promising clones, approximately 10 years, is a bottleneck
to increased productivity; a quicker means of identifying
clones with top-of-the-line performance is clearly
required.
A molecular genetic map of cassava was constructed
on the basis of the segregation of predominantly restriction
fragment length polymorphism (RFLP) markers in a
F1 intra-specific cross (Fregene et. al. 1997), as a first
step towards marker-assisted genetic analysis of traits of
agronomic importance. To date, the genetics of resistance
of two devastating cassava diseases, both major
production constraints, the cassava bacterial blight
(CBB) and the African cassava mosaic disease (ACMD),
have been studied using the mapping population, and a
backcross derivative (CIAT, unpublished data). Other
traits studied include the inheritance of early bulking and
root quality (Fregene et al. 2000). These studies have
been exclusively carried out at research centers that can
afford the technology required for RFLP markers, thereby
limiting the use of marker technology to these centers,
which account for a small percentage of the manpower
working on breeding of the crop. In an attempt to
make marker technology widely available in cassava, an
effort was embarked upon to place on the cassava map
simple-sequence repeat (SSR) markers, markers that are
polymerase chain reaction (PCR)-based and highly polymorphic
and best meet the criteria required for the transfer
of marker technology to research facilities in developing
countries.
SSR markers are found in all eukaryotic genomes.
They are short tandem repeat motifs usually consisting of
1–6 bp of nucleotides. They were first referred to as microsatellites
by Litt and Lutty (1989) and later as simple
sequence repeats (SSRs) by Jacob et al. (1991). Conserved
regions flanking the repeats are suitable for designing
PCR primer pairs to be used for amplifying the
intervening repeat loci. These loci are highly variable on
account of the number of repeat units found for each locus
in any given population (Morgante and Oliveri 1993).
The high levels of heterozygosity and the codominant,
and PCR-based nature of these repeat loci have made
SSRs the molecular markers of choice for genetic mapping
and diversity studies (Wang et al. 1994; Gupta et al.
1996). Many workers have described the use of SSR
markers in genetic mapping, usually integrating them onto
existing RFLP framework maps (Roder et al. 1998; Liu
et al. 1996; Taramino and Tingey 1996; Senior and Heun
1993; Wu and Tanksley 1993; Schmidt and Heslop-
Harrison 1996; Bell and Ecker 1994). The discovery, inheritance
and variability of fourteen GA repeats have
been described for cassava (Chavariaga-Aguirre et. al.
1998). A sub-set of 4 of those SSR markers were used to
evaluate the genetic diversity of the core collection, about
600 accessions, of the cassava world germplasm bank at
the International Center for Tropical Agriculture (CIAT,
the Spanish acronym) (Chavariaga-Aguirre et al. 1999).
Results showed high levels of heterozygosity (up to 0.88)
of the markers, revealed putative duplicates and indicated
the unequal representation of cassava diversity, by country,
in the core collection. We describe in this paper the
isolation and characterization of 172 SSR markers in cassava
for saturating the existing genetic map of cassava
and the mapping of 36 of them onto the existing genetic
map of cassava.
โคลนสัญญาประมาณ 10 ปีที่ผ่านมาเป็นคอขวด
ในการผลิตที่เพิ่มขึ้น; เป็นวิธีที่รวดเร็วในการระบุ
โคลนกับด้านบนของประสิทธิภาพการทำงานอย่างชัดเจน
ที่จำเป็น.
