Using methods described previously,

Using methods described previously,1,2 we extracted DNA from a single sample of lung tissue and sequenced the DNA on a single Illumina MiSeq run, according to the manufacturer's instructions (for a more complete description of our methods and results, see the Supplementary Appendix).
We obtained 5.5 million paired-end reads (deposited in the Sequence Read Archive with the accession number SRP018736). Less than 1% of the reads aligned against the human genome, whereas 8% aligned against the M. tuberculosis reference strain H37Rv; this was an average per-sample depth of coverage of 32× of the M. tuberculosis genome (see the Supplementary Appendix). Because we have not cultured M. tuberculosis or performed any M. tuberculosis–specific PCR analyses in our laboratory, and because we obtained deep and even genomic coverage, we believe the odds of having obtained artifactual sequences owing to contamination to be very low.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ใช้วิธีการอธิบายไว้ก่อนหน้านี้ 1, 2 เราสกัดดีเอ็นเอจากตัวอย่างเดียวของเนื้อเยื่อปอด และเรียงลำดับดีเอ็นเอระหว่าง Illumina MiSeq วิ่งเดี่ยว ตามคำแนะนำของผู้ผลิต (สำหรับคำอธิบายของวิธีการและผลของเรา ดูภาคผนวกเสริม)เราได้อ่านท้ายคู่ 5.5 ล้าน (ฝากไว้ในเก็บถาวรการอ่านลำดับกับหมายเลขทะเบียน SRP018736) น้อยกว่า 1% ของการอ่านที่สอดคล้องกับมมนุษย์ ในขณะที่ 8% ชิดกับสายพันธุ์อ้างอิงวัณโรค M. H37Rv นี้คือความครอบคลุมของ 32 ×ของจีโนวัณโรค M. ลึกต่อตัวอย่างเฉลี่ย (ดูภาคผนวกเสริม) เพราะเรามีไม่ล้างวัณโรค หรือดำเนินการใด ๆ M. วัณโรค – เฉพาะ PCR วิเคราะห์ในห้องปฏิบัติการ และเรารับความครอบคลุมลึก และออกแม้ เราเชื่อว่าราคาของประพรมลำดับ artifactual เนื่องจากปนเปื้อนจะต่ำมาก

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

โดยใช้วิธีการอธิบายไว้ก่อนหน้า, 1,2 เราสกัดดีเอ็นเอจากตัวอย่างเดียวของเนื้อเยื่อปอดและติดใจดีเอ็นเอที่เดียว Illumina MiSeq วิ่งตามคำแนะนำของผู้ผลิต (สำหรับคำอธิบายที่สมบูรณ์มากขึ้นของวิธีการและผลของเราให้ดูที่ภาคผนวกเสริม ).
เราได้รับ 5.5 ล้านจับคู่สิ้นอ่าน (ฝากไว้ในลำดับอ่านเอกสารเก่ากับ SRP018736 จำนวนภาคยานุวัติ) น้อยกว่า 1% ของการอ่านสอดคล้องกับจีโนมมนุษย์ในขณะที่ 8% สอดคล้องกับ H37Rv เมตรสายพันธุ์อ้างอิงวัณโรค; นี้คือความลึกเฉลี่ยต่อตัวอย่างของความคุ้มครอง 32 ×ของจีโนมเชื้อวัณโรค (ดูภาคผนวกเสริม) เพราะเรายังไม่ได้เพาะเลี้ยงเชื้อวัณโรคหรือดำเนินการใด ๆ วัณโรคเฉพาะ PCR วิเคราะห์ในห้องปฏิบัติการของเราและเนื่องจากเราได้รับลึกและแม้กระทั่งความคุ้มครองจีโนมที่เราเชื่อว่าราคาของที่ได้รับลำดับ artifactual เนื่องจากการปนเปื้อนจะต่ำมาก

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ใช้วิธีการที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ 1 , 2 เราสกัดดีเอ็นเอจากตัวอย่างเดียวของปอดและลำดับเบส DNA ในวิ่ง Illumina miseq เดียว ตามคำแนะนำของผู้ผลิต ( สำหรับคำอธิบายที่สมบูรณ์มากขึ้นของวิธีการและผลลัพธ์ ดูภาคผนวกเสริม )เราได้จบ 5.5 ล้านคู่อ่าน ( ฝากในลำดับอ่านถาวรกับหนังสือเลข srp018736 ) น้อยกว่า 1% ของอ่านชิดกับจีโนมมนุษย์ ในขณะที่ร้อยละ 8 ชิดกับวัณโรคสายพันธุ์อ้างอิง h37rv ; นี้เฉลี่ยต่อความลึกของความครอบคลุมของตัวอย่าง 32 ×ของวัณโรคจีโนม ( ดูภาคผนวกเสริม ) เพราะเราไม่ได้เลี้ยงวัณโรคหรือดำเนินการใด ๆโดยเฉพาะเชื้อวัณโรคการวิเคราะห์ในห้องปฏิบัติการของเรา และเนื่องจากเราได้รับลึกและแม้กระทั่งความคุ้มครองจีโนม เราเชื่อว่าโอกาสที่จะได้รับ artifactual ลำดับเนื่องจากการปนเปื้อนอยู่ในระดับที่ต่ำมาก