The alignment of the primary sequen

The alignment of the primary sequence of BtITx3 shows 50–60% homology with the short insect toxins based on which the three-dimensional structure of I5A (1SIS) was taken as the template to build the model structure of the desired toxin. BtITx3 was modeled with the template structure of the Mesobuthus eupeus toxin (I5A) [35] previously determined by nuclear magnetic resonance (NMR) (1SIS), showing one α-helix from Asn11 to Asp18 and a β-sheet consisting of three β-strands, one from Met3 to Cys5, the second from Lys25 to Phe27 and the third from Pro29 to Leu32 ( Fig. 4). The final modeled structure also has one α-helix from Asn11 to Lys18 and a β-sheet consisting of three β-strands, one of them from Pro3 to Cys5, the second from Tyr25 to Ala27 and the last one from Tyr29 to Ile32. The quality of the model for BtITx3 was assessed using the program WHAT IF, which showed that the model was as good as that of the homologous toxin structure 1SIS, implying good stereochemical quality. The PROCHECK report shows that the model has a Ramachandran score of 75.5, which is close to that of the template 76.9. Other stereochemical properties are also in agreement with that of the template, which indicates that the model structure of BtITx3 shows a similar scaffold as possessed by the other short insectotoxins blocking the chloride channel.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

จัดลำดับหลักของ BtITx3 แสดง 50 – 60% homology กับพิษแมลงสั้นตามที่โครงสร้างสามมิติของ I5A (1SIS) ถูกนำมาเป็นแบบในการสร้างแบบจำลองโครงสร้างของสารพิษต้องการ BtITx3 ถูกจำลอง ด้วยแม่แบบโครงสร้างของสารพิษ eupeus Mesobuthus (I5A) [35] ตามนิวเคลียร์แม่เหล็กสั่นพ้อง (NMR) (1SIS), แสดงเกลียวด้วยกองทัพหนึ่งจาก Asn11 เพื่อ Asp18 และβ-แผ่นประกอบด้วยสามβ-strands จาก Met3 เพื่อ Cys5 ที่สองจาก Lys25 เพื่อ Phe27 และสามจาก Pro29 เพื่อ Leu32 ก่อนหน้านี้ (Fig. 4) สุดท้ายสร้างแบบจำลองโครงสร้างยังมีหนึ่งด้วยกองทัพเกลียวจาก Asn11 เพื่อ Lys18 และβ-แผ่นประกอบด้วยสามβ-strands หนึ่งของพวกเขาจาก Pro3 เพื่อ Cys5 ที่สองจาก Tyr25 เพื่อ Ala27 และล่าสุดได้จาก Tyr29 เพื่อ Ile32 คุณภาพของแบบจำลองสำหรับ BtITx3 ถูกประเมินโดยใช้โปรแกรมถ้า ซึ่งแสดงให้เห็นว่า รูปแบบดีเป็นของ 1SIS โครงสร้างพิษ homologous หน้าที่คุณภาพดี stereochemical รายงาน PROCHECK แสดงว่า แบบจำลองมี Ramachandran คะแนน 75.5 ซึ่งเป็นที่ของแม่ 76.9 คุณสมบัติอื่น ๆ stereochemical ก็ยังคงที่แบบ ซึ่งบ่งชี้ว่า โครงสร้างแบบจำลองของ BtITx3 แสดงนั่งร้านคล้ายเป็นมอบ insectotoxins สั้นอื่น ๆ ที่บล็อกช่องคลอไรด์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การจัดตำแหน่งของลำดับหลักของ BtITx3 แสดงให้เห็นคล้ายคลึงกัน 50-60% ที่มีสารพิษแมลงสั้นตามที่โครงสร้างสามมิติของ I5A (1SIS) ถูกนำมาเป็นแม่แบบในการสร้างโครงสร้างรูปแบบของสารพิษที่ต้องการ BtITx3 เป็นรูปแบบที่มีโครงสร้างแม่แบบของสารพิษ Mesobuthus eupeus (I5A) [35] กำหนดก่อนหน้านี้โดยแม่เหล็กนิวเคลียร์ (NMR) (1SIS) แสดงให้เห็นอย่างใดอย่างหนึ่งα-เกลียวจาก Asn11 เพื่อ Asp18 และβแผ่นประกอบด้วยสามβ- เส้นหนึ่งจาก Met3 เพื่อ Cys5 ที่สองจากการ Lys25 Phe27 และคนที่สามจากการ Pro29 Leu32 (รูปที่. 4) โครงสร้างแบบจำลองสุดท้ายยังมีหนึ่งα-เกลียวจาก Asn11 เพื่อ Lys18 และβแผ่นประกอบด้วยสามเส้นβ-หนึ่งของพวกเขาจากการ Pro3 Cys5 สองจาก Tyr25 เพื่อ Ala27 และสุดท้ายจาก Tyr29 เพื่อ Ile32 คุณภาพของแบบจำลองสำหรับ BtITx3 ที่ได้รับการประเมินโดยใช้โปรแกรมอะไรขึ้นถ้าซึ่งแสดงให้เห็นว่ารูปแบบได้ดีเท่าที่ของโครงสร้างสารพิษที่คล้ายคลึงกัน 1SIS หมายความ stereochemical คุณภาพดี รายงาน PROCHECK แสดงให้เห็นว่ารูปแบบการมีคะแนน Ramachandran 75.5 ซึ่งใกล้เคียงกับที่ของแม่ 76.9 คุณสมบัติ stereochemical อื่น ๆ นอกจากนี้ยังมีในข้อตกลงกับที่ของแม่ซ​​ึ่งบ่งชี้ว่าโครงสร้างรูปแบบของ BtITx3 แสดงนั่งร้านที่คล้ายกันเป็นครอบงำโดย insectotoxins สั้นอื่นที่มีการปิดกั้นช่องคลอไรด์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ตำแหน่งของลำดับเบื้องต้นของ btitx3 แสดง 50 – 60 % ซึ่งมีสารพิษแมลงสั้นตามโครงสร้างสามมิติของ i5a ( 1sis ) ถูกนำมาเป็นแม่แบบในการสร้างแบบจำลองโครงสร้างของที่ต้องการ สารพิษ btitx3 ถูกออกแบบด้วยแม่แบบโครงสร้างของสารพิษ mesobuthus eupeus ( i5a ) [ 3 ] ซึ่งกำหนดโดยแม่เหล็กนิวเคลียร์ ( NMR ) ( 1sis )แสดง 1 ถึง asp18 จาก asn11 เป็นเกลียวแอลฟาบีตา - แผ่นและประกอบด้วยสามเกลียวบีตา - หนึ่งจาก met3 เพื่อ cys5 , ที่สองจาก lys25 เพื่อ phe27 และที่สามจาก pro29 เพื่อ leu32 ( รูปที่ 4 ) สุดท้ายก็มีโครงสร้างแบบเกลียวแอลฟาจาก asn11 เพื่อ lys18 และบีตา - แผ่นประกอบด้วยสามเกลียวบีตา - หนึ่งของพวกเขาจากการ cys5 pro3 ,ที่สองจาก tyr25 เพื่อ ala27 และครั้งสุดท้ายจาก tyr29 เพื่อ ile32 . คุณภาพของแบบประเมิน btitx3 โดยใช้โปรแกรมถ้า ซึ่งแสดงให้เห็นว่าแบบจำลองที่ดีของสารพิษเปรียบเทียบโครงสร้าง 1sis ยังคงคุณภาพ stereochemical ดี รายงาน ปตท. พบว่ารูปแบบมี Ramachandran คะแนน 75.5 ซึ่งอยู่ใกล้กับที่ของแม่แบบ 76.9 .คุณสมบัติ stereochemical อื่นก็เห็นด้วยกับที่ของแม่ ซึ่งพบว่า แบบจำลองโครงสร้างของ btitx3 แสดงคล้ายนั่งร้านเป็นครอบครองโดยอื่น ๆสั้น ๆ insectotoxins การปิดกั้นช่องทางคลอไรด์