แผนที่พันธุกรรมระดับโมเลกุลของมันสำปะหลังที่ถูกสร้างขึ้น
บนพื้นฐานของการแยกส่วนใหญ่ข้อ จำกัด
ส่วน length polymorphism (RFLP) เครื่องหมายใน
F1 ข้ามภายในที่เฉพาะเจาะจง (Fregene และ. al. 1997) เป็นครั้งแรก
ขั้นตอนต่อการวิเคราะห์ทางพันธุกรรมเครื่องหมายช่วยในลักษณะของ
ความสำคัญทางการเกษตร ในวันที่พันธุศาสตร์ของความต้านทาน
ของทั้งสองโรคมันสำปะหลังทำลายล้างทั้งที่สำคัญ
ข้อ จำกัด การผลิตมันสำปะหลังทำลายแบคทีเรีย
(CBB) และมันสำปะหลังโรคกระเบื้องโมเสคแอฟริกัน (ACMD)
ได้รับการศึกษาโดยใช้การทำแผนที่ประชากรและ
อนุพันธ์วิธีผสมกลับ (CIAT, ข้อมูลที่ไม่ถูกเผยแพร่) อื่น ๆ
ลักษณะศึกษา ได้แก่ มรดกของพะรุงพะรังต้นและ
รากที่มีคุณภาพ (Fregene et al. 2000) การศึกษาเหล่านี้ได้
รับการดำเนินการเฉพาะออกที่ศูนย์การวิจัยที่สามารถ
จ่ายได้เทคโนโลยีที่จำเป็นสำหรับเครื่องหมาย RFLP จึง
จำกัด การใช้เทคโนโลยีเครื่องหมายไปยังศูนย์เหล่านี้
ซึ่งมีสัดส่วนร้อยละขนาดเล็กของกำลังคน
ที่ทำงานเกี่ยวกับการปรับปรุงพันธุ์ของพืช ในความพยายามที่จะ
ทำให้เทคโนโลยีเครื่องหมายอย่างแพร่หลายในมันสำปะหลัง
ได้รับความพยายามลงมือที่จะวางบนแผนที่มันสำปะหลัง
ซ้ำง่ายลำดับ (SSR) เครื่องหมายเครื่องหมายที่มี
วิธี Polymerase chain reaction (PCR) -based และ polymorphic สูง
และดีที่สุดตอบสนองความ เกณฑ์ที่จำเป็นสำหรับการถ่ายโอน
เทคโนโลยีเครื่องหมายสิ่งอำนวยความสะดวกการวิจัยในการพัฒนา
ประเทศ.
เครื่องหมาย SSR ที่พบในจีโนม eukaryotic ทั้งหมด.
พวกเขามีความสำคัญควบคู่ซ้ำสั้นมักจะประกอบด้วย
1-6 bp ของนิวคลีโอ พวกเขาได้รับเป็นครั้งแรกเรียกว่าไมโคร
โดย Litt และ Lutty (1989) และต่อมาง่ายๆเป็น
ลำดับซ้ำ (SSRs) จาค็อบและคณะ (1991) อนุรักษ์
ภูมิภาคขนาบซ้ำมีความเหมาะสมสำหรับการออกแบบ
คู่ไพรเมอร์พีซีอาร์ที่จะใช้สำหรับขยาย
loci ซ้ำแทรกแซง loci เหล่านี้เป็นอย่างสูงที่ตัวแปรใน
บัญชีของจำนวนหน่วยซ้ำพบทางเดินแต่ละ
ประชากรใดก็ตาม (Morgante และ Oliveri 1993).
ระดับสูงของ heterozygosity และ codominant,
และธรรมชาติ PCR-based ของ loci ซ้ำเหล่านี้ได้ทำให้
SSRs โมเลกุลของทางเลือกสำหรับการทำแผนที่พันธุกรรม
และการศึกษาความหลากหลาย (Wang et al, 1994;.. Gupta et al,
1996) คนงานหลายคนได้อธิบายการใช้งานของ SSR
เครื่องหมายในการทำแผนที่พันธุกรรมมักจะบูรณาการพวกเขาลงบน
แผนที่ที่มีอยู่กรอบ RFLP (Roder et al, 1998;. หลิว
et al, 1996;. TARAMINO และ Tingey 1996; อาวุโสและเฮือน
1993; Wu และ Tanksley 1993; มิดท์ และ Heslop-
แฮร์ริสัน 1996; เบลล์และ Ecker 1994) การค้นพบมรดก
และความแปรปรวนของสิบสี่ซ้ำ GA ได้
รับการอธิบายมันสำปะหลัง (Chavariaga-Aguirre และ. al.
