Community acquired (CA) methicillin

Community acquired (CA) methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) increasingly causes disease worldwide. USA300 has emerged as the predominant clone causing superficial and invasive infections in children and adults in the USA. Epidemiological studies suggest that USA300 is more virulent than other CA-MRSA. The genetic determinants that render virulence and dominance to USA300 remain unclear.
RESULTS:
We sequenced the genomes of two pediatric USA300 isolates: one CA-MRSA and one CA-methicillin susceptible (MSSA), isolated at Texas Children's Hospital in Houston. DNA sequencing was performed by Sanger dideoxy whole genome shotgun (WGS) and 454 Life Sciences pyrosequencing strategies. The sequence of the USA300 MRSA strain was rigorously annotated. In USA300-MRSA 2658 chromosomal open reading frames were predicted and 3.1 and 27 kilobase (kb) plasmids were identified. USA300-MSSA contained a 20 kb plasmid with some homology to the 27 kb plasmid found in USA300-MRSA. Two regions found in US300-MRSA were absent in USA300-MSSA. One of these carried the arginine deiminase operon that appears to have been acquired from S. epidermidis. The USA300 sequence was aligned with other sequenced S. aureus genomes and regions unique to USA300 MRSA were identified.
CONCLUSION:
USA300-MRSA is highly similar to other MRSA strains based on whole genome alignments and gene content, indicating that the differences in pathogenesis are due to subtle changes rather than to large-scale acquisition of virulence factor genes. The USA300 Houston isolate differs from another sequenced USA300 strain isolate, derived from a patient in San Francisco, in plasmid content and a number of sequence polymorphisms. Such differences will provide new insights into the evolution of pathogens

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ชุมชนมา (CA) ทนทานต่อ methicillin Staphylococcus หมอเทศข้างลาย (MRSA) มากขึ้นทำให้เกิดโรคทั่วโลก USA300 ได้ผงาดขึ้นเป็นโคลนกันก่อให้เกิดการติดเชื้อผิวเผิน และรุกรานในเด็กและผู้ใหญ่ในประเทศสหรัฐอเมริกา ความแนะนำว่า USA300 virulent มากกว่า MRSA CA อื่น ๆ มากขึ้น ดีเทอร์มิแนนต์ทางพันธุกรรมที่แสดง virulence และครอบงำการ USA300 ยังคงไม่ชัดเจนผลลัพธ์:เราเรียงลำดับ genomes ของสองเด็ก USA300 แยก: หนึ่ง CA-MRSA และหนึ่ง CA-methicillin ไวต่อ (MSSA), แยกต่างหากที่โรงพยาบาลเด็กเท็กซัสในฮูสตัน ลำดับดีเอ็นเอที่ดำเนินการ โดย Sanger dideoxy จีโนมทั้งปืนลูกซอง (WGS) และ 454 วิทยาศาสตร์สุขภาพ pyrosequencing กลยุทธ์ ลำดับของสายพันธุ์ USA300 MRSA ถูกทดสอบใส่คำอธิบายประกอบ ใน USA300 MRSA 2658 ของโครโมโซมเปิดอ่านเฟรมคาดการณ์ และระบุ 3.1 และ 27 plasmids (kb) kilobase USA300-MSSA ประกอบด้วย plasmid 20 kb ด้วยบาง homology กับ plasmid 27 kb พบ USA300 MRSA ภาคสองที่พบใน US300 MRSA ได้ขาดงานไปใน USA300 MSSA หนึ่งทำ operon deiminase อาร์จินีนที่มีมาจาก S. epidermidis USA300 ลำดับสอดคล้องกับ genomes หมอเทศข้างลาย S. อื่น ๆ ตามลำดับ และระบุขอบเขตเฉพาะ USA300 MRSAสรุป:USA300 MRSA ได้สูงคล้ายคลึงกับสายพันธุ์ MRSA อื่น ๆ จัดแนวทั้งจีโนมและยีนเนื้อหา ระบุว่า ความแตกต่างในพยาธิกำเนิดเนื่อง จากการเปลี่ยนแปลงรายละเอียด แทน การซื้อขนาดใหญ่ของปัจจัย virulence ฮุสตัน USA300 แยกแตกต่างจากอีกตามลำดับ USA300 ต้องใช้แยก มาจากผู้ป่วยใน San Francisco, plasmid เนื้อหาและจำนวน polymorphisms ลำดับนั้น ความแตกต่างดังกล่าวจะให้ความเข้าใจใหม่ในวิวัฒนาการของโรค

