Protein–protein interaction network

Protein–protein interaction networks are useful for studying human diseases and to look for possible health care through a holistic approach. Networks are playing an increasing and important role in the understanding of physiological processes such as homeostasis, signaling, spatial and temporal organizations, and pathological conditions. In this article we show the complex system of interactions determined by human Sirtuins (Sirt) largely involved in many metabolic processes as well as in different diseases. The Sirtuin family consists of seven homologous Sirt-s having structurally similar cores but different terminal segments, being rather variable in length and/or intrinsically disordered. Many studies have determined their cellular location as well as biological functions although molecular mechanisms through which they act are actually little known therefore, the aim of this work was to define, explore and understand the Sirtuin-related human interactome. As a first step, we have integrated the experimentally determined protein–protein interactions of the Sirtuin-family as well as their first and second neighbors to a Sirtuin-related sub-interactome. Our data showed that the second-neighbor network of Sirtuins encompasses 25% of the entire human interactome, and exhibits a scale-free degree distribution and interconnectedness among top degree nodes. Moreover, the Sirtuin sub interactome showed a modular structure around the core comprising mixed functions. Finally, we extracted from the Sirtuin sub-interactome subnets related to cancer, aging and post-translational modifications for information on key nodes and topological space of the subnets in the Sirt family network.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เครือข่าย Protein–protein โต้ตอบมีประโยชน์ สำหรับการศึกษาโรคในมนุษย์ และหาได้ดูแลสุขภาพผ่านวิธีการแบบองค์รวม เครือข่ายกำลังเล่นบทบาทเพิ่มขึ้น และมีความสำคัญในความเข้าใจของกระบวนการสรีรวิทยาเช่นภาวะธำรงดุล สัญญาณ องค์กรพื้นที่ และขมับ และเงื่อนไขทางพยาธิวิทยา ในบทความนี้ เราแสดงระบบที่ซับซ้อนของการโต้ตอบที่กำหนด โดยมนุษย์ Sirtuins (Sirt) ส่วนใหญ่ที่เกี่ยวข้องในกระบวนการเผาผลาญมากเช่นในโรคต่าง ๆ ครอบครัว Sirtuin ประกอบด้วยเจ็ด homologous Sirt-s มีแกนคล้าย structurally แต่เทอร์มินัลที่แตกต่างเซ็กเมนต์ การผันแปรค่อนข้างยาว หรือ disordered ทำ หลายการศึกษาได้กำหนดผู้ที่ตั้งโทรศัพท์มือถือตลอดจนฟังก์ชันชีวภาพแม้ว่ากลไกระดับโมเลกุลที่จะทำเป็นจริงน้อยที่รู้จักดังนั้น จุดมุ่งหมายของงานนี้คือเพื่อ กำหนด สำรวจ และทำความเข้าใจเกี่ยวข้อง Sirtuin มนุษย์ interactome ก้าวแรก เราได้รวมการโต้ตอบที่กำหนด experimentally protein–protein Sirtuin-ครอบครัวเป็นบ้านของพวกเขา และสองจะ interactome ย่อย-Sirtuin ที่เกี่ยวข้อง ข้อมูลแสดงให้เห็นว่า เครือข่ายเพื่อนบ้านที่สองของ Sirtuins ครอบคลุม 25% ของ interactome มนุษย์ทั้งหมด และจัดแสดงแจกฟรีสเกลองศาและ interconnectedness ระหว่างโหนระดับสูงสุด นอกจากนี้ interactome ย่อย Sirtuin ที่แสดงโครงสร้างโมดุลรอบหลักที่ประกอบด้วยฟังก์ชันรวม สุดท้าย เราดึงข้อมูลจากเครือข่ายย่อยย่อย interactome Sirtuin ที่เกี่ยวข้องกับโรคมะเร็ง การกำหนดอายุ และ post-translational การปรับเปลี่ยนข้อมูลเกี่ยวกับคีย์โหนและพื้นที่ topological ของเครือข่ายย่อยในเครือข่ายครอบครัว Sirt