1998) ย่อยชุดที่ 4 ของเครื่องหมาย SSR เหล่านั้นถูกใช้ในการ
ประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรมของคอลเลกชันหลักประมาณ
600 สายของมันสำปะหลังธนาคารเชื้อพันธุกรรมโลกที่
ศูนย์นานาชาติเพื่อการเกษตรเขตร้อน (CIAT,
ย่อสเปน) (Chavariaga-Aguirre et al. 1999).
ผลการศึกษาพบระดับสูงของ heterozygosity (ถึง 0.88)
เครื่องหมายเปิดเผยซ้ำสมมุติและชี้ให้เห็น
การแสดงที่ไม่เท่าเทียมกันของความหลากหลายมันสำปะหลังโดยประเทศ
หลักในการเก็บรวบรวม เราอธิบายในบทความนี้
แยกและลักษณะของ 172 SSR เครื่องหมายในมันสำปะหลัง
สำหรับ saturating แผนที่ทางพันธุกรรมที่มีอยู่ของมันสำปะหลัง
และการทำแผนที่ของ 36 ของพวกเขาไปยังทางพันธุกรรมที่มีอยู่
แผนที่มันสำปะหลัง
การแปล กรุณารอสักครู่..
![](//thimg.ilovetranslation.com/pic/loading_3.gif?v=b9814dd30c1d7c59_8619)
โคลนสัญญาประมาณ 10 ปี เป็นคอขวด
เพื่อเพิ่มผลผลิต ; ได้เร็วขึ้นหมายถึงการระบุ
โคลนกับด้านบนของบรรทัดที่ต้องการประสิทธิภาพอย่างชัดเจน
.
แผนที่ทางพันธุศาสตร์ระดับโมเลกุลของมันถูกสร้างขึ้น
บนพื้นฐานของการแยกจากกันของเด่นจำกัด
fragment length polymorphism ( RFLP ) เครื่องหมายใน
F1 ภายในเฉพาะข้าม ( fregene et al . 1997 ) เป็นครั้งแรก
ขั้นตอนต่อดีเอ็นเอเครื่องหมายช่วยการวิเคราะห์ทางพันธุกรรมของลักษณะทางการเกษตรที่สำคัญของ
. วันที่ , พันธุกรรมความต้านทานโรคมันสำปะหลัง
2 แรง ทั้งสาขา
การผลิตมันสำปะหลังที่มีปัญหาโรค
( cbb ) ในแอฟริกา และมันสำปะหลังโมเสกโรค ( ACMD )
ได้รับการศึกษาโดยใช้แผนที่ประชากร และอนุพันธ์ ( เกี๊ยตพิมพ์ ,
( ข้อมูล )
อื่น ๆการวิจัยนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษา ลักษณะของต้นและมรดกเปรียบเทียบ
คุณภาพราก ( fregene et al . 2000 ) การศึกษาเหล่านี้ได้
ถูกเฉพาะดำเนินการที่ศูนย์วิจัยที่สามารถ
ซื้อเทคโนโลยีที่จำเป็นสำหรับ RFLP markers , จึง จำกัด การใช้เทคโนโลยีเครื่องหมาย
ซึ่งศูนย์เหล่านี้บัญชีสำหรับร้อยละขนาดเล็กของกำลังคน
ทำงานในการปรับปรุงพันธุ์ของพืช ในความพยายามที่จะ
ให้เทคโนโลยีเครื่องหมายที่มีอยู่อย่างกว้างขวางในมันสำปะหลัง ,
ความพยายามเริ่มต้นเมื่อวางบนแผนที่ลำดับซ้ำง่ายๆ มันสำปะหลัง
( SSR ) เครื่องหมาย , เครื่องหมายที่
