิก, ทาทาร์, นอร์เวย์, บอสเนีย, บัลแกเรีย, บาสก์, ปัญจาป, ฝรั่งเศส, พาชตู, ฟริเชียน, ฟินแลนด์, ฟิลิปปินส์, ภาษาอินโดนีเซี, มองโกเลีย, มัลทีส, มาซีโดเนีย, มาราฐี, มาลากาซี, มาลายาลัม, มาเลย์, ม้ง, ยิดดิช, ยูเครน, รัสเซีย, ละติน, ลักเซมเบิร์ก, ลัตเวีย, ลาว, ลิทัวเนีย, สวาฮิลี, สวีเดน, สิงหล, สินธี, สเปน, สโลวัก, สโลวีเนีย, อังกฤษ, อัมฮาริก, อาร์เซอร์ไบจัน, อาร์เมเนีย, อาหรับ, อิกโบ, อิตาลี, อุยกูร์, อุสเบกิสถาน, อูรดู, ฮังการี, ฮัวซา, ฮาวาย, ฮินดี, ฮีบรู, เกลิกสกอต, เกาหลี, เขมร, เคิร์ด, เช็ก, เซอร์เบียน, เซโซโท, เดนมาร์ก, เตลูกู, เติร์กเมน, เนปาล, เบงกอล, เบลารุส, เปอร์เซีย, เมารี, เมียนมา (พม่า), เยอรมัน, เวลส์, เวียดนาม, เอสเปอแรนโต, เอสโทเนีย, เฮติครีโอล, แอฟริกา, แอลเบเนีย, โคซา, โครเอเชีย, โชนา, โซมาลี, โปรตุเกส, โปแลนด์, โยรูบา, โรมาเนีย, โอเดีย (โอริยา), ไทย, ไอซ์แลนด์, ไอร์แลนด์, การแปลภาษา.

Copyright ©2025 I Love Translation. All reserved.

E-mail: