2.3.2. Pathogenic viruses
For each pathogenic virus, an amount close to the LOD (e.g., 9.3 × 102
copies for HAV; 1.2 × 104 copies for NoV GI and 1.6 × 102 for NoV GII) was
chosen to guide the inoculation tests. To assess the influence of inoculation
level, two or three inoculation levels were tested for each virus:
this base amount and an amount with 101 and/or 102 more copies.
Bottled mineral water samples (0.5 L) were spiked with 100 μL of
10-fold dilutions of pathogenic virus stocks (HAV, NoV GI or NoV GII)
in diethylpyrocarbonate (DEPC)-treated water (Life Technologies) to
obtain per-sample inoculation levels of 9.3 × 102 and 9.3 × 104 genome
copies for HAV; 1.2 × 104 and 1.2 × 106 genome copies for NoV GI and
1.6 × 102 and 1.6 × 104 genome copies for NoV GII.
Lettuce and semi-dried tomato samples (25 g) were spiked with
100 μL of 10-fold dilutions in DEPC-treated water of pathogenic virus
stocks (HAV, NoV GI or NoV GII) to obtain per-sample inoculation levels
of 9.3 × 102
, 9.3 × 103 and 9.3 × 104 genome copies for HAV; 1.2 × 104
and 1.2 × 106 genome copies for NoV GI; 1.6 × 102
, 1.6 × 103 and
1.6 × 104 genome copies of NoV GII. The contamination was carried
out by adding 100 μL of the viral inoculum distributed in small drops
evenly on the food samples (25 g, lettuce or semi-dried tomatoes) and
left to dry overnight at 4 °C to increase the number of adhering viral particles
as previously described (Fraisse et al., 2011; Stals et al., 2011a).
To determine the most appropriate process control virus to use according
to matrix type and pathogenic virus, one experiment set comprised
either 6 bottles of water or 8 solid food samples (lettuce or semidried
tomatoes) spiked with a pathogenic virus alone (HAV, NoV GI or
NoV GII); either 6 bottles of water or 8 solid food samples co-inoculated
with 109 genome copies MNV-1 as a process control; and either 6 bottles
of water or 8 solid food samples co-inoculated with 108 genome copies
Mengovirus (vMC0 strain) as a process control. For each experiment
and each matrix (bottled water, lettuce or semi-dried tomatoes), two
pathogenic virus-free samples (negative controls for the pathogenic
virus) were spiked either with MNV-1 or Mengovirus; and one unspiked
sample was used as a negative control.
2.3.2. pathogenic ไวรัสสำหรับไวรัสแต่ละ pathogenic ยอดปิดลอด (เช่น 9.3 × 102สำหรับ HAV สำเนาระดับ 1.2 × 104 NoV GI และ 1.6 × 102 สำหรับ NoV GII) ได้เลือกที่จะแนะนำการทดสอบ inoculation ในการประเมินอิทธิพลของ inoculationระดับ สอง หรือสาม inoculation ระดับทดสอบสำหรับไวรัสแต่ละ:ฐานนี้และยอดเงินที่ มีสำเนาเพิ่มเติมของ 101 / 102ตัวอย่างน้ำแร่ (0.5 L) มี spiked กับ μL 100 ของdilutions 10-fold ของไวรัส pathogenic หุ้น (HAV, NoV GI หรือ NoV GII)ใน diethylpyrocarbonate (DEPC) -รับน้ำ (ชีวิตเทคโนโลยี) เพื่อรับระดับ inoculation ต่อตัวอย่างที่ 9.3 × 102 และ 9.3 × 104 จีโนมสำหรับ HAV กลุ่ม 1.2 × 104 และ 1.2 × 106 คัดลอกสำหรับจิพฤศจิกายน และ1.6 × 102 และ 1.6 × 104 กลุ่มคัดลอกสำหรับ NoV GIIผักกาดหอมและมะเขือเทศอบแห้งกึ่งตัวอย่าง (25 กรัม) มี spiked ด้วยΜL 100 ของ dilutions 10-fold DEPC ถือน้ำ pathogenic ไวรัสหุ้น (HAV, NoV GI หรือ NoV GII) รับระดับ inoculation ต่อตัวอย่างของ 9.3 × 102การคัดลอกกลุ่ม 9.3 × 103 และ 9.3 × 104 สำหรับ HAV 1.2 × 104และ 1.2 × 106 กลุ่มสำเนาสำหรับพฤศจิกายนจิ 1.6 × 102, 1.6 × 103 และ1.6 สำเนาจีโนม× 104 ของ NoV GII ทำการปนเปื้อนออก โดยการเพิ่ม μL 100 ของ inoculum ไวรัสที่กระจายในหยดเล็ก ๆในตัวอย่างอาหาร (25 กรัม ผักกาดหอม หรือมะเขือเทศอบแห้งกึ่ง) อย่างสม่ำเสมอ และทิ้งให้แห้งข้ามคืนที่ 4 ° C เพื่อเพิ่มจำนวนของอนุภาคไวรัสมาตรฐานas previously described (Fraisse et al., 2011; Stals et al., 2011a).To determine the most appropriate process control virus to use accordingto matrix type and pathogenic virus, one experiment set comprisedeither 6 bottles of water or 8 solid food samples (lettuce or semidriedtomatoes) spiked with a pathogenic virus alone (HAV, NoV GI orNoV GII); either 6 bottles of water or 8 solid food samples co-inoculatedwith 109 genome copies MNV-1 as a process control; and either 6 bottlesof water or 8 solid food samples co-inoculated with 108 genome copiesMengovirus (vMC0 strain) as a process control. For each experimentand each matrix (bottled water, lettuce or semi-dried tomatoes), twopathogenic virus-free samples (negative controls for the pathogenicvirus) were spiked either with MNV-1 or Mengovirus; and one unspikedsample was used as a negative control.
การแปล กรุณารอสักครู่..
