Epigeic earthworms can significantly

Epigeic earthworms can significantly hasten the decomposition of organic matter, which is known to be mediated by gut associated microflora. However, there is scanty information on the abundance and diversity of the gut bacterial flora in different earthworm genera fed with a similar diet, particularly Eisenia foetida and Perionyx excavatus. In this context, 16S rDNA based clonal survey of gut metage- nomic DNA was assessed after growth of these two earthworms on lignocellulosic biomass. A set of 67 clonal sequences belonging to E. foetida and 75 to P. excavatus were taxonomically annotated using MG-RAST and RDP pipeline servers. Highest number of sequences were annotated to Proteobacteria (38–44%), followed by unclassified bacteria (14–18%) and Firmicutes (9.3–11%). Comparative analyses revealed significantly higher abundance of Actinobacteria and Firmicutes in the gut of P. excavatus. The functional annotation for the 16S rDNA clonal libraries of both the metagenomes revealed a high abundance of xylan degraders (12.1–24.1%). However, chitin degraders (16.7%), ammonia oxidizers (24.1%) and nitrogen fixers (7.4%) were relatively higher in E. foetida, while in P. excavatus; sulphate reducers and sulphate oxidizers (12.1–29.6%) were more abundant. Lignin degradation was detected in 3.7% clones of E. foetida, while cellulose degraders represented 1.7%. The gut microbiomes showed relative abundance of dehalogenators (17.2–22.2%) and aromatic hydrocarbon degraders (1.7–5.6%), illustrating their role in bioremediation. This study highlights the significance of differences in the inherent microbiome of these two earthworms in shaping the metagenome for effective degradation of different types of biomass under tropical conditions.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Significantly Epigeic ไส้เดือนสามารถเร่งการเน่าของอินทรีย์ ซึ่งเป็นที่รู้จักกันเป็น mediated โดยไส้สัมพันธ์ microflora อย่างไรก็ตาม มีข้อมูล scanty ความอุดมสมบูรณ์และความหลากหลายของไส้ flora แบคทีเรียในสกุลต่าง ๆ ไส้เดือนดินเลี้ยง ด้วยอาหารคล้าย โดยเฉพาะอย่างยิ่ง Eisenia โหมและ Perionyx excavatus ในบริบทนี้ 16S rDNA ใช้ clonal สำรวจไส้ metage-nomic ดีเอ็นเอถูกประเมินหลังจากเจริญเติบโตของไส้เดือนเหล่านี้สองในชีวมวล lignocellulosic ชุดลำดับ clonal 67 ของ E. โหมและ 75 กับ P. excavatus มี taxonomically ใส่คำอธิบายประกอบใช้ MG RAST และ RDP เซิร์ฟเวอร์ไปป์ไลน์ จำนวนสูงสุดของลำดับใส่คำอธิบายประกอบเพื่อ Proteobacteria (38-44%), ตาม ด้วยแบคทีเรีย unclassified (14-18%) และ Firmicutes (9.3-11%) วิเคราะห์เปรียบเทียบเปิดเผย significantly สูงมากมาย Actinobacteria และ Firmicutes ในลำไส้ของ P. excavatus อธิบายหน้าที่ของ 16S rDNA clonal รีของ metagenomes ทั้งเปิดเผยความสูงของ degraders xylan (12.1 – 24.1%) อย่างไรก็ตาม degraders ไคทิน (16.7%), แอมโมเนีย oxidizers (24.1%) และ fixers ไนโตรเจน (7.4%) ได้ค่อนข้างสูงในโหม E. ในขณะที่ใน P. excavatus; reducers ซัลเฟต และซัลเฟต oxidizers (12.1 – 29.6%) มากขึ้น ย่อยสลาย lignin พบในโคลน 3.7% ของ E. โหม ในขณะที่เซลลูโลส degraders แทน 1.7% Microbiomes ลำไส้พบญาติมากมาย dehalogenators (หา 17.2-22.2%) และไฮโดรคาร์บอน degraders (1.7 – 5.6%), การแสดงบทบาทของตนในววิธี การศึกษานี้เน้น significance ของความแตกต่างใน microbiome โดยธรรมชาติของไส้เดือนสองเหล่านี้ในการกำหนดทิศ metagenome สำหรับย่อยสลายมีประสิทธิภาพแตกต่างของชีวมวลสภาวะร้อน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ไส้เดือน Epigeic สามารถอย่างมีนัยสำคัญเร่งการสลายตัวของสารอินทรีย์ซึ่งเป็นที่รู้จักที่จะไกล่เกลี่ยโดยลำไส้ที่เกี่ยวข้องไมโครชั้นร่า แต่มีข้อมูลน้อยมากเกี่ยวกับความอุดมสมบูรณ์และความหลากหลายของไส้ร่าชั้นแบคทีเรียในจำพวกไส้เดือนดินที่แตกต่างกันที่เลี้ยงด้วยอาหารที่คล้ายกันโดยเฉพาะอย่างยิ่ง Eisenia foetida และ Perionyx excavatus ในบริบทนี้ 16S rDNA ตามการสำรวจ clonal ของลำไส้ metage- ดีเอ็นเอทางเศรษฐกิจหลังจากที่ได้รับการประเมินการเจริญเติบโตของทั้งสองไส้เดือนในชีวมวลลิกโนเซลลูโลส ชุดของ 67 ลำดับ clonal ที่อยู่ในประเภทอี foetida และ 75 ถึง excavatus P. ถูกข้อเขียน taxonomically ใช้ MG-RAST และ RDP เซิร์ฟเวอร์ท่อ จำนวนมากที่สุดของลำดับถูกข้อเขียนเพื่อ Proteobacteria (38-44%) ตามด้วยแบคทีเรียเอ็ด Fi unclassi (14-18%) และ Firmicutes (9.3-11%) การวิเคราะห์เปรียบเทียบเปิดเผยความอุดมสมบูรณ์อย่างมีนัยสำคัญที่สูงขึ้นของแอคติโนมัยสีทและ Firmicutes ในลำไส้ของพี excavatus คำอธิบายประกอบการทำงานสำหรับห้องสมุด clonal 16S rDNA ของทั้งสอง metagenomes เปิดเผยความอุดมสมบูรณ์สูงของ degraders ไซแลน (12.1-24.1%) อย่างไรก็ตาม degraders ไคติน (16.7%), แอมโมเนียอ​​อกซิไดเซอร์ (24.1%) และ Xers Fi ไนโตรเจน (7.4%) เป็นที่ค่อนข้างสูงในอี foetida ในขณะที่ P. exc​​avatus; ลดซัลเฟตและออกซิไดเซอร์ซัลเฟต (12.1-29.6%) มีความอุดมสมบูรณ์มากขึ้น การย่อยสลายลิกนินถูกตรวจพบในโคลน 3.7% ของอี foetida ขณะ degraders เซลลูโลสเป็นตัวแทนของ 1.7% ลำไส้ microbiomes แสดงให้เห็นความอุดมสมบูรณ์ของญาติของ dehalogenators (17.2-22.2%) และ degraders หอมไฮโดรคาร์บอน (1.7-5.6%) แสดงบทบาทของตนในการบำบัดทางชีวภาพ การศึกษาครั้งนี้เน้นให้เห็นถึงนัยมีนัยสำคัญของความแตกต่างใน microbiome โดยธรรมชาติของทั้งสองไส้เดือนดินในการสร้าง metagenome การย่อยสลายที่มีประสิทธิภาพของประเภทที่แตกต่างกันของสารชีวมวลภายใต้เงื่อนไขที่เขตร้อน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

epigeic ไส้เดือนสามารถ signi จึงลดลงอย่างมีนัยสําคัญเมื่อเร่งการสลายตัวของอินทรียวัตถุซึ่งเป็นที่รู้จักกันเป็นคนกลาง โดยไส้ที่เกี่ยวข้องโอร่าไมโครfl . อย่างไรก็ตาม มีข้อมูลขาดแคลนในความอุดมสมบูรณ์และความหลากหลายของแบคทีเรียในลำไส้flโอร่าไส้เดือนเลี้ยงด้วยอาหารต่างสกุลกัน โดยเฉพาะอย่างยิ่งอายซิเนีย ฟูทิดา และ perionyx excavatus . ในบริบทนี้16S rDNA จากงานสำรวจไส้ metage - nomic ดีเอ็นเอที่ได้รับหลังจากการเติบโตของทั้งสองไส้เดือนในชีวมวล lignocellulosic . ชุดรูปแบบลำดับ 67 เป็นของ E 75 P . excavatus เฟติดาเป็น taxonomically บันทึกย่อและใช้ mg-rast RDP ส่งเซิร์ฟเวอร์ จำนวนสูงสุดของลำดับคือ บันทึกย่อที่จะโพรทีโอแบคทีเรีย ( 38 - 44 )ตามด้วย unclassi จึงเอ็ดแบคทีเรีย ( 14 – 18 % ) และ Firmicutes ( 9.3 ( 11% ) การวิเคราะห์เปรียบเทียบระหว่าง signi จึงลดลงอย่างมีนัยสําคัญเมื่อสูงกว่าและความอุดมสมบูรณ์ของแอคติโนมัยสีท Firmicutes ในไส้หน้า excavatus . บันทึกย่อการทำงานสำหรับงานห้องสมุดของ 16S rDNA พบสูงทั้ง metagenomes ความอุดมสมบูรณ์ของความสามารถในการย่อยสลายไซ ( 12.1 ( ร้อยละ 24.1 ) อย่างไรก็ตาม ความสามารถในการย่อยสลาย ไคติน ( 16.7% ) oxidizers แอมโมเนีย ( 241 ) % และไนโตรเจน จึง xers ( 7.4% ) ค่อนข้างสูงใน เฟติดาในขณะที่ในหน้า excavatus ; reducers สารซัลเฟต oxidizers ( 12.1 ) ราวเปอร์เซ็นต์ ) มีค่ามากมาย มากกว่า ย่อยสลายลิกนินถูกตรวจพบในร้อยละ 3.7 โคลนของ E . เฟติดา ในขณะที่ความสามารถในการย่อยสลายเซลลูโลสแทน 1.7 % ไส้ microbiomes พบความชุกชุมสัมพัทธ์ของ dehalogenators ( 17.2 ( 22.2% ) และความสามารถในการย่อยสลายอะโรเมติกไฮโดรคาร์บอน ( 1.7 ( 5.6% ) ,ที่แสดงให้เห็นถึงบทบาทของตนในจังหวัด . การศึกษานี้เน้น signi ถ่ายทอดโรคมะเร็งของความแตกต่างในไมโครไบโ โดยธรรมชาติของทั้งสองไส้เดือนในรูปร่าง metagenome มีประสิทธิภาพการย่อยสลายของประเภทที่แตกต่างกันของชีวมวล ภายใต้สภาพอากาศร้อนชื้น