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ชุมชนที่ได้รับ (CA) methicillin-resistant ที่เชื้อ Staphylococcus aureus (MRSA) มากขึ้นทำให้เกิดโรคทั่วโลก USA300 ได้กลายเป็นโคลนทำให้เกิดการติดเชื้อเด่นตื้นและรุกรานในเด็กและผู้ใหญ่ในประเทศสหรัฐอเมริกา การศึกษาระบาดวิทยาชี้ให้เห็นว่า USA300 เป็นรุนแรงมากขึ้นกว่าที่อื่น ๆ CA-MRSA ปัจจัยทางพันธุกรรมที่ทำให้ความรุนแรงและการปกครองที่จะ USA300 ยังไม่ชัดเจน
ผลการศึกษา:
เราติดใจจีโนมของสอง USA300 เด็กแยก: หนึ่ง CA-MRSA และ CA-methicillin อ่อนไหว (MSSA) แยกที่โรงพยาบาลเด็กเท็กซัสในฮูสตัน ลำดับดีเอ็นเอได้รับการดำเนินการโดยแซงเจอร์ dideoxy ปืนลูกซองทั้งจีโนม (WGS) และ 454 วิทยาศาสตร์สิ่งมีชีวิต pyrosequencing กลยุทธ์ ลำดับของสายพันธุ์ USA300 MRSA เป็นข้อเขียนอย่างจริงจัง ใน USA300-MRSA 2658 เฟรมโครโมโซมเปิดอ่านได้คาดการณ์ไว้และ 3.1 และ 27 kilobase (KB) พลาสมิดที่ถูกระบุ USA300-MSSA ที่มีพลาสมิด 20 กิโลที่มีความคล้ายคลึงกันบางอย่างที่พลาสมิด 27 กิโลพบใน USA300-MRSA สองภูมิภาคที่พบใน US300-MRSA มีอยู่ใน USA300-MSSA หนึ่งในจำนวนนี้ดำเนิน Operon deiminase อาร์จินีที่ดูเหมือนจะได้รับมาจากเอส epidermidis USA300 ลำดับสอดคล้องกับคนอื่น ๆ ติดใจจีโนมของ S. aureus และภูมิภาคที่ไม่ซ้ำกัน USA300 MRSA ถูกระบุ
สรุป:
USA300-MRSA เป็นอย่างสูงที่คล้ายกับสายพันธุ์ MRSA อื่น ๆ ขึ้นอยู่กับการจัดแนวทั้งจีโนมและเนื้อหายีนแสดงให้เห็นว่าแตกต่างในการเกิดโรคที่เกิดจาก การเปลี่ยนแปลงที่ลึกซึ้งมากกว่าที่จะซื้อหุ้นขนาดใหญ่ของความรุนแรงยีนปัจจัย USA300 ฮุสตันแยกแตกต่างจากที่อื่นติดใจ USA300 แยกสายพันธุ์ที่ได้มาจากผู้ป่วยในซานฟรานซิสในเนื้อหาที่พลาสมิดและจำนวนของความหลากหลายลำดับ ความแตกต่างดังกล่าวจะให้ข้อมูลเชิงลึกใหม่เข้าสู่วิวัฒนาการของเชื้อโรค

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ชุมชนที่ได้มา ( CA ) methicillin-resistant Staphylococcus aureus ( MRSA ) ซึ่งเป็นสาเหตุของการเกิดโรคทั่วโลก usa300 ได้กลายเป็นโคลนทำให้โดดตื้นและรุกรานเชื้อในเด็กและผู้ใหญ่ในประเทศสหรัฐอเมริกา ศึกษาทางระบาดวิทยาชี้ให้เห็นว่า usa300 จะรุนแรงมากกว่า ca-mrsa อื่น ๆพันธุกรรมปัจจัยที่ทำให้ความรุนแรงและการปกครองเพื่อ usa300 ยังคงไม่ชัดเจน ผล :

เราลำดับเบสจีโนมของสายพันธุ์ที่ 2 เด็ก usa300 : หนึ่ง ca-mrsa และ CA เมทิซิลลินอ่อนแอ ( mssa ) , แยกโรงพยาบาลเด็กเท็กซัสในฮูสตัน การจัดลำดับดีเอ็นเอโดยใช้ แซงเกอร์ dideoxy ทั้งจีโนมปืนลูกซอง ( wgs ) และ 454 วิทยาศาสตร์สิ่งมีชีวิตไพโรซีเควนซิงกลยุทธ์การเรียงลำดับของ usa300 สายพันธุ์ MRSA และบันทึกย่อ . ใน usa300-mrsa 2658 โครโมโซม open reading frames ได้คาดการณ์และ 3.1 และ 27 กิโลเบส ( KB ) เพื่อระบุ . usa300-mssa จำนวน 20 สายพันธุ์ มีบางครั้งที่มีพลาสมิดที่พบใน usa300-mrsa 27 Kb . สองภูมิภาคที่พบใน us300-mrsa ขาดใน usa300-mssa .หนึ่งเหล่านี้แบกอาร์ deiminase โอเปอรอนที่ได้มาจากอาหาร . . . การ usa300 ลำดับเป็นลำดับสอดคล้องกับอื่น ๆ S . aureus จีโนมและภูมิภาคเฉพาะ usa300 MRSA ระบุ .
สรุป :
usa300-mrsa เป็นอย่างมากคล้ายกับอื่น ๆสายพันธุ์ MRSA ตามการจีโนมทั้งหมดของเนื้อหาระบุว่า ความแตกต่างในการเกิดเนื่องจากการเปลี่ยนแปลงที่ลึกซึ้งมากกว่าการซื้อขนาดใหญ่ของยีนปัจจัยความรุนแรง . การ usa300 ฮูสตันแยกแตกต่างจากสายพันธุ์อื่น นี้ usa300 แยก ที่ได้มาจากผู้ป่วย ในซานฟรานซิสโก ในพลาสมิด เนื้อหา และจำนวนของลำดับล . ความแตกต่างดังกล่าวจะให้ข้อมูลเชิงลึกใหม่ในวิวัฒนาการของเชื้อโรค