Duchenne/Becker muscular dystrophie

Duchenne/Becker muscular dystrophies are the most frequent inherited neuromuscular diseases caused by mutations of the dystrophin gene. However, approximately 30 % of patients with the disease do not receive a molecular diagnosis because of the complex mutational spectrum and the large size of the gene. The introduction and use of next-generation sequencing have advanced clinical genetic research and might be a suitable method for the detection of various types of mutations in the dystrophin gene. To identify the mutational spectrum using a single platform, whole dystrophin gene sequencing was performed using next-generation sequencing. The entire dystrophin gene, including all exons, introns and promoter regions, was target enriched using a DMD whole gene enrichment kit. The enrichment libraries were sequenced on an Illumina HiSeq 2000 sequencer using paired read 100 bp sequencing. We studied 26 patients: 21 had known large deletion/duplications and 5 did not have detectable large deletion/duplications by multiplex ligation-dependent probe amplification technology (MLPA). We applied whole dystrophin gene analysis by next-generation sequencing to the five patients who did not have detectable large deletion/duplications and to five randomly chosen patients from the 21 who did have large deletion/duplications. The sequencing data covered almost 100 % of the exonic region of the dystrophin gene by ≥10 reads with a mean read depth of 147. Five small mutations were identified in the first five patients, of which four variants were unreported in the dmd.nl database. The deleted or duplicated exons and the breakpoints in the five large deletion/duplication patients were precisely identified. Whole dystrophin gene sequencing by next-generation sequencing may be a useful tool for the genetic diagnosis of Duchenne and Becker muscular dystrophies.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Dystrophies กล้ามเนื้อ โรค/Becker ได้บ่อย ๆ สืบทอดกล้ามโรคเกิดจากการกลายพันธุ์ของยีน dystrophin อย่างไรก็ตาม ประมาณ 30% ของผู้ป่วยด้วยโรคไม่ได้วินิจฉัยระดับโมเลกุลเนื่องจากสเปกตรัม mutational ซับซ้อนและขนาดใหญ่ของยีน แนะนำการใช้ลำดับรุ่นต่อไปมีการวิจัยทางคลินิกพันธุกรรมขั้นสูง และอาจเป็นวิธีการเหมาะสมสำหรับการตรวจพบการกลายพันธุ์ในยีน dystrophin ชนิดต่าง ๆ ระบุคลื่น mutational ที่ใช้แพลตฟอร์มเดียว ทั้ง dystrophin ยีนลำดับที่ดำเนินการโดยใช้ลำดับรุ่นต่อไป ยีนทั้งหมด dystrophin รวม exons ทั้งหมด introns และโปรโมเตอร์ภูมิภาค ถูกเป้าหมายอุดมไปใช้ชุดฝ่ายการยีนทั้งหมดในบ่อ รีขอถูกเรียงลำดับบนการ Illumina HiSeq 2000 ใช้ sequencer จับคู่อ่าน 100 bp ลำดับ เราศึกษาผู้ป่วย 26:21 รู้จัก duplications ใหญ่ลบ และ 5 ไม่มีตรวจใหญ่ ลบ/duplications multiplex ไข่ขึ้นอยู่กับโพรบขยายเทคโนโลยี (MLPA) เราใช้ทั้ง dystrophin ยีนวิเคราะห์ โดยรุ่นต่อไปลำดับ 5 ผู้ป่วยไม่มีตรวจใหญ่ ลบ/duplications และห้าท่านสุ่มจาก 21 ผู้ป่วยไม่มีการลบ duplications ใหญ่ ข้อมูลลำดับครอบคลุมเกือบ 100% ภาค exonic ของยีน dystrophin โดย ≥10 อ่าน มีค่าเฉลี่ยการอ่านความลึกของ 147 กลายพันธุ์ขนาดเล็ก 5 ได้ระบุในผู้ป่วย 5 อันดับแรก ที่ 4 ตัวแปรไม่ถูกรายงานในฐานข้อมูล dmd.nl แม่นยำระบุ exons ลบ หรือซ้ำและจุดเปลี่ยนในผู้ป่วยซ้ำใหญ่ลบห้า ทั้ง dystrophin ยีนลำดับ โดยลำดับรุ่นต่อไปอาจจะเป็นเครื่องมือที่มีประโยชน์สำหรับการวินิจฉัยพันธุกรรมของโรคและ Becker dystrophies กล้ามเนื้อ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