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เครือข่ายปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนที่มีประโยชน์สำหรับการศึกษาโรคของมนุษย์และการที่จะมองหาการดูแลสุขภาพที่เป็นไปได้ผ่านวิธีการแบบองค์รวม เครือข่ายที่มีบทบาทเพิ่มขึ้นและมีความสำคัญในการทำความเข้าใจของกระบวนการทางสรีรวิทยาเช่นสภาวะสมดุลสัญญาณองค์กรเชิงพื้นที่และขมับและพยาธิสภาพ ในบทความนี้เราจะแสดงระบบที่ซับซ้อนของการมีปฏิสัมพันธ์กำหนดโดย Sirtuins มนุษย์ (Sirt) ที่เกี่ยวข้องส่วนใหญ่อยู่ในกระบวนการเผาผลาญอาหารเป็นจำนวนมากทั้งในโรคที่แตกต่างกัน ครอบครัวด้วย Sirtuin ประกอบด้วยเจ็ดคล้ายคลึงกัน Sirt-s มีแกนคล้ายกัน แต่โครงสร้างส่วนขั้วที่แตกต่างกันเป็นตัวแปรที่ค่อนข้างยาวและ / หรือระเบียบภายใน การศึกษาหลายแห่งได้กำหนดสถานโทรศัพท์มือถือของพวกเขาเช่นเดียวกับการทำงานทางชีวภาพแม้ว่ากลไกระดับโมเลกุลโดยที่พวกเขาทำหน้าที่เป็นจริงจึงเป็นที่รู้จักกันเล็ก ๆ น้อย ๆ จุดมุ่งหมายของงานนี้คือการกำหนดสำรวจและเข้าใจ interactome มนุษย์ด้วย Sirtuin ที่เกี่ยวข้องกับ เป็นขั้นตอนแรกที่เราได้บูรณาการกำหนดทดลองปฏิกริยาระหว่างโปรตีนของด้วย Sirtuin ครอบครัวเช่นเดียวกับที่ประเทศเพื่อนบ้านเป็นครั้งแรกและครั้งที่สองของพวกเขาที่จะย่อย interactome ด้วย Sirtuin ที่เกี่ยวข้องกับ ข้อมูลของเราแสดงให้เห็นว่าเครือข่ายเพื่อนบ้านที่สองของ Sirtuins ครอบคลุม 25% ของ interactome มนุษย์ทั้งหมดและแสดงการกระจายในระดับขนาดฟรีและสาขาในโหนดระดับบนสุด นอกจากนี้ย่อย interactome ด้วย Sirtuin แสดงให้เห็นโครงสร้างของโมดูลรอบแกนประกอบไปด้วยฟังก์ชั่นที่หลากหลาย สุดท้ายเราสกัดจากเครือข่ายย่อยย่อย interactome ด้วย Sirtuin ที่เกี่ยวข้องกับโรคมะเร็ง, อายุและการปรับเปลี่ยนการโพสต์แปลข้อมูลในโหนดที่สำคัญและพื้นที่ทอพอโลยีของเครือข่ายย่อยในเครือข่ายครอบครัว Sirt

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

โปรตีนและโปรตีนปฏิสัมพันธ์เครือข่ายที่มีประโยชน์สำหรับการศึกษาโรคของมนุษย์และมองหาการดูแลสุขภาพได้ผ่านวิธีการแบบองค์รวม เครือข่ายการเล่น และเพิ่มบทบาทสำคัญในความเข้าใจของกระบวนการทางสรีรวิทยา เช่น ภาษีอากร ส่งสัญญาณ องค์กรเชิงพื้นที่และเวลา และเงื่อนไขทางพยาธิวิทยาในบทความนี้เราจะแสดงระบบที่ซับซ้อนของการโต้ตอบที่กำหนดโดยมนุษย์เซอร์ทู นส์ ( ที่อยู่ ) ส่วนใหญ่เกี่ยวข้องในกระบวนการเผาผลาญมากเช่นเดียวกับในโรคที่แตกต่างกัน ครอบครัวเซอร์ทูนประกอบด้วยเจ็ดโฮโมโลกัส sirt-s มีโครงสร้างคล้ายแกนแต่ส่วนปลายที่แตกต่างกัน การแทนตัวแปรในความยาวและ / หรือภายในระบบ .หลายการศึกษาได้กำหนดตำแหน่งเซลล์ของพวกเขาเช่นเดียวกับฟังก์ชันแม้ว่ากลไกระดับโมเลกุลทางชีวภาพผ่านที่พวกเขาทำมีจริงที่รู้จักกันน้อย ดังนั้น เป้าหมายของงานนี้คือการกำหนด สำรวจและเข้าใจเซอร์ทูนที่เกี่ยวข้องกับมนุษย์ interactome . เป็นขั้นตอนแรกเราได้รวมการทดลองและปฏิสัมพันธ์ของโปรตีนโปรตีนครอบครัวเซอร์ทูนรวมทั้งเพื่อนบ้านครั้งแรกและครั้งที่สองของพวกเขาไปยังเซอร์ทูนที่เกี่ยวข้อง interactome ซบ ข้อมูลแสดงให้เห็นว่าสองเพื่อนบ้านเครือข่ายเซอร์ทู นส์ครอบคลุม 25% ของ interactome มนุษย์ทั้งหมดและจัดแสดงไท - วัดระดับการกระจายและ interconnectedness ของโหนดขึ้นไปด้านบน นอกจากนี้ที่เซอร์ทูน interactome แสดงโครงสร้างของโมดูลย่อยๆประกอบด้วยฟังก์ชันหลักผสม สุดท้าย เราสกัดจากเซอร์ทูนย่อย interactome เครือข่ายย่อยที่เกี่ยวข้องกับโรคมะเร็ง อายุ และการไปรษณีย์ - แปลข้อมูลในโหนดที่สำคัญและปริภูมิทอพอโลยีของเครือข่ายย่อยในครอบครัว
ที่มีเครือข่าย