ปฏิกิริยาลูกโซ่ ( PCR ) ซึ่งมีจำนวน
ที่ดีที่สุดและตรงกับเกณฑ์ที่จำเป็นสำหรับการถ่ายโอนเทคโนโลยีเพื่อการวิจัยเครื่องหมาย
สิ่งอำนวยความสะดวกในการพัฒนา ประเทศ ที่ได้รับเครื่องหมายที่พบในจีโนม
เข้ามาทั้งหมดพวกเขาจะสั้นตีคู่ซ้ำลวดลายมักจะประกอบด้วย
1 – 6 มีขนาด . พวกเขาครั้งแรกที่เรียกว่าไมโครแซเทลไลต์
โดย ลิท lutty และ ( 2532 ) และต่อมาเป็นลำดับง่ายๆ
ซ้ำ ( ssrs ) โดย Jacob et al . ( 1991 ) ป่าสงวน
ภูมิภาคจซ้ำเหมาะสำหรับการออกแบบ
PCR ไพรเมอร์คู่เพื่อใช้เป็น amplifying
แทรกแซงของย้ำ เทคนิคเหล่านี้มีตัวแปรบน
บัญชีที่ของจำนวนหน่วยซ้ำที่พบในแต่ละความเชื่อใดก็ตาม ( morgante
ในประชากร และ โอลิเวรี่ 1993 )
ระดับเฉพาะที่และ codominant
และ PCR , ตามธรรมชาติ loci ย้ำเหล่านี้ได้
ssrs เครื่องหมายโมเลกุลพันธุกรรมของทางเลือกสำหรับการทำแผนที่
และความหลากหลายของการศึกษา ( Wang et al . 1994 ; Gupta et al .
1996 ) คนงานหลายคนที่อธิบายการใช้ SSR
เครื่องหมายในแผนที่พันธุกรรม , มักจะรวมกับที่มีอยู่ :
กรอบแผนที่ ( roder et al . 1998 ; หลิว
et al . 1996 ; และ taramino tingey 1996 ; อาวุโสและฮุน
1993 ; วูและ Tanksley 1993 ; และชมิดท์ เฮสเลิป -
แฮร์ริสัน 1996 ; เบลล์และเอ็กเคอร์ 1994 ) การค้นพบมรดก
และการเปลี่ยนแปลงของสิบสี่ กา ซ้ำมี
ถูกอธิบายไว้สำหรับมันสำปะหลัง ( chavariaga อคิวเร่ et al .
1998 )เป็นซับเซตของ SSR markers จำนวน 4 คน
ศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของแกนคอลเลกชันเกี่ยวกับ
600 สายพันธุ์ของพันธุ์มันสำปะหลังโลกธนาคารที่
ศูนย์เกษตรเขตร้อนนานาชาติ ( เกี๊ยต
, ตัวย่อภาษาสเปน ) ( chavariaga อคิวเร่ et al . 1999 ) .
พบระดับสูงของเฉพาะที่ ( ถึง 0.88 )
ของเครื่องหมาย , การแสดงออกและเปิดเผยกันพบ
ไม่เท่ากัน เป็นตัวแทนของความหลากหลาย มันสำปะหลัง โดยประเทศ
ในแกนคอลเลกชัน เราอธิบายในบทความนี้
การแยกและการศึกษาคุณสมบัติของ SSR markers 172 ในมันสำปะหลัง
สำหรับ saturating ที่มีอยู่แผนที่พันธุกรรมมันสำปะหลัง
และการทำแผนที่ของ 36 ของพวกเขาไปยังที่มีอยู่
แผนที่พันธุกรรมมันสำปะหลัง
การแปล กรุณารอสักครู่..
![](//thimg.ilovetranslation.com/pic/loading_3.gif?v=b9814dd30c1d7c59_8619)