Duchenne / เบกเกอร์ dystrophies กล้ามเนื้อจะได้รับการถ่ายทอดโรคกล้ามเนื้อบ่อยที่สุดเกิดจากการกลายพันธุ์ของยีน dystrophin อย่างไรก็ตามประมาณ 30% ของผู้ป่วยที่มีโรคไม่ได้รับการวินิจฉัยโมเลกุลเพราะคลื่นความถี่ mutational ที่ซับซ้อนและขนาดใหญ่ของยีน การแนะนำและการใช้ลำดับรุ่นต่อไปมีสูงการวิจัยทางคลินิกและทางพันธุกรรมอาจจะเป็นวิธีการที่เหมาะสมในการตรวจหาประเภทต่างๆของการกลายพันธุ์ในยีน dystrophin เพื่อระบุคลื่นความถี่ mutational ใช้แพลตฟอร์มเดียวทั้งการหาลำดับเบสของยีน dystrophin ได้รับการดำเนินการโดยใช้ลำดับรุ่นต่อไป ยีน dystrophin รวมทั้ง exons ทั้งหมด introns และภูมิภาคก่อการเป็นเป้าหมายเสริมโดยใช้ชุดตกแต่ง DMD ยีนทั้ง การตกแต่งห้องสมุดมีลำดับขั้นตอนใน Illumina HiSeq 2000 ซีเควนเซอร์ใช้จับคู่อ่าน 100 ลำดับเบส เราศึกษาผู้ป่วยที่ 26: 21 ได้เป็นที่รู้จักกันมากลบ / เลียนและ 5 ไม่ได้มีการตรวจพบขนาดใหญ่ลบ / ซ้ำซ้อนกันโดยหลาย ligation ขึ้นอยู่กับเทคโนโลยีการสอบสวนขยาย (MLPA) เรานำมาใช้ในการวิเคราะห์ยีน dystrophin ทั้งโดยลำดับรุ่นต่อไปที่จะห้าผู้ป่วยที่ไม่ได้มีการตรวจพบขนาดใหญ่ลบ / เลียนและผู้ป่วยที่สุ่มเลือกห้าจาก 21 ที่ไม่ได้มีการลบขนาดใหญ่ / เลียน ข้อมูลลำดับครอบคลุมเกือบ 100% ของภูมิภาค exonic ของยีน dystrophin โดย≥10อ่านที่มีค่าเฉลี่ยความลึกอ่าน 147 ห้าการกลายพันธุ์ที่มีขนาดเล็กได้รับการระบุไว้ในผู้ป่วยที่ห้าครั้งแรกที่สี่สายพันธุ์ที่ได้รับการแจ้งความในฐานข้อมูล dmd.nl . exons ลบหรือซ้ำและจุดพักในขนาดใหญ่ลบ / ผู้ป่วยที่ห้าทำสำเนาถูกระบุอย่างแม่นยำ ทั้งการหาลำดับเบสของยีน dystrophin โดยลำดับรุ่นต่อไปอาจจะเป็นเครื่องมือที่มีประโยชน์สำหรับการวินิจฉัยโรคทางพันธุกรรมของ Duchenne และเบกเกอร์กล้ามเนื้อ dystrophies

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

กล้ามเนื้อ dystrophy / เบรคเกอร์ dystrophies เป็นบ่อยมากที่สุดได้รับการถ่ายทอดโรคของกล้ามเนื้อที่เกิดจากการกลายพันธุ์ในยีนดิสโทรฟิน . อย่างไรก็ตาม ประมาณร้อยละ 30 ของผู้ป่วยด้วยโรคที่ไม่ได้รับการวินิจฉัยระดับโมเลกุล เพราะซับซ้อนซึ่งเปลี่ยนแปลงสเปกตรัมและขนาดของยีนการใช้เทคโนโลยีและการวิจัยทางคลินิกขั้นสูง และมีพันธุกรรมอาจเป็นวิธีที่เหมาะสำหรับการตรวจสอบประเภทต่างๆของการกลายพันธุ์ในยีนดิสโทรฟิน . เพื่อศึกษาสเปกตรัมซึ่งเปลี่ยนแปลงการใช้แพลตฟอร์มเดียวลำดับยีนดิสโทรฟินทั้งหมดถูกดำเนินการโดยใช้ลำดับรุ่นต่อไป ยีนดิสโทรฟินทั้งหมด รวมทั้งที่มีทั้งหมด ,introns และผู้ก่อการ ภูมิภาค เป็นเป้าหมายที่อุดมด้วยการใช้ยีน DMD ทั้งค่าชุด ห้องสมุดมีการลำดับการ Illumina hiseq 2000 ซีเควนใช้จับคู่อ่าน 100 BP ของ เราเรียน 26 ผู้ป่วย 21 รู้ว่าการลบ / การขนาดใหญ่และ 5 ไม่ได้มีการลบ / การมัลติเพล็กซ์ขนาดใหญ่ได้โดยขึ้นอยู่กับเทคโนโลยี ( mlpa Ligation สอบสวนขยาย )เราประยุกต์การวิเคราะห์ยีนดิสโทรฟิน ( ทั้งโดยลำดับถึงห้าผู้ป่วยที่ไม่ได้มีขนาดใหญ่ และตรวจพบการลบ / การ 5 สุ่มเลือกจากผู้ป่วย 21 ใครมีการลบ / ขนาดใหญ่ การจัดข้อมูลครอบคลุมเกือบ 100% ของเขต exonic ของยีนดิสโทรฟิน โดย≥ 10 อ่านด้วยหมายถึงอ่านความลึกของ 147 .ห้าความผิดปกติขนาดเล็กถูกระบุในห้ารายแรก ซึ่งมี 4 สายพันธุ์ dmd.nl แต่ในฐานข้อมูล ลบหรือคัดลอกฆและจุดในห้าขนาดใหญ่การลบซ้ำซ้อนให้ผู้ป่วยระบุแน่นอนยีนดิสโทรฟินทั้งลำดับโดยลำดับ ( อาจเป็นเครื่องมือที่มีประโยชน์สำหรับการวินิจฉัยทางพันธุกรรมของ dystrophy กล้ามเนื้อ และ เบคเกอร์ dystrophies .